DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment AOX4 and AOX3

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_650478.1 Gene:AOX4 / 41897 FlyBaseID:FBgn0038350 Length:1256 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001303439.1 Gene:AOX3 / 41896 FlyBaseID:FBgn0038349 Length:1254 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1256 Identity:978/1256 - (77%)
Similarity:1130/1256 - (89%) Gaps:2/1256 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MSTTFTINGQPYAVNLTDLPPDITLNTFIREHAQLTATKFMCLEGGCGACVCAVSDGKSTWTVNS 65
            |:|.|:|||.|||||||:||||||||||||||||||||||||.|||||||:|.|.|||.:|.|||
  Fly     1 MTTKFSINGLPYAVNLTNLPPDITLNTFIREHAQLTATKFMCQEGGCGACICVVRDGKRSWAVNS 65

  Fly    66 CLKLLNTCAQLEIITCEGLGNQVTGYHPIQKRLAKMNGTQCGFCSPGFVMNMYGLMEQHGGRVTM 130
            ||.||||||||||:|.||||||.|||:|||||||||||||||||||||||||||||||:.|:|||
  Fly    66 CLTLLNTCAQLEIVTAEGLGNQRTGYNPIQKRLAKMNGTQCGFCSPGFVMNMYGLMEQNEGKVTM 130

  Fly   131 EEVENSFGGNICRCTGYRPILDAMKSFAVDSTVEVSEESVDIEDLNLKARNCPRSGKVCKGTCRQ 195
            .||||||||||||||||||||||||||||||.:.:..|..||||  ||.||||::|:.|.|:|..
  Fly   131 AEVENSFGGNICRCTGYRPILDAMKSFAVDSNIAIPAECGDIED--LKPRNCPKTGQACSGSCLP 193

  Fly   196 SKLIYEDGSQWYWPSTLAEIFEALENVGDSEEFMLVGGNTAHGVYRRSPDIKHFIDVNGVEDLHQ 260
            |.|:||||.||:||.:|:|:|:||:.|.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||:|||
  Fly   194 STLVYEDGVQWHWPKSLSELFDALDKVKDSEEFMLVAGNTAHGVYRRSTDIKHFIDVQGVEELHQ 258

  Fly   261 YSSDKEKLTLGASLSLTETMEIIQSTSKQSGFEYLEVLWHHIDLVANVPVRNSGTLAGNICTKKE 325
            :||:.::|.|||:||||:|||||::||||.|||||:|||:||||:|||||||||||||||..||:
  Fly   259 HSSEGQQLKLGANLSLTQTMEIIRTTSKQPGFEYLDVLWNHIDLIANVPVRNSGTLAGNISIKKQ 323

  Fly   326 HPEFPSDIFISFEALDVKVVAMKGIDDEKEMTLEEFLGDTDRKMLLKAFILPRYPKDMYIYDSFK 390
            :||||||||||||||:|||||:|...|||||:|.|:||..|:|::||.|:||.||||.|||:|:|
  Fly   324 NPEFPSDIFISFEALNVKVVALKNAADEKEMSLAEYLGTNDKKLVLKTFVLPAYPKDKYIYESYK 388

  Fly   391 IMPRAQNAHAYVNAGFLLELDGNSMVKSARICFGGIRPDFIHATDIEQLMVGHSPYESNLVEQTF 455
            ||||||||||||||.|||||:.::.||||||||||||||||||:.||:|:||.:||||:||||||
  Fly   389 IMPRAQNAHAYVNAAFLLELEADNKVKSARICFGGIRPDFIHASAIEKLLVGQNPYESSLVEQTF 453

  Fly   456 NKLESLVKPDEVLPDASPAYRSKLACGLLYKFLLKHAPDAEVSGKFKSGGELLQRPLSSGLQLFQ 520
            .|||.|:|||||||||||||||||||||.|||||||||.|||..||:|||::||||||||||:||
  Fly   454 TKLEDLIKPDEVLPDASPAYRSKLACGLFYKFLLKHAPVAEVGEKFRSGGQILQRPLSSGLQVFQ 518

  Fly   521 TNKQTYPVTQGVQKLEGMIQCSGEATYMNDVLTTSNSVYCAFVGATKVGATIDQIDATEALQHPG 585
            |.|:.|||||.|:|:|||||||||||||||||||||:::||||||||||:|||.|||:|||:.||
  Fly   519 TQKKNYPVTQAVEKVEGMIQCSGEATYMNDVLTTSNTLHCAFVGATKVGSTIDSIDASEALKQPG 583

  Fly   586 VVAFYTAKDIPGTNTFCEPSFGYEAEEIFCSGMVRHSEQPVGVIVALTADQAQRATKLVKISYSS 650
            |:|||:||||||||||||||||:|.|||||||:|||||||.|||||||||||.||.|||:||||:
  Fly   584 VIAFYSAKDIPGTNTFCEPSFGFEVEEIFCSGLVRHSEQPAGVIVALTADQAHRAAKLVRISYSN 648

  Fly   651 PSSNFKLMPSLKDVFSSETPDTSRIIPLVISKLKEVKFSDKPDLEVRGIFEMGLQYHFTMEPQTT 715
            |||:|||.|||.|||:|.|||:|||:|...|..|::|||::||.||||||:||||||||||||||
  Fly   649 PSSDFKLQPSLGDVFASPTPDSSRIVPASKSTSKKIKFSEQPDKEVRGIFQMGLQYHFTMEPQTT 713

  Fly   716 IIIPFEDGLKVFSATQWIDQTQSVIAHTLQMKAKDVQLEVRRLGGGYGCKISRGNQVACAAALAA 780
            :.||||||||:||||||:|||||||||.||:|||||||:|||||||||.||:|||||||||:|.|
  Fly   714 VAIPFEDGLKIFSATQWMDQTQSVIAHMLQVKAKDVQLQVRRLGGGYGSKITRGNQVACAASLVA 778

  Fly   781 HKLNRPVRFVQSLESMMDCNGKRWACRSEYQCHVKTSGRIVGLSNDFYEDAGWNTNESPVQGHST 845
            :|||||||||||||||||||||||||||:|:||:|.:|:||||:|||||||||:.||||::||||
  Fly   779 YKLNRPVRFVQSLESMMDCNGKRWACRSDYKCHIKDNGKIVGLTNDFYEDAGWSPNESPIEGHST 843

  Fly   846 FTAANCYEFTDSNFKLSGHAVLTDAPSSTWCRAPGSVEGIAMMENIIEHVAFEIQKDPAEVRLAN 910
            |||.|||:....|||.:|:|||||||||||||||||||||||:||||||||||:|||||||||||
  Fly   844 FTAVNCYDLNGDNFKNNGNAVLTDAPSSTWCRAPGSVEGIAMIENIIEHVAFEVQKDPAEVRLAN 908

  Fly   911 ISKKSKMATVFPEFLKTREYYSRKKEIEAFNANNRWKKRGLGLSLMNFPIIYIGQFPATVTIYHV 975
            |:..:|::.:.|:||::|||..||||||:.||.|||.||||||::|::||.|.||:||||.||||
  Fly   909 IAAGNKISELLPQFLESREYAQRKKEIESHNAKNRWTKRGLGLAVMDYPIFYFGQYPATVAIYHV 973

  Fly   976 DGTVVVTHGGIEMGQGMNTKIAQVAAYTLGIDLSYVKVESSTSINGANSMVTGYAIGSESVCYAV 1040
            ||||||||||||||||||||:|||||||||||||::|||||.:||||||||||.|:||||:||||
  Fly   974 DGTVVVTHGGIEMGQGMNTKVAQVAAYTLGIDLSFIKVESSDTINGANSMVTGGAVGSESLCYAV 1038

  Fly  1041 RKICETLNARLKPVRKAKATWVETVEAANAQLINLIASDHYKTGDMQNYHVLGLALSEVEIDVLT 1105
            ||.|||||:||:||:|..|:|:||||||..:.||||||||||.|||||||:.||||:|||:||||
  Fly  1039 RKACETLNSRLEPVKKKDASWIETVEAAYGKSINLIASDHYKKGDMQNYHIYGLALTEVELDVLT 1103

  Fly  1106 GNILIRRVDILEDAGESLSPWIDVGQVEGAFVMGLGYWLSELLIYEGDNGRLLTNRTWNYKPLGA 1170
            ||..|:|||||||||||||||||:||:||||||.||||:||.|:|:.:.|||||||||||||.||
  Fly  1104 GNSQIKRVDILEDAGESLSPWIDIGQIEGAFVMCLGYWMSEQLVYDRETGRLLTNRTWNYKPPGA 1168

  Fly  1171 KDIPIDFRVELVHNPRPSSSGFMGSKATGEPPCCLAVSVIFALQQALQSARQDAGLPREWLRLGA 1235
            ||||||||:||:..|.||.:|||.|||||||||||||||:|||:|||.|||.||||||||:||||
  Fly  1169 KDIPIDFRIELIQKPNPSGAGFMRSKATGEPPCCLAVSVVFALRQALDSARHDAGLPREWVRLGA 1233

  Fly  1236 PTTPETLLLNAGHQVSEFKLK 1256
            |||||||::||||:.:.|:||
  Fly  1234 PTTPETLVVNAGHEAASFRLK 1254

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
AOX4NP_650478.1 PLN02906 24..1240 CDD:215491 949/1215 (78%)
Fer2_2 80..153 CDD:280048 65/72 (90%)
FAD_binding_5 203..378 CDD:279309 127/174 (73%)
CO_deh_flav_C 388..489 CDD:281449 82/100 (82%)
Ald_Xan_dh_C 542..648 CDD:214971 88/105 (84%)
Ald_Xan_dh_C2 690..1174 CDD:280834 380/483 (79%)
AOX3NP_001303439.1 PLN02906 24..1238 CDD:215491 949/1215 (78%)
Fer2_2 80..153 CDD:280048 65/72 (90%)
FAD_binding_4 201..360 CDD:303082 119/158 (75%)
CO_deh_flav_C 386..487 CDD:281449 82/100 (82%)
Ald_Xan_dh_C 540..646 CDD:214971 88/105 (84%)
Ald_Xan_dh_C2 688..1172 CDD:280834 380/483 (79%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C45439666
Domainoid 1 1.000 83 1.000 Domainoid score I2880
eggNOG 1 0.900 - - E1_COG4631
Homologene 1 1.000 - - H98597
Inparanoid 1 1.050 1220 1.000 Inparanoid score I588
Isobase 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 1 1.010 - - D19024at33392
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0000201
OrthoInspector 1 1.000 - - mtm9740
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100184
Panther 1 1.100 - - P PTHR11908
Phylome 1 0.910 - -
RoundUp 00.000 Not matched by this tool.
SonicParanoid 1 1.000 - - X4296
1211.800

Return to query results.
Submit another query.