Protein Alignment pic and rik1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_650257.1
• Gene: pic / 41611
• FlyBaseID: FBgn0260962
• Length: 1140
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_588204.1
• Gene: rik1 / 2539050
• PomBaseID: SPCC11E10.08
• Length: 1040
• Species: Schizosaccharomyces pombe
• Alignment Length: 1171
• Identity: 234/1171 - (19%)
• Similarity: 460/1171 - (39%)
• Gaps: 257/1171 - (21%)

  Fly    13 TAVVACLTGNFTSPTDLNLIIARNNQVEIDLVTP-EGLRPLKEININGTIAVMRHFRPPDSNKDL 76
            |||....:.:|.|..:. |::.:..::.|.|.:. .||:....|.:..|:..:|.:|||..::|.
pombe    11 TAVDTATSCHFISSENC-LVLLQALKINIYLCSEVHGLQFFTSIPLFSTVKHIRPYRPPGLDRDY 74

  Fly    77 LFILTRRYNVMILEARMVNDVITVVTKANGNVSDSVGIPSEGGVIAAIDPKARVIGMCLYQGLFT 141
            ||::                       .|.:...|:....:...:....|..|      |:..|
pombe    75 LFVV-----------------------LNDDTYFSIYWDEDYQKVIVDHPPVR------YRVTF- 109

  Fly   142 IIPMDKDASELKATNLRM-------DELN-------------------------------VYDVE 168
              |.:::|......:|||       ||::                               :||:.
pombe   110 --PWNRNAKSYCLVDLRMRAIFLSIDEISMICIRILSAEERLKTGRSIDSGFPFSFPVHLIYDMC 172

  Fly   169 FLHGCLNPTVIVIHKDSDGRHVKSHEINLRDKEFMKIAWKQDNVETEATMLIPVPSPIG--GVIV 231
            .|:....||::|:|.|....:|.:..::|..|...|.....:.|:....|      |.|  |::|
pombe   173 ILNDSSTPTLVVLHSDGLDCYVTAFLLDLSSKSLGKGIRLFERVKPSMIM------PFGKRGLLV 231

  Fly   232 IGRESIVYH---DGSNYHAVAPLTFRQSTINCYARVSSNGLRYLLGNMDGQLYMLFLGTAETSKG 293
            .  ||:..|   .|:......|.|    |...:..:....:.|::.:.:|.|:.::......:|.
pombe   232 F--ESLFIHCMYRGNFVTINGPCT----TYMHWTPLKGQKMHYIVCDTNGYLFGVYSSILGKNKW 290

  Fly   294 VTVKDIKVEQLGEISIP--ECITYLDN---GFLYIGARHGDSQLVRLNSEAIDGSYVVPVENFTN 353
            ..|.:       .:.||  :.||.|::   |.|:||:::.:|:|:.|       |.:..|::..|
pombe   291 SLVME-------RLPIPPFDFITSLNSIHEGLLFIGSKNSESKLINL-------STLKDVDSIPN 341

  Fly   354 LAPILDIAVV--DLDRQGQGQIITCSGSFKDGSLRIIRIGIGIQEHACIDLPG---IKGMWSLKV 413
            |.||.|:.|:  |:::    ..:.|:|:.::.||      |..|....:|:.|   |.|:  |:.
pombe   342 LGPIHDLLVLKNDIEK----SFLVCAGTPRNASL------IYFQHALKLDILGQTKISGI--LRA 394

  Fly   414 GVDESPYENTLVLAFVGHTRILTLSGEEVEETEIPGFASDLQTFLCSNVDYDQLIQVTSDSVRLV 478
            .|..|..|:.|.|.|...|....:. |:.:....|..::..:|...|..: .:.:||||..:.:.
pombe   395 MVLPSYPEHKLFLGFPSETVAFNIK-EDFQLELDPSLSTKERTIALSGTN-GEFVQVTSTFLCIY 457

  Fly   479 SSATKALVAEWRPTGDRTIGVVSCNTTQILVASACDIFY--IVIEDGSL------REQSRRTLAY 535
            .||.::          |.:.:      :.:..:||...|  |||...:|      .|.:|:....
pombe   458 DSAKRS----------RLVYI------EKITNAACYQEYSAIVINGTALAIFKKDTEVARKVFES 506

  Fly   536 EVACLDITPLDETQKKSDLVAVGLWTDISAVILSLPDLETIYTE-KLSGEIIPRSILMTTFEGI- 598
            |::|||.:...:       :.||.|:. ..:||:..|..:|... :.:...:||:|::   ||:
pombe   507 EISCLDFSAQFQ-------IGVGFWSK-QVMILTFSDNSSISCAFQTNVPSLPRNIIL---EGVG 560

  Fly   599 ---HYLLCALGDGSMYYFIMDQTTGQLTDKKKVTLGTQPTTLRTFRSLSTTNVFACSDRPTVIYS 660
               :.||.:.|.|....:::.:.....::.|.  .||.|.:.|.|.....|.:...:|.|.::|.
pombe   561 VDRNLLLVSSGSGEFKSYVLFKNNLVFSETKH--FGTTPVSFRRFTMNIGTYIICNNDCPHMVYG 623

  Fly   661 SNHKLVFSNVNLKEVNHMCSLNAQAYPD---SLALANKNAVILGTIDEI--QKLHIRTVPLGEGP 720
            .|..|.:..:::.:...:|.....:..|   |::|.....:.|..:.|:  :|:.:..|||
pombe   624 FNGALCYMPLSMPQSYDVCQFRDNSGKDFLISVSLGGLKFLQLNPLPELTPRKVLLEHVPL---- 684

  Fly   721 RRIAYQESSQTFAVSTLRIDVHGRGGAKPLRNSASTQAQNITCSSNFLPKPGGGNSTAANAEVGQ 785
            :.|.:|....                   ||...:......:...|:
pombe   685 QAIIFQNKLL-------------------LRTLENRYEDYESYKENY------------------ 712

  Fly   786 EIDVHNLLV--IDQNTFEVLHAHQFVAPETISSLMSAKLGDDPNTYYVVATSLVIPEEPEPKVGR 848
                |..||  .|.|:|.|....:....|.:..:..:.|        :|.||::..::..|..||
pombe   713 ----HLELVDSYDDNSFRVFSFTENERCEKVLKINESSL--------LVGTSIIEQDKLVPVNGR 765

  Fly   849 IIIFHYHE--NKLTQVAETKVDGTCYALVEFNGKVLAGIGSFVRLYEWTNEKELRMECNIQNMIA 911
            :|:..:.:  ..|..|:...:......|..:|.:.:...|..|.:.:.|.|: |.::..|.....
pombe   766 LILLEFEKELQSLKVVSSMVLSAAVIDLGVYNDRYIVAFGQQVAIVKLTEER-LMIDSRISLGSI 829

  Fly   912 ALFLKAKGDFILVGDLMRSITLLQHKQMEGIFVEIARDCEPKWMRAVEILDDDTFLGSETNGNLF 976
            .|.|..:|:.|.:.|.:...|::.....:  |:.:||....:.:....:.:...::.:..:|.|.
pombe   830 VLQLIVEGNEIAIADSIGRFTIMYFDGQK--FIVVARYLFGENIVKAALYEGTVYIIATNSGLLK 892

  Fly   977 VCQKDSAATTDEERQLLPELARFHLGDTVNVFRHGSLVMQNVGERTTPINGCVLYGTCNGAIGIV 1041
            :.:.:..|....:|.:...:  :||.|.|:.|::..:...|     :.:...:|:.|..||||.:
pombe   893 LLRYNKDAKNFNDRFICESV--YHLHDKVSKFQNFPITNTN-----SFLEPKMLFATEIGAIGSI 950

  Fly  1042 TQIPQDFYDFLHGLEERLKKIIKSVGKIEHTYYRNFQINS----KVEPSEGFIDGDLIESFLDLS 1102
            ..        |...|..|:::.:.:.|::.:|..:....|    .:.|.. ||||||:   :|:.
pombe   951 VS--------LKDKELELEELTRKIRKLKFSYLSSMDYESIEADLISPVP-FIDGDLV---IDVK 1003

  Fly  1103 R 1103
            |
pombe  1004 R 1004

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
pic	NP_650257.1	MMS1_N	75..542	CDD:463091	108/527 (20%)
		CPSF_A	790..1100	CDD:427182	64/317 (20%)
rik1	NP_588204.1	MMS1_N	73..512	CDD:463091	107/526 (20%)
		CPSF_A	712..999	CDD:427182	63/335 (19%)