DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MARS1 and Mars1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_004981.2 Gene:MARS1 / 4141 HGNCID:6898 Length:900 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_006241513.1 Gene:Mars1 / 299851 RGDID:1305321 Length:910 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:910 Identity:819/910 - (90%)
Similarity:854/910 - (93%) Gaps:10/910 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MRLFVSDGVPGCLPVLAAAGRARGRAEVLISTVGPEDCVVPFLTRPKVPVLQLDSGNYLFSTSAI 65
            ||||||:|.||.|||||||.|||||||:||||||||:||||||||||||||||||||||||.|||
  Rat     1 MRLFVSEGSPGSLPVLAAAARARGRAELLISTVGPEECVVPFLTRPKVPVLQLDSGNYLFSASAI 65

Human    66 CRYFFLLSGWEQDDLTNQWLEWEATELQPALSAALYYLVVQGKKGEDVLGSVRRALTHIDHSLSR 130
            |||||||.|||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.:||.||||||||||
  Rat    66 CRYFFLLCGWEQDDLTNQWLEWEATELQPVLSAALYCLVVQGKKGEDVLGPLRRVLTHIDHSLSR 130

Human   131 QNCPFLAGETESLADIVLWGALYPLLQDPAYLPEELSALHSWFQTLSTQEPCQRAAETVLKQQGV 195
            ||||||||:|||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 QNCPFLAGDTESLADIVLWGALYPLLQDPAYLPEELGALQSWFQTLSTQEPCQRAAETVLKQQGV 195

Human   196 LALRPYLQKQPQPS--PAEGRAVTNEPEEEELATLSEEEIAMAVTAWEKGLESLPPLRPQQNPVL 258
            |||||||||||||.  |.|||||:||||||||||||||:|..||.|||||||:||||:|||:|||
  Rat   196 LALRPYLQKQPQPQPLPPEGRAVSNEPEEEELATLSEEDIIAAVAAWEKGLENLPPLQPQQHPVL 260

Human   259 PVAGERNVLITSALPYVNNVPHLGNIIGCVLSADVFARYSRLRQWNTLYLCGTDEYGTATETKAL 323
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:
  Rat   261 PVPGERNVLITSALPYVNNVPHLGNIIGCVLSADVFARYSRLRQWNTLYLCGTDEYGTATETKAM 325

Human   324 EEGLTPQEICDKYHIIHADIYRWFNISFDIFGRTTTPQQTKITQDIFQQLLKRGFVLQDTVEQLR 388
            ||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||.||||||||||:||.|||||||||||||
  Rat   326 EEGLTPQEICDKYHAIHVDIYRWFNISFDTFGRTTTPLQTKITQDIFQRLLTRGFVLQDTVEQLR 390

Human   389 CEHCARFLADRFVEGVCPFCGYEEARGDQCDKCGKLINAVELKKPQCKVCRSCPVVQSSQHLFLD 453
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||:||||||||.|||:||:|||||
  Rat   391 CEQCARFLADRFVEGVCPFCGYEEARGDQCDKCGKLINAIELKRPQCKVCRSHPVVKSSKHLFLD 455

Human   454 LPKLEKRLEEWLGRTLPGSDWTPNAQFITRSWLRDGLKPRCITRDLKWGTPVPLEGFEDKVFYVW 518
            |||||||||:|||:|:|||||||||:||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 LPKLEKRLEDWLGKTMPGSDWTPNARFIIRSWLRDGLKPRCITRDLKWGTPVPLEGFEDKVFYVW 520

Human   519 FDATIGYLSITANYTDQWERWWKNPEQVDLYQFMAKDNVPFHSLVFPCSALGAEDNYTLVSHLIA 583
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.:|||
  Rat   521 FDATIGYLSITANYTDQWERWWKNPEQVDLYQFMAKDNVPFHGLVFPCSALGAEDNYTLVKNLIA 585

Human   584 TEYLNYEDGKFSKSRGVGVFGDMAQDTGIPADIWRFYLLYIRPEGQDSAFSWTDLLLKNNSELLN 648
            ||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||
  Rat   586 TEYLNYEDGKFSKSRGIGVFGDMAQDTGIPADIWRFYLLYIRPEGQDSAFSWTDLLIKNNSELLN 650

Human   649 NLGNFINRAGMFVSKFFGGYVPEMVLTPDDQRLLAHVTLELQHYHQLLEKVRIRDALRSILTISR 713
            |||||||||||||||||||.|||||||.||:||:|||:.|||.||||||||||||||||||||||
  Rat   651 NLGNFINRAGMFVSKFFGGCVPEMVLTHDDRRLVAHVSWELQRYHQLLEKVRIRDALRSILTISR 715

Human   714 HGNQYIQVNEPWKRIKGSEADRQRAGTVTGLAVNIAALLSVMLQPYMPTVSATIQAQLQLPPPAC 778
            |||||||||||||||||.|.||||||||||:||||||||||||||||||||:|||.|||||..||
  Rat   716 HGNQYIQVNEPWKRIKGDEMDRQRAGTVTGMAVNIAALLSVMLQPYMPTVSSTIQTQLQLPEAAC 780

Human   779 SILLTNFLCTLPAGHQIGTVSPLFQKLENDQIESLRQRFGGG--------QAKTSPKPAVVETVT 835
            .||.|:|:|||||||:|||||||||||||||||:||||||||        |||.||||||||.||
  Rat   781 RILATSFICTLPAGHRIGTVSPLFQKLENDQIENLRQRFGGGQLEESLELQAKGSPKPAVVEAVT 845

Human   836 TAKPQQIQALMDEVTKQGNIVRELKAQKADKNEVAAEVAKLLDLKKQLAVAEGKPPEAPKGKKKK 900
            ||..|.||.|:|||||||||||||||||||||:||||||||||||||||:|||||.|.|||||||
  Rat   846 TAGSQDIQVLVDEVTKQGNIVRELKAQKADKNQVAAEVAKLLDLKKQLALAEGKPIETPKGKKKK 910

Human   901  900
              Rat   911  910

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MARS1NP_004981.2 GST_N_5 1..74 CDD:436537 65/72 (90%)
GST_C_MetRS_N 77..179 CDD:198340 93/101 (92%)
PLN02610 251..893 CDD:215329 585/649 (90%)
'HIGH' region 273..283 9/9 (100%)
'KMSKS' region 593..597 3/3 (100%)
Mars1XP_006241513.1 GST_N_5 1..74 CDD:436537 65/72 (90%)
GST_C_MetRS_N 77..179 CDD:198340 93/101 (92%)
PLN02610 258..>839 CDD:215329 527/580 (91%)
MetRS_RNA 855..899 CDD:238475 40/43 (93%)

Return to query results.
Submit another query.