DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Mrp4 and CG9270

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_650086.2 Gene:Mrp4 / 41387 FlyBaseID:FBgn0263316 Length:1316 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_995741.2 Gene:CG9270 / 35366 FlyBaseID:FBgn0032908 Length:1292 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1312 Identity:810/1312 - (61%)
Similarity:1014/1312 - (77%) Gaps:35/1312 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     4 MKADELPENPRERSSPLSSLMFCFALPVLFKGRKKTLEQKDLYRALKEHKSDSLGDRLCAAWDEQ 68
            |:|.:|..||||.:...|:||||||||:||||||||||..|||.||||||:::|||:..|.|..:
  Fly     1 MQAKKLQTNPRESAGIFSTLMFCFALPILFKGRKKTLEPTDLYNALKEHKAETLGDKFFATWQSE 65

  Fly    69 V-----AKNETPRLGRALTKVFGFHLFITGVFLLAQEFLTKVTQPICLIGVMAYFAGN-DPDRSK 127
            |     :..:.|.:.|.:.||||:.||::|:.:...|..|:.|.|:.|..::|.|..| :.|...
  Fly    66 VRSCGDSPKKEPSIIRVILKVFGWQLFLSGIVVGVLELGTRATLPLILGALIAEFTRNGNGDGLW 130

  Fly   128 AQLWAAGLIAGSVFSVCIGHPYMLGLLHLGMKMRIALSSLIYRKALRLSRTALGDTTVGQVVNLL 192
            ||::...||...:|||.:.||.|:||:||.||||:|:|:.|||||||||||||||||.||||||:
  Fly   131 AQIYGLTLILSILFSVLMFHPLMMGLMHLAMKMRVAVSTAIYRKALRLSRTALGDTTTGQVVNLI 195

  Fly   193 SNDVGRFDLVLINVHYLWIAPLELIAVTYLMYLEIGISSMFGVAIMLLFLPFQSYLGKRTSVLRL 257
            |||:||||..||:.|:||:.||||:..:|.:|.:||::|::|:.|:|||||.|::|.:.||.||.
  Fly   196 SNDLGRFDRALIHFHFLWLGPLELLISSYFLYQQIGVASLYGIVILLLFLPIQTFLSRLTSRLRH 260

  Fly   258 RTALRTDERVRMMNEIISGIQVIKMYAWEKPFGKVVEMTRFNEMLCIKQVNYIRGILISFAMFLS 322
            :||||||:||||||||||||||||||.||||||:::|..|.:||..|::||||||.|:||.:.||
  Fly   261 QTALRTDQRVRMMNEIISGIQVIKMYTWEKPFGRLIERLRRSEMSSIRKVNYIRGTLLSFEITLS 325

  Fly   323 RIFTSSSLIAFVLLGNILNAEKAFFVTAYYNILRRSVTMFFPQGISEFAELLVSVRRLEAFMHRP 387
            ||....||:.|||:|..|.||:||.|||:||||||:|..|||.|:|:|||::|::||::.||.|.
  Fly   326 RIAIFVSLLGFVLMGGELTAERAFSVTAFYNILRRTVCKFFPSGMSQFAEMMVTLRRIKGFMMRS 390

  Fly   388 ETKVRDKSKVKNANQKAESPNGDSPKGNGIPENLIEFSQFQARWESHSLEPTLEDINLQLGRRKL 452
            ||:.. ..|....|:..|.            |.|::...|||||....:||.||:||:.|...:|
  Fly   391 ETEAL-YLKGGQTNKLFEG------------EPLVKLQSFQARWNHDHVEPVLENINISLSPPQL 442

  Fly   453 VAVIGPVGAGKSSLIQAILGELPGESGTLRINGSYSYAAQEPWLFTGTVRQNILFGLDWDKHRYR 517
            ||||||||:||||||||||||||||||.|::.|..|||:||||||..:||.||||||..||||||
  Fly   443 VAVIGPVGSGKSSLIQAILGELPGESGKLKVQGDISYASQEPWLFNASVRDNILFGLPMDKHRYR 507

  Fly   518 TVVKKCALERDFELLPFGDKTIVGERGASLSGGQKARISLARAVYRRADIYLLDDPLSAVDTHVG 582
            .|::.|||||||||| .||:|.||||||||||||:|||||||||||:||.|||||||||||||||
  Fly   508 NVIRNCALERDFELL-HGDRTFVGERGASLSGGQRARISLARAVYRQADTYLLDDPLSAVDTHVG 571

  Fly   583 RHLFDQCMRGYLRSELVILVTHQLQFLEQADLIVIMDKGRISAMGTYSSMKRSGLDFAQLLTAPN 647
            ||||::||||:||.:|||||||||||||.||||||||||:|||:|||..|.:||.||.:||....
  Fly   572 RHLFEECMRGFLRDKLVILVTHQLQFLEHADLIVIMDKGKISAVGTYEEMLKSGQDFGKLLATEA 636

  Fly   648 KDAEDLD-EIDGAGGDGLDLLNVPSLSRRGSKNSKPSTRNNSFTSLSSMAESMAQEASLQMQETR 711
            ::..|.: |...|.||..:  :..:.||:.|:.|:.|.     ||:.|..||:........||:|
  Fly   637 QEMGDSNQEQVNAEGDSRN--DKSTYSRQSSRVSRVSV-----TSVDSSTESILDNERQPAQESR 694

  Fly   712 VEGKIGLGLYKEYLTSGSSWFMIFFMVFLCLATQILCSAADYFLSYWVDKNVDGQTDINTDPQDM 776
            .:||||||:|.:|.::||.|.|:..:.|.||.||||.|..|||||||| ||.|     ::...|:
  Fly   695 SQGKIGLGIYGKYFSAGSGWLMVILVAFFCLGTQILASGGDYFLSYWV-KNND-----SSSSTDI 753

  Fly   777 YYFAALNVAVVVFTIVRTMLFYKMAMRSSTQLHNAMYQGITRAAMYFFNTNPSGRILNRFSKDLG 841
            |.|:.:|.|:|:|.::||:||:.|||.|||||||.|:||::|.|:|||:.||||||||||:.|||
  Fly   754 YIFSGINAALVIFALLRTLLFFSMAMHSSTQLHNTMFQGVSRTALYFFHANPSGRILNRFAMDLG 818

  Fly   842 QLDEVLPSVMLDVVQLFLTLLGIIVVICITNPYYLILTLALAIIFYYIREFYLKTSRDVKRLEAV 906
            |:||:||:||||.:|:|||:.|||.|:|||||:|||.|:.:.:.|:::|.|||.||||:|||||:
  Fly   819 QVDEILPAVMLDCIQIFLTISGIIGVLCITNPWYLINTITMFLAFHFLRTFYLSTSRDLKRLEAI 883

  Fly   907 ARSPIYSHLSATITGLPTIRALGAQKELIAEFDNLQDLHSSGYYTFLATNRAFGYYLDCFCTLYI 971
            ||||:|||.|||:.||.||||:.||..|..|:||.||:|||||||||:||||||||||.||..|:
  Fly   884 ARSPMYSHFSATLNGLSTIRAMEAQDLLTKEYDNYQDIHSSGYYTFLSTNRAFGYYLDLFCVAYV 948

  Fly   972 VIIILNYFINPP-QSPGEVGLAITQAMGMTGMVQWAMRQSAELENTMTAVERVVEYDEIEPEGEF 1035
            :.:.|..:.||| .:||::||.|||||.|||.|||.|||||||||:||:||||:||..:|.||||
  Fly   949 ISVTLMSYFNPPVDNPGQIGLVITQAMSMTGTVQWGMRQSAELENSMTSVERVLEYRHLEAEGEF 1013

  Fly  1036 DSREGKKPSPSWPEKGEIIAEDLCLRYFPDPQAKYVLKALNFRIRPCEKVGIVGRTGAGKSSLIN 1100
            :|.:.|||..:||::|.|.||.|.|||.|||:|..|||:|||.|.|.||:|||||||||||||||
  Fly  1014 ESPDDKKPPMNWPQEGLISAEQLSLRYNPDPKADRVLKSLNFIIMPREKIGIVGRTGAGKSSLIN 1078

  Fly  1101 ALFRLSYNEGIITIDERDTADMGLFDLRSKISIIPQEPVLFSGSMRYNLDPFEEYNDAKLWDALE 1165
            ||||||||||.:.||..|...:||.||||||||||||||||||::|.||||||:|.|.|||:|||
  Fly  1079 ALFRLSYNEGSLVIDNTDILGIGLHDLRSKISIIPQEPVLFSGTLRCNLDPFEQYADEKLWEALE 1143

  Fly  1166 EVKLKPLISELPNGLQSKISEGGSNFSVGQRQLVCLARAILRENRVLVMDEATANVDPQTDALIQ 1230
            ||.||..:|||||||:|.::|||||:|||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||
  Fly  1144 EVHLKDEVSELPNGLESVVAEGGSNYSVGQRQLVCLARAILRENRILVMDEATANVDPQTDALIQ 1208

  Fly  1231 ATIRSKFRDCTVLTIAHRLNTIMDSDRVLVMDAGHLVEFGSPYELLTSSESKIFHGMVMETGQNT 1295
            :|||.|||||||||||||||||:|||||:|:|||.|||||||:||||.|.||:|:|||::||:::
  Fly  1209 STIRRKFRDCTVLTIAHRLNTIIDSDRVMVLDAGTLVEFGSPFELLTQSWSKVFYGMVLQTGRSS 1273

  Fly  1296 FDSLLKVAEKAH 1307
            |:.|||:|.:||
  Fly  1274 FEHLLKLALEAH 1285

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Mrp4NP_650086.2 CFTR_protein 12..1277 CDD:273530 789/1272 (62%)
ABC_membrane 93..359 CDD:294371 155/266 (58%)
ABCC_MRP_domain1 422..622 CDD:213217 150/199 (75%)
ABC_membrane 735..978 CDD:294371 148/242 (61%)
ABCC_MRP_domain2 1051..1272 CDD:213211 174/220 (79%)
CG9270NP_995741.2 CFTR_protein 6..1257 CDD:273530 792/1277 (62%)
ABC_membrane 92..362 CDD:294371 156/269 (58%)
ABCC_MRP_domain1 412..611 CDD:213217 150/199 (75%)
ABC_membrane 718..981 CDD:294371 163/268 (61%)
ABCC_MRP_domain2 1029..1250 CDD:213211 174/220 (79%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C45440873
Domainoid 1 1.000 179 1.000 Domainoid score I1056
eggNOG 1 0.900 - - E2759_KOG0054
Homologene 1 1.000 - - H74563
Inparanoid 1 1.050 1131 1.000 Inparanoid score I210
Isobase 00.000 Not matched by this tool.
OMA 1 1.010 - - QHG51855
OrthoDB 1 1.010 - - D138195at2759
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0001028
OrthoInspector 1 1.000 - - otm26173
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100026
Panther 1 1.100 - - P PTHR24223
Phylome 1 0.910 - -
RoundUp 00.000 Not matched by this tool.
SonicParanoid 1 1.000 - - X771
1312.810

Return to query results.
Submit another query.