DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Ipo9 and Ipo9

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_650068.1 Gene:Ipo9 / 41367 FlyBaseID:FBgn0037894 Length:1018 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001100650.1 Gene:Ipo9 / 304817 RGDID:1310537 Length:1041 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1046 Identity:391/1046 - (37%)
Similarity:610/1046 - (58%) Gaps:77/1046 - (7%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    13 VKQAIIEELQNLLSSDTGVLQQTEKRIKQLEYTEGYGVYLSEIIMNQAHELPLRQIAIVMLTRYV 77
            :|:|:::.|..:||....|....|::||.||.||.:||:|:|:.::....|.:||:|.|:|.:||
  Rat    21 LKEALVDTLTGILSPVQEVRAAAEEQIKVLEVTEEFGVHLAELTVDPQGALAIRQLASVILKQYV 85

  Fly    78 ENHWTDDDDVKRKANGCMASEQAKRTIRNILPNGLYDPNSKIRSSVAHTISTIAATDYPHCWAEL 142
            |.||....:..|...   .:|:||..||.:|||||.:..||:|||||:.:|.||..|:|..|.:|
  Rat    86 ETHWCAQSEKFRPPE---TTERAKIVIRELLPNGLRESISKVRSSVAYAVSAIAHWDWPEAWPQL 147

  Fly   143 FDIIVKCL-GGNEDSIHGAMQVLQDFSYDV--EQIKELGPVVIPEVYRIFDSEQNYSIKTRVSAI 204
            |:::::.| .|:.:::||||:||.:|:.:|  .|:..:.||::||:|:||...:.|.|:||..|:
  Rat   148 FNLLMEMLVSGDLNAVHGAMRVLTEFTREVTDTQMPLVAPVILPEMYKIFTMAEVYGIRTRSRAV 212

  Fly   205 RILKPLFASIAALITNKEE-----QSTMMSSILTNFMDKLMHYLSMNSGAVSSFLLRTEIIKVFT 264
            .|    |.:.|.:|.|.||     ...::..::..|.:..:..|.|..|..|....:.|::|..|
  Rat   213 EI----FTTCAHMICNMEELEKGAAKVLIFPVVQQFTEAFVQALQMPDGPTSDSGFKMEVLKAVT 273

  Fly   265 HLVNEMPKYINPFMDRVLPIVWQLLTQIAETYVKVSVNQTE--TSPLASGDSEEDDEQTNFQSLI 327
            .||...||::...|.::|||||..||:.|..||:..||.||  ..|:     :.|.|...|::|:
  Rat   274 ALVKNFPKHMVSSMQQILPIVWNTLTESAAFYVRTEVNYTEEVEDPV-----DSDGEVLGFENLV 333

  Fly   328 IQILEFINCILTCNKLRGSIKNVLADLIYITIVYIQLSEEQLEDWHDDPEKFVDDEDDGGVELTV 392
            ..|.||::.:|..:|.:.::|..|.:|||..|:|:|::|||::.|..:|::||:||||.....||
  Rat   334 FSIFEFVHALLENSKFKSTVKKALPELIYYIILYMQITEEQIKVWTANPQQFVEDEDDDTFSYTV 398

  Fly   393 RMCGRDVLLAINDEFGANAIQPLQEALGRHFSVADAEKAANNPNWWKIQEACMDAVHAFRDVILA 457
            |:..:|:|||:..:|...:...|..|..||...|:..||:...:||||.||||.|:.:.:.:|. 
  Rat   399 RIAAQDLLLAVATDFQNESAVALATAATRHLQEAEQTKASGTEHWWKIHEACMLALGSVKSIIT- 462

  Fly   458 GDST------FDLLNYLT--IVRNLLVHQESPPLVGRALWTLSIYSKSDLYNPQMLTEILDVTLC 514
             ||.      ||:..:||  |:.:|.: ..||.|:|||||..|.::.:  .:|:::.:.|..|:.
  Rat   463 -DSVKNGRIHFDMHGFLTNVILADLNL-SASPFLLGRALWAASRFTVA--MSPELIQQFLQATVS 523

  Fly   515 SLSPEKSHILRISAVRTLNGFLQANETIDGEKRTLLVSKLPGFLDGIMALVPGSKAAVLALLMEA 579
            .|...:...:||||||.:.|:  .::....|...:|...||..|||::.|.....:.||.|:||.
  Rat   524 GLHETQPPSVRISAVRAIWGY--CDQLKVSESTHVLQPFLPSILDGLIHLAAQFSSEVLNLVMET 586

  Fly   580 LTFMVKFDAEFAFASQAKITPLAIAVFLKYTEDPYVLETVQDLIKALCQRKECLGPLQEKFIPTI 644
            |..:...|.||..:.::||.|..||:||||:.||.|....||:.|.|.|.:.|.||:|.:.|||:
  Rat   587 LCIVCTVDPEFTASVESKICPFTIAIFLKYSNDPVVASLAQDIFKELSQIEACQGPMQMRLIPTL 651

  Fly   645 VSILGL------TGAASTEKQDIALDVLNTIVRYTEPPLNNSLLETAFPAIINCVLHTDDHAVMV 703
            |||:..      .|..:|     |:|:|.|:||.|:|||:..|:..||||:..|.|||||:|.|.
  Rat   652 VSIMQAPADKIPAGLCAT-----AIDILTTVVRNTKPPLSQLLICQAFPAVAQCTLHTDDNATMQ 711

  Fly   704 AGGECLRSFINVSPEQICSYKNGEGIN---CIMQVVATVLLNPMNSEMTAAGQIGRLVITIITKM 765
            .||||||::::|:.||:..:.:.:|.|   .:||||:. ||:|..||.||| .:||||.|:|:|.
  Rat   712 NGGECLRAYVSVTLEQVAQWHDEQGHNGLWYVMQVVSQ-LLDPRTSEFTAA-FVGRLVSTLISKA 774

  Fly   766 GSMLGQNVDMLLKAVISKMQNLECLKVIMNLVLIFAHLFLTQMDAVLNFLSTVPGPNGEPAMQFV 830
            |..||:|:|.:|:|::||||..|.|.|:.:|:::||||..||::.:|.||.::|||.|:||::||
  Rat   775 GRELGENLDQILRAILSKMQQAETLSVMQSLIMVFAHLVHTQLEPLLEFLCSLPGPTGKPALEFV 839

  Fly   831 LTNWLSRQNSFFGNYERKVTTMALCKLFEYGVATQDNRLTTITFK--ELVDDPTDTRRRTRSVAA 893
            :..|.|||:.|:|.||.||:::|||||.::|:...|.||..|..|  |:.......|.|::| |.
  Rat   840 MAEWTSRQHLFYGQYEGKVSSVALCKLLQHGINADDKRLQDIRVKGEEIYSMDEGIRTRSKS-AK 903

  Fly   894 TTQKWVTIPALVKIFKVLISEYQHFQEGKSDEPLTDSEEDGDD-----EDAPGNPDKP------R 947
            ..::|..||.||||.|::|:|..:..|..:....|.:|.:.||     ||.....::.      :
  Rat   904 NPERWTNIPLLVKILKLIINELSNVMEANAARQATPAEWNQDDSNDMWEDQEEEEEEEEDGLAGQ 968

  Fly   948 YISDL-----FESD--EDNAEDEQLLQELLKETNYQGDIADNLQKFLTTFTQNEHFPTFYEHLTE 1005
            .:||:     :|.|  ||:.||:   .:.||:..||.|:...|..||..|.|...:..|..||.:
  Rat   969 LLSDILATSKYEEDYYEDDEEDD---PDALKDPLYQIDLQAYLTDFLCQFAQQPCYIMFSCHLND 1030

  Fly  1006 GERLIL 1011
            .||.:|
  Rat  1031 TERRVL 1036

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Ipo9NP_650068.1 SXM1 14..891 CDD:227943 348/905 (38%)
CSE1 17..>424 CDD:227944 150/416 (36%)
Ipo9NP_001100650.1 CSE1 34..812 CDD:227944 306/804 (38%)

Return to query results.
Submit another query.