DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc1 and Dhc16F

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001287256.1 Gene:Dhc1 / 41171 FlyBaseID:FBgn0287844 Length:4724 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_523394.1 Gene:Dhc16F / 32785 FlyBaseID:FBgn0283476 Length:4081 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:4165 Identity:1195/4165 - (28%)
Similarity:1982/4165 - (47%) Gaps:544/4165 - (13%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   786 FITIQDSLNCLIKMFLSTVRAVKLEVRPLFLPQLVRLTAMLKPGLHTINWTNQNWTEFYERCKQA 850
            |.|..|......|.|||.:     ::|..   .:.||....|....||.|...|           
  Fly   223 FFTPLDQWQQEFKQFLSII-----QIRSF---SIFRLWKGFKVWEKTIKWRKLN----------- 268

  Fly   851 IESFDVLVARVHDIYSNRILHVLMWMQD-VSLQIL----PADDEIWTVDEFLE---RSEEACRKA 907
             |:.|.|...:..:.......:|....| |.||.|    .::.|.|....|||   |..|...|.
  Fly   269 -EARDYLQNNLFIVIPQLAKAILRMRSDIVQLQRLNFVNVSNIENWHPFYFLETHMRIYEQLHKT 332

  Fly   908 AIELNRKSQMVSEAVEEVLSLVDRATAAFKEIAGDDVITLFDAATPKGDNSGSGGRKPEDGGGGG 972
            ..:                         |:|....   |:|.|.|   |...:.|..|:|...  
  Fly   333 FTD-------------------------FREFIAK---TIFRACT---DAIQARGFYPDDEVN-- 364

  Fly   973 GGAAAPSTSGGGGGGQQQDWSILWSCFENPLSLLSTTES-LPKGMQDMVCNAVVEMRRYYSRKVI 1036
                                      :...|..:....| :.:..:...|..:.....|....|.
  Fly   365 --------------------------YYPSLKKMREAHSFMDRARKRAFCKTLTNFLTYCDMMVY 403

  Fly  1037 DVLIKVIRAALDTLRRRF-IADE----------NETVFKK------------PVFALHAQLQIPH 1078
            .:|.::.:.:.:.|...| :.||          ::.|.|:            |.|....:|....
  Fly   404 QMLYRITKKSFEDLATSFEVHDEVGPSEADINKHDRVDKRIEKQRPQDKPQSPFFLAMLRLLPDR 468

  Fly  1079 VVIKPNLDELQDILVTAGKNITG-IAKGVAQWSSGKDPPQVSMTVQPRV-GRNHNESTGGGKSRR 1141
            :.|:|:    :||:....:.||| |.:.|.:.......|..:...||.: ||.......|.....
  Fly   469 IDIEPS----EDIIRIIFQRITGLILETVLEIHPFTTDPFFTQYTQPSIMGRQEEVLYEGAPDLH 529

  Fly  1142 RKIYCLASE-----ERPQMPHMLKSFYS----------AIMDNKEVAKAVNQLASCTKNVKPEIQ 1191
               |.|.::     .|..|..:::..|.          .|.:|.|:..:.:.....|:.....::
  Fly   530 ---YLLRADIRFQYNRKNMFVLIRKAYERARLYTQRFHQIRENFEIDNSTDPTVLNTERDLQILR 591

  Fly  1192 TYIKRWKPYHFLWKNDRTTRQLMEF---GLQEFETT--------------------LRCLSDLDA 1233
            .|..|:      ..|.|....::|:   ||.:...|                    |..|::.:.
  Fly   592 AYCDRY------CNNVRALDGILEYVFLGLLKLTQTNFKDTVTPVCSRLQNVLATYLPKLAEEET 650

  Fly  1234 NLLVEPDMEVFGQCVAVYNEKLKYGLAIE-IKSCNHKIGQAMKKKYKKEMDYVY---AVINEMDR 1294
            ..|.|...:..|:.....:|.|:....|. :..|:.::....     ..:|||:   .:|.:...
  Fly   651 TRLYEEAQDFHGRICYEPHETLEIVAHIRFLDKCSTELDGIF-----DGIDYVHDLLLIIKDFGI 710

  Fly  1295 KLD----RPIRDLDD-VRMIMETLGKIREQEVDMELRIDPIEEAFNVLTRYEVQVEREQFDLVDN 1354
            .:|    ....|.:| :....|||.:|||:..|.   |:.:|:|                 :.|:
  Fly   711 PIDDDSKEDYMDTEDYLNRTRETLEEIREKRQDF---INRLEDA-----------------MQDD 755

  Fly  1355 LRATFQNLLAGALQA-QVKLLDMQPAFQDDLRTNLDNFKQDKISYVTEYRTAGPMQAGLTPREAS 1418
            :.|..:::...|::| |..|||     .:..|.::.|.....:..:.:.            ||.:
  Fly   756 IAALKEDIHEVAIEALQPWLLD-----ANSNRLSVTNKLDSMLERLNKC------------RETA 803

  Fly  1419 DRLILFQNRFEGMWRRLQTYQSGEELFGLPQTDYPELGQIRKELNLLQKLYKLYNDVIDRVSSYY 1483
            |..:.:|..|:                 :..|.|.|:.....::.:.|.||:.::|..:.::.:.
  Fly   804 DEFLGYQKEFQ-----------------IDLTMYDEMASGFYDIRMRQNLYRTWSDWEESLAEWI 851

  Fly  1484 DIPWNE---VDIEEINNELMEFQNRCRKLPKGLKEWPAFHALKKTIDDFNDMCPLLELMANKAMK 1545
            ...:|.   ||:.|:|::.::   .|.:..|.|.|......|:|:.:.|.:..|::..:.|..::
  Fly   852 VSDFNTLNVVDMVELNSKTIK---NCMQFQKYLPENNIVPVLQKSAEAFKEKLPVIGYLRNPNLR 913

  Fly  1546 PRHWQRIMDVTRYIFEFDSEGFSLKNILEAPLLKHKEDI---EDICI---------SAMKEKDIE 1598
            .|||..|.|:....|      |..|:|    |::..||:   :|:.|         .|..|..:|
  Fly   914 ARHWAEIEDLLNRKF------FQEKDI----LIQTYEDVHAFDDVAIGEALMQISSQATGEVQLE 968

  Fly  1599 AKLKQVTNEWSVHELQFMSFNNRGEL-LLRGDTTAETIGQLEDSLMVLGSLLSNRYNAPFRKQIQ 1662
            ..||.:...|...||..:..::..:: :|.|  |.|....|:||.:.:.::.::::..|.:.::.
  Fly   969 NMLKGIETTWKETELSIVPHHDAKDVFILAG--TEELQAVLDDSNVNINTIAASKFVGPIKSKVD 1031

  Fly  1663 QWVYDLSNSNEILERWLLVQNMWVYLEAVFVGGDIAKQLPKEAKRFSKIDKSWQKIMQRAHETPG 1727
            :|:..:....:..|.|:..|..|:||||:|...||.:|||.|||.|..:|||:::.:::|.:...
  Fly  1032 EWINAMDQFAKTFESWMDCQGAWIYLEAIFASADIQRQLPHEAKMFFTVDKSFKETVRQAKKVAL 1096

  Fly  1728 VVACCVGDDLLKQLLPHLQEQLEICQKSLSGYLERKRMMFPRFFFVSDPALLEILGQASDSHTIQ 1792
            .:......|:.|.|:.: ...|::..:.|..|||.||::||||:|:|:..|||||.|......:|
  Fly  1097 ALPTMSSVDVHKVLVEN-NRLLDLISRGLEAYLEVKRVVFPRFYFLSNDELLEILAQTRIPQAVQ 1160

  Fly  1793 NHLLNIFDNTKSVKFHD--------VEYNKMMAIISSEGEMIQLDRAIRAEGSVETWLTQLLVTA 1849
            .||...||....::|..        |..|.::|.:|.|||.:|..:.::|.|:||.||:::....
  Fly  1161 PHLRKCFDAIYRLEFGSKEGGDGKMVATNDIVAFLSPEGEKLQFGKGLKARGAVEEWLSKVEEAM 1225

  Fly  1850 QASLHSIIRTAYATINDPNFTLLSFLEKAPAQIGLLGIQMVWTRDAEMALMRGRERKVM--METN 1912
            ..|....:|..|...  |......:.:..|.|:.|...|:.|..|.. .:..|:||..:  :|..
  Fly  1226 FVSCKRYMRFGYQCY--PAKEREDWFQDHPNQVVLTVSQVQWAADIH-RIYEGKERNPLNILEKM 1287

  Fly  1913 NKF----LEMLNTLIDQTTRNLTKRERTNFETLITIHVHQRDIFDILCRMNIKSANDFEWLKQCR 1973
            .||    |:.|..|...|.:|::...|.....||||.||.:|...:|....:..|:||.|||..|
  Fly  1288 AKFEIKCLKDLGALAALTRKNISSLLRKILCALITIDVHAKDSVRMLIEKEVCKASDFNWLKMLR 1352

  Fly  1974 FYFKEDLDKTWISVTDVTFTYQNEYLGCTDRLVITPLTDRCYITLAQALTLSMGGAPCGPAGTGK 2038
            ||:.::.:..:..:......|..||||....||:||||||||:.|..|..:.:||||.|||||||
  Fly  1353 FYWADETETVYSRMAAANIPYYYEYLGAGGVLVLTPLTDRCYLCLMGAFQMDLGGAPAGPAGTGK 1417

  Fly  2039 TETVKDMGKTLAKYVVVFNCSDQMDYRGLGRIYKGLAQSGSWGCFDEFNRIELPVLSVAAQQVAV 2103
            |||.||:.|.|||..|||||||.:||:.:||.:.||||.|:|.||||||||::.||||.|||:..
  Fly  1418 TETTKDLAKALAKQCVVFNCSDGLDYKMMGRFFSGLAQCGAWCCFDEFNRIDIEVLSVIAQQLIT 1482

  Fly  2104 VLTAKKEKRKTFLFTDGDTIEMNPEFGIFITMNPGYAGRKELPENLKIQFRTVAMMVPDRQIIIR 2168
            :.|||..:.|.|:| :|..|::|....:|||||||||||.|||:|||..||.::|||||..:|..
  Fly  1483 IRTAKAMRVKRFIF-EGREIKINRSCCVFITMNPGYAGRTELPDNLKALFRPISMMVPDYALISE 1546

  Fly  2169 VKLASCGFLENITLARKFYTLYKLCEEQLTKQVHYDFGLRNILSVLRTLGAAKRRNSKDTESTIV 2233
            |.|.|.||.:...||||...:|:||.:||::|.|||||:|.:.|||...||.||.:....|...:
  Fly  1547 VILYSEGFEDPKILARKMVQMYQLCSQQLSQQNHYDFGMRAVKSVLVMAGALKRASPNQREDITL 1611

  Fly  2234 MRVLRDMNLSKLIDDDEPLFMSLVSDLFPNQTLEKTNYPELEAAILQQTDEASLVYHPPWVLKLI 2298
            :..|||.|:.|.:.||..||..::|||||...|..:.:|.|||::.....:.:|...|..:.|.:
  Fly  1612 IAALRDSNIPKFLADDAVLFRGILSDLFPGVELPDSQHPHLEASLRLGLRQKNLQAVPTTIRKCL 1676

  Fly  2299 QLYETQHVRHGIMTLGPSGAGKTTCIHTLMKAMTQMGDNHRE---------MRMNPKAITAAQMF 2354
            |||||..||.|:|.:||:|.||:..:|.|..|::.:.:|..:         ..|||||:|..:::
  Fly  1677 QLYETMCVRWGVMLVGPTGGGKSVVLHALEFALSHLFENEVQDPNFRPVVIQTMNPKAVTMNELY 1741

  Fly  2355 GRLDVATNDWTDGIFSALWRKTLKLKAGEHVWLVLDGPVDSIWIENLNSVLDDNKTLTLANGDRL 2419
            |.:|:.|.:|.||:.....|....::...|.|::.|||||::||||||:||||||.|.|||.:|:
  Fly  1742 GYVDLKTLEWQDGLLGLAVRTATTVEDEIHQWIMCDGPVDAVWIENLNTVLDDNKMLCLANSERI 1806

  Fly  2420 TMAPTVKIIFEPHNIDNASPATVSRNGMVYMSSSGLDSRPIVQAW----LKNRAPGEKSTFSDLF 2480
            .:...:.::||..::..||||||||.||||:....|...|::..|    :|::.|...:.|.   
  Fly  1807 KLTAWIHMLFEVQDLLQASPATVSRCGMVYVDPGDLGWIPLIDTWREVDMKHKLPAPLAEFC--- 1868

  Fly  2481 DQTFVEVYNWGVQMVKLQMPVLQCNIVQQMLFILEGLIPVKKEDEQAVSMSSKESHDANKRLEHQ 2545
            .|.||..::   :.:|::                                        .||..:.
  Fly  1869 YQLFVGYFD---KALKIE----------------------------------------RKRAVYT 1890

  Fly  2546 KHVEEARRQSIGSQI----------VEDLPPETSIEEKEDTCTPEHLHRLYIFALAWGLGGYLST 2600
            .|      |.:||::          .|.:......||:    ..|.:.:::.:|:.|.:...|..
  Fly  1891 IH------QVLGSKVRLCCELNSAQFEAVKWSAMSEEQ----GKELVTKIFAWAVLWAIASNLKD 1945

  Fly  2601 SDRQRMNLFVKESFPQLDYPKGSA-HEN------TIFDFFVSPAGV-WQSWKTLVTPYMY-PELS 2656
            ::        |.||.: .:.|..| |.|      |::::.:....: |.||..::..::: ||.|
  Fly  1946 AE--------KVSFEE-QWSKAIAQHPNMTLPNFTLWNYRIDLEKMDWGSWIDIMAKFVFDPETS 2001

  Fly  2657 TPDYLSILVPIVDNVRIDYLIGTIANQERAVMVIGEQGTGKTVIMKNFMKKMNVESYMGRSFNFS 2721
               |..:.||.||..:..|:...:..:...|||.|:.|.||||:..:.||:::..:.:....|||
  Fly  2002 ---YYDMQVPTVDTTKYGYVSDLLFKRGMPVMVTGDTGVGKTVLAISCMKRLSQGNVIPVILNFS 2063

  Fly  2722 SATSPYQFQRTIESYVEKRVGVTFGPPGGRKLIVFIDDINLPEINEWGDQITNEIVRQSMDMKGF 2786
            :.||..:.|..||..:|||.....|.|.|:.:||||||:|:|:::.:|.....|::||.:|.|||
  Fly  2064 AQTSSNRTQEMIEGPLEKRKKTQLGAPVGKTVIVFIDDVNMPKLDTYGASPAIELLRQFLDFKGF 2128

  Fly  2787 YSLEKPGDFTTIVDVQYVAAMGLPGGGRNDIPSRLKRQFCVFNCNIPDNDSIDKIFRVIGEGHYN 2851
            |..||. .:..|:||....|...||||||.:..|..|.|.:|:...|:.:::.:||..|..|...
  Fly  2129 YDREKL-YWKEILDVVLGCACAPPGGGRNPLTPRFVRHFALFSLPKPNEETLTQIFNGILRGFLQ 2192

  Fly  2852 AKRGFVPEIRSLVKKLIVVTRHLWQRTREKLLPTPAKFHYVFSLRDLSRIWQGMVGTLSTVITSE 2916
            .   |...:|:|.:.::.....::.|....:||||.|.||:|:|||||:..||::...:.....|
  Fly  2193 T---FSSAVRALSEPMVNACVDVYMRVATVMLPTPDKSHYIFNLRDLSKCIQGILQASNLHYNQE 2254

  Fly  2917 SVLMALWKHECTRVFADRFTTFQDKEWFGSELACLVREELGDSHSQMIL----PNPVFVDFMRDA 2977
            :.::.|:.||.||||.||....:||..|    ..|::|...|..::.::    |..:|.|||...
  Fly  2255 NQILRLFYHETTRVFHDRLINIEDKNIF----KALMKEVCMDHFNRPVINDNEPPILFGDFMVFG 2315

  Fly  2978 PEPTGEEGEDTDMELPKVYEPVHSHEVLRERLVMFLAQFNEMVRGSGMDLVFFPDAMLHLVKISR 3042
             :|..|          ::|:.:..|..|...|..::|.:|.:..|..|.|:.|.|||.|.|:::|
  Fly  2316 -KPKNE----------RIYDEIRDHTKLESVLNDYIADYNSVAVGKQMKLILFQDAMEHTVRLAR 2369

  Fly  3043 IIRHPRGSVMLVGVGGSGKQSLTKLASFIAGYKTFQIALTRSYNVANFLEDLKLLYRTCGVQGKG 3107
            ::|..||:.:||||.|.||||||:|||.:..|..:||.:.|:|::..|.|||::|||..|:..:.
  Fly  2370 LLRSDRGNGLLVGVAGMGKQSLTRLASHVNEYNCWQIEMRRNYDLNAFHEDLRVLYRIAGIDNQP 2434

  Fly  3108 TTFLFTDMDIKEEGFLEYLNNILSSGVISNLFSRDEQAEIVQELTPVMKRENQRKTATPESVMDF 3172
            .|||..|..|.||.|||.:||||:||.:.|||..||..:|:.:.........:....|.:.:..|
  Fly  2435 VTFLLIDSQIVEEEFLEDINNILNSGEVPNLFEGDEFEKIILDARDGCNENRKDDPCTRDDIYKF 2499

  Fly  3173 FLARTCTNLHVAFCFSPVGETFRSRVQRFPALVSGCTIDWLHPWPKDALVSVARHFLSHFEIECT 3237
            |:.|...||||....||||:.||.|.:.||:||:..||||...||.:||.|||...|:    :..
  Fly  2500 FINRVRNNLHVVMSMSPVGDAFRRRCRMFPSLVNCTTIDWFTSWPTEALYSVALGLLT----KIA 2560

  Fly  3238 PAVKEELVNALGSI--QDIVAETSQEYFQRFRRATHVTPKSYLNFIAGYKNIYQMKQQELRDGVE 3300
            |.:::.:..|..::  ...|.:.|.::::..:|..:.||.|||..:..|:|:.::|..|:....:
  Fly  2561 PKMEDRISLASTTVFMHKTVEDASVKFYKEMKRHYYTTPSSYLELLKLYQNLLKIKNMEIIAKRK 2625

  Fly  3301 KMDTGLEKLKEASASVEILKKDLVVMEEELVEASKNAESVLVEVTERAMQAEIVKNQVL----IV 3361
            ::..||.||.|.:..:.::.|:|.||..:|.|.|...:|::..:|:...||:.||..||    ..
  Fly  2626 RIANGLNKLLETNEVIAVMGKELEVMVPQLDEKSAMMKSLVDNLTKETKQADAVKQSVLEDEMNA 2690

  Fly  3362 KDKAEALVACIAHEKALAEEKLEAAKPALEEAENALNTIKPAHIATVRKLGRPPHLIMRIMDCVL 3426
            |:|| |:...|:.:   |.:.||.|.|||.|||.||..:..|.|..::....||.|:...|:.|.
  Fly  2691 KEKA-AVAQAISED---AGKDLEIAMPALREAEEALKGLTKADINELKSFTTPPALVQFCMEAVC 2751

  Fly  3427 ILFKRKLHPCIPDAGTPCPKPSWQESLKMMASATFLLQLQNYPKDTINDEMIDLLQPYFRMEDYN 3491
            ||.           |.   ||:|..:..:||...|:.:|..|.|:.:.::.:..::.|...:|:.
  Fly  2752 ILL-----------GV---KPTWASAKAIMADINFIKRLFEYDKEHMKEDTLKKVKKYIDHKDFV 2802

  Fly  3492 MDMARRVCGDVAGLLSWTKAMSFFHSVNKEVLPLKANLTMQEARLKLAMDDLAGAEEQLREREEA 3556
            .....:|......:..|..:|..|..|.|.|.|........||.||..|..|...:::|...|..
  Fly  2803 PAKFEKVSKVAKSMSMWVISMDKFSKVYKVVEPKIKRKEAAEAELKEVMTVLRQKQKELAAVEAK 2867

  Fly  3557 LQAVKDQYDKAVGEKQRLTDAANVCLRKMTAATALINGLSDEKHRWTNQSKEFKIQLGKLVGDVL 3621
            :|.::|..::...|.|.:.|..::...::..|..|.:.||||:.||....|.....|..:.||||
  Fly  2868 IQGLRDSLEEKQREFQVIQDNVDLTYGRINRAGRLTSALSDEQVRWRETVKSLTGDLACVPGDVL 2932

  Fly  3622 LATGFLSYCGPYNQEFRANLIKTWMGILKQKNIPFTTGLNIINMLVDSSTVSEWTLQGLPNDELS 3686
            :|...::|.|.::.|:|.::...|:...::..||.:...|::.:|.|...:.:|.:.|||.|.:|
  Fly  2933 VAAACVAYLGAFSHEYRRDMSALWVSKCREHKIPSSPEFNLLKVLGDPYEMRQWNVDGLPKDNIS 2997

  Fly  3687 VQNALIATKSSSYPLLVDPQTQGKIWIKCKEDRNELQITSLNHKYFRTHLEDSLSLGRPLLIEDV 3751
            ::|.:.||::..:.|::|||.|...||:..|..|.||:..:........||:::..|.|:|:|::
  Fly  2998 IENGIYATRALRWALMIDPQEQANRWIRNMERANNLQVIKMTDSTMMRVLENAVRQGYPVLLEEI 3062

  Fly  3752 GIDLDPVIDNVLEKNFIKSGSIEKVLVGDKECDVMPGFMLYITTKLPNPAFSPEVSAKTSIIDFT 3816
            ...:||.:..:|::...:......:.:||...|....|.||:|||||||.:.|||....::::|.
  Fly  3063 NETIDPSLRPILQRETYRFEGRTYLKLGDMVIDYDDNFKLYMTTKLPNPHYLPEVCINVTLVNFL 3127

  Fly  3817 VTMRGLEDQLLGRVILMEKSDLEAERVALFETVMQNQRNMKELEANLLLRLSSSQGSLVDDEALI 3881
            ||..|||||||..::.:|...:|.:|..|...:..:::.:..||..:|..|.:|:|:::|||.|:
  Fly  3128 VTESGLEDQLLADIVAIELPAMEIQRNDLVVKINSDKQQLLALEDKVLKLLFNSEGNILDDEELV 3192

  Fly  3882 EVLRVTKTTAEEVNQKLKISEVTERKIMKAREEFRAVAKRGSILYFLIVEMSNVNAMYQNSLKQF 3946
            |.|...|.|:..:..:|..:|.||:.|..:||.:|.:|.||:||||::..::.::.|||.|||.|
  Fly  3193 ETLNDAKETSLIIAARLIDTEETEKVITASRERYRILASRGAILYFVVAGLAEIDPMYQYSLKYF 3257

  Fly  3947 LVIFNHSITKSTKSSVTEERINIILRYLTYEVYKFTNRSLYERHKQLFTLMLAIKIDYHNGNISH 4011
            ..:|.:.:.........|.||:.::......::...:|.|:|.||.:|:.:||:.::...|.::.
  Fly  3258 TQVFCNVLRLDHPPQSVEVRISTLMTDELRAIFDNISRGLFENHKIIFSFLLALSVERQEGRVTE 3322

  Fly  4012 EEFLTFIKGGASLDLNAVTPKPFRWILDITWLNLVEISKLETFSTVLQVIELNEKDWRCWYECEK 4076
            ||||...:|........:.|...: :..|.|.:.:.:.  :.||:....:.         .|.:|
  Fly  3323 EEFLFLSRGPVGNIRTKIQPAKIK-MSQIEWDSCIFLE--DNFSSFFSGLT---------DELDK 3375

  Fly  4077 P------ENEEI---------PCG-YNAILDGFRKLLLIRSWCPDRTISQAKKYIEESLGPEYSE 4125
            |      ||:|:         |.. :|..|..|.||:.|.::...|.:.....|::.::|..::|
  Fly  3376 PFFIQMQENKEVFDFAQTNQPPTDKWNKRLRVFHKLMFISAFRKPRFLLNVVCYLQSTVGKYFTE 3440

  Fly  4126 MQ-ILDLEEMWLESEPRTPFVCLLSIGSDP-------TTQIGALAKQKSIVLKSVSMGQGQEYHA 4182
            .. ...|..::|::...||.:.:||.||||       |||:....|..||     |:||||...|
  Fly  3441 ASGGTQLSSVYLDTSAVTPLIFVLSTGSDPMSGFLKFTTQMQFTDKYYSI-----SLGQGQGPLA 3500

  Fly  4183 RKMIIESMAIGGWVLLQNVHLSLPFCSEI------IDMLVESEHIDDSFRMWVTTEPHNEFPIGL 4241
            ..:|.:|:.:|.||.|||.||:..|...:      :.:.:...|:|  ||:::::.|...|||.:
  Fly  3501 ENLIEKSLRLGHWVFLQNCHLATSFMQTLETIVRNLTLGITKAHVD--FRLYLSSMPIQTFPISV 3563

  Fly  4242 LQMALKFTNEPPQGIRASLKRSYQSFTQDFLD-YTSATQWPPLLYTVAFLHTIVQERRKFGPLGW 4305
            ||.::|.|||||:||:|::..:.....|||.: :.....|..:::.:...|.::.||||||||||
  Fly  3564 LQNSVKITNEPPKGIKANVFGALTDLKQDFFEQHIQNGNWRAIVFGLCMFHAVLLERRKFGPLGW 3628

  Fly  4306 NIPYEFNQADFAASVQ----FIQNH-LDEMDPKKGVSWQTLVYMIGEVQYGGRVTDDFDKRLLTT 4365
            ||.|||:::|....::    ||... |||      :.|:.::|:.|::.:||||||.:|.|.|.|
  Fly  3629 NITYEFSESDRECGLKTLDFFIDREVLDE------IPWEAILYINGDITWGGRVTDYWDLRCLRT 3687

  Fly  4366 FTSVWFCEPLLSNSFEFYKG---YKVPGTKSLQGFIDYINSLPAYDTPEVFGLHSNADITYQINS 4427
            ..:::..:.::...:::.:|   |:.|..|:|..:..|:...|..:.||:||::.||:|.:|...
  Fly  3688 ILTIFSSKRIIQPDYKYCRGDSYYRDPRKKTLTEYSAYVQGFPVLEDPEIFGMNQNANIVFQTKE 3752

  Fly  4428 AKGILDTILSVQPKEGGGGGGETRESIVYQLADDMLRKLPAQYNAYEVRENLTRM---GILLPMN 4489
            ....::|:|..||:.....|......|..|....:.:.|..:.....:.:.|:.:   |.:..:.
  Fly  3753 TAFFINTLLLGQPRSAADEGQAMENEIAQQTIARIQKALATKIKREPIHDTLSVLDAKGQVPSLT 3817

  Fly  4490 IFLRQEIDRMQRVIKRVHTCLCDLKLAIDGTIVMSPALKESLDAMYDARIPETWMKISWES-TTL 4553
            |.|.|||||....:..:|..|.:|..||.|.:|||..|:....|:...::|.:|.|.|:.| ..|
  Fly  3818 IVLVQEIDRFNIALGIIHDSLVNLSKAIKGLVVMSEELENVFKALLSNQVPASWAKRSFLSIKPL 3882

  Fly  4554 GFWYTELLERNGQFRTWISTDRPKVFWMTGFFNPQGFLTAMRQEVTRAHKGWALDSV-----VLQ 4613
            ..:.::...|....:.|.....|:.:|::|||.||.|||.:.|...| .:...:||:     |.:
  Fly  3883 PSYISDFQRRIDFIQQWAENGAPRSYWISGFFFPQSFLTGVLQTYAR-RRVLPIDSLKIDFDVFE 3946

  Fly  4614 NQITRYNKEDITEYPTEG-----------------VYVHGLFLEGASLDRRSGKLIESKMKVLYE 4661
            .::.   ::|..|..|..                 :.|||:|:|.|..|...|.|.::....|:.
  Fly  3947 RELV---QQDFFEMHTNNMSDQKLYGNLPECTDAIINVHGIFIEAARWDLSKGGLCDANFGELFS 4008

  Fly  4662 QMPVIYI---YAINTTAGKDPKLYECPIYRKPQRTDL--------KYVGSIDFETEFNPKHWTLR 4715
            :|||:..   ..|:.|.     .||.|:|:..||:.:        .::.::...:..:|:.|.:|
  Fly  4009 RMPVVRFKPCLEISPTV-----RYEAPLYKTQQRSGVLSTTGHSTNFILAVLLRSHNDPEFWIMR 4068

  Fly  4716 GVALL 4720
            |.||:
  Fly  4069 GTALV 4073

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc1NP_001287256.1 DHC_N1 287..843 CDD:462457 15/56 (27%)
DYN1 1178..4372 CDD:227570 1019/3334 (31%)
DHC_N2 1455..1860 CDD:462462 115/428 (27%)
AAA_6 1994..2321 CDD:463697 167/326 (51%)
Dynein_C 4425..4721 CDD:465677 81/333 (24%)
Dhc16FNP_523394.1 DHC_N2 829..1234 CDD:462462 114/420 (27%)
DYN1 1047..3704 CDD:227570 916/2795 (33%)
AAA_6 1373..1699 CDD:463697 167/326 (51%)
Dynein_C 3750..4073 CDD:465677 80/331 (24%)

Return to query results.
Submit another query.