DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Sra-1 and Cyfip1

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_650447.1 Gene:Sra-1 / 41861 FlyBaseID:FBgn0038320 Length:1291 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001100987.1 Gene:Cyfip1 / 308666 RGDID:1310332 Length:1253 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1281 Identity:839/1281 - (65%)
Similarity:1034/1281 - (80%) Gaps:34/1281 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MTEKITLADALSNVEVLDELSLPDEQPCIEAQPCSIIYKANFDTNFEDRNGFVTGIAKYIEEATT 65
            |..::||.||||||::|:||.|||:|||||..|.|::|:.||:|||||||.||||||:|||:||.
  Rat     1 MAAQVTLEDALSNVDLLEELPLPDQQPCIEPPPSSLLYQPNFNTNFEDRNAFVTGIARYIEQATV 65

  Fly    66 HANLNVLLDEGQKHAVMLYTWRCCSRAIPQPKSNEQPNRVEIYEKTVEVLAPEVNKLLNFMYFQR 130
            |:::|.:|:|||::||||||||.|||||||.|.|||||||||||||||||.|||.||:|||||||
  Rat    66 HSSMNEMLEEGQEYAVMLYTWRSCSRAIPQVKCNEQPNRVEIYEKTVEVLEPEVTKLMNFMYFQR 130

  Fly   131 KAIEAFSGEVKRLCHAEKRKDFVSEAYLLTLGKFINMFAVLDELKNMKSSVKNDYSTYRRAAQFL 195
            .|||.|.|||:||||||:||||||||||:|||||||||||||||||||.|||||:|.|:||||||
  Rat   131 NAIERFCGEVRRLCHAERRKDFVSEAYLITLGKFINMFAVLDELKNMKCSVKNDHSAYKRAAQFL 195

  Fly   196 KVMSDSHTLQESQNLSMFLATQNKIRDTVKDTLEKIVGYEDLLSDVVNICVHMFETKMYLTPEEK 260
            :.|:|..::|||||||||||..|||..:::..||.|.|||:||:|:||:||..:|.:|||||.||
  Rat   196 RKMADPQSIQESQNLSMFLANHNKITQSLQQQLEVISGYEELLADIVNLCVDYYENRMYLTPSEK 260

  Fly   261 HMLVKVMGFGLFLMDSDACNINKLDQKKKIRLDRIDRIFKNLEVVPLFGDMQIAPFNYIKRSKHF 325
            |||:|||||||:|||....||.|||.||:|.|.:||:.||.|:||||||||||....|||.|.|:
  Rat   261 HMLLKVMGFGLYLMDGSVSNIYKLDAKKRINLSKIDKYFKQLQVVPLFGDMQIELARYIKTSAHY 325

  Fly   326 D--SSKWPLSSSNAISPQADLMVHLPQIREDHVKYISELARYTN-EVTT---TVKENPSDAENRI 384
            :  .|:|..:||:: |||.::...:.||||||:::|||||||:| ||.|   ..:...:|||.|.
  Rat   326 EENKSRWTCTSSSS-SPQYNICEQMIQIREDHMRFISELARYSNSEVVTGSGRQEAQKTDAEYRK 389

  Fly   385 TADLALRGLQLLSEWTSVVTELYSWKLLHPTDHHQNKECPVEAEEYERATRYNYTSEEKFALIEV 449
            ..||||:||||||:|::.|.|:|||||:||||.:.||:||..|||||||||||||:||||||:||
  Rat   390 LFDLALQGLQLLSQWSAHVMEVYSWKLVHPTDKYSNKDCPDNAEEYERATRYNYTTEEKFALVEV 454

  Fly   450 IAMIKGLQVLMARIETVLCEAIRRNIYSELQDFVQLSLREPLRKAVKNKKDLIRSIIMSVRETSA 514
            |||||||||||.|:|:|...|||..:|:.||||.|::||||||:|:|.||::|:|::.::|:|..
  Rat   455 IAMIKGLQVLMGRMESVFNHAIRHTVYAALQDFSQVTLREPLRQAIKKKKNVIQSVLQAIRKTVC 519

  Fly   515 DWQKGYEPTDDPVAKGKKDPDGGFRIQVPRLNVGPSSTQLYMVRTMLESLIADKSGGKRTLRKDI 579
            ||:.|:||.:||..:|:|||..||.|:|||..||||||||||||||||||||||||.|:|||..:
  Rat   520 DWETGHEPFNDPALRGEKDPKSGFDIKVPRRAVGPSSTQLYMVRTMLESLIADKSGSKKTLRSSL 584

  Fly   580 DGNCLLQIDTFHKTSFYWSYLLNFSDTLQKCCDLSQLWYREFYLEMTMGRKVNKCLVRHQHNEEC 644
            :|..:|.|:.||:.||::::|:|||:|||:||||||||:|||:||:||||               
  Rat   585 EGPTILDIEKFHRESFFYTHLINFSETLQQCCDLSQLWFREFFLELTMGR--------------- 634

  Fly   645 KDLITMEKRIQFPIEMSMPWILTDHILQTKEPSMMEFVLYPLDLYNDSAYYALTVFRKQFLYDEV 709
                    |||||||||||||||||||:|||.||||:|||.||||||||:||||.|.|||||||:
  Rat   635 --------RIQFPIEMSMPWILTDHILETKEASMMEYVLYSLDLYNDSAHYALTKFNKQFLYDEI 691

  Fly   710 EAEVNLCFDQFVYKLSEQIFAHYKQLAGSIFLDKRFRLECEVLGFNFQSYPRNNRYETLLKQRHV 774
            |||||||||||||||::||||:||.:|||:.||||.|.||:..|.... .|.:||||||||||||
  Rat   692 EAEVNLCFDQFVYKLADQIFAYYKVMAGSLLLDKRLRSECKNQGATIH-LPPSNRYETLLKQRHV 755

  Fly   775 QLLGRSIDLNKLITQRINANMHKSIELAISRFEGNDITGIVELEGLLEANRICHKLLSKYLALDN 839
            ||||||||||:|||||::|.|:||:||||.|||..|:|.:|||:||||.||:.|||||:||.||:
  Rat   756 QLLGRSIDLNRLITQRVSAAMYKSLELAIGRFESEDLTSVVELDGLLEINRMTHKLLSRYLTLDS 820

  Fly   840 FDGMVKEANHNVLAPYGRITLHVFVELNYDFLVNYCYNAATNRFIRTKVNLSSSQAIQREKPPQM 904
            ||.|.:||||||.|||||||||||.|||||||.|||||.:||||:||.  |..||..||:|.|..
  Rat   821 FDAMFREANHNVSAPYGRITLHVFWELNYDFLPNYCYNGSTNRFVRTV--LPFSQEFQRDKQPNA 883

  Fly   905 SHYYLWGSKQLNAAYSTQYGQYTGFVGSPHFHAMCRLLGYQGIAVVMDIILKDIVKPLIQGSLLQ 969
            ...||.|||.||.|||:.||.|..|||.|||..:|||||||||||||:.:|| :||.|:||::||
  Rat   884 QPQYLHGSKALNLAYSSIYGSYRNFVGPPHFQVICRLLGYQGIAVVMEELLK-VVKSLLQGTILQ 947

  Fly   970 FTKTLMIAMPKSCKLPRCEYGSPGVLSYYQAHLTDIVQYPDAKTELFQSFREFGNSIIFCLLIEQ 1034
            :.||||..|||.|:|||.||||||:|.::...|.|||:|.:.||..||:.||.||:::|||||||
  Rat   948 YVKTLMEVMPKICRLPRHEYGSPGILEFFHHQLKDIVEYAELKTVCFQNLREVGNAVLFCLLIEQ 1012

  Fly  1035 ALSQEEVCDLLHAALFQNIFPRPFCKENEKPEAKQKRLEAQFANLQIVSNVEKIGTAKQAMIARE 1099
            :||.||||||||||.||||.||...||.|:.:||.||||:::|.|.:|..:|::||.:|..||||
  Rat  1013 SLSLEEVCDLLHAAPFQNILPRVHVKEGERVDAKMKRLESKYAPLHLVPLIERLGTPQQIAIARE 1077

  Fly  1100 GDLLTRERLCCGLSIFEVILNRVKSYLDDPVWCGPPPANGIIHVDECSEFHRLWSALQFVYCIPV 1164
            |||||:||||||||:|||||.|::::||||:|.||.|:||::|||||.||||||||:||||||||
  Rat  1078 GDLLTKERLCCGLSMFEVILTRIRTFLDDPIWRGPLPSNGVMHVDECVEFHRLWSAMQFVYCIPV 1142

  Fly  1165 RGTEYTIEELFGEGLNWAGCVMIVLLGQQRRFEALDFCYHILRVQRVDGKDEDVKGIQLKRMVDR 1229
            ...|:|:|:.||:||:||||::||||||||||..||||||:|:||:.|||||.:|.:.||:||:|
  Rat  1143 GTHEFTVEQCFGDGLHWAGCMIIVLLGQQRRFAVLDFCYHLLKVQKHDGKDEIIKNVPLKKMVER 1207

  Fly  1230 IRRFQVLNSQIFSILNKYLKGGDGEGSNVEHVRCFPPPQHPSVISS 1275
            ||:||:||.:|.:||:||||.||||.:.|||||||.||.|.|:.||
  Rat  1208 IRKFQILNDEIITILDKYLKSGDGESTPVEHVRCFQPPIHQSLASS 1253

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Sra-1NP_650447.1 DUF1394 89..>267 CDD:399855 133/177 (75%)
FragX_IP 386..1244 CDD:399175 560/857 (65%)
Cyfip1NP_001100987.1 FragX_IP 389..1222 CDD:399175 560/859 (65%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C166341521
Domainoid 1 1.000 1163 1.000 Domainoid score I13
eggNOG 1 0.900 - - E1_KOG3534
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 1 1.050 1714 1.000 Inparanoid score I65
OMA 1 1.010 - - QHG54601
OrthoDB 1 1.010 - - D108507at2759
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0003030
OrthoInspector 1 1.000 - - oto96618
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_102235
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR12195
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X2020
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 1 0.960 - -
1514.770

Return to query results.
Submit another query.