DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Mrp4 and CG9270

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_650086.2 Gene:Mrp4 / 41387 FlyBaseID:FBgn0263316 Length:1316 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_995741.2 Gene:CG9270 / 35366 FlyBaseID:FBgn0032908 Length:1292 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1312 Identity:810/1312 - (61%)
Similarity:1014/1312 - (77%) Gaps:35/1312 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     4 MKADELPENPRERSSPLSSLMFCFALPVLFKGRKKTLEQKDLYRALKEHKSDSLGDRLCAAWDEQ 68
            |:|.:|..||||.:...|:||||||||:||||||||||..|||.||||||:::|||:..|.|..:
  Fly     1 MQAKKLQTNPRESAGIFSTLMFCFALPILFKGRKKTLEPTDLYNALKEHKAETLGDKFFATWQSE 65

  Fly    69 V-----AKNETPRLGRALTKVFGFHLFITGVFLLAQEFLTKVTQPICLIGVMAYFAGN-DPDRSK 127
            |     :..:.|.:.|.:.||||:.||::|:.:...|..|:.|.|:.|..::|.|..| :.|...
  Fly    66 VRSCGDSPKKEPSIIRVILKVFGWQLFLSGIVVGVLELGTRATLPLILGALIAEFTRNGNGDGLW 130

  Fly   128 AQLWAAGLIAGSVFSVCIGHPYMLGLLHLGMKMRIALSSLIYRKALRLSRTALGDTTVGQVVNLL 192
            ||::...||...:|||.:.||.|:||:||.||||:|:|:.|||||||||||||||||.||||||:
  Fly   131 AQIYGLTLILSILFSVLMFHPLMMGLMHLAMKMRVAVSTAIYRKALRLSRTALGDTTTGQVVNLI 195

  Fly   193 SNDVGRFDLVLINVHYLWIAPLELIAVTYLMYLEIGISSMFGVAIMLLFLPFQSYLGKRTSVLRL 257
            |||:||||..||:.|:||:.||||:..:|.:|.:||::|::|:.|:|||||.|::|.:.||.||.
  Fly   196 SNDLGRFDRALIHFHFLWLGPLELLISSYFLYQQIGVASLYGIVILLLFLPIQTFLSRLTSRLRH 260

  Fly   258 RTALRTDERVRMMNEIISGIQVIKMYAWEKPFGKVVEMTRFNEMLCIKQVNYIRGILISFAMFLS 322
            :||||||:||||||||||||||||||.||||||:::|..|.:||..|::||||||.|:||.:.||
  Fly   261 QTALRTDQRVRMMNEIISGIQVIKMYTWEKPFGRLIERLRRSEMSSIRKVNYIRGTLLSFEITLS 325

  Fly   323 RIFTSSSLIAFVLLGNILNAEKAFFVTAYYNILRRSVTMFFPQGISEFAELLVSVRRLEAFMHRP 387
            ||....||:.|||:|..|.||:||.|||:||||||:|..|||.|:|:|||::|::||::.||.|.
  Fly   326 RIAIFVSLLGFVLMGGELTAERAFSVTAFYNILRRTVCKFFPSGMSQFAEMMVTLRRIKGFMMRS 390

  Fly   388 ETKVRDKSKVKNANQKAESPNGDSPKGNGIPENLIEFSQFQARWESHSLEPTLEDINLQLGRRKL 452
            ||:.. ..|....|:..|.            |.|::...|||||....:||.||:||:.|...:|
  Fly   391 ETEAL-YLKGGQTNKLFEG------------EPLVKLQSFQARWNHDHVEPVLENINISLSPPQL 442

  Fly   453 VAVIGPVGAGKSSLIQAILGELPGESGTLRINGSYSYAAQEPWLFTGTVRQNILFGLDWDKHRYR 517
            ||||||||:||||||||||||||||||.|::.|..|||:||||||..:||.||||||..||||||
  Fly   443 VAVIGPVGSGKSSLIQAILGELPGESGKLKVQGDISYASQEPWLFNASVRDNILFGLPMDKHRYR 507

  Fly   518 TVVKKCALERDFELLPFGDKTIVGERGASLSGGQKARISLARAVYRRADIYLLDDPLSAVDTHVG 582
            .|::.|||||||||| .||:|.||||||||||||:|||||||||||:||.|||||||||||||||
  Fly   508 NVIRNCALERDFELL-HGDRTFVGERGASLSGGQRARISLARAVYRQADTYLLDDPLSAVDTHVG 571

  Fly   583 RHLFDQCMRGYLRSELVILVTHQLQFLEQADLIVIMDKGRISAMGTYSSMKRSGLDFAQLLTAPN 647
            ||||::||||:||.:|||||||||||||.||||||||||:|||:|||..|.:||.||.:||....
  Fly   572 RHLFEECMRGFLRDKLVILVTHQLQFLEHADLIVIMDKGKISAVGTYEEMLKSGQDFGKLLATEA 636

  Fly   648 KDAEDLD-EIDGAGGDGLDLLNVPSLSRRGSKNSKPSTRNNSFTSLSSMAESMAQEASLQMQETR 711
            ::..|.: |...|.||..:  :..:.||:.|:.|:.|.     ||:.|..||:........||:|
  Fly   637 QEMGDSNQEQVNAEGDSRN--DKSTYSRQSSRVSRVSV-----TSVDSSTESILDNERQPAQESR 694

  Fly   712 VEGKIGLGLYKEYLTSGSSWFMIFFMVFLCLATQILCSAADYFLSYWVDKNVDGQTDINTDPQDM 776
            .:||||||:|.:|.::||.|.|:..:.|.||.||||.|..|||||||| ||.|     ::...|:
  Fly   695 SQGKIGLGIYGKYFSAGSGWLMVILVAFFCLGTQILASGGDYFLSYWV-KNND-----SSSSTDI 753

  Fly   777 YYFAALNVAVVVFTIVRTMLFYKMAMRSSTQLHNAMYQGITRAAMYFFNTNPSGRILNRFSKDLG 841
            |.|:.:|.|:|:|.::||:||:.|||.|||||||.|:||::|.|:|||:.||||||||||:.|||
  Fly   754 YIFSGINAALVIFALLRTLLFFSMAMHSSTQLHNTMFQGVSRTALYFFHANPSGRILNRFAMDLG 818

  Fly   842 QLDEVLPSVMLDVVQLFLTLLGIIVVICITNPYYLILTLALAIIFYYIREFYLKTSRDVKRLEAV 906
            |:||:||:||||.:|:|||:.|||.|:|||||:|||.|:.:.:.|:::|.|||.||||:|||||:
  Fly   819 QVDEILPAVMLDCIQIFLTISGIIGVLCITNPWYLINTITMFLAFHFLRTFYLSTSRDLKRLEAI 883

  Fly   907 ARSPIYSHLSATITGLPTIRALGAQKELIAEFDNLQDLHSSGYYTFLATNRAFGYYLDCFCTLYI 971
            ||||:|||.|||:.||.||||:.||..|..|:||.||:|||||||||:||||||||||.||..|:
  Fly   884 ARSPMYSHFSATLNGLSTIRAMEAQDLLTKEYDNYQDIHSSGYYTFLSTNRAFGYYLDLFCVAYV 948

  Fly   972 VIIILNYFINPP-QSPGEVGLAITQAMGMTGMVQWAMRQSAELENTMTAVERVVEYDEIEPEGEF 1035
            :.:.|..:.||| .:||::||.|||||.|||.|||.|||||||||:||:||||:||..:|.||||
  Fly   949 ISVTLMSYFNPPVDNPGQIGLVITQAMSMTGTVQWGMRQSAELENSMTSVERVLEYRHLEAEGEF 1013

  Fly  1036 DSREGKKPSPSWPEKGEIIAEDLCLRYFPDPQAKYVLKALNFRIRPCEKVGIVGRTGAGKSSLIN 1100
            :|.:.|||..:||::|.|.||.|.|||.|||:|..|||:|||.|.|.||:|||||||||||||||
  Fly  1014 ESPDDKKPPMNWPQEGLISAEQLSLRYNPDPKADRVLKSLNFIIMPREKIGIVGRTGAGKSSLIN 1078

  Fly  1101 ALFRLSYNEGIITIDERDTADMGLFDLRSKISIIPQEPVLFSGSMRYNLDPFEEYNDAKLWDALE 1165
            ||||||||||.:.||..|...:||.||||||||||||||||||::|.||||||:|.|.|||:|||
  Fly  1079 ALFRLSYNEGSLVIDNTDILGIGLHDLRSKISIIPQEPVLFSGTLRCNLDPFEQYADEKLWEALE 1143

  Fly  1166 EVKLKPLISELPNGLQSKISEGGSNFSVGQRQLVCLARAILRENRVLVMDEATANVDPQTDALIQ 1230
            ||.||..:|||||||:|.::|||||:|||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||
  Fly  1144 EVHLKDEVSELPNGLESVVAEGGSNYSVGQRQLVCLARAILRENRILVMDEATANVDPQTDALIQ 1208

  Fly  1231 ATIRSKFRDCTVLTIAHRLNTIMDSDRVLVMDAGHLVEFGSPYELLTSSESKIFHGMVMETGQNT 1295
            :|||.|||||||||||||||||:|||||:|:|||.|||||||:||||.|.||:|:|||::||:::
  Fly  1209 STIRRKFRDCTVLTIAHRLNTIIDSDRVMVLDAGTLVEFGSPFELLTQSWSKVFYGMVLQTGRSS 1273

  Fly  1296 FDSLLKVAEKAH 1307
            |:.|||:|.:||
  Fly  1274 FEHLLKLALEAH 1285

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Mrp4NP_650086.2 MRP_assoc_pro 13..1292 CDD:188098 797/1286 (62%)
CG9270NP_995741.2 PLN03130 10..1289 CDD:215595 806/1303 (62%)

Return to query results.
Submit another query.