Protein Alignment Mrp4 and abc3

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_650086.2
• Gene: Mrp4 / 41387
• FlyBaseID: FBgn0263316
• Length: 1316
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_595055.1
• Gene: abc3 / 2540937
• PomBaseID: SPBC359.05
• Length: 1465
• Species: Schizosaccharomyces pombe
• Alignment Length: 1346
• Identity: 448/1346 - (33%)
• Similarity: 707/1346 - (52%)
• Gaps: 137/1346 - (10%)

  Fly    21 SSLMFCFALPVLFKGRKKTLEQKDLYRALKEHKSDSLGDRLCAAWDEQVAKNETPRLGRALTKVF 85
            |.|.|.:....:..|....|::.|::....:.:|   |:.:....|..:..::..|....|.|:
pombe   181 SKLSFSWISSFIKFGYTNYLKESDVWLLPPDERS---GNLIIGFEDWWIYHSKNKRRSLFLWKL- 241

  Fly    86 GFHLFITGVFLLAQEFLTKVTQPI-----------CLIGVMAYFAGNDPDRSKAQLWAAGLIAGS 139
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pombe   242 ---LFFNHWKLVALITITKLIQDVLAFVQPTLIQKTILFISSYTSPNPESPSRGFIIAILVLVAN 303

  Fly   140 VFSVCIGHPYMLGLLHLGMKMRIALSSLIYRKALRLSRTALGDTTVGQVVNLLSNDVGRF-DLVL 203
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pombe   304 FLQTLLLQQYNQLIMLLGMRWKTELLASIYRKSLLLSSSARQNRSIGDIINYMAVDTQKISDLPI 368

  Fly   204 INVHYLWI---APLELIAVTYLMYLEIGISSMFGVAIMLLFLP-----------FQSYLGKRTSV 254
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pombe   369 ----YLFIIVSGPFQIALALSNLYHLMGYSAFTGVAASVILFPCNIIVANVYKKFQSILMK---- 425

  Fly   255 LRLRTALRTDERVRMMNEIISGIQVIKMYAWEKPF-GKVVEMTRFNEMLCIKQVNYIRGILISFA 318
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pombe   426 -------NKDSRSKLMTEIINNIRSIKLYAWETPFLQKLLHIRNTKELSMLKKIGFITAIGDFAW 483

  Fly   319 MFLSRIFTSSSLIAFVLL---GNILNAEKAFFVTAYYNILRRSVTMFFPQGISEFAELLVSVRRL 380
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pombe   484 IFTTIIVTTVAFGAFIIFHGKTQALTADIVFPAVSLFNLLQFPLAM-LPTVISSLLEASVSVSRI 547

  Fly   381 EAFMHRPETKVRDKSKVKNANQKAESPNGDSPKGNGIPENLIEFSQFQARWESHSLE----PTLE 441
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pombe   548 YEFLIAQEL---------DYNGVQRFPATEIPH-----EICLEIKSGTFSWSKKTLKQQVTPTLR 598

  Fly   442 DINLQLGRRKLVAVIGPVGAGKSSLIQAILGELPGESGTLRINGSYSYAAQEPWLFTGTVRQNIL 506
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pombe   599 QINFVAKNGELTCIFGKVGAGKSSLLEACMGNMYKNSGSVFQCGSLAYAAQQPWIFDATIRENIL 663

  Fly   507 FGLDWDKHRYRTVVKKCALERDFELLPFGDKTIVGERGASLSGGQKARISLARAVYRRADIYLLD 571
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pombe   664 FGSEFDPELYEKTIHACCLKRDFEIFTEGDQTEVGQKGASLSGGQKSRISLARAIYSQADIYLLD 728

  Fly   572 DPLSAVDTHVGRHLFDQCM--RGYLRSELVILVTHQLQFLEQADLIVIMDKGRISAMGTY----- 629
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pombe   729 DVLSSVDQHVSRDLIKNLFGPEGFLRTHCVVLTTNSLNVLKEADSIYILSNGKIVEKGNYEHLFV 793

  Fly   630 ---SSMKRSGLDF------------------AQLLTAPNKDAEDLDEIDGAGGDGLDLLNVPSLS 673
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pombe   794 STNSELKQQLSEFNDEKDTQPLPEHTTSYPSTQISLAPSIHVEGLE-------------TYSSSE 845

  Fly   674 RRGSKNSKPSTRNNSFTSLSSMAESMAQEASLQMQETRVEGKIGLGLYKEYLTSGSSWFMIFFMV 738
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pombe   846 RKDSSNKYKSRKRNPIR--QKVTEDDKGKCVAQTDELVQRGKVKWHVYWMYFKSCSIGLILLYFF 908

  Fly   739 FLCLATQILCSAADYFLSYWVDKNVDGQTDINTDPQ---DMY-YFAALNVAVV-VFTIVRTMLFY 798
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pombe   909 FI-ISGIMMNVATNVWLKHWSEENGKSSSELNPSPYFYLGIYLFFGFLSCAFISSSSLTMTVL-- 970

  Fly   799 KMAMRSSTQLHNAMYQGITRAAMYFFNTNPSGRILNRFSKDLGQLDEVLPSVMLDVVQLFLTLLG 863
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pombe   971 -CGIRSGRYLHDSMLKTILRAPMGFFETTSSGRILNRFSNDVYKVDEVVSLTFMFFFRNSIQVLF 1034

  Fly   864 IIVVICITNPYYLILTLALAIIFYYIREFYLKTSRDVKRLEAVARSPIYSHLSATITGLPTIRAL 928
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pombe  1035 ILGVICYSAPLSLLLIVPLFFLYLYNRAYYVRTSRELKRLDNVTRSPLYAHVQESLSGLSTIRAY 1099

  Fly   929 GAQKELIAEFDNLQDLHSSGYYTFLATNRAFGYYLDC------FCTLYIVIIILNYFINPPQSPG 987
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pombe  1100 GMQETFVEENDLRIDTNHRVWFMFFSSSRWQAIRVECIGDLIIFCTAFYGILSA---IKGSPNPG 1161

  Fly   988 EVGLAITQAMGMTGMVQWAMRQSAELENTMTAVERVVEYDEIEPEGEFDSREGKKPSPSWPEKGE 1052
            .||.:::.|:.:|..:.:.::||.:.||...:|||::||..::.|......|.:.|. .||..|.
pombe  1162 LVGFSLSYAIQITQGLSFIVQQSVDAENNTVSVERILEYINVKSEAPEIIPENRPPC-EWPTDGA 1225

  Fly  1053 IIAEDLCLRYFPDPQAKYVLKALNFRIRPCEKVGIVGRTGAGKSSLINALFR-LSYNEGIITIDE 1116
            :.......:|..|  ..:.|..:|..|.|.||:|||||||||||:|..|||| :...||.|.||.
pombe  1226 VSFNHYSAKYRED--LSFALNNINIEISPREKIGIVGRTGAGKSTLAMALFRIIEPTEGKIEIDN 1288

  Fly  1117 RDTADMGLFDLRSKISIIPQEPVLFSGSMRYNLDPFEEYNDAKLWDALEEVKLKPLISELPNGLQ 1181
            .|....||:||||::||||||..:|.|::|.||||.....|.|:|:.||...||..||:|.:||.
pombe  1289 EDITKFGLYDLRSRLSIIPQESQIFEGNIRENLDPNHRLTDKKIWEVLEIASLKNCISQLEDGLY 1353

  Fly  1182 SKISEGGSNFSVGQRQLVCLARAILRENRVLVMDEATANVDPQTDALIQATIRSKFRDCTVLTIA 1246
            |:::|||:|||.|||||:||||.:|...|:|::|||||:|..:|||::|.|||.:|:|.|:||:|
pombe  1354 SRVAEGGANFSSGQRQLICLARVLLTSTRILLLDEATASVHAETDAIVQQTIRKRFKDRTILTVA 1418

  Fly  1247 HRLNTIMDSDRVLVMDAGHLVEFGSPYELLTSSESKIFHGMVMETG 1292
            ||:||:|||||:||:|.|.:|||.:..:||.:.:| :|:.:..|:|
pombe  1419 HRINTVMDSDRILVLDHGKVVEFDATKKLLENKDS-MFYSLAKESG 1463

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Mrp4	NP_650086.2	MRP_assoc_pro	13..1292	CDD:188098	447/1344 (33%)
abc3	NP_595055.1	MRP_assoc_pro	101..1464	CDD:188098	448/1346 (33%)