DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment AOX2 and AOX3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_732047.2 Gene:AOX2 / 41895 FlyBaseID:FBgn0038348 Length:1264 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_650477.1 Gene:AOX3 / 41896 FlyBaseID:FBgn0038349 Length:1254 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1277 Identity:749/1277 - (58%)
Similarity:961/1277 - (75%) Gaps:37/1277 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MSIKFNVNGFPYEVQAADYPPDTTLNTFLREHLHLTATKYMCLEGGCGSCVCVIRRRHPVTQEVQ 65
            |:.||::||.||.|...:.|||.|||||:|||..|||||:||.|||||:|:||:|      ...:
  Fly     1 MTTKFSINGLPYAVNLTNLPPDITLNTFIREHAQLTATKFMCQEGGCGACICVVR------DGKR 59

  Fly    66 SRAANSCLTLLNTCDDAEIMTDEGLGNQLSGYHPIQKRVAQMNGTQCGYCSPGFVMNMYGLLEQH 130
            |.|.||||||||||...||:|.||||||.:||:|||||:|:|||||||:||||||||||||:||:
  Fly    60 SWAVNSCLTLLNTCAQLEIVTAEGLGNQRTGYNPIQKRLAKMNGTQCGFCSPGFVMNMYGLMEQN 124

  Fly   131 RGQVSMSQVEDAFGGNLCRCTGYRPILDAMKSFAVDSNVEVPAESVDIEDSFELLCPRTGQSCKG 195
            .|:|:|::||::||||:|||||||||||||||||||||:.:|||..||||.....||:|||:|.|
  Fly   125 EGKVTMAEVENSFGGNICRCTGYRPILDAMKSFAVDSNIAIPAECGDIEDLKPRNCPKTGQACSG 189

  Fly   196 SCSRPPLRDHGDSQWYWPKTLTELFGALSQVANGELYMLVAGNTAHGVYRRPRDIRHFIDVNMVP 260
            ||....|......||:|||:|:|||.||.:|.:.|.:||||||||||||||..||:|||||..|.
  Fly   190 SCLPSTLVYEDGVQWHWPKSLSELFDALDKVKDSEEFMLVAGNTAHGVYRRSTDIKHFIDVQGVE 254

  Fly   261 ELRQYSIETDHLLLGGNVTLTDAMQVFLLAAKRPGFEYCAQLWQHFNLIANVPVRNNGTLAGNIN 325
            ||.|:|.|...|.||.|::||..|::....:|:|||||...||.|.:|||||||||:|||||||:
  Fly   255 ELHQHSSEGQQLKLGANLSLTQTMEIIRTTSKQPGFEYLDVLWNHIDLIANVPVRNSGTLAGNIS 319

  Fly   326 IKKQHFEFPSDVFITFEALDVHVLVYDNPSTQRVMNLLTYLGDTTSKLVLGGFILKAYPKDRFLF 390
            ||||:.|||||:||:||||:|.|:...|.:.::.|:|..|||....||||..|:|.|||||::::
  Fly   320 IKKQNPEFPSDIFISFEALNVKVVALKNAADEKEMSLAEYLGTNDKKLVLKTFVLPAYPKDKYIY 384

  Fly   391 RSYKILPRAQNVHAYVNAGFLIEWQDIQHRIVHSARICFGNIRPDYIHDDQVEQLLPGRDLYDPA 455
            .||||:|||||.||||||.||:|.:  ....|.|||||||.||||:||...:|:||.|::.|:.:
  Fly   385 ESYKIMPRAQNAHAYVNAAFLLELE--ADNKVKSARICFGGIRPDFIHASAIEKLLVGQNPYESS 447

  Fly   456 TVAQIFQELPASLQPEERPPEASPEYRQMLACSLLYKFLLATAPKERVRERFRTGGLLLERPLSS 520
            .|.|.|.:|...::|:|..|:|||.||..|||.|.|||||..||...|.|:||:||.:|:|||||
  Fly   448 LVEQTFTKLEDLIKPDEVLPDASPAYRSKLACGLFYKFLLKHAPVAEVGEKFRSGGQILQRPLSS 512

  Fly   521 GSQSFETIKKNYPVTQPVQKLEGLIQCSGEATYMNDLLTTSNAVHCAFVTAKRVGATIEQIDPSA 585
            |.|.|:|.||||||||.|:|:||:||||||||||||:|||||.:|||||.|.:||:||:.||.|.
  Fly   513 GLQVFQTQKKNYPVTQAVEKVEGMIQCSGEATYMNDVLTTSNTLHCAFVGATKVGSTIDSIDASE 577

  Fly   586 ALQCKGVVAFYSAEDIPGSNNFVLVNQLTP----EVDEVFVAGRVKYFDQPLGVIAALTHDAAVY 646
            ||:..||:|||||:||||:|.|     ..|    ||:|:|.:|.|::.:||.|||.|||.|.|..
  Fly   578 ALKQPGVIAFYSAKDIPGTNTF-----CEPSFGFEVEEIFCSGLVRHSEQPAGVIVALTADQAHR 637

  Fly   647 AATLVVVTYARDQR--KIFTTMNQVLAEKQTD--RIVSTKKDTVEPLKLPPLAPGDVLGRGILEL 707
            ||.||.::|:....  |:..::..|.|....|  |||...|.|.:.:|.......:|  |||.::
  Fly   638 AAKLVRISYSNPSSDFKLQPSLGDVFASPTPDSSRIVPASKSTSKKIKFSEQPDKEV--RGIFQM 700

  Fly   708 ASQYHFTMEPQTTIVVPLDNILQVYCATQWMDATQGAIAHMLKVSVNSIQLQVRRVGGAYGAKVT 772
            ..|||||||||||:.:|.::.|:::.||||||.||..|||||:|....:||||||:||.||:|:|
  Fly   701 GLQYHFTMEPQTTVAIPFEDGLKIFSATQWMDQTQSVIAHMLQVKAKDVQLQVRRLGGGYGSKIT 765

  Fly   773 RGNIVACATALVASKLRRPARFVQTIESMMETIGKRWACRSDYEFRARANGSIIMLSNNYYEDSG 837
            |||.||||.:|||.||.||.||||::||||:..||||||||||:...:.||.|:.|:|::|||:|
  Fly   766 RGNQVACAASLVAYKLNRPVRFVQSLESMMDCNGKRWACRSDYKCHIKDNGKIVGLTNDFYEDAG 830

  Fly   838 CNLNENVVDFLTLPILRNVYNLTDANYRTQGSAIRTDAPSSTWCRAPGSAEGIAMTETALEHIAF 902
            .:.||:.::..:.....|.|:|...|::..|:|:.||||||||||||||.|||||.|..:||:||
  Fly   831 WSPNESPIEGHSTFTAVNCYDLNGDNFKNNGNAVLTDAPSSTWCRAPGSVEGIAMIENIIEHVAF 895

  Fly   903 TCQLDPADVRLVNLQPGNKMVQLLPKFLASTEYHKRRDQINLFNSQNRWRKRGLGLALMSFPLNT 967
            ..|.|||:|||.|:..|||:.:|||:||.|.||.:|:.:|...|::|||.|||||||:|.:|:  
  Fly   896 EVQKDPAEVRLANIAAGNKISELLPQFLESREYAQRKKEIESHNAKNRWTKRGLGLAVMDYPI-- 958

  Fly   968 TVAF---NYPVTVAIYHEDGSVVISHGGIEIGQGVNTKAAQVAAFVLGVPLDQVRVEASNTVNGA 1029
               |   .||.||||||.||:||::|||||:|||:|||.|||||:.||:.|..::||:|:|:|||
  Fly   959 ---FYFGQYPATVAIYHVDGTVVVTHGGIEMGQGMNTKVAQVAAYTLGIDLSFIKVESSDTINGA 1020

  Fly  1030 NSMLTANSMTSEMIGLAVRKACDTLNKRLAPVKERLGPRASWVQVLQAAFLQSVFLIATESYRLG 1094
            |||:|..::.||.:..||||||:|||.||.|||::   .|||::.::||:.:|:.|||::.|:.|
  Fly  1021 NSMVTGGAVGSESLCYAVRKACETLNSRLEPVKKK---DASWIETVEAAYGKSINLIASDHYKKG 1082

  Fly  1095 DIPNYNIFGLSLTELELDILTGNHLIRRVDILEDAGESLSPHIDVGQVEGAFVMGLGYYLTEQLV 1159
            |:.||:|:||:|||:|||:||||..|:||||||||||||||.||:||:||||||.|||:::||||
  Fly  1083 DMQNYHIYGLALTEVELDVLTGNSQIKRVDILEDAGESLSPWIDIGQIEGAFVMCLGYWMSEQLV 1147

  Fly  1160 YDRQTGQILTNRTWNYHPPGAKDIPIDFRIELLQKSPNP--VGFMRSKATGEPALCLAVGALFAM 1222
            |||:||::||||||||.|||||||||||||||:|| |||  .|||||||||||..||||..:||:
  Fly  1148 YDRETGRLLTNRTWNYKPPGAKDIPIDFRIELIQK-PNPSGAGFMRSKATGEPPCCLAVSVVFAL 1211

  Fly  1223 QHAIQSARNDAGLPREWVRLGAPTTPETVVLNSGSQVEAFAL 1264
            :.|:.|||:|||||||||||||||||||:|:|:|.:..:|.|
  Fly  1212 RQALDSARHDAGLPREWVRLGAPTTPETLVVNAGHEAASFRL 1253

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
AOX2NP_732047.2 PLN02906 24..1251 CDD:215491 732/1239 (59%)
AOX3NP_650477.1 PLN02906 24..1238 CDD:215491 730/1237 (59%)

Return to query results.
Submit another query.