DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc1 and CG3339

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001287256.1 Gene:Dhc1 / 41171 FlyBaseID:FBgn0287844 Length:4724 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001036762.2 Gene:CG3339 / 43295 FlyBaseID:FBgn0039510 Length:4842 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:5045 Identity:1376/5045 - (27%)
Similarity:2309/5045 - (45%) Gaps:751/5045 - (14%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   113 VPDPNKPGPSRSGVASSSSKTPQGGASPSGM--PPPKHKKLFLT-DGWTCAFTGVCIYIFRVNTS 174
            :|....|....:....:::.:....|:|..:  |.|.....|.| ||   ...|.|.|..|.|||
  Fly   109 IPSAMLPAEDEAMATVTAAVSAVVSATPGALLIPLPPASSSFTTLDG---VPRGKCAYFVRRNTS 170

  Fly   175 -----------------------------------KQLPEEG-------FQKDLYCGVIDAKNIG 197
                                               :.|.|:.       .:|||...:.:.:|  
  Fly   171 DGPLTASNFAESVLYGDFPVHSKIETMSLLFDDVLQPLLEQAQSQWPAIVRKDLQARIKEVRN-- 233

  Fly   198 LVTSIE-RIVEFVFMQALAFPSLEGDEEDVSCGLIKGQLLPGLRSFCSALRVCEQVCDHHNVFAD 261
            .:|.|: :......:..|..|::   .|:|...:.:|.|.|.|                      
  Fly   234 TLTEIKGKTNNRTILSLLVSPTI---VEEVFAHVSQGHLRPAL---------------------- 273

  Fly   262 GCDMFEKIDAVEEVKDMSKNQEFCAQLEERVNNWTKGILKIL---GESEQLRKENDHSG------ 317
                               :.:|...|||...|||..:..|:   .|.:.|......:|      
  Fly   274 -------------------DPKFRNLLEEMFINWTTQMHDIVLERSECQPLGSTTQSAGHQPKYI 319

  Fly   318 -----PQDELEYWKKRGAQFSQLLAHLQDKEVQFTLHCLFLAGSRIIKQWKETDRKITFCYNEAR 377
                 |..|:.:|..|......:...|::...:.....|....|...:.:....||:...:.||:
  Fly   320 TLVSLPAQEIGFWTNRKLNLQNIYEQLRESTHKTLAQILERIESVYYEPYATAFRKLVAAWLEAQ 384

  Fly   378 DNSKFIQAM--ETCC---------HSLYLDDPVSMKESILSLLQTVRLIYSVSQFYNTSERTSAL 431
            |.|.::|.:  :|..         |.|           :..|:..|.|::|.:::|.:::|.|.|
  Fly   385 DVSLWLQPLLRQTAAFNSVQFSNGHDL-----------VAPLVHIVHLVWSNARYYRSTQRMSVL 438

  Fly   432 MVKITNQMIETCKSYITCRCKETIWSQDRNVIRTKLSNCIKLNHIYHETYYTVRE-----QPFLP 491
            :..|.|.::......:..   :.::..|.:....|::..|.:..::.:.....:|     |..||
  Fly   439 LRCICNMLVHRAAEDLEL---QLLFQGDADEGLLKINRTIAVLELFKQRMLDYKERYAGSQVLLP 500

  Fly   492 -----------------NQTPFGFSENFVFGK-FDTFCERLSKIISMFNLIDDYNHLFERRLE-G 537
                             .|..:.|....|||: .|.|..:|.::..:|.....:..|  .:|| |
  Fly   501 ALSEGAAAVASSPSPDDQQQLWRFCHEDVFGQTLDGFSLQLLELRQVFEAAVQFQQL--EKLEVG 563

  Fly   538 LLLGEALEDASNHFEEAKKEVTSRKYDYLDHRNSDFNIDFERFIHKTNSLKDTIAT--------- 593
            .|.|:.|       .|..:|:.           .:|.:.||::.:....|..|:|:         
  Fly   564 GLRGKIL-------TERVREIF-----------GEFKVLFEQWSNVDIDLTATVASKWKCFRREQ 610

  Fly   594 --------LIEKDFDTVWETPQCIRFLVRFEKVSEKIPLTRMDEKYTRILR--YVEKEVDRIL-- 646
                    |:|:...||        .|..||:....:.|.|:...:..:|:  .|..|:.|:|  
  Fly   611 TLFFSRMQLLEQKLATV--------LLQAFEQCHSWMHLLRLTLMFGSLLQREAVRPELARVLPH 667

  Fly   647 -----KTFRKQRDDP----------------PLARNFPPIAGRIHWCRALSLHI----------- 679
                 .|..:|.:|.                |||.||||||..:.|   |..||           
  Fly   668 ILFIYDTEMEQLEDSVGEVLLGYEIRGLAALPLANNFPPIANAMMW---LEQHISRCDEFGAKEL 729

  Fly   680 TELMDAVM-EHVVLSSLPMAKDLDVRYHNVLGILQEYEDEIVSIWLDQDVSVADACLLQPL---- 739
            ::|::.:: |...|.:||:..:..:...|:|  ..:..:..:.||:.....| |..::|.|    
  Fly   730 SQLVEQLLKEKSELQTLPIQWNSLLSRRNIL--TTKLSNLQMKIWISWHECV-DKLIIQGLDESV 791

  Fly   740 LSLQGD--KLFVNLHPTIPLLIREAKMLAKLD---------IELPIVAATLMS-RQQYFITIQDS 792
            ||...|  :|.:|....:..|::|.|.|..|.         .:||....||.. |..|:    :.
  Fly   792 LSRSQDLSQLHLNFSQVLFTLLKETKYLLALQATGSLSGDLFQLPEPLLTLYGHRDAYW----ER 852

  Fly   793 LNCLIKM--FLSTVRAVKLEVRPLFLPQLVR-----LTAMLKPGLHTINWTNQN----------W 840
            ...|||:  |.:.:|:.:.....|   ||:|     :...::.....:.|.|.|          .
  Fly   853 RIRLIKIGEFYNGIRSGECAAAEL---QLIRNDLASIDEHVEVACQQLTWRNYNDELVAGIFEQS 914

  Fly   841 TEFYERCKQAIESFDVLVARV----------HDIYSNRILHVLMWMQDVSLQILPADD------- 888
            .:.:.|.:|:..:.|.::|.:          ..:|...:|.:......|.|::|..|:       
  Fly   915 RDLFARLQQSHGNLDAILASMRRWSREPLHQRSLYGRNLLDLRHQQDRVRLRLLQCDETKMLLNR 979

  Fly   889 -----------------EIW----TVDEFL-ERSEEACRKAAIELNRKSQMVSEAVEEVLSLVDR 931
                             :::    :|.||: |..||..|:....|....:::...|.|.:.:  .
  Fly   980 LLIANFCLFFNYESQEFQLYSRDLSVQEFIREFPEEQRRQYNKYLASVDELICREVREAMRI--S 1042

  Fly   932 ATAAFKEIAGDDVITLFDAATPKGDNSGSGGRK--------PEDGGGGGGGAA-APSTSGGGGGG 987
            ....:||:......|....|.|......:|..:        |:.....|.||: ||.|:...   
  Fly  1043 LEYLYKEMTATATATTTPTAPPVDPGCSAGMARLVLQQITTPQATSTAGAGASGAPPTANDA--- 1104

  Fly   988 QQQDWSILWSCFENPLSLLSTTESLPKGMQDMVCNAVVEMRRYYSRKVIDVLIKVIRAALDTLRR 1052
                     ..||..|.|..|...........|.|..        :::::.|:..|:...|.: .
  Fly  1105 ---------PLFEVKLELTETEIRFSPAFDASVENNF--------QQIVEQLLLDIKQTCDCM-P 1151

  Fly  1053 RFIADENETVFKKPVFALHAQLQIPHVVIKPNLDELQDILVTAGKNITGIAKGVAQWSSGKDPPQ 1117
            |.:||.                       .|:.|:..|...|..      .:...:|...:|..|
  Fly  1152 RIVADN-----------------------APSEDDEDDDTATVD------YEQELRWEPREDRAQ 1187

  Fly  1118 VSMTVQPRVGRNHNESTGGGKSRRRKIYCLASEERPQMPHMLKSFYSAIMDNKEVAKAVNQLASC 1182
            ..                  :.|::|...|..|:....|..::....|      .|||.:|...|
  Fly  1188 EL------------------QERKKKDLELEQEQGDPKPQAVQFNLLA------AAKAYSQKMEC 1228

  Fly  1183 TKNVKPEIQ---------------TYIKRWKPYHFLWKNDRTTRQLMEFGLQEFETTLRCLSDLD 1232
            |.:....::               .|..:::.|.|||     |:|..|......:|.......:.
  Fly  1229 TADGLEMLERAIRDALADTVAAASAYAAKFQAYAFLW-----TQQSSEVLAACMQTAREQTHHVS 1288

  Fly  1233 ANLLVEPDMEVFGQCVAVYNE-----------------------KLKYGLAIEIKSCNHKIGQAM 1274
            |....  .||.|.:.:..|||                       .|||||.......:|     |
  Fly  1289 AGGYA--IMETFKKEIENYNEVHDAIDQCENRECINGWLALDIKPLKYGLLNLACKWSH-----M 1346

  Fly  1275 KKKYKKEMDYVYAVINEMDRKLDRPI---------RDLDDVRMIMETLGKIREQEVDMELRIDPI 1330
            .||:.  :.||...:.|::..:.|..         :|...:..::..:.:|||:|...:....|:
  Fly  1347 CKKWL--LRYVQGTLKELNAFIARGFETLQLHIARQDFATLLRVLAIMSEIREREPYADNVFKPL 1409

  Fly  1331 EEAFNVLTRYEVQVEREQFDLVDNLRATFQNLLAGALQAQVKLLDMQPAFQDDLRT--------- 1386
            :|...:|..|.|:.|.:....::.|...:|.|...:...|..|.|.:  |....|.         
  Fly  1410 KEIMGLLKTYNVEFEPQLLRGIEQLPQQWQQLKHSSTVKQEALQDTR--FHQQQRVTALIGLHTC 1472

  Fly  1387 NLDNFKQ--DKISYVTEYRTAGPMQAGLTPREASDRLILFQNRFEGMWRRLQTYQSGEELFGLPQ 1449
            :|.::.:  .|:.:   :|...|.     ..:..|.:.|..:||.   |:.:.|.....|..:..
  Fly  1473 HLQHYARQFQKMPF---FRVPCPQ-----VYDVCDEVYLRLHRFR---RQQRLYTRWARLLDIQP 1526

  Fly  1450 TDYPELGQIRKELNLLQKLYKLYNDVIDRVSSYYDIPWNEVDIEEINNELMEFQNRCRKLPKGLK 1514
            .|...|.....||..:::|:.....:...:.:::..||..:|.:::.:|..:|....|.|.|.::
  Fly  1527 PDPATLQFCEVELRRVKQLWDFVRVIESCIVAWHATPWLLIDTDDMEHECKKFTRDLRTLDKCIR 1591

  Fly  1515 EW-PAFHALKKTIDDFNDMCPLLELMANKAMKPRHWQRIMDVTRYIFEFDSEGFSLKNILEAPLL 1578
            || |..|.:....:....:..:.||. |.|:..|||..:|.:|:..::. ::...|..:|...|.
  Fly  1592 EWAPYVHIVGVLRELVASLRAITELQ-NPAITERHWMELMQLTKLSYKC-NKSTRLAQLLTLQLQ 1654

  Fly  1579 KHKEDIEDICISAMKEKDIEAKLKQVTNEWSVHELQFMSFNNRGEL-LLRGDTTAETIGQLEDSL 1642
            .|:|||::....|:||..:...|.::...|:..|.:....:.|..: ||:  .:.|.|..|:|:.
  Fly  1655 HHEEDIKNTVDRAIKEMTVTKVLDEIKATWAHLEFELEQHHTRPHIQLLK--VSEELIETLDDNQ 1717

  Fly  1643 MVLGSLLSNRYNAPFRKQIQQWVYDLSNSNEILERWLLVQNMWVYLEAVFVG-GDIAKQLPKEAK 1706
            |.|.::.::::......::..|...|...:.::..|..||..|:|||.:|:| .||..|||.:|.
  Fly  1718 MQLQNISTSKHIEYLLDKLTHWQKVLGGIDTLIVNWFEVQRKWIYLECIFIGSADIRAQLPADAA 1782

  Fly  1707 RFSKIDKSWQKIMQRAHETPGVVACCV-GDDLLKQLLPHLQEQLEICQKSLSGYLERKRMMFPRF 1770
            .|.:||:.:..::.:..|...|:...: .||:|.||| .||.:|.:|:|:|:.|||.||:.||||
  Fly  1783 NFERIDEDFTALLAKVQEVRVVMQVVLRHDDVLAQLL-QLQHRLAVCEKALNDYLETKRLAFPRF 1846

  Fly  1771 FFVSDPALLEILGQASDSHTIQNHLLNIFDNTKSVKF----------HDVEYNKMMAIISSEGEM 1825
            :|:|...||:||...::...|..||:.:||:...:::          |..|.::.:..:|.:.:.
  Fly  1847 YFISAADLLDILSNGNNPQVIDRHLIKLFDSILRLQYETNTPNALGMHSKENDEYVPFVSFDPDQ 1911

  Fly  1826 IQLDRAIRAEGSVETWLTQLLVTAQASLHSIIRTAYATINDPNFTLLSFLEKAPAQIGLLGIQMV 1890
               ...|...|.||.||..::...:::||.:.|.|.....:....|  :|...|||:.|...|:.
  Fly  1912 ---PAFIVCGGRVELWLRAIIQQMRSTLHELFRRALRVFGEKPREL--WLYDWPAQVALCCSQIS 1971

  Fly  1891 WTRDAEMAL--MRGRERKVMMETNNKFLEMLNTLIDQTTRNLTKRERTNFETLITIHVHQRDIFD 1953
            ||.|...:.  |......||.|.:.:.:..||.||:.....|:..:|....|:.||.||.||:..
  Fly  1972 WTADVNRSFGCMEEGYEGVMKELHKRQIAQLNALINLLLGELSPGDRQKIMTICTIDVHSRDVVG 2036

  Fly  1954 ILCRMNIKSANDFEWLKQCRFYFKEDL------------------DKTWISVTDVTFTYQNEYLG 2000
            .:....:.::..|:|..|.|..:.:|.                  :..:.::.|..|.|..||||
  Fly  2037 KIIASKVDNSLAFQWQSQLRHRWDDDQAGSSSGRASTAISCGGGDEDCFANICDAEFRYAYEYLG 2101

  Fly  2001 CTDRLVITPLTDRCYITLAQALTLSMGGAPCGPAGTGKTETVKDMGKTLAKYVVVFNCSDQMDYR 2065
            .|.|||||||||||||||.|:|.|.:.||..||||||||||.||:|:.|...|.|||||:||||:
  Fly  2102 NTSRLVITPLTDRCYITLTQSLRLRLAGATAGPAGTGKTETTKDLGRALGVMVYVFNCSEQMDYK 2166

  Fly  2066 GLGRIYKGLAQSGSWGCFDEFNRIELPVLSVAAQQVAVVLTAKKEKRKTFLFTDGDTIEMNPEFG 2130
            ..|.|||||||:|:||||||||||.:.||||.|.||..:..|.|..:..|:|. |:.|.:.|..|
  Fly  2167 SCGNIYKGLAQTGAWGCFDEFNRICVEVLSVVAVQVKTIQEAIKMHKTQFIFM-GERISLEPSVG 2230

  Fly  2131 IFITMNPGYAGRKELPENLKIQFRTVAMMVPDRQIIIRVKLASCGFLENITLARKFYTLYKLCEE 2195
            ||||||||||||.|||||||..||..||:|||..:|..:.|.:.||.:...|||||.|||.||:|
  Fly  2231 IFITMNPGYAGRTELPENLKTLFRPCAMIVPDFALICEIMLMAEGFQDARLLARKFITLYTLCKE 2295

  Fly  2196 QLTKQVHYDFGLRNILSVLRTLGAAKRRNSKDTESTIVMRVLRDMNLSKLIDDDEPLFMSLVSDL 2260
            .|:||.|||:|||.|.|||...|..||.:....|..::||.|||.|:.|::.:|.|:||.|:.||
  Fly  2296 LLSKQDHYDWGLRAIKSVLVVAGTLKRDDHSRPEDQVLMRALRDFNIPKIVTEDVPIFMGLIGDL 2360

  Fly  2261 FPNQTLEKTNYPELEAAILQQTDEASLVYHPPWVLKLIQLYETQHVRHGIMTLGPSGAGKTTCIH 2325
            ||...:.:....|.|..|.:..:|..|.....:::|::||.|...|||.:..:|.:|.|||....
  Fly  2361 FPALDVPRKRVFEFEKTIRRAVNEIKLQPEEGFLMKVVQLQELLDVRHSVFIVGNAGTGKTKIWQ 2425

  Fly  2326 TLMKAMTQMGDNHREMR-------MNPKAITAAQMFGRLDVATNDWTDGIFSALWRKTLKLKAGE 2383
            ||.       :.:|..:       :||||::..::||.::..|.:|.||:||::.|:...:..|.
  Fly  2426 TLR-------ETYRIQKLKPVCHVLNPKALSNDELFGIVNPTTREWKDGLFSSIMREQANMPPGN 2483

  Fly  2384 HVWLVLDGPVDSIWIENLNSVLDDNKTLTLANGDRLTMAPTVKIIFEPHNIDNASPATVSRNGMV 2448
            ..|:||||.:|.:|||:||:::||||.||||:.:|:::...::::||..::..|:||||||.|::
  Fly  2484 PKWIVLDGDIDPMWIESLNTLMDDNKILTLASNERISLKREMRLLFEVGHLKAATPATVSRAGIL 2548

  Fly  2449 YMSSSGLDSRPIVQAWLKNRAPG-EKSTFSDLFDQTFVEVYNWGVQMVKLQMPVLQCNIVQQMLF 2512
            |::...|...|.|.:||:.|... |:...:.||::.|..:........:: .|:....::|....
  Fly  2549 YINPQDLGWSPYVSSWLETRVDMIERGILNALFEKYFPCLMQRQRDFRRI-TPITDMAMIQMTCH 2612

  Fly  2513 ILEGLIPVKKEDEQAVSMSSKESHDANKRLEHQKHVEEARRQSIGSQIVEDLPPETSIEEKEDTC 2577
            :||.|:...:.:.......|.....||   .|..|..|...:::...                  
  Fly  2613 LLECLLDSDEGNADGRGRGSATGGAAN---PHSLHHGELSHEAMVMA------------------ 2656

  Fly  2578 TPEHLHRLYIFALAWGLGGYLSTS-----DRQRMNLFVKESFPQLDYPKGSAHENTIFDFFVSPA 2637
                |..::::|..|..|..||..     .|:....::.| |..:..|.    :.|:||:.::..
  Fly  2657 ----LETIFVYATVWSFGSALSQDVIIDWHREFHKWWIGE-FKDIKLPS----QGTVFDYQLNVQ 2712

  Fly  2638 GV-WQSWKTLVTPYMYP---ELSTPDYLSILVPIVDNVRIDYLIGTIANQERAVMVIGEQGTGKT 2698
            .: :|.|..|.......   :..|| ..::|:...:.:|:.|.:..:.::..|.|::|..|.||.
  Fly  2713 TLKFQPWSELAAHQSLEGQIDSETP-LQNVLISTAETIRLAYFLKLLIDRNLACMLVGNSGCGKG 2776

  Fly  2699 VIMK-------NFMKKMNV---------ESYMGRSFN--------------------------FS 2721
            .|.:       |..:.:.|         .|:..:|.|                          |:
  Fly  2777 AIFRQLFGQYANDQELLEVAVSAATAGDSSHQQQSGNPAGAVVVRRKASSSATPLLTTVQATHFN 2841

  Fly  2722 SATSPYQFQRTIESYVEKRVGVTFGPPG-GRKLIVFIDDINLPEINEWGDQITNEIVRQSMDMKG 2785
            ..||...||:.::..:||:.|..:.|.| .|:||.|::|:|:||::.:|....:.|:||.||.:.
  Fly  2842 FYTSSEIFQKMLDRPLEKKSGRCYAPSGPKRRLIYFVNDLNMPEVDAYGTVQPHTIMRQFMDYRQ 2906

  Fly  2786 FYSLEKPGDFTTIVDV---QYVAAMGLPGGGRNDIPSRLKRQFCVFNCNIPDNDSIDKIFRVIGE 2847
            :|..::    ..:.|:   |:.|.|. |..|...|..||:|.||||:...|..|::..|:..|..
  Fly  2907 WYDRQR----LQLKDIRHCQFAACMN-PTAGSFTIDPRLQRHFCVFSVAPPGEDTLHHIYGSILS 2966

  Fly  2848 GHYNA-KRGFVPEIRSLVKKLIVVTRHLWQRTREKLLPTPAKFHYVFSLRDLSRIWQGMVGTL-- 2909
            .|..: .:||..||||:...|:.|...|.:|.....|||..||||:|:||||:.|:||::.::  
  Fly  2967 SHLESPSQGFTKEIRSIGSLLVRVGIALHRRVEYAFLPTALKFHYLFNLRDLTGIYQGLMNSVGA 3031

  Fly  2910 -------------STVITSESVLMALWKHECTRVFADRFTTFQDKEWFGSELACLVREELGDSHS 2961
                         .|:.:..|.||.|:.||..||:.||.....|.:.|.|.:..:.:::..|...
  Fly  3032 PASAGGGGASGFGGTICSRPSELMRLYVHEAFRVYHDRLVDPYDIKSFKSSIRDIFKKDFEDFDE 3096

  Fly  2962 QMILPNP-VFVDFMRDAPEPTGEEGEDTDMELPKVYEPVHSHEVLRERLVMFLAQFNEMVRGSGM 3025
            ..:...| ::..|.:..              :.:.|.|:.|.:.|.:.|:...|.:||:|  ..|
  Fly  3097 DFVFAEPLIYSHFAQSL--------------VDQKYMPLKSWDSLYQLLIEAQASYNEVV--GYM 3145

  Fly  3026 DLVFFPDAMLHLVKISRIIRHPRGSVMLVGVGGSGKQSLTKLASFIAGYKTFQIALTRSYNVANF 3090
            :||.|.|||:|:.:|:||:..|||:.:|:||||||||:|.:||:||:.....||.:.|.:.:.:.
  Fly  3146 NLVLFEDAMIHVCRINRILESPRGNALLIGVGGSGKQTLARLAAFISSLNVSQIQIKRGFGLLDM 3210

  Fly  3091 LEDLKLLYRTCGVQGKGTTFLFTDMDIKEEGFLEYLNNILSSGVISNLFSRDEQAEIVQELTPVM 3155
            .|::..||...|::...:.||.:|..|.:|..|..:|::|:||.|..||:.|:...|...:...:
  Fly  3211 REEIGNLYMKVGLKNLASVFLISDAQIPDESILMLINDLLASGEIPELFNDDQLDTITNGIRNEV 3275

  Fly  3156 KRENQRKTATPESVMDFFLARTCTNLHVAFCFSPVGETFRSRVQRFPALVSGCTIDWLHPWPKDA 3220
            |:..  ...|.|:...:|:.:....|.|..||||||:|.|.|.::|||::|...|||.|.|||.|
  Fly  3276 KQSG--TLDTKENCWRYFVEKVRRLLKVVLCFSPVGQTLRVRARKFPAIISRTAIDWFHEWPKSA 3338

  Fly  3221 LVSVARHFLSHFEIECTPAVKEELVNALGSIQDIVAETSQEYFQRFRRATHVTPKSYLNFIAGYK 3285
            |.||::.||:.......||:...:...:..:...|.:.|:.|.|..:|..:.|||::|.:|..|:
  Fly  3339 LESVSQKFLNEINGILEPALVPPIGCFMAYVHGTVNQISRIYLQNEKRYNYTTPKTFLEYIFLYR 3403

  Fly  3286 NIYQMKQQELRDGVEKMDTGLEKLKEASASVEILKKDLVVMEEELVEASKNAESVLVEVTERAMQ 3350
            .:...|..|..:.:.::.:|:.||.|.:..|:.||..|.:.|.:|...:..|:.::|.|   :.:
  Fly  3404 KLLVDKNGEFAERIARLQSGMSKLAECARQVDTLKHQLAIQEVQLAAKNAAADKLIVIV---SAE 3465

  Fly  3351 AEIVKNQVLIVKDKAEALVACIAHEKA----LAEEKLEAAKPALEEAENALNTIKPAHIATVRKL 3411
            :|.||.:..|..:: |..|..|..:.:    :.||.|..|:|||..|:.||||:...::..::..
  Fly  3466 SEKVKRERYIASEE-EKRVRIIEEDVSIKTKMCEEDLRQAEPALVAAQAALNTLNKNNLTELKSF 3529

  Fly  3412 GRPPHLIMRIMDCVLILFKRKLHPCIPDAGTPCPKP-SWQESLKMMASA-TFLLQLQNYPKDTIN 3474
            |.||..::.:...|::|..         :....|:. ||:.|..||... .||..|.||.||.|:
  Fly  3530 GSPPKAVVNVCAAVMVLLA---------SNGKIPRDRSWKASKLMMVRVDQFLNDLLNYNKDNIH 3585

  Fly  3475 DEMIDLLQPYFRMEDYNMDMARRVCGDVAGLLSWTKAMSFFHSVNKEVLPLKANLTMQEARLKLA 3539
            ..:|:.||.|.:..::|.|...:.....|||.:|...:..:|.|...|.|.:..|......|..|
  Fly  3586 PNIIETLQEYLKDPEFNPDKVVQKSVAAAGLCAWVINLHRYHQVFLIVGPKQQALQDSHQELLEA 3650

  Fly  3540 MDDLAGAEEQLREREEALQAVKDQYDKAVGEKQRLTDAANVCLRKMTAATALINGLSDEKHRWTN 3604
            .:.|...:.::...|..|..::.:::.|||||||....|:.....:..|..|:|||::|..||..
  Fly  3651 RERLQYLKAKINNLEAKLAEIQAEFENAVGEKQRCQREADKTAFTIDLAHRLVNGLANENVRWKE 3715

  Fly  3605 QSKEFKIQLGKLVGDVLLATGFLSYCGPYNQEFRANL-IKTWMGILKQ--KNIPFTTGLNIINML 3666
            ..:....::|.|.||:||.:.||||.|.:.:.:|..| .|.|:...::  .:||.|.|::.:.:.
  Fly  3716 SVQSLLAKIGTLPGDILLISSFLSYVGCFTRRYREELQHKMWLPNFRKIDPHIPHTEGVDTLALF 3780

  Fly  3667 VDSSTVSEWTLQGLPNDELSVQNALIATKSSSYPLLVDPQTQGKIWIKCKEDRNELQITSLNHKY 3731
            .|.:.::.|..:|||.|.:|.:||.|...|:.:||::|||.||..||| .....:|.:..|..|.
  Fly  3781 SDDAQIAAWNNEGLPMDRMSTENATILQYSTRWPLMIDPQLQGIKWIK-NRFGTDLVVLRLRQKG 3844

  Fly  3732 FRTHLEDSLSLGRPLLIEDVGIDLDPVIDNVLEKNFIKSGSIEKVLVGDKECDVMPGFMLYITTK 3796
            |...||.|:|.|..:|||.:...:|.|::.:|.:..||.|  ..:.:||||.:....|.|.:.||
  Fly  3845 FLEALEKSISQGDTVLIEQIEESMDTVLEPLLSRALIKKG--RYLRIGDKEIEFHASFRLILHTK 3907

  Fly  3797 LPNPAFSPEVSAKTSIIDFTVTMRGLEDQLLGRVILMEKSDLEAERVALFETVMQN--QRNMKEL 3859
            :.||.:.||:.|:|::|:||||..|||:|||..|:.:|:.|||..:..:  ||.||  :.::|.|
  Fly  3908 MANPHYKPEMQAQTTLINFTVTPDGLEEQLLAEVVKIERPDLEQMKTEV--TVQQNKFKISLKAL 3970

  Fly  3860 EANLLLRLSSSQGSLVDDEALIEVLRVTKTTAEEVNQKLKISEVTERKIMKAREEFRAVAKRGSI 3924
            |..||.||:||..:::||.||:..|..||.|.:|:..|::.:.||..:|...|..:|:.|||.:|
  Fly  3971 EDELLARLASSGENVLDDHALVINLENTKRTVDEIEAKVREARVTTLQIDDTRNIYRSAAKRAAI 4035

  Fly  3925 LYFLIVEMSNVNAMYQNSLKQFLVIFNHSITKSTKSSVTEERINIILRYLTYEVYKFTNRSLYER 3989
            |||::.::|.:|.:|:.|||.|:.:|..:|..:.:|...|:|:..::..:|.:.|::|.|.|:|.
  Fly  4036 LYFVLTDLSRINPIYKFSLKSFMNVFRQAIAMAAESKNYEKRVLHLVESITLQTYRYTLRGLFEA 4100

  Fly  3990 HKQLFTLMLAIKIDYHNGNISHEE--FLTFIKGGASLDLNAVTPKPFRWILDITWLNLVEISKLE 4052
            .|..||..:.::|......::.:|  ||      .....:..|..|..::....|..:..::.:|
  Fly  4101 DKLTFTSHMTLRILIAAEQVAKDETDFL------LRFPHDPTTLSPLDFVGRSAWGGIKSLTLIE 4159

  Fly  4053 TFSTVLQVIELNEKDWRCWYECEKPENEEIPCGYNAILDGFRKLLLIRSWCPDRTISQAKKYIEE 4117
            .|..:.:.:|...|.||.:...:.||.|:.| |........:||.:|||..|||.....::::|:
  Fly  4160 HFYGIDKDMENYTKRWRKFMASDTPEREQFP-GEWKHRTPLQKLCIIRSLRPDRMTYAMRQFVEQ 4223

  Fly  4118 SLGPEYSEMQILDLEEMWLESEPRTPFVCLLSIGSDPTTQIGALAKQ-----KSIVLKSVSMGQG 4177
            ::|..|:|:|......::.|....||...:||.|.||...:....::     :|..|.::|:|||
  Fly  4224 TMGRSYAEIQTPPFGAIFQELNAATPAFFILSPGVDPIRDVERYGQRQGFHSESDTLVNISLGQG 4288

  Fly  4178 QEYHARKMIIESMAIG-GWVLLQNVHLS---LPFCSEIIDMLV-ESEHIDDS-FRMWVTTEP--- 4233
            ||..|.:.||.::..| .||:|||:||.   ||...::|:.:| :||...:| ||::::.||   
  Fly  4289 QELLAEQAIIGALESGQQWVILQNIHLVVNWLPTLEKLIERIVLQSESKGESNFRLFISAEPAPD 4353

  Fly  4234 --HNEFPIGLLQMALKFTNEPPQGIRASLKRSYQSFTQDFLD-YTSATQWPPLLYTVAFLHTIVQ 4295
              ::..|.|:|:.:||..||||.|:.|:|.:::.:|:||.|: .|...::..:|:.:.:.|.:..
  Fly  4354 PQYHVIPQGILESSLKVVNEPPSGMAANLHKAWDNFSQDALETCTQEAEFKSILFALCYFHAVAG 4418

  Fly  4296 ERRKFGPLGWNIPYEFNQADFAASVQFIQNHLDEMDPKKGVSWQTLVYMIGEVQYGGRVTDDFDK 4360
            |||||||.|||..|.||..|...|...:.|:|   :....:.|:.|.|:.||:.|||.:|||:|:
  Fly  4419 ERRKFGPQGWNKVYPFNIGDLTISSNVLHNYL---EGSNRIPWEDLRYLFGEIMYGGHITDDWDR 4480

  Fly  4361 RLLTTFTSVWFCEPLLSNSFEFYKGYKVPGTKSLQGFIDYINSLPAYDTPEVFGLHSNADITYQI 4425
            ||..|:......:.|:...||...|:..|.....:|:..||..:...::|.::|||.||:|.:..
  Fly  4481 RLCQTYLEELLQQDLIDGDFELCPGFPAPPNLDFEGYHSYITEMLPEESPLLYGLHPNAEIGFLT 4545

  Fly  4426 NSAKGILDTILSVQPKEG--GGGGGETRESIVYQLADDMLRKLPAQYNAYEVRENLTRMGILLPM 4488
            .:::.:|.||..:||:|.  ....|..||.:|..:.||.|.||..::|   ::..|.|:....|.
  Fly  4546 TASEQLLRTIFELQPRESELSSHCGAPREELVKIMIDDFLDKLQDEFN---LQALLNRVERKTPF 4607

  Fly  4489 NIFLRQEIDRMQRVIKRVHTCLCDLKLAIDGTIVMSPALKESLDAMYDARIPETWMKISWESTTL 4553
            .:...||.:||..:|:.:...|.:|.|.:.|.:.::..::....|::...:|..|.::::.| .|
  Fly  4608 VVVALQECERMNALIREIKRSLRELMLGLRGELTITQEMERLDHAIFYDHVPAAWARLAYPS-ML 4671

  Fly  4554 GF--WYTELLERNGQFRTWISTDR-PKVFWMTGFFNPQGFLTAMRQEVTRAHKGWALDSVVLQNQ 4615
            |.  |:.:||.|..:...|::..: |...|:.|.||||.||||:.||..|.| ...||.:::...
  Fly  4672 GLQSWFADLLHRIKELAGWLNDFKLPCAIWLGGLFNPQSFLTAIMQESARKH-DLPLDRMLISCD 4735

  Fly  4616 ITRYNKEDITEYPTEGVYVHGLFLEGASLDRRSGKLIESKMKVLYEQMPVIYIYAINTTAGKDPK 4680
            :|:..|:|:|..|.||.:||.|:::|||.|.:...::..:.|.:...||||||.:|.....:..:
  Fly  4736 VTKKQKDDVTLPPMEGAFVHDLYMDGASWDCQLNSIVALRPKEMLCAMPVIYIKSIVQEKQELQR 4800

  Fly  4681 LYECPIYRKPQRTDLKYVGSIDFETEFNPKHWTLRGVALL 4720
            :||||:|:...|.: .||.:.:.:|...|..|.|.|||||
  Fly  4801 VYECPLYKTRSRGN-TYVWTFNLKTRERPSRWILGGVALL 4839

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc1NP_001287256.1 DHC_N1 287..843 CDD:462457 139/691 (20%)
DYN1 1178..4372 CDD:227570 1031/3395 (30%)
DHC_N2 1455..1860 CDD:462462 113/418 (27%)
AAA_6 1994..2321 CDD:463697 173/326 (53%)
Dynein_C 4425..4721 CDD:465677 95/301 (32%)
CG3339NP_001036762.2 DHC_N1 279..903 CDD:462457 138/678 (20%)
DHC_N2 1532..1943 CDD:462462 113/418 (27%)
DYN1 1759..4514 CDD:227570 921/2851 (32%)
AAA_6 2095..2421 CDD:463697 173/326 (53%)
MT 3419..3759 CDD:463699 102/352 (29%)
Dynein_C 4545..4840 CDD:465677 95/301 (32%)

Return to query results.
Submit another query.