DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment trx and Ash1l

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_476769.1 Gene:trx / 41737 FlyBaseID:FBgn0003862 Length:3726 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_063137913.1 Gene:Ash1l / 310638 RGDID:1306350 Length:3000 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2477 Identity:445/2477 - (17%)
Similarity:813/2477 - (32%) Gaps:834/2477 - (33%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly  1853 SPSVTYESNFEVSRPVYVE--------LDRKRKKLIE--------PARVQFHI-------GSLEV 1894
            |||..........|.|.:|        ..|.|::.||        .|:.||.:       |:|::
  Rat    64 SPSAISSGTLASKREVEIEGNTDEEDPRKRNRERAIEAGKDDGLTDAQQQFSVKETNFSEGNLKL 128

  Fly  1895 RQLGAIVPRFSDSYEAVVPINFLCSRLYWSSKEPWKIVEY----TVRTTIQNSSSTL-------- 1947
            : :|....|                    :.|.|..:..|    .::||:::|...|        
  Rat   129 K-IGLQAKR--------------------TKKPPKNLENYVCRPAIKTTVKHSRKALKSGKMTDE 172

  Fly  1948 ---------------------TALDVGRNYTV-----DHTNPNSKEVQLGMAQIARWHTSL---- 1982
                                 ||::.....:|     ...||.||::....:|:|.:..:.    
  Rat   173 KNEHCPSKWDSSKLFKKAGDATAIECQSEESVHLHSQGENNPLSKKLSPVHSQMADYIPAAPPLV 237

  Fly  1983 ------ARSEFLENGGTDWSGEFPNPNSCVPPDENTEEEPQQ----------------------- 2018
                  .:...|.||||..:.:.....:..||.::::.:|::                       
  Rat   238 GSRDPDIKDRALLNGGTSVTEKLAQLIATCPPSKSSKAKPKKLGTGTTVGLVSKDLIRKPGVGSI 302

  Fly  2019 ----QADLL-PPELKDAIFEDLPHELLDGISMLDIFLYDDKTDLF--AISEQSKD-------GTQ 2069
                ..||: .|.|..|:          |:...|    ..|..:|  |:|..:||       ||.
  Rat   303 AGIIHKDLIKKPALSTAV----------GLVTKD----PGKKPMFNAAVSLINKDSVKKLGTGTT 353

  Fly  2070 AMTSNQAQNQNQQAGGANSVSICDED--------------TRNSNTSLGNGWPASNPVEDAMLSA 2120
            |:..|  ::..::.|...:|.:..:|              .:.|...||.|.......::.   .
  Rat   354 AVFIN--KDLGKKPGTVTTVGLLSKDPGKKLGIGIVPGLVNKESGKKLGLGTVVGLVNKEL---G 413

  Fly  2121 ARNSSQVQMLKTLAWPKLDGNSAMATAIKRRKLSKNLAEGVFLTLSSQQRNKKEMATVAGVSRRQ 2185
            .:.||.|.::......|:..:|||..      ::|::.:.:.....:.|...|:...:    :.:
  Rat   414 KKLSSTVGLVAKDVTKKIVASSAMGL------VNKDIGKKLLSCPIAGQLGSKDALNL----KSE 468

  Fly  2186 SISETSVEGVATTSGSVRS-------KSFTWSAAKRYFEKSEGREEAAKMRIMQMDGVDDSIT-- 2241
            ::..|..:..|:.|.::.:       :|...||..:.|||:..|.  :|..:::...|...||  
  Rat   469 ALLPTQEQLKASCSANISNHESQELPESLKDSATSKTFEKNVMRH--SKESMLEKFSVRKEITNL 531

  Fly  2242 ------EFRIISGD-------GNLSTAQFSGQVKCDRCQCTYRNY------DAF----------Q 2277
                  |...|..|       |...|::...|   ....||..::      ||.          :
  Rat   532 EKEMFNEGTCIQQDSFSSNERGAFETSKHEKQ---PPVYCTSPDFQIGGASDASTAKSPFGAVGE 593

  Fly  2278 RHLPSCSPTMSSN-------ETESDVSGQGMTNNATQISAESLNELQKQLLANAGGLNYLQSATS 2335
            .:|||.|||:|.|       ||.|.:....:..|:|   ||.:.|:.:.:     |.|...:.::
  Rat   594 SNLPSSSPTVSVNPLTRNPPETSSQLVPNPLLLNST---AEQMEEISESI-----GKNQFTAEST 650

  Fly  2336 FPQV--QSLGSLGQFGLQGLQQ-----------LQLQPQSLGSGFFLSQPNPATQANTDDLQIYA 2387
            ...|  :|||.......:|:.:           :.....|||     .:|:.|:.:....:....
  Rat   651 HLNVGHRSLGHSISIECKGIDKELNESKSTHLDISRISSSLG-----KKPSLASDSGIHTITPSV 710

  Fly  2388 NSLQSLAAN-----LGGGFTLAQPTVTAPAQPQLIAVSTNPDGTQQFIQIPQTMQATTTPTATYQ 2447
            .:..||.:|     ||        .|.||.:...:|.|.:.....:.::..:..:|..|......
  Rat   711 VNFTSLFSNKPFLKLG--------AVAAPDKHCQVAESLSTSFQSKPLKKRKGRKARWTKVVARS 767

  Fly  2448 T--------LQATNTDKKIML-PLTAAGKPLKTVATKAAQQAA----VKQRQLKSGHQVKPIQAK 2499
            |        |:.:...|.:.. .|:.:.:|.|.:.|..|....    :|:|..|......|..|.
  Rat   768 TCRSPKGLDLERSELFKNVSCSSLSNSSEPAKFMKTIGASSFVDHDFLKRRLPKLSKSSAPSLAL 832

  Fly  2500 L-------------------------------QPHPQQHQQQQQTQVQQP----ITVMGQNLLQP 2529
            |                               :|...:.:.::..|::.|    :.:....:...
  Rat   833 LADSEKASHKSFITHKLSSSMCVTSDLLSDIYKPKRGRPKSKEMPQLEGPPKRTLKIPASKVFSL 897

  Fly  2530 QLLFQSSTQTQAPQIILPQAQPQNI---ISFVTGDGSQGQPLQYISIPTAGEYKPQPQPTATPTF 2591
            |     |.:.|.|.|:.|:.:..:.   :|.......:|:|.:.:..|.  :.|| |..:..|..
  Rat   898 Q-----SKEEQEPPILQPEIEIPSFKQSLSVSPFPKKRGRPKRQMRSPV--KMKP-PVLSVAPFV 954

  Fly  2592 LTTAPG----------AGATYLQTDASGNLVLTTTPSNSGLQMLTAQS-LQAQP----------Q 2635
            .|.:|.          :.:.:.:::  ..|..|....:|..|.:.:.| |:.:|          |
  Rat   955 ATESPSKLESESENHRSSSDFFESE--DQLQDTDDLEDSHRQSVCSVSDLEMEPDKKISKRNNGQ 1017

  Fly  2636 VIGTLIQP----QTIQ--------LGGGADGNQPGSNQQPL-----ILGGTGGGSSGLEFATTSP 2683
            ::.|:|:.    :|::        |....:.:..|..|..|     .|..|.|...|.:...:..
  Rat  1018 LMKTIIRKINKMKTLKRKKLLNQILSSSVESSNKGKVQSKLHNTVSSLAATFGSKLGQQINVSKK 1082

  Fly  2684 QVILATQPMYYGL------ETIVQNTVMSS-----------QQFVSTA----MPGMLSQNASF-- 2725
            ..|      |.|.      :|::...:..|           ||...:|    :|.:|...||.  
  Rat  1083 GTI------YIGKRRGRKPKTVLNGLLSGSPASLAVLEQTAQQAAGSALGQILPPLLPSPASSSE 1141

  Fly  2726 ---SATTTQVFQASKIEPIVDLPAGYV---------VLNNTGD---------------ASSAGTF 2763
               |...:|....|..:..|...||:|         |.:..|.               ..|..|.
  Rat  1142 ILPSPICSQSSGTSGGQSPVSSDAGFVEPSSVPYLHVHSRQGSMIQTLAMKKAAKGRRRLSPPTL 1206

  Fly  2764 L-NAASVLQQQTQDDTTTQILQNANFQFQSVPTSSGASTSMDYTS--------------PVMVTA 2813
            | |:.|.|.:.|.....|....:.:...:::|:.||..|..:.||              .....:
  Rat  1207 LPNSPSHLSELTSLKEATPSPVSESHSDETIPSDSGIGTDNNSTSDRAEKFCGQKKRRHSFEHIS 1271

  Fly  2814 KIPPVT--------------------------QIKRTNAQAKAAGISGVGKVPPQPQVVNKVLP- 2851
            .|||.|                          ::||...:.|          ...||:.|:..| 
  Rat  1272 LIPPETSTVLNSLKEKHKHKCKRRSHDYLSYDKMKRQKRKRK----------KKYPQLRNRQDPD 1326

  Fly  2852 -----TSIVTQQSQVQVKNSN---------------------------------LKQSQVKGKAA 2878
                 ..::::.|::::.:.:                                 :::..:|.|. 
  Rat  1327 FIAELEELISRLSEIRITHRSHHFIPRDLLPTIFRINFNSFYTHPSFPLDPLHYIRKPDLKKKR- 1390

  Fly  2879 SGTGTTCGAPP----SIASKPLQKKTNM------IRPIHKLEVKPKVMK---------------- 2917
                   |.||    ::|..|.....:.      ..|.:.:...|..:.                
  Rat  1391 -------GRPPKMREAMAEMPFMHSLSFPLSSTGFYPSYGMPYSPSPLTAAPIGLGYYGRYPPTL 1448

  Fly  2918 -------------PTPKVQNQNHSLLQ--QQQQQQPQLQQQIPAVVVNQVPKVTIS-QQRIPAQT 2966
                         |.|...:..|.||.  :..:::.:|.:|...:..::.|.:::| ...:|   
  Rat  1449 YPPPPSPSFTTPLPPPSYMHAGHLLLNPTKYHKKKHKLLRQEAFLTTSRTPLLSMSTYPSVP--- 1510

  Fly  2967 QQQQLQQAQMIHIPQQQQPLQQQQVQVQPSMPIITLAEAPVVQS----QFVME------------ 3015
              .::....|:....:.:...::....||.:.:.|.:...|::|    :|..:            
  Rat  1511 --PEMAYGWMVEHKHRHRHKHREHRSEQPQVSMDTGSSRSVLESLKRYRFGKDTVGDRYKHKEKH 1573

  Fly  3016 ------PQALEQQELANRVQHFSTSSSSSSSNCSLPTNVVNPMQ----QQAPS------------ 3058
                  |.....:.|.||.:.:.:...|.||  ||...:..|:|    :.:||            
  Rat  1574 RCHMSCPHLSPSKSLINREEQWVSREPSESS--SLALGLQTPLQIDCSESSPSLSLGGFTPNSEP 1636

  Fly  3059 ----------TTSSSTTRPTN-------------RVLPMQ-------QRQEPAPLSNECPVVSSP 3093
                      |::..:.|.:|             .:.|:|       .|:||.| |.|..:.|..
  Rat  1637 ASSDEHMNLFTSAIGSCRVSNPNSSCRKKLTDSPGLFPVQDTALSRPHRKEPLP-STERAIQSLA 1700

  Fly  3094 TPPKPVEQPIIHQMTSASVS---KCYAQKST------LP--SPVYEAEL--KVSSVLESIVPDVT 3145
            ......::|......|.:.|   |..:.:||      :|  ||...|.|  .|..:|:.||....
  Rat  1701 GSQSASDKPSQRSSESTNCSPTRKRSSSESTSSTVNGIPSRSPRLVASLDDSVDCLLQRIVQHDE 1765

  Fly  3146 MDAILE--EQPVTESIYTEGLYEKNSPGESKTEQLLLQQQQREQLNQQLVNNGYLLDKHTFQVEP 3208
            .:::.:  :.|:|    |......:|||.|.:::..|.:..                  :..|..
  Rat  1766 QESVEKNGDAPIT----TVSAPPSSSPGHSYSKERTLGKSD------------------SLLVPA 1808

  Fly  3209 MDTDVYREEDLEEEEDEDDDFSLKMATSACNDHEMSDSEEPAVKDK------ISKILDNLTNDDC 3267
            :.:|......|..|         |:| |.|:.|.:..|...|::.:      ..|||....|.|.
  Rat  1809 VPSDSCNSIPLLSE---------KLA-SRCSPHHIKRSVVEAMQRQARKMCNYDKILATKKNLDH 1863

  Fly  3268 ADSIATATTMEVDASAGYQ--------------QMVEDVLATTAAQSAPTEEFEGA--------- 3309
            .:.|..|..::..|..|..              |.|..:.|..|||....|..||.         
  Rat  1864 VNKILKAKKLQRQARTGNNFVKRRPGRPRKCPLQAVVSMQAFQAAQFVNPELNEGEEVSLHLSPD 1928

  Fly  3310 LETAAVEAAATYINEMADAHVLDLKQLQNGVELELRRRKEEQRTVSQEQEQSKAAIVPTAAAPEP 3374
            ..|..:||....:| :...|....|: :|.:..|..|:|::.....:|||.:|:.|....   |.
  Rat  1929 TVTDVIEAVVQSVN-LNSEHKKGWKR-KNWLLEEQTRKKQKTVPEEEEQENNKSFIEKPV---EI 1988

  Fly  3375 PQPIQEPKKMTGPHLLYEIQSEDGFTYKSSSITEIWEKVFEAVQVARRAHGLTPLPEGPLADMGG 3439
            |.|::.|.:.:.|               .|::    :.|...:...::|    |.|........|
  Rat  1989 PSPLETPAEPSEP---------------ESNL----QPVLALIPREKKA----PRPPKKKYQRAG 2030

  Fly  3440 IQMIGLKTNALKYLIEQLPGVEKCSKYTPKYHKRNGNVSTAANGAHGGNLGGSSASAALSVSGGD 3504
            :.....||...|..:.||. .||. :|||..|                                 
  Rat  2031 LYSDVYKTTDPKSRLIQLK-KEKL-EYTPGEH--------------------------------- 2060

  Fly  3505 SHGLLDYGSDQDELEENAYDCARCEPYSNRSEYD-MFSWLASRHRKQP-----------IQVFVQ 3557
                 :||.....:....|  .|.:....:..|| ::.|..::..|:|           :.|.|:
  Rat  2061 -----EYGLFPAPIHVGKY--LRQKRIDFQLPYDILWQWKHNQLYKKPDVPLYKKIRSNVYVDVK 2118

  Fly  3558 P-------------SDNELVPRRGTGSNLPMAMKY-----------------RTLKETYKDYVGV 3592
            |             .|::  .|:|.|.:....|.:                 |..:..:...:..
  Rat  2119 PLSGYEATTCNCKKPDDD--TRKGCGDDCLNRMIFAECSPNTCPCGEQCCNQRIQRHEWVQCLER 2181

  Fly  3593 FRSHIHGRGLYCTKDIEAGEMVIEYAGELI-----RSTLTDKRERYYDSRGIGCYMFKIDDNLVV 3652
            ||:...|.|:...:.::||:.:|||.||::     |:.:.::...:.|.     |...:|..:|:
  Rat  2182 FRAEEKGWGIRTKEPLKAGQFIIEYLGEVVSEQEFRNRMIEQYHNHSDH-----YCLNLDSGMVI 2241

  Fly  3653 DATMRGNAARFINHCCEPNCYSKVVDILGHKHIIIFALRRIVQGEELTYDYKF-PFEDEKIP-CS 3715
            |:...||.||||||.|:|||..:...:.|...|.::||:.:..|.||||||.| .|..||.. |.
  Rat  2242 DSYRMGNEARFINHSCDPNCEMQKWSVNGVYRIGLYALKDVPAGTELTYDYNFHSFNVEKQQLCK 2306

  Fly  3716 CGSKRCR 3722
            ||.::||
  Rat  2307 CGFEKCR 2313

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
trxNP_476769.1 NR_DBD_like 762..>856 CDD:413390
PRK13914 <1006..>1224 CDD:237555
PHD1_KMT2A_like 1268..1344 CDD:276981
PHD 1346..1390 CDD:214584
PHD3_KMT2A_like 1423..1479 CDD:276983
ePHD_KMT2A_like 1737..1841 CDD:277134
FYRN 1890..1937 CDD:461787 7/50 (14%)
FYRC 3388..3476 CDD:197781 17/87 (20%)
SET_KMT2A_2B 3575..3726 CDD:380947 51/172 (30%)
Ash1lXP_063137913.1 None
Blue background indicates that the domain is not in the aligned region.

Return to query results.
Submit another query.