DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment AOX3 and ry

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_650477.1 Gene:AOX3 / 41896 FlyBaseID:FBgn0038349 Length:1254 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_524337.1 Gene:ry / 41605 FlyBaseID:FBgn0003308 Length:1335 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1354 Identity:425/1354 - (31%)
Similarity:632/1354 - (46%) Gaps:179/1354 - (13%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     5 FSINGLPYAVNLTNLPPD--ITLNTFIREHAQLTATKFMCQEGGCGACICVV-----RDGK-RSW 61
            |.:||    ..:|.:.||  .||.||:||..:|..||..|.|||||||..:|     |..| |..
  Fly     8 FFVNG----KKVTEVSPDPECTLLTFLREKLRLCGTKLGCAEGGCGACTVMVSRLDRRANKIRHL 68

  Fly    62 AVNSCLT---LLNTCAQLEIVTAEGLGNQRTGYNPIQKRLAKMNGTQCGFCSPGFVMNMYGLMEQ 123
            |||:|||   .::.||   :.|.||:|:.:|..:|:|:||||.:|:|||||:||.||:||.|: :
  Fly    69 AVNACLTPVCSMHGCA---VTTVEGIGSTKTRLHPVQERLAKAHGSQCGFCTPGIVMSMYALL-R 129

  Fly   124 NEGKVTMAEVENSFGGNICRCTGYRPILDAMKSFAVDSNIAIPAECGDIEDLKPRNCPKTGQACS 188
            |..:.:|.::|.:|.||:||||||||||:..|:|..:....:..:|          |..:|:.|.
  Fly   130 NAEQPSMRDLEVAFQGNLCRCTGYRPILEGYKTFTKEFACGMGEKC----------CKVSGKGCG 184

  Fly   189 GSCLPSTLVYE----------------------------------DGVQWHWPKSLSELFDALDK 219
            ........::|                                  |.|.|:.|.:|.||.....|
  Fly   185 TDAETDDKLFERSEFQPLDPSQEPIFPPELQLSDAFDSQSLIFSSDRVTWYRPTNLEELLQLKAK 249

  Fly   220 VKDSEEFMLVAGNTAHGVYRRSTDIKHF-----IDVQGVEELHQHSSEGQQLKLGANLSLTQTME 279
            ...::   ||.|||..||   ....|||     |:...|:||.:.......:..||.:||.:...
  Fly   250 HPAAK---LVVGNTEVGV---EVKFKHFLYPHLINPTQVKELLEIKENQDGIYFGAAVSLMEIDA 308

  Fly   280 IIRTTSKQPGFEYLDVLWNHIDLI---ANVPVRNSGTLAGNI----SIKKQNPEFPSDIFISFEA 337
            ::|...:|.......:....:|::   |...:||...|.|||    .|...||      .:|...
  Fly   309 LLRQRIEQLPESETRLFQCTVDMLHYFAGKQIRNVACLGGNIMTGSPISDMNP------VLSAAG 367

  Fly   338 LNVKVVALKNAADEKEMSLAEYLGTN----------DKKLVLKTFVLPAYPKDKYIYESYKIMPR 392
            ..::|.:.   .|.|....:.::||.          :...||..........|:||. ::|...|
  Fly   368 AQLEVASF---VDGKLQKRSVHMGTGFFTGYRRNVIEAHEVLLGIHFRKTTPDQYIV-AFKQARR 428

  Fly   393 AQNAHAYVNAAFLLEL-EADNKVKSARICFGGIRPDFIHASAIEKLLVGQNPYESSLVEQTFTKL 456
            ..:..|.||||..:.. |..|.|....:.|||:.|..:.|....:|:|||. :...|||:....|
  Fly   429 RDDDIAIVNAAINVRFEEKSNIVAEISMAFGGMAPTTVLAPRTSQLMVGQE-WSHQLVERVAESL 492

  Fly   457 EDLIKPDEVLPDASPAYRSKLACGLFYK-FLLKHAPVAEVG--------EKFRSGGQILQRPLSS 512
            ...:......|....|||..|...||:| :|.....:::.|        .:.|||.:....|:..
  Fly   493 CTELPLAASAPGGMIAYRRALVVSLFFKAYLAISLKLSKSGITSSDALPSEERSGAETFHTPVLK 557

  Fly   513 GLQVFQTQKKNYPVTQAVEK----VEGMIQCSGEATYMNDVLTTSNTLHCAFVGATKVGSTIDSI 573
            ..|:|:....:.|:...:.:    ...:.|.:|||.|.:|:......::.|||.:||..:.|..:
  Fly   558 SAQLFERVCSDQPICDPIGRPKVHAAALKQATGEAIYTDDIPRMDGEVYLAFVLSTKPRAKITKL 622

  Fly   574 DASEALKQPGVIAFYSAKDIPGTNTFCEPSFG--FEVEEIFCSGLVRHSEQPAGVIVALTADQAH 636
            ||||||...||..|:..||:    |..|...|  |..|.:|.:|.|....|..|.|.|.....|.
  Fly   623 DASEALALDGVHQFFCYKDL----TEHENEVGPVFHDEHVFAAGEVHCYGQIVGAIAADNKALAQ 683

  Fly   637 RAAKLVRISYSNPSSDFKLQPSLGDV-----FASPTPDSSRIVPASKSTSKKIKFS-EQPDKEVR 695
            |||:||::.|.      :|.|.:..:     ..|..||..|.|     |...::.: .|.|....
  Fly   684 RAARLVKVEYE------ELSPVIVTIEQAIEHKSYFPDYPRFV-----TKGNVEEALAQADHTFE 737

  Fly   696 GIFQMGLQYHFTMEPQTTVAIPFE-DGLKIFSATQWMDQTQSVIAHMLQVKAKDVQLQVRRLGGG 759
            |..:||.|.||.:|....:|:|.: |.|::|.:||...:.|.::||:..:.|..|..:.:|||||
  Fly   738 GTCRMGGQEHFYLETHAALAVPRDSDELELFCSTQHPSEVQKLVAHVTALPAHRVVCRAKRLGGG 802

  Fly   760 YGSKITRGNQVACAASLVAYKLNRPVRFVQSLESMMDCNGKRWACRSDYKCHIKDNGKIVGLTND 824
            :|.|.:||..||...:|.||::.||||.:...:..|...|.|......||......|.|.....:
  Fly   803 FGGKESRGISVALPVALAAYRMGRPVRCMLDRDEDMLITGTRHPFLFKYKVGFTKEGLITACDIE 867

  Fly   825 FYEDAGWSPNES-PIEGHSTFTAVNCYDLNGDNFKNNGNAVLTDAPSSTWCRAPGSVEGIAMIEN 888
            .|.:||||.:.| .:...:.|...|||.:  .|.:..|....|:.||:|..|..|..:|:...|:
  Fly   868 CYNNAGWSMDLSFSVLERAMFHFENCYRI--PNVRVGGWVCKTNLPSNTAFRGFGGPQGMYAGEH 930

  Fly   889 IIEHVAFEVQKDPAEV-RLANIAAGN-----------KISELLPQFLESREYAQRKKEIESHNAK 941
            ||..||..|.:|..:| ||.....|:           .|...|...|:...|.::::||...|.:
  Fly   931 IIRDVARIVGRDVVDVMRLNFYKTGDYTHYHQQLEHFPIERCLEDCLKQSRYDEKRQEIARFNRE 995

  Fly   942 NRWTKRGLGLAVMDYPI----FYFGQYPATVAIYHVDGTVVVTHGGIEMGQGMNTKVAQVAAYTL 1002
            |||.|||:.:....|.|    .:..|..:.:.||. ||:|:::|||:|:|||:|||:.|.||..|
  Fly   996 NRWRKRGMAVVPTKYGIAFGVMHLNQAGSLINIYG-DGSVLLSHGGVEIGQGLNTKMIQCAARAL 1059

  Fly  1003 GIDLSFIKVESSDTINGANSMVTGGAVGSESLCYAVRKACETLNSRLEPVKK--KDASWIETVEA 1065
            ||....|.:..:.|....|:..|..:|||:....||..|||.||.||.|:|:  ...:|.|.:..
  Fly  1060 GIPSELIHISETATDKVPNTSPTAASVGSDLNGMAVLDACEKLNKRLAPIKEALPGGTWKEWINK 1124

  Fly  1066 AYGKSINLIASDHY------------KKGDMQNYHIYGLALTEVELDVLTGNSQIKRVDILEDAG 1118
            ||...::|.|:..|            ......:|:..|:.:|.||:|.|||:.|:...||:.|.|
  Fly  1125 AYFDRVSLSATGFYAMPGIGYHPETNPNARTYSYYTNGVGVTVVEIDCLTGDHQVLSTDIVMDIG 1189

  Fly  1119 ESLSPWIDIGQIEGAFVMCLGYWMSEQLVYDRETGRLLTNRTWNYKPPGAKDIPIDFRIELIQ-K 1182
            .||:|.||||||||||:...|.:..|:|:|..: |.|.:.....||.||..|||.:|.:.|:. .
  Fly  1190 SSLNPAIDIGQIEGAFMQGYGLFTLEELMYSPQ-GMLYSRGPGMYKLPGFADIPGEFNVSLLTGA 1253

  Fly  1183 PNPSGAGFMRSKATGEPPCCLAVSVVFALRQALDSARHDAGLPREWVRLGAPTT 1236
            |||...  ..|||.||||..:..|..||:::|:.:||.|.||..:: .|.||:|
  Fly  1254 PNPRAV--YSSKAVGEPPLFIGSSAFFAIKEAIAAAREDQGLSGDF-PLEAPST 1304

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
AOX3NP_650477.1 PLN02906 24..1238 CDD:215491 419/1333 (31%)
ryNP_524337.1 PLN02906 25..1317 CDD:215491 419/1333 (31%)

Return to query results.
Submit another query.