Protein Alignment Ipo9 and msk

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_650068.1
• Gene: Ipo9 / 41367
• FlyBaseID: FBgn0037894
• Length: 1018
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_524780.1
• Gene: msk / 44747
• FlyBaseID: FBgn0026252
• Length: 1049
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 1134
• Identity: 217/1134 - (19%)
• Similarity: 415/1134 - (36%)
• Gaps: 277/1134 - (24%)

  Fly    15 QAIIEELQNLLSSDTGVLQQTEKRIKQLEYTEGYGVYLSEIIMNQAHELPLRQIAIVMLTRYVEN 79
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  Fly     4 QKLTELLRATIDPNPEQRKAAEDQLAQIHKIIGFVPTILQIVMQTTVEQPVRQAGAVYLKNLINS 68

  Fly    80 HWTDDDDVKRKANGCMASEQAKRTIRNILPNGLYDPNSKIRSSVAHTISTIAATDYPHCWAELFD 144
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  Fly    69 SWSDHEAKPGEPIPFSIHEQDRAMIRGAIVDAIVHAPELIRVQLSVCVNHIIKSDFPGRWPQVVD 133

  Fly   145 IIVKCLGGNED--SIHGAM----QVLQDFSYDVEQ----IKELGPVVIPEVYRIF------DSEQ 193
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  Fly   134 SISIYL-QNQDVNGWNGALVTMYQLVKTYEYKRHEERTPLNEAMNLLLPMIYQLMVRLLAEQSEQ 197

  Fly   194 NYSIKTRVSAI------------RILKPLFASIAALITNKEEQSTMMSSILTNFMDKLMHYLSMN 246
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  Fly   198 SVLLQKQILKIYYALTQYTLPLDLITKEIFSQWMEICRQVADRAVPDSSHLDDDERTEFPYWKTK 262

  Fly   247 SGAVSSFLLRTEIIKVFTHLVNEMPK-----YINPFMDRVLPIVWQLLTQIAETYVKVSVNQTET 306
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  Fly   263 KWALHIMVRMFERYGSPSNVVSEKYQKFAEWYLPTFSQGVLEVLLKILDQYR--------NRVYV 319

  Fly   307 SPLASGDSEEDDEQTNFQSLIIQILEFI-NCI---LTCNKLRGSIKNVLADLIYITIVYIQLSEE 367
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  Fly   320 SP----------------RVLTDVLNYLKNAVSHAYTWKLIKPHMVAVIQDVIF-PIMSFTDSDQ 367

  Fly   368 QLEDWHDDPEKFV----DDEDD------GGVELTVRMCGRDVLLAINDEFGANAIQPLQEALGRH 422
            :|  |..||.:::    |..:|      ....|...||.:           ...|.|  :|:...
  Fly   368 EL--WESDPYEYIRLKFDIFEDYATPVPAAQSLLHSMCKK-----------RKGILP--KAMATI 417

  Fly   423 FSVADAEKAANNPNWWKIQEACMDAVHAFRDVILAGDSTFDLLNYLTIVRNLLVHQESPP----- 482
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  Fly   418 MQIITSPNADN-----KQKDGALHMIGTLADVLLKKAS------YRDQVESMLTTYVFPEFQNPA 471

  Fly   483 --LVGRALWTLSIYSKSDLYNPQMLTEILDVTLCSLSPEKSHILRISAVRTLNGFLQANETIDGE 545
              :..||.|.|..:....:.|||:|.||:.:|..:|..:|...:::.|...|..|:.:.:
  Fly   472 GHMRARACWVLHYFCDVQIKNPQVLAEIMRLTTNALLTDKELPVKVEAAIGLQMFISSQD----- 531

  Fly   546 KRTLLVSKLPGFLDGIMALVPGSKAAVLALLMEALTFMVKFDAEFAFASQAKITPLAIAVFLKYT 610
                   :.|.:::          |.:..:..|.||.:.:.:.|       .:|.:...:...:|
  Fly   532 -------EAPQYVE----------AQIKEITKELLTIIRETENE-------DLTNVMQKIVCTFT 572

  Fly   611 ED--PYVLETVQDLIKALCQRKECLGPLQEKFIPTIVSILGLTGAASTEKQDIALDVLNTI---- 669
            |.  |...|..|.|.....|..|                   :...|.||...|:.:||||
  Fly   573 EQLLPVATEICQHLATTFSQVLE-------------------SEEGSDEKAITAMSLLNTIETLL 618

  Fly   670 -VRYTEPPLNNSLLETAFPAIINCVLHTDDHAV-------------------------------M 702
             |....|    .:|....|.:||.|.|...|.:                               .
  Fly   619 SVMEEHP----DVLLNLHPIVINVVGHIFQHNITDFYEETFSLVYDLTAKAISPEMWQMLELIYQ 679

  Fly   703 VAGGECLRSFINVSPEQICSY---------KNGEGINCIMQVVATVLLNP--MNSEMTAAGQIGR 756
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  Fly   680 VFKKDGIDYFIDIMP-ALHNYVTVDTPAFLSNPNRLLAILDMCKTMLTSSPGEDPECHAAKLMEV 743

  Fly   757 LVITIITKMGSMLGQNVDMLLKAVISKMQNLE----CLKVIMNLVLIFAHLFLTQMDAVLNFLST 817
            :::....::.|::...|::.|..:..::|:.|    ||:|:     |.|..:..|:  :|:.|..
  Fly   744 IILQCKGQIDSVIHMFVELALSRLTREVQSSELRTMCLQVV-----IAALYYNPQL--LLSILDK 801

  Fly   818 VPGPNGEPAMQFVLTNWLSRQNSFFGNYERKVTTMALCKLFEYGVATQDNRLTTITFKELVDDPT 882
            :...|.:......:..||...:.|.|.::||:..:.||.|...|.| :...|:.:..|
  Fly   802 MSQQNNDSISAHFIKQWLHDTDCFLGIHDRKLCVLGLCTLISLGEA-KPQVLSEVAGK------- 858

  Fly   883 DTRRRTRSVAATTQKWVTIPALVKIFKVLISEYQ-HFQEGKSDEPLTDSEEDGDD-EDAPGNPD- 944
                             .:|||:.:|..|...|: ..||.:.||    .|||||| |:|..:.:
  Fly   859 -----------------IVPALILLFDGLKRAYESRAQEEEEDE----EEEDGDDCEEALSSDED 902

  Fly   945 -----KPRYISDL----------------FESDEDNAEDEQLLQELLKETNYQGDIADNLQKFLT 988
                 .|.|:..|                .|..:|:|:.:...:|.:.:.|..|     |:.|.|
  Fly   903 DMDEMAPDYLDKLAEFAKTKGNESGFEVKAEIKDDDADSDGDAEESVGDLNETG-----LESFTT 962

  Fly   989 TFTQNEHFPTFYEHLTEGERLILLSKVQQ 1017
            .....|:.....|:.|..|.:..||...|
  Fly   963 PIDDEENESAIDEYWTFKEVITALSAQDQ 991

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Ipo9	NP_650068.1	SXM1	14..891	CDD:227943	180/982 (18%)
		CSE1	17..>424	CDD:227944	81/453 (18%)
msk	NP_524780.1	SXM1	4..1013	CDD:227943	217/1134 (19%)