Protein Alignment pic and sf3b3

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_650257.1
• Gene: pic / 41611
• FlyBaseID: FBgn0260962
• Length: 1140
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_002931705.1
• Gene: sf3b3 / 100101755
• XenbaseID: XB-GENE-921994
• Length: 1217
• Species: Xenopus tropicalis
• Alignment Length: 1267
• Identity: 284/1267 - (22%)
• Similarity: 534/1267 - (42%)
• Gaps: 194/1267 - (15%)

  Fly     5 YVVTAQKPTAVVACLTGNFTSPTDLNLIIARNNQVEIDLVTPEG----LRPLKEININGTIAVMR 65
            |.:|.|:.|.:...:.||| |.|.|..|:....:: |:|:.|:.    :..|..:.:.|.|..:.
 Frog     4 YNITLQRATGISFAIHGNF-SGTKLQEIVVSRGKI-IELLRPDANTGKVHTLLTVEVFGVIRSLM 66

  Fly    66 HFRPPDSNKDLLFILTRRYNVMILEARMVNDVITVVTKANGNVSDSVGIPSEGGVIAAIDPKARV 130
            .||.....||.:.:.:....::|||.....::...:.:.....|....|..  |...|:|||.|.
 Frog    67 AFRLTGGTKDYIVVGSDSGRIIILEYHPSKNMFEKIHQETFGKSGCRRIVP--GQFIAVDPKGRA 129

  Fly   131 IGMCLYQGLFTIIPMDKDASEL----------KATNLRMDELNVYDVEF---LHGCLNPTVIVIH 182
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 Frog   130 VMISAIEKQKLVYILNRDAAARLTISSPLEAHKANTLVYHVVGV-DVGFENPMFACLEMDYEEAD 193

  Fly   183 KDSDGRHVKSHEINLR----DKEFMKIAWK-QDNVETEATMLIPVP----SPIGGVIVIGRESIV 238
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 Frog   194 NDPTGEAAANTQQTLTFYELDLGLNHVVRKYSEPLEEHGNFLITVPGGSDGP-SGVLICSENYIT 257

  Fly   239 YHD-GSNYHAVAPLTFRQSTIN---------CYARVSSNGLRYLLGNMD-GQLYMLFLGTAETSK 292
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 Frog   258 YKNFGDQPDIRCPIPRRRNDLDDPERGMIFVCSATHKTKSMFFFLAQTEQGDIFKITLETDED-- 320

  Fly   293 GVTVKDIKVEQLGEISIPECITYLDNGFLYIGARHGDSQLVRL-----NSEAIDGSYVVPVE--- 349
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 Frog   321 --MVTEIRLKYFDTVPVAAAMCVLKTGFLFVASEFGNHYLYQIAHLGDDDDEPEFSSAMPLEEGD 383

  Fly   350 ----------NFT------NLAPILDIAVVDLDRQGQGQIITCSGSFKDGSLRIIRIGIGIQEHA 398
                      |..      :|:||:...:.||..:...|:....|.....|||::|.|:.:.|.|
 Frog   384 TFFFQPRPLKNLVLVDEQDSLSPIMSCQIADLANEDTPQLYVACGRGPRSSLRVLRHGLEVSEMA 448

  Fly   399 CIDLPG-IKGMWSLKVGVDESPYENTLVLAFVGHTRILTLSGEEVEETEIPGFASDLQTFLCSNV 462
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 Frog   449 VSELPGNPNAVWTVRRHI-EDEYDAYIIVSFVNATLVLSI-GETVEEVTDSGFLGTTPTLSCSLL 511

  Fly   463 DYDQLIQVTSDSVRLVSSATKALVAEWRPTGDRTIGVVSCNTTQILVA-SACDIFYIVIE-DGSL 525
            ..|.|:||..|.:|.:.:..:  |.||:..|.:.|...:.|..|:::| :..::.|..:: .|.|
 Frog   512 GEDALVQVYPDGIRHIRADKR--VNEWKTPGKKIIVKCAVNQRQVVIALTGGELVYFEMDPSGQL 574

  Fly   526 REQS-RRTLAYEVACLDITPLDETQKKSDLVAVGLWTDISAVILSLPDLETIYTEKLSGEIIPRS 589
            .|.: |:.::.:|.|:.:..:...:::|..:|||| .|.:..|:||...:.:  :.||.:.:|..
 Frog   575 NEYTERKEMSADVVCMSLANVPPGEQRSRFLAVGL-VDNTVRIISLDPSDCL--QPLSMQALPAQ 636

  Fly   590 ------ILMTTFE-----------GIHYLLCALGDGSMYYFIMDQTTGQLTDKKKVTLGTQPTTL 637
                  :.|...|           |..||...|.:|.:...::|..||.|:|.:...||::|..|
 Frog   637 PEALCIVEMGGAERQDELGERGSIGFLYLNIGLQNGVLLRTVLDPVTGDLSDTRTRYLGSRPVKL 701

  Fly   638 RTFRSLSTTNVFACSDRPTVIYSSNHKLVFSNVNLKEVNHMCSLNAQAYPDSLALANKNAVILGT 702
            ...|......|.|.|.|..:.||...:...:.::.:.:.:.....::..|:.:...:.|.:.:..
 Frog   702 FRVRMQGQEAVLAMSSRSWLSYSYQSRFHLTPLSYETLEYASGFASEQCPEGIVAISTNTLRILA 766

  Fly   703 IDEIQKLHIRTV-PLGEGPRR-IAYQESSQTFAVSTLRIDVHG----------RGGAKPLRNSAS 755
            ::::..:..:.. ||...||: :.:.||:....:.|   |.:.          :..|:.:..:|.
 Frog   767 LEKLGAVFNQVAFPLQYTPRKFVIHPESNNLIIIET---DHNAYTEATKAQRKQQMAEEMVEAAG 828

  Fly   756 TQAQNITCS------SNFLPKPGGGNSTAANAEVGQEIDVHNLLVIDQNTFEVLHAHQFVAPETI 814
            ...:.:...      :..||:...|...|.|.:....|.|.|  .|..||.:::...|..|..::
 Frog   829 EDERELAAEMAAAFLNENLPESIFGAPKAGNGQWASVIRVMN--PIQGNTLDLVQLEQNEAAFSV 891

  Fly   815 SSLMSAKLGDDPNTYYV---VATSLVIPEEPEPK-VGRIIIFHY----HENKLTQVAETKVDGTC 871
            :.......|||   :||   ||..|::    .|: |...:::.|    :..||..|.:|.|:...
 Frog   892 AVCRFTNTGDD---WYVLVGVAKDLIL----NPRSVAAGLVYTYKLVNNGEKLEFVHKTPVEEVP 949

  Fly   872 YALVEFNGKVLAGIGSFVRLYEWTNEKELRMEC---NIQNMIAALFLKAKGDFILVGDLMRSITL 933
            .|:..|.|:||.|:|..:|:|:...:|.|| :|   :|.|.|..  ::..|..:::.|:..|...
 Frog   950 AAIAPFQGRVLIGVGKLLRIYDLGKKKLLR-KCENKHISNFIVG--IQTIGQRVILSDVQESFIW 1011

  Fly   934 LQHKQMEGIFVEIARDCEPKWMRAVEILDDDTFLGSETNGNLFVCQKDSAATTDEER-------- 990
            :::|:.|...:..|.|..|:|:....:||.||..|::..||:.:.:..|....|.:.
 Frog  1012 VRYKRNENQLIIFADDTYPRWVTTSCLLDYDTVAGADKFGNICIVRLPSNTNDDVDEDPTGNKAL 1076

  Fly   991 ----------QLLPELARFHLGDTVNVFRHGSLVMQNVGERTTPING---CVLYGTCNGAIGIVT 1042
                      |....:..:|:|:||       |.:|    :||.|.|   .::|.|.:|.|||:
 Frog  1077 WDRGLLNGASQKAEVIVNYHVGETV-------LSVQ----KTTLIPGGSESLVYTTLSGGIGIL- 1129

  Fly  1043 QIP---QDFYDFLHGLEERLKKIIKSVGKIEHTYYRNFQINSKVEPSEGFIDGDLIESFLDLSRD 1104
             :|   .:.:||...:|..|:.....:...:|..:|::..     |.:..|||||.|.|..:...
 Frog  1130 -VPFTSHEDHDFFQHVEMHLRSEHPPICGRDHLSFRSYYF-----PVKNVIDGDLCEQFNSMEPV 1188

  Fly  1105 KMRDAVQGLELTLNGERKSADVEDVIKIVEDL 1136
            |.:...:.|:.|         ..:|.|.:||:
 Frog  1189 KQKSVAEELDRT---------PPEVSKKLEDI 1211

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
pic	NP_650257.1	MMS1_N	75..542	CDD:463091	115/527 (22%)
		CPSF_A	790..1100	CDD:427182	88/344 (26%)
sf3b3	XP_002931705.1	MMS1_N	76..592	CDD:463091	115/527 (22%)
		CPSF_A	863..1182	CDD:427182	89/348 (26%)