Protein Alignment CG3397 and kcnab1a

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_650140.1
• Gene: CG3397 / 41454
• FlyBaseID: FBgn0037975
• Length: 342
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_073785179.1
• Gene: kcnab1a / 541540
• ZFINID: ZDB-GENE-050327-79
• Length: 423
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 322
• Identity: 82/322 - (25%)
• Similarity: 137/322 - (42%)
• Gaps: 59/322 - (18%)

  Fly    22 MEYRQLGSTGLRVSKIALG-GATLSKLFSDDFDREEGILTVQEAIRSGINYIDTAPFYGQGKSEE 85
            |.||.||.:|||||.:.|| ..|.....|||.  .|.::|:  |..||:|..|||..|..||:|.
Zfish    88 MPYRNLGKSGLRVSCLGLGTWVTFGGQISDDV--AEQLMTI--AYESGVNLFDTAEVYAAGKAEV 148

  Fly    86 LLGQALKDV--PREAYYIATKVARYELDPNNMFDYTAAKAR-----------ESVKRSLELLQLD 137
            :||..:|..  .|.:..|.||:            |...||.           |.:|.||:.:|::
Zfish   149 ILGNIIKKKGWRRSSLVITTKL------------YWGGKAETERGLSRKHIIEGLKGSLQRMQME 201

  Fly   138 RVDVLQVHDVDAAPSLDMVLNETIPVLEEYVQAGKARFIGVTAYDVDVLKEC--AERGKGRIQVV 200
            .|||:..:    .|..:..:.|.:..:...:..|.:.:.|.:.:....:.|.  ..|....|..|
Zfish   202 YVDVVFAN----RPDSNTPMEEIVRAMTYVINQGMSMYWGTSRWTAMEIMEAYSVARQFNLIPPV 262

  Fly   201 LNYARYTLL--DNTLLRHMKAFQEMGVGVVCAAAHSLGLLS----NAGPQS---------W---- 246
            ...|.|.|.  :...::..:.:.::|||.:..:..:.|:::    |..|.|         |
Zfish   263 CEQAEYHLFQREKVEVQLPELYHKIGVGAMTWSPLACGIITGKYENGIPDSSRASMKSYQWLKEK 327

  Fly   247 ---HPGSPELLAVGKRGAEICQKRNVELGKLAMYYTMQLDGAATFLIGIPNRKLLRINLDAI 305
               ..|..:...:.:.| .|.:|....|.:||:.:.::.:|.::.|:|..|.:.|..||.||
Zfish   328 IVSEDGRKQQAKLKELG-HIAEKLGCTLPQLAVAWCLRNEGVSSVLLGTSNAEQLTENLGAI 388

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG3397	NP_650140.1	AKR_galDH	22..315	CDD:381389	82/322 (25%)
kcnab1a	XP_073785179.1	None