DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ry and Aox2

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_524337.1 Gene:ry / 41605 FlyBaseID:FBgn0003308 Length:1335 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038939552.1 Gene:Aox2 / 316421 RGDID:1359668 Length:1347 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1358 Identity:626/1358 - (46%)
Similarity:863/1358 - (63%) Gaps:46/1358 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     2 SNSVLVFFVNGKKVTEVSPDPECTLLTFLREKLRLC--GTKLGCAEGGCGACTVMVSRLDRRANK 64
            |:..|.||||||||||.:.|||.|||.|||:...||  |||..|..|.|||||||||:.|....|
  Rat     7 SSDELEFFVNGKKVTEKNVDPEVTLLAFLRKNWTLCLTGTKYACGTGSCGACTVMVSQHDPVCKK 71

  Fly    65 IRHLAVNACLTPVCSMHGCAVTTVEGIGSTKTRLHPVQERLAKAHGSQCGFCTPGIVMSMYALLR 129
            .||.:|.|||.|:||:||.|||||||:||.|||||||||||||:||:|||||:||:|||||||||
  Rat    72 TRHFSVMACLVPLCSLHGAAVTTVEGVGSIKTRLHPVQERLAKSHGTQCGFCSPGMVMSMYALLR 136

  Fly   130 NAEQPSMRDLEVAFQGNLCRCTGYRPILEGYKTFTKEF-AC---GMGEKCC--KVSGKGCGTDAE 188
            |..|||...|..|..||||||||||||||..:||..|. .|   |.|: ||  :..|...|:.::
  Rat   137 NHPQPSEEQLLEALGGNLCRCTGYRPILESGRTFCMESDGCLQKGTGQ-CCLDQKEGDSSGSKSD 200

  Fly   189 TDDKLFERSEFQPLDPSQEPIFPPE-LQLSDAFDSQSLIFSSDRVTWYRPTNLEELLQLKAKHPA 252
            ...:||.:.|||||||:||.||||| |::::..:.|:|.|..:|:||..|..|:|||.||||:|.
  Rat   201 ICTELFVKDEFQPLDPTQELIFPPELLRMAENPEKQTLTFYGERITWIAPGTLQELLVLKAKYPE 265

  Fly   253 AKLVVGNTEVGVEVKFKHFLYPHLINPTQVKELLEIKENQDGIYFGAAVSLMEIDALLRQRIEQL 317
            |.|:.|||.:|..:|.:...||.|::|.::.:|..:.:...|:..||..||.::..:|.:.|.:|
  Rat   266 APLISGNTALGPAMKSQGHFYPVLLSPARIPDLRMVTKTSGGLTIGACCSLAQVKDVLAESISEL 330

  Fly   318 PESETRLFQCTVDMLHYFAGKQIRNVACLGGNIMTGSPISDMNPVLSAAGAQLEVASFVDGKLQK 382
            ||.:|:.::..:..|...||:||||:|.|||::::....||:||:||...|.|.:.| .:|   .
  Rat   331 PEEKTQTYRALLKHLRSLAGQQIRNMASLGGHVISRHYYSDLNPILSVGNATLNLLS-EEG---L 391

  Fly   383 RSVHMGTGFFTGYRRNVIEAHEVLLGIHFRKTTPDQYIVAFKQARRRDDDIAIVNAAINVRFEEK 447
            |.:.:...|..|.....::..|:|..::...:...:::.||:||:...:.:..|||.:.|.|:|.
  Rat   392 RQIPLNGHFLAGLANEDLKPEEILGSVYIPHSQKREFVSAFRQAQCHQNALPDVNAGMRVLFKEG 456

  Fly   448 SNIVAEISMAFGGMAPTTVLAPRTSQLMVGQEWSHQLVERVAESLCTELPLAASAPGGMIAYRRA 512
            ::|:.|:|:|:||:.||||.|.|:.|.::|:.|:..|::.....|..|:.|..||.||.:.:||.
  Rat   457 TDIIEELSIAYGGVGPTTVSAHRSCQQLLGRRWNALLLDEACRLLLDEVSLPGSAVGGKVEFRRT 521

  Fly   513 LVVSLFFKAYLAI--SLKLSKSGI---TSSDALP---SEERSGAETFHTPVLKSAQLFERVCSDQ 569
            |:||.|||.||.:  .||..|..:   |.|...|   ...||....|...:.:..|.::||.|.|
  Rat   522 LIVSFFFKFYLEVLQELKADKRLLPESTDSQRYPEIADGSRSSLGDFQVTLPQGVQTYQRVNSHQ 586

  Fly   570 PICDPIGRPKVHAAALKQATGEAIYTDDIPRMDGEVYLAFVLSTKPRAKITKLDASEALALDGVH 634
            |:.||:|||.:|.:.||.|||||::.|||||:|.|:::|.|.||:..|:|..:|:||.|.|.||.
  Rat   587 PLQDPVGRPIMHLSGLKHATGEAVFCDDIPRVDKELFMALVTSTRAHARIISIDSSEVLDLPGVV 651

  Fly   635 QFFCYKDLTEHENEVGPVFHDEHVFAAGEVHCYGQIVGAIAADNKALAQRAARLVKVEYEELSPV 699
            .....:|:..:..|     .|:.:.|..:|.|.||:|.|:.|:....|:||.:.:|:.||:|.||
  Rat   652 DVITAEDIPGNNGE-----EDDKLLAVDKVLCVGQVVCAVVAETDVQAKRATKKIKITYEDLKPV 711

  Fly   700 IVTIEQAIEHKSYF-PDYPRFVTKGNVEEALAQADHTFEGTCRMGGQEHFYLETHAALAVPRDSD 763
            :.|||.||:|.|:. |:  :.:.:||:|||....|...||...:|||||||:||...|.:|:..|
  Rat   712 LFTIEDAIQHNSFLCPE--KKLEQGNMEEAFENVDQIVEGKVHVGGQEHFYMETQRVLVIPKTED 774

  Fly   764 -ELELFCSTQHPSEVQKLVAHVTALPAHRVVCRAKRLGGGFGGKESRGISVALPVALAAYRMGRP 827
             ||:::.|||.|:.|||.|:....:|..|:.|..||:|||||||..|........|:.|.:.|||
  Rat   775 KELDMYVSTQDPAHVQKTVSSALNIPLSRITCHVKRVGGGFGGKVGRPAVFGAIAAVGAVKTGRP 839

  Fly   828 VRCMLDRDEDMLITGTRHPFLFKYKVGFTKEGLITACDIECYNNAGWSMDLSFSVLERAMFHFEN 892
            :|.:|||::||||||.|||...||||||...|.|.|.|||||.|.|.::|.|..|.|..:...||
  Rat   840 IRLVLDREDDMLITGGRHPLFAKYKVGFMNSGRIKALDIECYINGGCTLDDSELVTEFLVLKLEN 904

  Fly   893 CYRIPNVRVGGWVCKTNLPSNTAFRGFGGPQGMYAGEHIIRDVARIVGRDVVDVMRLNFYKTGDY 957
            .|:|.|:|:.|..|.|||||||||||||.|||....|..|..||...|.....:...|.|||.|.
  Rat   905 AYKIRNLRLRGRACMTNLPSNTAFRGFGFPQGALVTESCITAVAAKCGLPPEKIREKNMYKTVDK 969

  Fly   958 THYHQQLEHFPIERCLEDCLKQSRYDEKRQEIARFNRENRWRKRGMAVVPTKYGIAFGVMHLNQA 1022
            |.|.|.....|:.||..:||.:|.:..:|..:..||:::.|||||:||||.|:.:.|.....:||
  Rat   970 TIYKQAFNPEPLIRCWNECLDKSSFAIRRTRVDEFNKKSYWRKRGIAVVPMKFSVGFAATSYHQA 1034

  Fly  1023 GSLINIYGDGSVLLSHGGVEIGQGLNTKMIQCAARALGIPSELIHISETATDKVPNTSPTAASVG 1087
            .:|::||.|||||::|||.|:|||::|||:|.|:|.|.||...:|.|||.|..||||..||||||
  Rat  1035 AALVHIYTDGSVLVAHGGNELGQGIHTKMLQVASRELKIPMSYLHTSETCTAAVPNTIATAASVG 1099

  Fly  1088 SDLNGMAVLDACEKLNKRLAPIKEALPGGTWKEWINKAYFDRVSLSATGFYAMPGIGYHP----- 1147
            :|:||.||.:||:.|.|||.|:.:..|.|||::||..|:..|:||||||::.    ||..     
  Rat  1100 ADVNGRAVQNACQILLKRLEPVIKKNPEGTWRDWIEAAFEQRISLSATGYFR----GYKAFMDWE 1160

  Fly  1148 --ETNPNARTYSYYTNGVGVTVVEIDCLTGDHQVLSTDIVMDIGSSLNPAIDIGQIEGAFMQGYG 1210
              |.:|    :.||..|...:.||||||||.|:.:.||||||...|||||||:|||||||:||.|
  Rat  1161 KGEGDP----FPYYVYGAACSEVEIDCLTGAHKKMRTDIVMDACCSLNPAIDVGQIEGAFIQGMG 1221

  Fly  1211 LFTLEELMYSPQGMLYSRGPGMYKLPGFADIPGEFNVSLLTGAPNPRAVYSSKAVGEPPLFIGSS 1275
            |:|.|||.|||:|:||||.|..||:|...|:|.:||||||..:..|..:||||.:||..:|:|||
  Rat  1222 LYTTEELHYSPEGVLYSRSPDKYKIPTVTDVPEQFNVSLLPSSQTPLTIYSSKGLGESGMFLGSS 1286

  Fly  1276 AFFAIKEAIAAAREDQGLSGDFPLEAPSTSARIRIACQDKFTELLEIPEPGSFTPWNI 1333
            .||||.:|:||||..:.::.||.:::|:|..|:|:||.|:||:::...:|.:|.||:|
  Rat  1287 VFFAIADAVAAARRQRDIAEDFTVKSPATPERVRMACADRFTDMIPRDDPKTFKPWSI 1344

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ryNP_524337.1 Fer2 8..78 CDD:278537 44/71 (62%)
PLN02906 25..1317 CDD:215491 604/1317 (46%)
Fer2_2 87..158 CDD:280048 55/70 (79%)
FAD_binding_5 231..411 CDD:279309 62/179 (35%)
CO_deh_flav_C 422..525 CDD:281449 43/102 (42%)
Ald_Xan_dh_C 589..696 CDD:279635 41/106 (39%)
Ald_Xan_dh_C2 716..1242 CDD:280834 262/533 (49%)
Aox2XP_038939552.1 mam_aldehyde_ox 10..1346 CDD:132014 625/1355 (46%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C166341488
Domainoid 1 1.000 123 1.000 Domainoid score I5437
eggNOG 1 0.900 - - E1_COG4631
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 1 1.010 - - QHG54386
OrthoDB 1 1.010 - - D48717at2759
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0000201
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100184
Panther 1 1.100 - - O PTHR11908
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X518
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1211.760

Return to query results.
Submit another query.