DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment AOX4 and Aox3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_650478.1 Gene:AOX4 / 41897 FlyBaseID:FBgn0038350 Length:1256 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001008527.2 Gene:Aox3 / 493909 RGDID:1359328 Length:1334 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1355 Identity:404/1355 - (29%)
Similarity:640/1355 - (47%) Gaps:177/1355 - (13%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     5 FTINGQPYAVNLTDLPPDITLNTFIREHAQLTATKFMCLEGGCGACVCAVSDGK------STWTV 63
            |.:||:.......|  |::.|..::|:..|||.||:.|..|.||||...:|...      |.::.
  Rat    12 FFVNGKKVIERNAD--PEVNLLFYLRKIIQLTGTKYGCGGGDCGACTVMISRYNPISKKISHFSA 74

  Fly    64 NSCLKLLNTCAQLEIITCEGLGNQVTGYHPIQKRLAKMNGTQCGFCSPGFVMNMYGLMEQHGGRV 128
            .:||..:.:.....:.|.||:|:..|..||:|:|:||.:|||||||:||.||::|.|:..|....
  Rat    75 AACLVPICSLHGAAVTTVEGIGSTKTRIHPVQERIAKGHGTQCGFCTPGMVMSIYTLLRNHPEPS 139

  Fly   129 TMEEVENSFGGNICRCTGYRPILDAMKSFAVDSTVEVSEESVDIEDLNLKARNCPRSGK------ 187
            | |::..:.|||:|||||||||:::.:||:.:|.         ...:|.|.:.|...||      
  Rat   140 T-EQIMETLGGNLCRCTGYRPIVESARSFSPNSA---------CCPMNEKWKCCLDEGKNEPERK 194

  Fly   188 --VCKGTCRQ---------SKLIY--------EDG-----------SQWYWPSTLAEIFEALENV 222
              ||.....:         .:||:        ||.           :.|..|.||.::.|.....
  Rat   195 NSVCTKLYEKEEFQPLDPTQELIFPPELMRMAEDSPNTVLTFRGERTTWIAPGTLNDLLELKMEY 259

  Fly   223 GDSEEFMLVGGNTAHGVYRRSPDIKHFIDVN--GVEDLHQYSSDKEKLTLGASLSLTETMEIIQ- 284
            ..:.   ||.|||..|:..:..|:.:.|.::  .:.:|...::..|.|||||.||||:...|:. 
  Rat   260 PSAP---LVIGNTCLGLDMKFKDVSYPIIISPARILELFVVTNTNEGLTLGAGLSLTQVKNILSD 321

  Fly   285 --STSKQSGFEYLEVLWHHIDLVANVPVRNSGTLAGNICTKKEHPEFP-SDIFISFEALDVK--V 344
              |...:...:....|..|:..:|...:||..:|.|:|.::     .| ||:...|...:.|  |
  Rat   322 VVSRLPKERTQTYRALLKHLRTLAGQQIRNVASLGGHIISR-----LPTSDLNPIFGVGNCKLNV 381

  Fly   345 VAMKGIDDEKEMTL-EEFLGDT------DRKMLLKAFILPRYPKDMYIYDSFKIMPRAQNAHAYV 402
            .:.:|   .:::.| :.||...      ..::|:..|: |...|..:: .:|:..||.|||.|.|
  Rat   382 ASTEG---TQQIPLNDHFLAGVPEAILKPEQVLISVFV-PLSRKWEFV-SAFRQAPRQQNAFAIV 441

  Fly   403 NAGFLLEL-DGNSMVKSARICFGGIRPDFIHATDIEQLMVGHSPYESNLVEQTFNKLESLVKPDE 466
            |||..:.. :..:.:....|.:|||....:.|...:|| :|.. ::..:::.....:...|....
  Rat   442 NAGMRVAFKEDTNTITDLSILYGGIGATVVSAKSCQQL-IGRC-WDEEMLDDAGRMIREEVSLLT 504

  Fly   467 VLPDASPAYRSKLACGLLYKFLL-----------KHAPDAEVSGKFKSGGELLQRPLSSGLQLFQ 520
            ..|.....||..||...|:||.|           ...||  :|.|.....|.....:..|.|.|:
  Rat   505 AAPGGMVEYRKTLAISFLFKFYLDVLKQLKRRNPHRCPD--ISQKLLQVLEDFPLTMPHGTQSFK 567

  Fly   521 --TNKQTY--PVTQGVQKLEGMIQCSGEATYMNDVLTTSNSVYCAFVGATKVGATIDQIDATEAL 581
              .::|..  ||.:.:....|:...:|||.:.:|:...:..::.|.|.::|..|.|..:||:|||
  Rat   568 DVDSQQPLQDPVGRPIMHQSGIKHATGEAVFCDDMSVLAGELFLAVVTSSKPHARIISLDASEAL 632

  Fly   582 QHPGVVAFYTAKDIPGTNTFCEPSFGYEAEEIFCSGMVRHSEQPVGVIVALTAD---QAQRATKL 643
            ..||||...||:|:||.|...|.|. |..:|:.|.|.         ::.|:.||   :|::|||.
  Rat   633 ASPGVVDVITAQDVPGDNGREEESL-YAQDEVICVGQ---------IVCAVAADSYARAKQATKK 687

  Fly   644 VKISYSSPSSNFKLMPSLKDVFSSET---PDTSRIIPLVISKLKE--VKFS-DKPDLEVRGIFEM 702
            |||.|....   .::.:::|....|:   |:         .||::  |:.: ...|..:.|...:
  Rat   688 VKIVYEDME---PMIVTVQDALQHESFIGPE---------KKLEQGNVQLAFQSADQILEGEVHL 740

  Fly   703 GLQYHFTMEPQTTIIIPFEDGLK--VFSATQWIDQTQSVIAHTLQMKAKDVQLEVRRLGGGYGCK 765
            |.|.||.||.|:..:||..:.::  ::.::|....||.::|.||.:....:...|:|:||.:|.|
  Rat   741 GGQEHFYMETQSVRVIPKGEDMEMDIYVSSQDAAFTQEMVARTLGIPKNRITCHVKRVGGAFGGK 805

  Fly   766 ISRGNQVACAAALAAHKLNRPVRFVQSLESMMDCNGKRWACRSEYQCHVKTSGRIVGLSNDFYED 830
            .|:...:|..||:||.|..||:||:......|...|.|.....:|:.....:|:|.......|.:
  Rat   806 TSKPGLLASVAAVAAQKTGRPIRFILERGDDMLITGGRHPLLGKYRVGFMNNGKIKAADIQLYIN 870

  Fly   831 AGWNTNESP-VQGHSTFTAANCYEFTDSNFKLSGHAVLTDAPSSTWCRAPGSVEGIAMMENIIEH 894
            .|...::|. |..::.....|.|:.  .|.::.|....|:.||:|..|..|..:|..:.|..:..
  Rat   871 GGCTPDDSELVIEYALLKLENAYKI--PNLRVRGRVCKTNLPSNTAFRGFGFPQGAFVTETWVSA 933

  Fly   895 VAFEIQKDPAEVRLANISKKSKMATVFPEF------------LKTREYYSRKKEIEAFNANNRWK 947
            ||.:....|.:||..|:.|.........||            ::...||||||.::.||..:.||
  Rat   934 VAAKCHLPPEKVRELNMYKTIDRTIHKQEFDPTNLIKCWETCMENSSYYSRKKAVDEFNQQSFWK 998

  Fly   948 KRGLGLSLM----NFPIIYIGQFPATVTIYHVDGTVVVTHGGIEMGQGMNTKIAQVAAYTLGIDL 1008
            |||:.:..|    .||..:..|..|.|.|| .||:|:|.|||:|:|||:|||:.|||:..|.|.:
  Rat   999 KRGIAIIPMKFSVGFPKTFYHQAAALVQIY-TDGSVLVAHGGVELGQGINTKMIQVASRELKIPM 1062

  Fly  1009 SYVKVESSTSINGANSMVTGYAIGSESVCYAVRKICETLNARLKPV--RKAKATWVETVEAANAQ 1071
            ||:.::...::...|::.||.:.|::....||:..|:.|..||:|:  :.....|.|.:..|..|
  Rat  1063 SYIHLDEMNTMTVPNTITTGGSTGADVNGRAVQNACQILMKRLEPIISQNPNGDWEEWINEAFIQ 1127

  Fly  1072 LINLIASDHYK-----------TGDMQNYHVLGLALSEVEIDVLTG---NILIRRVDILEDAGES 1122
            .|:|.|:.:::           .||:..|.|.|.|.||||||.|||   ||   |.||:.|...|
  Rat  1128 SISLSATGYFRGYQADMDWEKGEGDIYPYFVFGAACSEVEIDCLTGAHKNI---RTDIVMDGSFS 1189

  Fly  1123 LSPWIDVGQVEGAFVMGLGYWLSELLIYEGDNGRLLTNRTWNYKPLGAKDIPIDFRVELVHNPRP 1187
            ::|.:|:||:|||||.|||.:..|.|.|..: |.|.|.....||.....|||.:|.|.|: .|..
  Rat  1190 INPAVDIGQIEGAFVQGLGLYTLEELKYSPE-GVLYTRGPHQYKIASVSDIPEEFHVSLL-TPTQ 1252

  Fly  1188 SSSGFMGSKATGEPPCCLAVSVIFALQQALQSARQDAGLPREWLRLGAPTTPETL 1242
            :......||..||....|..||.||:..|:.:||::.|||. .|.:.:|.|.|.:
  Rat  1253 NPKAIYSSKGLGEAGMFLGSSVFFAIAAAVAAARKERGLPL-ILAINSPATAEVI 1306

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
AOX4NP_650478.1 PLN02906 24..1240 CDD:215491 398/1332 (30%)
Aox3NP_001008527.2 mam_aldehyde_ox 9..1333 CDD:132014 404/1355 (30%)

Return to query results.
Submit another query.