Protein Alignment PolQ and poln

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_524333.1
• Gene: PolQ / 41571
• FlyBaseID: FBgn0002905
• Length: 2059
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001093496.1
• Gene: poln / 566857
• ZFINID: ZDB-GENE-100917-1
• Length: 1146
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1231
• Identity: 290/1231 - (23%)
• Similarity: 490/1231 - (39%)
• Gaps: 273/1231 - (22%)

  Fly   995 VSEAAKLLIGEAR-QFVQ---------HEIGLGTIKWTQTQAGVEIASRAIHDGGEVDLHMS--- 1046
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Zfish    14 LSAAAQRIISALRVQYVQKADRSRATWSDQGFG---MAQQQDG-EDRNVELHSGNSRDLNLNELA 74

  Fly  1047 -------LEE--------EQPPVKRKL---------SIEENGTANSQKNPRLETVVDTQRGY-KV 1086
                   ||:        ..|.::|.:         .|.::.|.:.|....|:|...|..|. :.
Zfish    75 EHSNSSELEDMAIDKFALNLPIIERFVFDHADNIITPIGQHFTPSVQGEDSLQTFCLTSMGSPQA 139

  Fly  1087 DKNIANQSKMNPNL----KEIDAQNKARRN-------STAHMDNLN---PISNDPCQNNVNVKTA 1137
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Zfish   140 RADVITQSEIHGRTFRKRKWIQPASPPEQDLVGCSQPETPPMKKFNFMLPIDN-----------C 193

  Fly  1138 QPIISNLNDIQKQGSQI---EKMKINPATVVCSPQLANEEKPSTSQSARRKLVNEGMAERRRVAL 1199
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Zfish   194 QPAFG------EEGKMIDIVDKRNNNG-----QPWLPEKENSDSVSEDRAAFIEVQLGSLR--CI 245

  Fly  1200 MKIQQRTQKENQSKDQPIQASRSNQLSSPVNRTPANRWTQS----ENPNNEMNNSQLPRRNPRNQ 1260
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Zfish   246 SNVDMITSKCVLETSHYWEESRNCQLSVPMENSPDAKRCESISVFECQQDTANRSDKMMDSSREK 310

  Fly  1261 SPVPNANRTASRKVSNAEEDLFMADDSFMLNTGLAAALTAAESKIASCTEADVIPSSQPKEPEVI 1325
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Zfish   311 VD----NGTERRDITKLRTSSPQSDDNTVVMPVLEGEMECAASSSRNAMQHSIQPHSQAVE---V 368

  Fly  1326 GALTPHASR----------------------------LKRSDQLRSQRIQSPSPTPQREIEI--- 1359
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Zfish   369 TSFSKHAGKWEPPGPSQKALCKKTFRNPRFPIQLFHQVNGSMRLLKQR-KAPQPMVKRQRRLLRP 432

  Fly  1360 --DLESKNESNGVSSMEISDMSMENPLMKNPLHLNASHIMSCS--KVDETAS----SFSSID--- 1413
              ..:||.........:.||.|:..       ...:|||:|.:  |.|.|.:    :||.|.
Zfish   433 QKIFKSKRGKKQNKLTKTSDSSLSG-------SKESSHILSETDRKEDGTTTTLKGAFSLISDPR 490

  Fly  1414 --------------IIDVCGHRNAFQAAIIEINNATRLGFSVGLQAQAGKQK---PLIGSNLLIN 1461
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Zfish   491 VCDTGRVSQEERECILEETGKAKAFVVTMVYQDGTTQLD---------SEQKLCPPVCGLLILLK 546

  Fly  1462 QVAAAENREAAARERVLF-QVDDTNFISGVSFCLADNVAYYWNMQ--IDERAAYQGVPTPLKVQE 1523
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Zfish   547 SELNSEEPLERPPERVLYLRLEQTP---------------AWAQQDFTQKQDAY---AREMLLKI 593

  Fly  1524 LCNLMARKDLTLVMHDGKEQLKMLRKAIPQL---KRISAKLEDAKVANWLLQP-DKTVNFLNM-- 1582
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Zfish   594 MCGTK-----TFVCFKAKDLLRTVLRHFRDLSWTQVLGCQVMDPQIAAWLLDPADSSSCFQTLLS 653

  Fly  1583 ---CQTFAPECTGLANLCGSGRGYSSYGLDTSSAIL--PRIRTAIESCVTLHILQGQTENLS-RI 1641
               ...|.|                    .|...:|  .::...|.:...||.|.   |.|. ::
Zfish   654 KHYTHQFTP--------------------TTLQPVLEQAKVTQVISNLSLLHKLM---EELHYKL 695

  Fly  1642 GNGDLLKFFHDIEMPIQLTLCQMELVGFPAQKQRLQQLYQRMVAVMKKVETKIYEQHGSRFNLGS 1706
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Zfish   696 RTQGLWQLYSGIEQKMIPVLAAMESYKMHVDKEALKKTSEMLGSKLKQLEQEAHQAAGQKFLVSS 760

  Fly  1707 SQAVAKV----LGLH---------RKAKGRVTTSRQVLEKLNS--PISHLILGYRKLSGLLAKSI 1756
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Zfish   761 SAQLRLILFEKLRLHELCENKKLPKTVKQQQSTSETALLQLQKLHPLPKIILEYRQIHKIKTTFV 825

  Fly  1757 QPLMECCQADRIHGQ-SITYTATGRISMTEPNLQNVAKEFSIQV---------GSDVVHISCRSP 1811
            ..::.|.:...|... :.|.|.:||:|...||.|.:.| ..:|:         .||:|.:..|:.
Zfish   826 DGILSCTRKTFISSTWNQTSTVSGRLSAKHPNFQALPK-LPLQISKKQYIHGKASDIVTVHPRAM 889

  Fly  1812 FMPTDESRCLLSADFCQLEMRILAHMSQDKALLEVMKSSQ-DLFIAIAAHWNKIEESEVTQDLRN 1875
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Zfish   890 FIPR-EGWTFLSADFCQVELRLLAHLSADPQLLRIFQSPEADAFTMLAAQWKGVSEDRVSLEDRE 953

  Fly  1876 STKQVCYGIVYGMGMRSLAESLNCSEQEARMISDQFHQAYKGIRDYTTRVVNFARSKGFVETITG 1940
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Zfish   954 QAKRIVYSVVYGAGRERLSGILGVSAEEASRFQDSFLKTYREVPAFIQHTIQHCQSHGFVRSIMG 1018

  Fly  1941 RRRYLENINSDVEHLKNQAERQAVNSTIQGSAADIAKNAILKMEKNIERYREKLALGDNSVDLVM 2005
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Zfish  1019 RRRFLPHIHSADWSLRNQAERQAVNFVLQGSAADLAKLAMI-------RICSQVSSDSQTARLVA 1076

  Fly  2006 HLHDELIFEVPTGKAKKIAKVLSLTMENC-------VKLSVPLKVKLRIGRSWGEFKEVSV 2059
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Zfish  1077 QIHDELLFEVEISQLDQFAALVKKTMESLQHIEYLNVNLSVPLKVLLSTGRSWGSMYEMNL 1137

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
PolQ	NP_524333.1	BRR2	216..779	CDD:440817
		DNA_pol_A_theta	1668..2053	CDD:176475	137/417 (33%)
poln	NP_001093496.1	DNA_pol_P_Exo	492..696	CDD:465627	45/258 (17%)
		DNA_pol_A_theta	723..1132	CDD:176475	138/417 (33%)