DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ATP8B and Atp10d

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_731669.2 Gene:ATP8B / 41469 FlyBaseID:FBgn0037989 Length:1726 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001414735.1 Gene:Atp10d / 360932 RGDID:1588541 Length:1417 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1513 Identity:467/1513 - (30%)
Similarity:718/1513 - (47%) Gaps:324/1513 - (21%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   209 YHNNYIKTSKYSLFTFLPFNLLEQFQRLANFYFLCLLVLQLIPAISSLTPVTTAIPLIGVLTLTA 273
            |.||.|:|:||:|..|:|.||.|||.|.||.|||.|:||..:|.:.:.....|.:||:.|||:.|
  Rat    71 YVNNRIRTTKYTLLNFVPRNLFEQFHRAANLYFLFLVVLNWVPLVEAFQKEITMLPLVVVLTIIA 135

  Fly   274 VKDAYDDIQRHISDSQVNN-------RKSKTLRNGKLVEAKWSEVQVGDVIRLDNNQFVAADTLL 331
            :||..:|.:::..|.|:||       ||.|     |.::..|..|.|||.|||..|:.:.||.:|
  Rat   136 IKDGLEDYRKYKIDKQINNLITKVYSRKEK-----KYIDCCWKNVTVGDFIRLSCNEIIPADMVL 195

  Fly   332 LSTSEPNGLCFIETAELDGETNLKAKQCLTETIELGDRHDSLWNFNGEIICERPNNLLNKFDGTL 396
            |.:::|:|:|.|||:.||||:|||.:|.:....|.....|. ..|:..|.||.|||.|::|.|.|
  Rat   196 LFSTDPDGICHIETSGLDGESNLKQRQVVRGYAEQDSEVDP-EKFSSRIECESPNNDLSRFRGFL 259

  Fly   397 IWRG-QRFALDNEKILLRGCVLRNTQWCYGVVVFAGVDTKLMQNSGKTQFKSTGVDRLLNFIIIG 460
            .... :|..|..|.:|||||.:|||:...|:||:||.:||.|.|:...::|.:.::|..|..::.
  Rat   260 EHSNKERVGLSKENLLLRGCTIRNTEAVVGIVVYAGHETKAMLNNSGPRYKRSKLERRANTDVLW 324

  Fly   461 IVLFLVSICALFAIGCAIW----EGLIGQHFQLYLPWEHIIPKDYIPTGATVIGLLVFFSYAIVL 521
            .||.|:.:|...|:|..||    |.::  .|.:..|...::       ...:.|..||::..|:|
  Rat   325 CVLLLIVMCLTGALGHGIWLSRYENML--FFNIPEPDGRVL-------SPVLTGFYVFWTMIILL 380

  Fly   522 NTVVPISLYVSVEVIRFVQSFLINWDEEMYYPTTNTYAKARTTTLNEELGQIQYIFSDKTGTLTQ 586
            ..::|||||||:|:::..|.:.|..|.|.|....::..:.|...:.|:||||||:|||||||||:
  Rat   381 QVLIPISLYVSIEIVKLGQIYFIQSDVEFYNEKMDSTIQCRALNITEDLGQIQYLFSDKTGTLTE 445

  Fly   587 NIMTFNKCSINGRSYGDVIDLRTGELVEITEQQTIFQNSNTNNRPSPLSGAIVAPPAAPPPIILV 651
            |.|.|.:||:.|..|   ......:.:|..::....:...|:.....||...||.|.|.      
  Rat   446 NKMVFRRCSVAGFDY---CHEENAKRLESYQEAVSEEEECTDTLSGSLSLGSVARPRAQ------ 501

  Fly   652 HKAEVHAKKTSMVVTSSGEAQVLPDRPRSDIERSAPPMDASEKRPGLKHVRYSAPSRSQDADA-- 714
            .....|::              ||.:|.:.:..|...:...|....:.|.|.:|.|...:.|.  
  Rat   502 SCRTAHSR--------------LPGKPLAQLSGSTSAVGNGEGSGEVLHSRQAAFSSPIETDVVP 552

  Fly   715 --------GRLSP----RLDGSGGLSP---------------------PVGNEERRISGGFKRSG 746
                    .:::|    ||||:...:|                     ...|:.|:..|   .|.
  Rat   553 DTRLLDKFSQITPQLFTRLDGAAQSAPLETLYIMDFFIALAICNTVVVSAPNQPRQKIG---LSS 614

  Fly   747 AGCMQRQLSRTSSCDKVKILHDSQQTETHNMHHSSHNRKRLVKIRFKKAPSTAT----------- 800
            .|.|.     ..|.:::|                  |..:.:.:|...:||.|:           
  Rat   615 LGGMP-----IKSLEEIK------------------NIFQKLSVRRSSSPSLASGKDSTSGTPCA 656

  Fly   801 ------------LGVVISQLEHHLDEEPQSTSTLSTTKHHHHRSKAFATNWSSSPHRVHALQSVD 853
                        |...:......:||.||::::...|:                           
  Rat   657 FVSRISFFSRTKLSPPVEDESSQMDEIPQASNSACCTE--------------------------- 694

  Fly   854 FSANPHHESDFRWYDRTLLDAVRSDEEHSHVFFRLLALCHTVMAETVDG------KLEYQAQSPD 912
                                   |:.|:|.|...:.:      ||.:||      .|.|:|:|||
  Rat   695 -----------------------SEAENSDVGLPIDS------AEALDGPPPLASNLCYEAESPD 730

  Fly   913 EAALVSAARNFGFVFRTRTPNSITIE--VMGQTEEYELLNILDFNNVRKRMSVILRR--GDSMVL 973
            |||||.|||.:....|:|||..:.::  .:|.. .::||:||.|::|||||||::|.  ...:|:
  Rat   731 EAALVYAARAYHCTLRSRTPEQVVVDFAALGPL-TFQLLHILPFDSVRKRMSVVVRHPLSKQVVV 794

  Fly   974 YCKGADNVIYDRLHGGQED----------LKARTQDHLNKFAGEGLRTLALAERRLTEQYYNDWR 1028
            |.||||:||.:.|.....|          ::.|||.||:::|..|||||.:|::.:::..|.:|.
  Rat   795 YTKGADSVIMELLSVASSDGTNLEDQQMVIRERTQRHLDEYAKRGLRTLCVAKKVMSDTEYAEWL 859

  Fly  1029 SRQQEAALSMDSREQKLNAIYEEIESEMQLVGVTAIEDKLQDGVPKSIANLQNAGIKIWVLTGDK 1093
            .....|..|:|:||:.|......:|:::.|:|.|.|||:||:|||:||..|..||||||:|||||
  Rat   860 RNHFLAETSIDNREELLVESAMRLENKLTLLGATGIEDRLQEGVPESIEALHKAGIKIWMLTGDK 924

  Fly  1094 QETAINIGYSCQLLTDELADVFIVDGNSVEEVEKQLRQFKESIKIYNRFRPGGFDPFDR---LNS 1155
            ||||:||.|:|:||                                        :|.|:   ||:
  Rat   925 QETAVNIAYACKLL----------------------------------------EPDDKLFILNT 949

  Fly  1156 DSNMDPLSVTMTQTSAFMQETNLPPTPPPPPAISVVTFRWDEKNKDNKGGPDSAECNNLFGDEKG 1220
            .|. |...:.|   ||.::|.                      .|..:..|:.|.....|.....
  Rat   950 QSE-DACGMLM---SAILEEL----------------------QKRTQVSPELASPRKNFPQPPD 988

  Fly  1221 SEDGGTASIVVDENTGFALVVNGHSLVHCLSPELENKFLDIASQCKAVICCRVTPLQKALVVELI 1285
            .:..|.|          .||:.|.:|...|...|:.:||::.:.|:||||||.|||||:.||:|:
  Rat   989 PQVPGRA----------GLVITGKTLEFALQESLQKQFLELTAWCQAVICCRATPLQKSEVVKLV 1043

  Fly  1286 KRAKNAVTLAIGDGANDVSMIKAAHIGVGISGQEGLQAVLSSDYSIAQFRYLERLLLVHGRWSYY 1350
            :...:.:||||||||||||||:.|.||:|:|||||:|||::||::|:|||:|.:||||||.|.|.
  Rat  1044 RNHLHVMTLAIGDGANDVSMIQVADIGIGVSGQEGMQAVMASDFAISQFRHLSKLLLVHGHWCYT 1108

  Fly  1351 RMCKFLRYFFYKNFAFTLCHCWYSLFCGFSAQTVFDPMFISVYNLFYTSLPVLALGVFEQDVSDK 1415
            |:...:.||||||.|:.....||..|||||..::.|...:..:||.:||:|.:..||.|:|||.:
  Rat  1109 RLSNMILYFFYKNVAYVNLLFWYQFFCGFSGTSMTDYWVLIFFNLLFTSVPPIIYGVLEKDVSAE 1173

  Fly  1416 NSLEFPRLYTPGLKSELFNIREFIYSVLHGAFTSLVLFLIPYGVYKDGVSANGFVVSDHMTLGAV 1480
            ..|:.|.||..|.:||.:....|..::|...:.|||.|.:||..|: |...:.|...:.:...|:
  Rat  1174 TLLQLPELYQSGQRSEEYLPLTFWITLLDAFYQSLVCFFVPYFTYQ-GSDIDIFTFGNPLNTAAL 1237

  Fly  1481 VATILIVDNTAQISLYTSYWTVVNHVTIWGSLVWYFVLDYFYNYVIG----------GPYVGSLT 1535
            :..:|      .:.:.:...|.::.:.|.||::.||    |:....|          .|| |.:.
  Rat  1238 LIILL------HLVIESKSLTWIHMLVIVGSILSYF----FFALAFGALCVTCNPPSNPY-GIMQ 1291

  Fly  1536 QAMKDLTFWVTMLITVMALVAPVLAYKFYLLDVHPS----------LSDKIRQKSLKKIHSRASS 1590
            :.|.|..|::..::|....:.|...|:.....|.||          ||.:.|.::||:  .|.::
  Rat  1292 KHMLDPVFYLVCVLTTCVALLPRFVYRVLQGSVFPSPILRAKYFDRLSPEERAEALKR--WRGTA 1354

  Fly  1591 DVRRTASSRRGRRSVRSG 1608
            .|...||....:.:.:||
  Rat  1355 KVNHVASKYASQSAAKSG 1372

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ATP8BNP_731669.2 Haloacid Dehalogenase-like Hydrolases 211..>602 CDD:473868 157/402 (39%)
Haloacid Dehalogenase-like Hydrolases <885..1456 CDD:473868 222/593 (37%)
Atp10dNP_001414735.1 None

Return to query results.
Submit another query.