DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MARK3 and Mark3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001122390.2 Gene:MARK3 / 4140 HGNCID:6897 Length:753 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_006240625.1 Gene:Mark3 / 170577 RGDID:619883 Length:806 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:806 Identity:727/806 - (90%)
Similarity:737/806 - (91%) Gaps:53/806 - (6%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MSTRTPLPTVNERDTENHTSHGDGRQEVTSRTSRSGARCRNSIASCADEQPHIGNYRLLKTIGKG 65
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MSTRTPLPTVNERDTENHISHGDGRQEVTSRTGRSGARCRNSIASCADEQPHIGNYRLLKTIGKG 65

Human    66 NFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIVKLFEVIETEKTLYL 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 NFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIVKLFEVIETEKTLYL 130

Human   131 IMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARSKFRQIVSAVQYCHQKRIVHRDLKAENLLLDADMNIKIA 195
            ||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 IMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKRIVHRDLKAENLLLDADMNIKIA 195

Human   196 DFGFSNEFTVGGKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKE 260
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 DFGFSNEFTVGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKE 260

Human   261 LRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLEQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELD 325
            ||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||:|||||||||||
  Rat   261 LRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPVKRGTLEQIMKDRWINAGHEEEELKPFVEPELD 325

Human   326 ISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEITATYLLLGRKSSELDASDSSSSSNLSLAKVRPS 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||
  Rat   326 ISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEITATYLLLGRKSAELDASDSSSSSNLSLAKVRPS 390

Human   391 SDLNNSTGQSPHHKVQRSVSSSQKQRRYSDHAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADSDLKEDGISSRKS 455
            |||:||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:.||||
  Rat   391 SDLSNSTGQSPHHKGQRSVSSSQKQRRYSDHAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADSDLKEDGVPSRKS 455

Human   456 SGSAVGGKGIAPASPMLGNASNPNKADIPERKKSSTVPSSNTASGGMTRRNTYVCSERTTADRHS 520
            ..||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||.||||||||||||||||..|||||
  Rat   456 GSSAVGGKGIAPASPMLGNASNPNKADIPERKKSPAVPSSNAASGGMTRRNTYVCSERCAADRHS 520

Human   521 VIQNGKENS-----------------------------------------------------TIP 532
            |||||||:|                                                     |.|
  Rat   521 VIQNGKESSLTEVFAYAASPASLCATSTCRLRHQRSMSVSASGHPKMVLPPIDSEGDTFKAITTP 585

Human   533 DQRTPVASTHSISSAATPDRIRFPRGTASRSTFHGQPRERRTATYNGPPASPSLSHEATPLSQTR 597
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   586 DQRTPVASTHSISSATTPDRIRFPRGTASRSTFHGQPRERRTATYNGPPASPSLSHEATPLSQTR 650

Human   598 SRGSTNLFSKLTSKLTRRNMSFRFIKRLPTEYERNGRYEGSSRNVSAEQKDENKEAKPRSLRFTW 662
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||:|||||||||||
  Rat   651 SRGSTNLFSKLTSKLTRRNMSFRFIKRLPTEYERNGRYEGSSRNVSSEQKDENREAKPRSLRFTW 715

Human   663 SMKTTSSMDPGDMMREIRKVLDANNCDYEQRERFLLFCVHGDGHAENLVQWEMEVCKLPRLSLNG 727
            ||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||
  Rat   716 SMKTTSSMDPSDMMREIRKVLDANTCDYEQRERFLLFCVHGDGHAESLVQWEMEVCKLPRLSLNG 780

Human   728 VRFKRISGTSIAFKNIASKIANELKL 753
            ||||||||||||||||||||||||||
  Rat   781 VRFKRISGTSIAFKNIASKIANELKL 806

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MARK3NP_001122390.2 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1..36 32/34 (94%)
STKc_MARK 55..307 CDD:270974 248/251 (99%)
UBA_MARK3_4 325..367 CDD:270590 41/41 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 370..600 215/282 (76%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 632..655 20/22 (91%)
MARK1-3_C 654..751 CDD:213381 93/96 (97%)
Mark3XP_006240625.1 STKc_MARK 55..307 CDD:270974 248/251 (99%)
UBA_MARK3_4 325..367 CDD:270590 41/41 (100%)
MARK1-3_C 707..804 CDD:213381 93/96 (97%)

Return to query results.
Submit another query.