DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc1 and Dhc36C

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001287256.1 Gene:Dhc1 / 41171 FlyBaseID:FBgn0287844 Length:4724 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001369131.1 Gene:Dhc36C / 35061 FlyBaseID:FBgn0013810 Length:4065 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:4106 Identity:1212/4106 - (29%)
Similarity:1982/4106 - (48%) Gaps:594/4106 - (14%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly  1001 NPLS---LLSTTESLPKGM---QDMVCNAVVEMRRYY----SRKVIDVLIKVIRAALDTLRR--- 1052
            :|||   |...|:.:|..:   |..:...:.|:|..|    .:.|:|.:::  ...||.|.:   
  Fly   169 SPLSKKILKRITDLVPPLLYKWQTALNENIAEVRADYVFAMKKAVVDFVLR--HTVLDRLTKEGV 231

  Fly  1053 -------------------RFIADENETVFKKPVFALH-------------------------AQ 1073
                               |:..|||..|..|.:|.:|                         |:
  Fly   232 GGKYDTAERREVQSMTNFWRYRYDENRNVLMKTLFCIHRSVASILELWSMKYKDKSLIDSKELAK 296

  Fly  1074 LQIP------------HV------------------VIK-------PNL---------------- 1085
            ::.|            |:                  ::|       |::                
  Fly   297 VESPFSLFTFVYLCGSHIDNGKTLLEESWYGEIHSSLLKASKRGQLPDIRRFTLVKRFFNCVAAL 361

  Fly  1086 --DELQDILVTAGKNITGIAKGVAQWSSGKDPPQVSMTVQPRVGRNHNESTGGGKSRRRKIYCLA 1148
              .:|:||.:   :::...|..:..:.......::|:.:........|.|....:|...::....
  Fly   362 MTQQLEDICI---RSLKEYADFICDYGHSNPGFEISVMLADEDTIQFNPSFSKVQSELLRVIDSI 423

  Fly  1149 SEERPQMPHMLKSFYSAIMDNKEVAKAVNQLASCTKNVKPEIQTYI--KRWKPYHFLWKNDRTTR 1211
            ......:|.:....|:.::.:|::........|..:..|..|...:  :|..|            
  Fly   424 MLSIQMLPRIESKLYTDLIVSKKIFLTPTVPESIVQETKNRICAMLEEQRIGP------------ 476

  Fly  1212 QLMEFGLQEFETTLRCLSDLDANLL---VEPD--MEVFGQCVAVYNEKLKYGLAIEIKSCNHKIG 1271
               |..||:|:..:..::..||..:   :|.|  .|.:...|..|.||                 
  Fly   477 ---ELRLQDFDPFIDLINGSDAERVGNFMESDATFEQYADMVYEYKEK----------------- 521

  Fly  1272 QAMKKKYKKEMDYVYAVIN----EMDRKLDRPIRDLDDVRMIMETLGKIREQEVDMELRIDPIEE 1332
               :.:..||   |:|||.    |..|  |:.|..|:.:...:: |..:.....|.:.||..:.:
  Fly   522 ---EDRIAKE---VWAVIRMGFYEFHR--DKFITHLESLCRQLQ-LDLLARMVTDQQARITRLGK 577

  Fly  1333 AFNVLTRYEVQVEREQFDLVDNLRA----TFQNLLAGALQAQVK--------LLDMQPAFQDDLR 1385
            .::.:.:..:.|.::..:|: .|:|    ..:||:. .::|::|        |:|.......:::
  Fly   578 EYDAIAKKALTVPKDTAELM-QLKAYVVHAEENLVP-EMEARLKVNMSEILWLMDHTLYSPLEIK 640

  Fly  1386 TNLDNFK-QDKISYVTEYRTAGPMQAGLTPRE-ASDRLILFQNRFEGMWRRLQTY---------- 1438
            .|.::|: ..|:..:.|...|...:..:..:| ...|:.||:...:..:.::|||          
  Fly   641 NNSNSFQWYLKLPSIFEQHRAIIAEKVIEYQELLKKRIELFRRELQNYYEQVQTYDTWGDIKQLS 705

  Fly  1439 ---------------------QSGEE--LFGLPQTDYPELGQIRKELNLLQKLYKLYNDVIDRVS 1480
                                 |..||  .:|...:.||...:...:|...:.|:....|.:|:..
  Fly   706 RYKKRAGVLDQRLVQAMETIDQINEEETSYGWDLSQYPMRKKAHDQLKPYKTLFDAGQDFMDKWD 770

  Fly  1481 SYYDIPWNEVDIEEINNELMEFQNRCRKLPKGLKEWP----AFHALKKTIDDFNDMCPLLELMAN 1541
            .:........|.:||:.::..|....:||.|.:.:.|    ....:|..|:.|.:..|::..:.|
  Fly   771 LWMHSQVGSFDPDEIDGDVSNFYRIIQKLDKQMGDHPITMQLIQDVKAQIEAFREHMPIINTLGN 835

  Fly  1542 KAMKPRHWQRIMDVTRYIFEFDSEGFSLKNILEAPLLKHKEDIEDICISAMKEKDIEAKLKQVTN 1606
            ..||.|||:.:.::..:..:...| .:|:.|:|..|.::....|.|..||.||.::|..:.::.|
  Fly   836 PGMKARHWELVSEIIGFPIKVSPE-LTLEKIIEYQLDEYVPKFEAISESATKENNLERAMAKMVN 899

  Fly  1607 EWSVHELQFMSFNNRGELLLRGDTTAETIGQLEDSLMVLGSLLSNRYNAPFRKQIQQWVYDLSNS 1671
            ||...|.....:.:.|...|......:.:  |:|.::...::.|:.|..||...|.:|...|...
  Fly   900 EWEGVEFSISPYRDSGTFKLAAVDDIQIL--LDDQIIKTQTMKSSPYIKPFEADIIKWEAKLMLL 962

  Fly  1672 NEILERWLLVQNMWVYLEAVFVGGDIAKQLPKEAKRFSKIDKSWQKIMQRAHETPGVVACCVGDD 1736
            .|||:.||.||..|:|||.:|...||.:|:|:|.:|||.:||.|:::|::..:.|.|:. .|..|
  Fly   963 QEILDEWLRVQATWMYLEPIFSSPDIQQQMPEEGRRFSAVDKIWKELMKQVSQDPKVMV-VVQID 1026

  Fly  1737 LLKQLLPHLQEQLEICQKSLSGYLERKRMMFPRFFFVSDPALLEILGQASDSHTIQNHLLNIFDN 1801
            .:...|......||:.||.|:.|||:||:.||||||:|:..|||||.:..|...:|.||...|:.
  Fly  1027 KMNDKLKKAYSLLEVIQKGLNAYLEKKRLYFPRFFFLSNDELLEILSETKDPTRVQIHLKKCFEG 1091

  Fly  1802 TKSVKFHDVEYNKMMAIISSEGEMIQLDRAI---RAEGSVETWLTQLLVTAQASLHSIIRTAYAT 1863
            ..::.|  .|...:.|:.|||.|.:.|...|   :|.|.||.||.:|.:..:.|:|..:..|:  
  Fly  1092 IATLNF--TEELDVTAMRSSEREEVTLVDVISTSKARGQVEKWLLELEIDMKKSVHHKVSEAF-- 1152

  Fly  1864 INDPNFTLLSFLEKA-----PAQIGLLGIQMV----WTRDAEMALMRGRERKVMMETNNKFLEML 1919
                 ::.|..|...     |.|.    :|.:    ||.:..........::.:.:...|.:..:
  Fly  1153 -----YSYLKMLRHVWVLTWPGQC----VQSISLTYWTLEITECFESEEPKENLAKYLQKCVLQI 1208

  Fly  1920 NTLIDQTTRNLTKRERTNFETLITIHVHQRDIFDILCRMNIKSANDFEWLKQCRFYFKE-DLDKT 1983
            |.::|....:|..:.|.....|:.:.||.||:...:....::...||:||.|.|:|::: :||..
  Fly  1209 NKIVDLVRGDLNTQNRITLGALVVLDVHARDVLAEIVANQVEDLQDFQWLCQLRYYWEDNNLDTR 1273

  Fly  1984 WISVTDVTFTYQNEYLGCTDRLVITPLTDRCYITLAQALTLSMGGAPCGPAGTGKTETVKDMGKT 2048
            .|   :.:..|..||||.|.|||:||||||||.||..||.|.:||||.||||||||||.||:.|.
  Fly  1274 MI---NCSLPYGYEYLGNTPRLVVTPLTDRCYRTLFAALNLHLGGAPEGPAGTGKTETTKDLAKA 1335

  Fly  2049 LAKYVVVFNCSDQMDYRGLGRIYKGLAQSGSWGCFDEFNRIELPVLSVAAQQVAVVLTAKKEKRK 2113
            :||..|||||||.:||..||:.:||||..|:|.||||||||:|.||||.|||:..:.........
  Fly  1336 VAKQCVVFNCSDGLDYLALGKFFKGLASCGAWSCFDEFNRIDLEVLSVVAQQILTIQRGINSGSP 1400

  Fly  2114 TFLFTDGDTIEMNPEFGIFITMNPGYAGRKELPENLKIQFRTVAMMVPDRQIIIRVKLASCGFLE 2178
            |.:| :|.|:.::|...:|||||||||||.|||:|||..||:|||||||..:|..::|.|.|||.
  Fly  1401 TLVF-EGTTLTLDPTCAVFITMNPGYAGRSELPDNLKALFRSVAMMVPDYALISEIELYSYGFLT 1464

  Fly  2179 NITLARKFYTLYKLCEEQLTKQVHYDFGLRNILSVLRTLGAAKRRNSKDTESTIVMRVLRDMNLS 2243
            ...|:.|....|:||.|||:.|.|||:|:|.:.|||:..||.|.|...:.|..:|:|.::|:||.
  Fly  1465 AKPLSVKIVATYRLCSEQLSTQCHYDYGMRAVKSVLKAAGALKLRYRDENEDILVLRSIKDVNLP 1529

  Fly  2244 KLIDDDEPLFMSLVSDLFPNQTLEKTNYPEL----EAAILQQTDEASLVYHPPWVL-KLIQLYET 2303
            |.::.|.|||..:.|||||...|.:.:|...    :.|..:|..:.:     |:|| |:.||||.
  Fly  1530 KFLNQDIPLFQGITSDLFPGTVLPEADYVLFNKCTQMACERQNKQCT-----PFVLEKVQQLYEM 1589

  Fly  2304 QHVRHGIMTLGPSGAGKTTCIHTLMKAMTQM----GDNHREMR--MNPKAITAAQMFGRLDVATN 2362
            ..||||:|.:|....||||....|.:|:..|    |..::.:.  :||||||..|::|:.|..::
  Fly  1590 IVVRHGLMLVGYPFGGKTTTYRVLAEALECMEKTDGSENKAIYTVINPKAITMGQLYGQFDAVSH 1654

  Fly  2363 DWTDGIFSALWRKTLKLKAGEHVWLVLDGPVDSIWIENLNSVLDDNKTLTLANGDRLTMAPTVKI 2427
            :|:|||.:..:|......:.:..||:.|||||:|||||:|:||||||.|.|.:|:.:.::.|..:
  Fly  1655 EWSDGILAVNYRIFAISDSPDRKWLIFDGPVDAIWIENMNTVLDDNKKLCLMSGEIIQLSNTTNL 1719

  Fly  2428 IFEPHNIDNASPATVSRNGMVYMSSSGLDSRPIVQAWLKNRAPGEKSTFSDLFDQTFVEVYNWGV 2492
            :|||.:::.||||||||.||:|:..|.|...|:|.:| ||..|....|.|.              
  Fly  1720 VFEPMDLEVASPATVSRCGMIYLEPSSLGWEPLVASW-KNTLPAAFHTVSK-------------- 1769

  Fly  2493 QMVKLQM----PVLQCNIVQQMLFILEGLIPVKKEDEQAVSMSSKE---SHDANKRLEHQKHVEE 2550
            |::.:.:    |:|        ||||.              .|.||   :.|||..:......| 
  Fly  1770 QLISMLISRFCPIL--------LFILR--------------KSLKEIAPTSDANLMVSLMNFFE- 1811

  Fly  2551 ARRQSIGSQIVEDLPPETSIEEKEDTCTPEHLHRLYIFALAWGLGGYLSTSDRQRMNL----FVK 2611
                    ..::|...|..:....|.........:::|:..|.|||.|....|::.|:    .::
  Fly  1812 --------CFIDDFRDEKYVANVSDLDFRAQTEGIFLFSCIWSLGGSLDADSREKFNIIFRALME 1868

  Fly  2612 ESFPQLDY----------------------PKGSAHENTIFDF-FVSPA-GVWQSWKTLVTPYMY 2652
            ::|||..|                      ||    :.::||: ::... |.|:.|:..|.    
  Fly  1869 KTFPQSLYDTYGVPEDLYVESLAKPFIFPIPK----QGSVFDYRYIKEGKGKWKPWQDDVN---- 1925

  Fly  2653 PELSTP------DYLSILVPIVDNVRIDYLIGTIANQERAVMVIGEQGTGKTVIMKNFM-KKMNV 2710
               |.|      ....|::...::|||..::..:....:.:|::|..||||:|.:.::| |||::
  Fly  1926 ---SAPPIPRDIPVNQIIIQTNESVRIGAVLDLLNRHGKPIMLVGPTGTGKSVYVIDYMLKKMDL 1987

  Fly  2711 ESYMGRSFNFSSATSPYQFQRTIESYVEKRVGVTFGPPGGRKLIVFIDDINLPEINEWGDQITNE 2775
            ..|.....:||:.||..|.|..|.|.::||....||||...:.::|:||:::|....:|.|...|
  Fly  1988 SFYKPLLISFSAQTSANQTQDIIMSKLDKRRKGVFGPPLNSRFVIFVDDVSMPLKENYGAQPPIE 2052

  Fly  2776 IVRQSMDMKGFYSLEK--PGDFTTIVDVQYVAAMGLPGGGRNDIPSRLKRQFCVFNCNIPDNDSI 2838
            ::|..:|...:|..:.  |   ..::|:|.:.|||.|..| |.:..|.:|.|.|.:.:..:||.:
  Fly  2053 LLRMMLDHMMWYDRKNIVP---MKLIDLQMIVAMGPPSTG-NTVTPRFQRFFNVISIDDFNNDIL 2113

  Fly  2839 DKIFRVIGEGHYNAKRGFVPEIRSLVKKLIVVTRHLWQRTREKLLPTPAKFHYVFSLRDLSRIWQ 2903
            :.||..|...|.:. |||..|....:.:::..|..::...:..|||||||.||:|:|||.||:.|
  Fly  2114 NTIFSKIVLWHLDT-RGFSKEFDPCIDEIVGATLTIYNDAKLNLLPTPAKSHYLFNLRDFSRVIQ 2177

  Fly  2904 GMVGTLSTVITSESV--LMALWKHECTRVFADRFTTFQDKEWFGSELACLVR------------- 2953
            |::  ||....:|.|  :..||.||..||:.||.....|:.|....:...|:             
  Fly  2178 GVL--LSVPEATEDVNSMRRLWVHEVLRVYGDRLVEDADRSWLFENICSTVKSCFNTDPSRLFGR 2240

  Fly  2954 -----EELGDSHSQMILPNPVFVDFMRDAPEPTGEEGEDTDMELPKVYEPVHSHEVLRERLVMFL 3013
                 :.|.:|..:.:    ::.||..  |:      .||     |.|..|...|.||..:..:|
  Fly  2241 LVEKDKSLQESDFRQL----IYCDFTN--PK------ADT-----KNYVEVQDLEELRRVVEAYL 2288

  Fly  3014 AQFNEMVRGSGMDLVFFPDAMLHLVKISRIIRHPRGSVMLVGVGGSGKQSLTKLASFIAGYKTFQ 3078
            .::|.|.: ..|:||.|..|:.||.:|.|||:.||...:|:||||||:||||:|||.|..|:.||
  Fly  2289 VEYNNMSK-KPMNLVLFRFAIEHLSRICRIIKQPRSHALLIGVGGSGRQSLTRLASHICDYELFQ 2352

  Fly  3079 IALTRSYNVANFLEDLKLLYRTCGVQGKGTTFLFTDMDIKEEGFLEYLNNILSSGVISNLFSRDE 3143
            :.:||.|....:.||:|.:.|..|.......|||||:.||:|.|||.::|:|:||.:.|||:.:|
  Fly  2353 VEITRLYGPYEYHEDIKAILRKIGASEMHGVFLFTDVQIKDESFLEDISNLLNSGEVPNLFTNEE 2417

  Fly  3144 QAEIVQELTPVMKRENQ--RKTATPESVMDFFLARTCTNLHVAFCFSPVGETFRSRVQRFPALVS 3206
            :.|:.:::..:.|:.::  :...:|.::.:||:......||:....||:|:..|:|:::||::|:
  Fly  2418 KIEVQEKMAQIDKQRDKAVQTDGSPVALFNFFVTTCKDQLHIVLAMSPIGDALRNRIRKFPSIVN 2482

  Fly  3207 GCTIDWLHPWPKDALVSVARHFLSHFEIECTPAVKEELVNALGSIQDIVAETSQEYFQRFRRATH 3271
            .|||||...||:|||::|:..||:..::  |...:...::..........|.|.::|.|..|..:
  Fly  2483 CCTIDWFQSWPEDALLAVSTRFLASEDL--TALERRTAIDMCMEFHTSTQELSAKFFSRLHRYNY 2545

  Fly  3272 VTPKSYLNFIAGYKNIYQMKQQELRDGVEKMDTGLEKLKEASASVEILKKDLVVMEEELVEASKN 3336
            |||.|||..|..:|.:...|:..:.:...:..||:.:|..|:..|.::::.|:.:|.:|.|||  
  Fly  2546 VTPTSYLELIQTFKALLSQKRNNITNNRNRYLTGISQLDIAAQQVAVMQEQLIALEPKLKEAS-- 2608

  Fly  3337 AESVLVEVTERAMQAEIVKNQVLIVK--DKAEALVACIAHE-KALAEEKLEAAKPALEEAENALN 3398
             |.|..:|.:....:::.:.|..|||  :.|....|.:|.| |...:.||..|.|.||.|..|||
  Fly  2609 -EIVAEQVAKVTADSKLAEEQREIVKLDESAAKEQAAVAQEIKDECDAKLGEALPILESALAALN 2672

  Fly  3399 TIKPAHIATVRKLGRPPHLIMRIMDCVLILFKRKLHPCIPDAGTPCPKPS--------WQESLKM 3455
            |:..|.||.|:.:..||..:..:|:.|.||...|     ||   ..|.||        |..|.::
  Fly  2673 TLTTADIAVVKTMKSPPIGVRIVMEAVCILKDVK-----PD---KVPNPSGLGTVEDYWGPSKRV 2729

  Fly  3456 MASATFLLQLQNYPKDTINDE-MIDLLQPYFRMEDYNMDMARRVCGDVAGLLSWTKAMSFFHSVN 3519
            ::...||..|.|:.||.|..| |..|.|.....|.::.|..:.......||..|..|::.:..|.
  Fly  2730 LSDMKFLDSLLNFDKDNIPVEVMKKLAQRILSNEAFDPDKIKSASTACEGLCRWVIALTKYDVVA 2794

  Fly  3520 KEVLPLKANLTMQEARLKLAMDDLAGAEEQLREREEALQAVKDQYDKAVGEKQRLTDAANVCLRK 3584
            |.|.|.|..|...||....||..|......|.:.|..|.|::...|:.:.:...|......|.:|
  Fly  2795 KIVAPKKLALAEAEATYNAAMKTLNEKLAMLAKVEANLAAIQKILDEQLRQYGILLAEHEACTKK 2859

  Fly  3585 MTAATALINGLSDEKHRWTNQSKEFKIQLGKLVGDVLLATGFLSYCGPYNQEFRANLIKTWMGIL 3649
            :..|..||:||..|:.||:..:|..:.....:.||||:::|.:||.||:..:||.:.|:.|:...
  Fly  2860 LQRAQELISGLGGERTRWSETAKMLQASFKSVTGDVLISSGVVSYLGPFTIDFRVDQIRKWVTKC 2924

  Fly  3650 KQKNIPFTTGLNIINMLVDSSTVSEWTLQGLPNDELSVQNALIATKSSSYPLLVDPQTQGKIWIK 3714
            ....:..|....:..:|.:...:..|.:.|||.|..|:::|::...:..:||::|||.|...|||
  Fly  2925 LNFGVTCTADFQLAVVLGEPVEIRFWNICGLPTDAFSIESAIMMKNARRWPLMIDPQGQANKWIK 2989

  Fly  3715 CKEDRNELQITSLNHKYFRTHLEDSLSLGRPLLIEDVGIDLDPVIDNVLEKNFIKSGSIEKVLVG 3779
            ..|..|:|.:..||...:...:|:::..|.|:|:|::|.:||||:::||:|...|.|....:.:|
  Fly  2990 NYEKNNKLCVIRLNQADYTRVMENAIQFGLPVLLENIGEELDPVLESVLQKTLFKQGGALCIKLG 3054

  Fly  3780 DKECDVMPGFMLYITTKLPNPAFSPEVSAKTSIIDFTVTMRGLEDQLLGRVILMEKSDLEAERVA 3844
            |...:....|..|:||||.||.:.|||:.|.::::|.:|.:||:|||||..:..|:.|||||:..
  Fly  3055 DSVIEYNHSFRFYMTTKLRNPHYLPEVAVKVTLLNFMITTQGLQDQLLGITVARERPDLEAEKNN 3119

  Fly  3845 LFETVMQNQRNMKELEANLLLRLSSSQGSLVDDEALIEVLRVTKTTAEEVNQKLKISEVTERKIM 3909
            |......|:|.:||.|..:|..|||:: ::::||..:::|...|..|.::::|..|:|.||::|.
  Fly  3120 LIVQGADNKRMLKETEDQILEVLSSAE-NILEDETAVQILSSAKALANDISEKQVITEATEKQID 3183

  Fly  3910 KAREEFRAVAKRGSILYFLIVEMSNVNAMYQNSLKQFLVIFNHSITKSTKSSVTEERINIILRYL 3974
            .||..:..:|:..:||:|.|||::|::.|||.||..|:.::..||..:.|......|:..:..:.
  Fly  3184 IARLSYVPIAEHSTILFFTIVELANIDPMYQYSLVWFVNLYMSSIDNTEKVDDIAARLLDLRNHF 3248

  Fly  3975 TYEVYKFTNRSLYERHKQLFTLMLAIKIDYHNGNISHEEFLTFIKGGASLDLNAVTP--KPFRWI 4037
            ||.:|....|||:||.|.||:|:|.|.:..|:..|.:.|::..:.||..|:    .|  .|..|:
  Fly  3249 TYSLYVNICRSLFERDKLLFSLILNINMMKHDNRIDNAEWMFLLTGGVGLE----NPYKNPTTWL 3309

  Fly  4038 LDITWLNLVEISKLETFSTVLQVIELNEKDWRCWYECEKP-ENEEIPCGYNAILDGFRKLLLIRS 4101
            ....|..|..::.|..|..:.:....|...|:.:::.:.| :|::||..::..:..|:||||:|.
  Fly  3310 GVQNWDELCRLTNLTNFKGLREDFNENSAQWKPFFDSKSPQDNKDIPKSWDNRVSVFQKLLLLRV 3374

  Fly  4102 WCPDRTISQAKKYIEESLGPEYSEMQILDLEEMWLESEPRTPFVCLLSIGSDPTTQIGALAKQKS 4166
            :.||:.:.....::...||..:.:....||...:.:|....|.:.:|:.|||||..:...|:.:.
  Fly  3375 FRPDKLVPAVLNFVSGELGERFVDPPQFDLMASFADSHCCVPLIFILTPGSDPTATLLKFAEDQG 3439

  Fly  4167 I---VLKSVSMGQGQEYHARKMIIESMAIGGWVLLQNVHLS---LPFCSEIID-MLVESEHIDDS 4224
            .   .|.|:|:||||...|.|||.|.:.:|.||:|||.||:   :|...:|.: :|.::.|.|  
  Fly  3440 FGTNRLFSLSLGQGQGPIAMKMIDEGVKMGNWVVLQNCHLAASFMPLLEKICENLLPDATHPD-- 3502

  Fly  4225 FRMWVTTEPHNEFPIGLLQMALKFTNEPPQGIRASLKRS-----------YQSFTQDFLDYTSAT 4278
            ||:|:|:.|.:.||:.:||..:|.|||||:|:|:::.||           |:|.||..:      
  Fly  3503 FRLWLTSYPADHFPVVVLQNGIKMTNEPPKGLRSNILRSMISDPISDPEWYESCTQPRI------ 3561

  Fly  4279 QWPPLLYTVAFLHTIVQERRKFGPLGWNIPYEFNQADFAASVQFIQNHLDEMDPKKGVSWQTLVY 4343
             :..|:|::.|.|.::||||.|||:|||||||||:.|...|:..::..|::.:.   |::..|.|
  Fly  3562 -FKQLIYSLCFFHAVIQERRYFGPIGWNIPYEFNETDLRISLMQLRMFLNQYET---VNYDALRY 3622

  Fly  4344 MIGEVQYGGRVTDDFDKRLLTTFTSVWFCEPLLSNSFEFYKG----YKVPGTKSLQGFIDYINSL 4404
            :.||..||||||||:|:|.|.|....::|..::.....:|..    |.||..|.:..::::...|
  Fly  3623 LTGECNYGGRVTDDWDRRTLKTILDKFYCPAVIDLETPYYLDETGLYYVPVFKEVDLYLNFTRDL 3687

  Fly  4405 PAYDTPEVFGLHSNADI------------------------------------------------ 4421
            |....|.:||.|:||||                                                
  Fly  3688 PQISAPAIFGFHANADIMKDQKETDMLLSHTLLTQKLEKKQRVYVETLSRRFPENLSLPTYPTCP 3752

  Fly  4422 ----TYQINSAKGILDTILSVQPKEGGGGGGETRESIVYQLADDMLRKLPAQYNAYEVRENLTRM 4482
                .||::    :.||  |....:.||....|.|.:|..:|.|:|.|||..::         |.
  Fly  3753 PFLALYQMS----LKDT--SASSDDSGGSKALTPEEVVTNVATDILDKLPKLFD---------RD 3802

  Fly  4483 GILL--------PMNIFLRQEIDRMQRVIKRVHTCLCDLKLAIDGTIVMSPALKESLDAMYDARI 4539
            ..||        .||..|.||:.|...::..:.|.|..|:..|.|.:|||||::....::..|:|
  Fly  3803 AALLKYPTLYHQSMNTVLVQEMVRFNVLLNTIRTSLITLRKGIKGLVVMSPAVEAVYKSVLIAKI 3867

  Fly  4540 PETWMKISWES-TTLGFWYTELLERNGQFRTWISTDRPKVFWMTGFFNPQGFLTAMRQEVTRAHK 4603
            |..|...|:.| ..||.:.|:.|.|....:.|.....|..||::|||..|.|||..:|...|.: 
  Fly  3868 PAMWAGKSYPSLKPLGSYVTDFLRRLEFLQHWFDHGAPSTFWLSGFFFTQAFLTGAQQNYARKY- 3931

  Fly  4604 GWALDSVVLQNQITRYNKEDIT---------EYPTEGVYVHGLFLEGASLDRRSGKLIESKMKVL 4659
                   |:...:..::.|.:|         ..|.:||:|:|:|||||..||....|.||:.:.|
  Fly  3932 -------VISIDLLAFDYEVLTVEEPQRQGLSGPEDGVFVYGIFLEGARWDRTGKYLAESRPREL 3989

  Fly  4660 YEQMPVIYIYAINTTAGKDPKLYECPIYRKPQRTDLKYVGSIDFETEF--------NP----KHW 4712
            ::.||:|::..:......:...|.||:|:..:|..:  :.:....|.|        ||    .||
  Fly  3990 FDTMPLIWLKPLKRVDLPERHNYLCPMYKTAERRGV--LSTTGHSTNFVVAMLLLCNPNTPVSHW 4052

  Fly  4713 TLRGVALLCDI 4723
            .:||.||||.:
  Fly  4053 IIRGTALLCQL 4063

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc1NP_001287256.1 DHC_N1 287..843 CDD:462457
DYN1 1178..4372 CDD:227570 1059/3378 (31%)
DHC_N2 1455..1860 CDD:462462 123/411 (30%)
AAA_6 1994..2321 CDD:463697 167/331 (50%)
Dynein_C 4425..4721 CDD:465677 94/325 (29%)
Dhc36CNP_001369131.1 DHC_N2 746..1151 CDD:462462 123/410 (30%)
DYN1 <984..3651 CDD:227570 937/2801 (33%)
AAA_6 1281..1607 CDD:463697 167/331 (50%)
AAA_8 2299..2561 CDD:463701 100/263 (38%)
AAA_9 2948..3168 CDD:463702 80/220 (36%)
Dynein_C 3779..4061 CDD:465677 89/300 (30%)
Blue background indicates that the domain is not in the aligned region.

Return to query results.
Submit another query.