DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG9492 and Dnah11

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001287256.1 Gene:CG9492 / 41171 FlyBaseID:FBgn0037726 Length:4724 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038934019.1 Gene:Dnah11 / 117253 RGDID:621088 Length:4514 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4893 Identity:1428/4893 - (29%)
Similarity:2295/4893 - (46%) Gaps:563/4893 - (11%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    13 LAMRAEG-----GSSDDDDEEEDQGDILQRRREECERKARRGEMDPRLEFTFQLLIDATQLPRHQ 72
            :|.:.||     ..|:.:|||:::.        |..|:|:|..:|||:.|....|..|...|...
  Rat     1 MAAQEEGTVLRLSPSEQEDEEDEEA--------EAARRAQRFAVDPRVRFLGGRLQQALGFPEET 57

  Fly    73 LMDYIFEGDMLDEINQLFLPNMKNKLLWFYQETDDPEP---TPVPDPNKPGPSRSGVASSSSKTP 134
            ..:|:...|             ..::|..:.|:..|..   :..|          |:.|:|.:.|
  Rat    58 WGEYLESED-------------HRQVLGDFLESSGPASLVFSVAP----------GLLSASPEIP 99

  Fly   135 QGGASPSGMPPPKHKKLFLTDGWTCAFTGVCIYIFRVNTSKQLPEEGFQKDLYCGVIDAKNIGLV 199
            :         ..|||.::.....| ..||               |..|.:.:..|.|.......|
  Rat   100 R---------DVKHKLVYFAKKMT-GSTG---------------ESDFSQTVLFGEIPRSLFTHV 139

  Fly   200 TSIERIVEFVFMQALAFPSL--EGDEEDVSCGLIKGQLLPGLRSFCSALRVCEQVCDHH-NVFAD 261
            |:        |:..:..|.|  :.:.|..||             |.|      |..:|| .:..:
  Rat   140 TA--------FLDEILVPILSNKNNHESWSC-------------FIS------QDVEHHTEIMKN 177

  Fly   262 GCDMF----------------EKIDAVEE---VKDMSKNQEFCAQLEERVNNWTKGILKIL-GES 306
            ...:|                |.||..:.   .:..|..:.....:|..|..|:..|.:|: .:|
  Rat   178 KMHIFRGKMSRRTHLPIPTIAENIDLDQHYSVTRPQSDERRILHAIESVVIKWSHQIQEIIEKDS 242

  Fly   307 EQLRKENDHSGPQDELEYWKKRGAQFSQLLAHLQDKEVQFTLHCLFLAGSRIIKQWKETDRKITF 371
            .|......|..|:.||::|..|......:...||...|...:..|....|..:...|.....:..
  Rat   243 AQPLLSGLHPTPETELDFWTMRHDNLKCIYHQLQAPIVLKMVKILRTRQSSYLPALKGIFTTVEN 307

  Fly   372 CYNEARDNSKFIQAMETCCHSLYLDDPVSMKESILSLLQTVRLIYSVSQFYNTSERTSALMVKIT 436
            ...||||....::.:......|...|.......|..|:.|:.||:|.|:|||:..|...|:.:..
  Rat   308 ALLEARDVELHLRPLRKHIQGLQEADFPQTGILIAPLIHTICLIWSHSKFYNSPARVIVLLQEFC 372

  Fly   437 NQMIETCKSYITCRCKETIWSQDRNVIRTKLSNCIKLNHIYHETYYTVRE---QPFL--PNQTPF 496
            |..|:..::|::   .|.:...:......|:...|.:..::..:::..|.   ..|.  ..|.|:
  Rat   373 NLFIDQARAYLS---PEDLLKGEIEDALEKVQVAIGVLRMFQNSFFKYRRGLTSYFTGDTEQRPW 434

  Fly   497 GFSENFVFGKFDTFCERLSKIISMFNLIDDYNHLFERRLE-----GLLLGEALEDASNHFEEAKK 556
            .|..:.||.:|:.|.:||.||..||..|.::..|  .|||     |.:|...:......|.|...
  Rat   435 DFQSHLVFSRFNKFLDRLVKIEDMFVTILEFEKL--ERLEFGGSKGAVLNAQIHSMKEEFIECCN 497

  Fly   557 EVTSRKYDYLDHRNSDFNIDFERFIHKTNSLKDTIATLIEKDFDTVWETPQCIRFLVRFEKVSEK 621
            ......||..|..:.:|..|:.:|..||......:.||:.:............:.|..|....||
  Rat   498 VFRQSIYDPSDCDSMEFESDYFQFKSKTLDFDRRLGTLLCEGLSNCSGLESAFKLLTIFGNFLEK 562

  Fly   622 -IPLTRMDEKYTRILRYVEKEVD---RILKTFRKQ--RDDPPLARNFPPIAGRIHWCRALS---- 676
             :.:......|:.:|.....|:|   |:.....||  .....|.:|.|..:|.|.|.|.|.    
  Rat   563 PVVMEIFSPHYSTLLNMFNAELDMCKRLYDEHMKQIEHGHEILNKNMPFTSGNIKWARMLLERLQ 627

  Fly   677 ---LHITELMDAVMEHVVLSSLPMAKDLDVRYHNVLGILQEYEDEIVSIWLDQDVSVADACLLQP 738
               .:.|.|      |.:....|....:..:|..:..:|.::|..|.|.|........:..|.||
  Rat   628 MFWSNFTSL------HYLFPDSPDEAAVCQKYAEMTTLLDQFESRIYSEWRRNVDKTCEFNLNQP 686

  Fly   739 LLSLQ--GDKLFVNLHPTIPLLIREAK---MLAKLDIELPIVAATLMSRQQYFITIQDSLNCLIK 798
            |:...  ...|.||..|.:..::||.|   ||.|.:|  |..|..:..::...:....:|..|::
  Rat   687 LVKFSPINGLLSVNFDPKLVAVLREVKYLLMLKKSNI--PDSALGIFQKKNIILKHIGNLELLVQ 749

  Fly   799 MFLSTVRAVKLEVR-PLFLPQLVRLTAMLKPGLHTINWTNQNWTEFYERCKQAIESFDVLVARVH 862
            .: :.::...|||. ||...:|..:...|:.....:.|.:..|. :.|:.:.|...   |..||.
  Rat   750 GY-NKLKQTLLEVEYPLIEKELGAIDEQLRVAATWLTWQDDFWV-YMEKVQVATAE---LERRVS 809

  Fly   863 DIYSNRILHVLMWMQDVSLQILPADDEIWTVDEFLERSEEACRKAAIELN-------RKSQMVSE 920
            ...||             :|.:....:.|.....|.| .|..|:||:.|:       :|.:::.|
  Rat   810 QTQSN-------------VQTIQQTMQAWAEWPLLPR-RETRREAALTLDDKGDLFAKKYKLIRE 860

  Fly   921 AVEEVLSLVDRATAAFKEIAGDDVITLFDAATPKGDNSGSGGRKPEDGGGGGGGAAAPSTSGGGG 985
            ...::.:||:.....|:             |.|..|:                            
  Rat   861 DGYKIHNLVEENRKLFR-------------ADPSLDS---------------------------- 884

  Fly   986 GGQQQDWSILWSCFENPLSLLSTTESLPKGMQDMVCNAVVEMRRYYSRKVIDVLIKVIRAALDTL 1050
                  |.|                             .||   :....|::...:.|...||. 
  Rat   885 ------WKI-----------------------------YVE---FIDDIVVEGFFQTILHDLDF- 910

  Fly  1051 RRRFIADENETVFKKPVFALHAQLQIPHVVIKPNLDELQDILVTAGKNITGIAKGVAQWSSGKDP 1115
               |:.:..:.:...|.|.....|..|.:|.||.|:.      .||.....:.:.:.   .|   
  Rat   911 ---FLRNTEKQLKPAPFFQAQMLLMPPEIVFKPPLER------EAGDGFYNLVEAML---CG--- 960

  Fly  1116 PQVSMTVQPRVGRNHNESTGGGKSRRRKIYCLASEERPQMPHMLKSFYSAIMDNK-EVAKAVNQL 1179
               |..|..::||                  :|:       |:....|...|||. .:|:...::
  Rat   961 ---SFKVSAQMGR------------------VAA-------HLDIPDYQNDMDNMLGLAEVRQEI 997

  Fly  1180 ASCTKNVKPEIQTYIKRWKPYHFLWKNDRT--TRQLMEFG---------------------LQEF 1221
            .:...:|..::..:....:.|.:||.:||.  .||.:.:|                     |::|
  Rat   998 MNRVADVIDKVLEFRSSLETYSYLWVDDRVEILRQFLLYGHAVPSEEIDAPAGEDILQSPTLEQF 1062

  Fly  1222 ETTLRCLSDLDANLLVEPDMEVFGQCVAVYNEKLKYGLAIEIKSCNHKIGQAMKKKYKKEMDYVY 1286
            :..:.....|...:....|..||.....:.....|..:...||..:....:.:.:.....:..:.
  Rat  1063 KEQIDIYEALYVQMSKFDDFRVFNSWFKIDMRPFKLSMLNVIKKWSWMFQEHLLRFVVDSLSELQ 1127

  Fly  1287 AVINEMDRKLDRPIR--DLDDVRMIMETLGKIREQEVDMELRIDPIEEAFNVLTRYEVQVEREQF 1349
            ..|.:.:..|.|...  |.|.:..||..|..:|.::...:...:|::|...:|..|..::..:.:
  Rat  1128 GFIKQTNAGLQRQPHEGDHDGLVDIMGHLLAVRSRQRATDELFEPLKETIMLLESYGQKMPEQVY 1192

  Fly  1350 DLVDNLRATFQNLLAGALQAQVKLLDMQPAFQDDLRTNLDNFKQDKISYVTEYRTAGPMQAGLTP 1414
            ..::.|...::.....|...:.::..:|.|....||.....|.:.:..:...:|:..|:  |...
  Rat  1193 AQLEELPERWETTKKIAAVVRHEVSPLQNAEVTLLRKKCILFDEKQAEFRERFRSYAPL--GFKA 1255

  Fly  1415 REASDRLILFQNRFEGMWRRLQTYQSGEELFGLPQTDYPELGQIRKELNLLQKLYKLYNDVIDRV 1479
            ......|.......|.:...:...|:...||.:...:|.::.|.|:|:.||::|:.:...|...:
  Rat  1256 ENPYSVLDKANQELEALEEEVVQMQNCARLFEVVLPEYKQMKQCRREVRLLKELWDIIVYVRRSI 1320

  Fly  1480 SSYYDIPWNEVDIEEINNELMEFQNRCRKLPKGLKEWPAFHALKKTIDDFNDMCPLLELMANKAM 1544
            .::.:..|.:|::|:::.||..|......|.|.::.|.|:..|:.|:.|.......:..:.|.|:
  Rat  1321 DNWTETRWRQVNMEQMDLELRRFAKEIWSLDKAVRVWDAYSGLEGTVKDMTTSLRAVAELQNPAL 1385

  Fly  1545 KPRHWQRIMDVTRYIFEFDSEGFSLKNILEAPLLKHKEDIEDICISAMKEKDIEAKLKQVTNEWS 1609
            :.||||::.:.....|.. ::..:|.::|...|.:.:||:.||...|:||...|..:..|::.|.
  Rat  1386 RDRHWQQLTNAIGVRFSI-NDSTTLADLLAVQLHQVEEDVRDIVDKAVKELGTEKVITDVSHTWE 1449

  Fly  1610 VHELQFMSFNNRGELLLRGDTTA-ETIGQLEDSLMVLG------------------------SLL 1649
            ..|..:...:..|..||:.|... ||:...:..|:.||                        :||
  Rat  1450 ALEFSYEVHHRTGTPLLKSDEQLFETLEHNQSFLLGLGTSWLATEPLGSAYSHAGILQVQLQTLL 1514

  Fly  1650 SNRYNAPFRKQIQQWVYDLSNSNEILERWLLVQNMWVYLEAVFV-GGDIAKQLPKEAKRFSKIDK 1713
            .::|...|..|:..|...|:.::.::..|:.||..|.:||::|| ..||..||.::|:||.::|.
  Rat  1515 QSKYVEYFIDQVLSWQNKLNVADAVIFTWMQVQRTWSHLESIFVCSEDIRIQLVEDAQRFDEVDA 1579

  Fly  1714 SWQKIMQRAHETPGVV-ACCVGDDLLKQLLPHL-------QEQLEICQKSLSGYLERKRMMFPRF 1770
            .::::|.:..:...|: |.|         .|||       |.:|.:|:|:|:.|||.||:.|.||
  Rat  1580 EFKELMFKTAKIKNVLEATC---------RPHLYEKLKDFQHRLSLCEKALAEYLETKRVTFSRF 1635

  Fly  1771 FFVSDPALLEILGQASDSHTIQNHLLNIFDNTKSVKFHD---VEYNKMMAIISSEGEMIQLDRAI 1832
            :|:|...||::|.:.:....:..||:.:||:...::|.|   |...|.:.:.|.|.|.:......
  Rat  1636 YFISSADLLDLLSKGAQPKQVTRHLVKLFDSISDLQFEDNPEVSTCKAVGMFSKEKEYVSFQAGC 1700

  Fly  1833 RAEGSVETWLTQLLVTAQASLHSIIRTAYATINDPNFTLLSFLEKAPAQIGLLGIQMVWTRDAEM 1897
            ...|.||:||.||..|.:.::...|..|.|...:....|..|  ..|||:.|.|.|:.||.|..:
  Rat  1701 ECIGHVESWLLQLEQTMKETVRLAIAEAIAAYEEKPRELWIF--DFPAQVALTGSQIWWTTDVGI 1763

  Fly  1898 ALMRGRE--RKVMMETNNKFLEMLNTLIDQTTRNLTKRERTNFETLITIHVHQRDIFDILCRMNI 1960
            |..|..|  ...:.:.:.|.:..|||||......|:..:|....|:.||.||.||:...|....:
  Rat  1764 AFSRLEEGYETALKDFHKKQISQLNTLITLLLGELSPGDRQKVMTICTIDVHARDVVAKLISQKV 1828

  Fly  1961 KSANDFEWLKQCRFYFKEDLDKTWISVTDVTFTYQNEYLGCTDRLVITPLTDRCYITLAQALTLS 2025
            .|...|.||.|.|..::|......:::.|..|.|..||||.:.|||||||||||||||.|:|.|:
  Rat  1829 VSPRAFTWLSQLRHEWEESRKHCIVNICDAHFQYCYEYLGNSPRLVITPLTDRCYITLTQSLHLT 1893

  Fly  2026 MGGAPCGPAGTGKTETVKDMGKTLAKYVVVFNCSDQMDYRGLGRIYKGLAQSGSWGCFDEFNRIE 2090
            |.|||.||||||||||.||:|:.|...|.|||||:|||||.:|.|||||.|:|:||||||||||.
  Rat  1894 MSGAPAGPAGTGKTETTKDLGRALGMMVYVFNCSEQMDYRSIGNIYKGLVQTGAWGCFDEFNRIA 1958

  Fly  2091 LPVLSVAAQQVAVVLTAKKEKRKTFLFTDGDTIEMNPEFGIFITMNPGYAGRKELPENLKIQFRT 2155
            :.||||.|.||.::..|.:.:|:.|:|. |:||.:.|..|||||:|||||||.|||||||..||.
  Rat  1959 VEVLSVVAVQVKMIHDAIRSRRRRFVFL-GETIPLKPSVGIFITLNPGYAGRTELPENLKALFRP 2022

  Fly  2156 VAMMVPDRQIIIRVKLASCGFLENITLARKFYTLYKLCEEQLTKQVHYDFGLRNILSVLRTLGAA 2220
            .||:.||.::|..:.|.:.||::..:|||||.:||.||:|.|:||.|||:|||.|.|||...|:.
  Rat  2023 CAMVAPDTELICEIMLVAEGFVDARSLARKFISLYTLCDELLSKQDHYDWGLRAIKSVLVVAGSL 2087

  Fly  2221 KRRNSKDTESTIVMRVLRDMNLSKLIDDDEPLFMSLVSDLFPNQTLEKTNYPELEAAILQQTDEA 2285
            ||.:....|..::||.|||.|:.|::.||.|:|:.|||||||...:.:...|..|..:.|.|.|.
  Rat  2088 KRGDKNRPEDQVLMRALRDFNMPKIVTDDVPVFLGLVSDLFPALDVPRQRKPHFEQMVKQSTLEL 2152

  Fly  2286 SLVYHPPWVLKLIQLYETQHVRHGIMTLGPSGAGKTTCIHTLMKAMTQMGDNHREMRMNPKAITA 2350
            .|.....::||::||.|...|||.|..:|.:|.||:..:.||.:....|........:||||:|.
  Rat  2153 RLQPEESFILKVVQLEELLAVRHSIFVVGNAGTGKSKILRTLNRTYVNMKQKPVWNDLNPKAVTT 2217

  Fly  2351 AQMFGRLDVATNDWTDGIFSALWRKTLKLKAGEHVWLVLDGPVDSIWIENLNSVLDDNKTLTLAN 2415
            .::||.:..||.:|.||:.|::.|:...|......|:||||.:|.:|||:||:|:||||.||||:
  Rat  2218 DELFGFIHHATREWKDGLLSSILREQANLTHDGPTWIVLDGDIDPLWIESLNTVMDDNKVLTLAS 2282

  Fly  2416 GDRLTMAPTVKIIFEPHNIDNASPATVSRNGMVYMSSSGLDSRPIVQAWL-KNRAPGEKSTFSDL 2479
            .:|:.:.|:::::||.|::..|:||||||.|::|::...|...|.|.:|: :.|...||:..:.|
  Rat  2283 NERVALTPSMRLLFETHHLQTATPATVSRAGILYVNPQDLGWNPYVASWIDRRRHQSEKANLTIL 2347

  Fly  2480 FDQTFVEVYNWGVQMVKLQ------MPVLQCNIVQQMLFILEGLIPVKKEDEQAVSMSSKESHDA 2538
            ||: ::.|.     :.||:      ..|.:.::||.:..:||.|:    ..|...|.|.||:::.
  Rat  2348 FDK-YIPVC-----LEKLRTSFKAITSVPESSLVQTICTLLECLL----TPENIPSDSPKETYEV 2402

  Fly  2539 NKRLEHQKHVEEARRQSIGSQIVEDLPPETSIEEKEDTCTPEHLHRLYIFALAWGLGGYL---ST 2600
                                                          .::||..|..||.|   ..
  Rat  2403 ----------------------------------------------YFVFACVWTFGGTLLRDQL 2421

  Fly  2601 SDRQR-MNLFVKESFPQLDYPKGSAHENTIFDFFVS-PAGVWQSWKTLVTPYMYPELSTPDYLSI 2663
            ||.|. .:.:..:....:.:|.    :.||||:::. ....:..|...| |....:...| ..::
  Rat  2422 SDYQADFSRWWHKEMKAVKFPS----QGTIFDYYLDHKTKKFLPWTDKV-PQFTMDADAP-LKTV 2480

  Fly  2664 LVPIVDNVRIDYLIGTIANQERAVMVIGEQGTGKTVIMKNFMKKMNVESYMGRSFNFSSATSPYQ 2728
            ||...:..|:.|....:.|:.:.:|::|..|.||||.:.:.:..:: |.|:.....|:..|:...
  Rat  2481 LVHTPETTRLRYFTELLLNKGKPLMLVGNAGVGKTVFLSDTLASIS-EDYIVSRVPFNYYTTSAD 2544

  Fly  2729 FQRTIESYVEKRVGVTFGPPGGRKLIVFIDDINLPEINEWGDQITNEIVRQSMDMKGFYSLEKPG 2793
            .||.:|..:||:.|..:||.|.:||:.||||:|:||::.:|....:.::||.:|...:|...|. 
  Rat  2545 LQRILEKPLEKKAGRNYGPRGNKKLVYFIDDLNMPEVDLYGTVQPHALLRQHIDYGHWYDRHKV- 2608

  Fly  2794 DFTTIVDVQYVAAMGLPGGGRNDIPSRLKRQFCVFNCNIPDNDSIDKIFRVIGE--GHYNAKRGF 2856
            ....|.:.||||.|. |..|...:..||||.|.|...|.|   |:|.:..:.|:  ..|..::.|
  Rat  2609 MLKEIRNCQYVACMN-PMAGSFTVDPRLKRHFTVLAFNFP---SLDTLTTIYGQIFSFYLQQQAF 2669

  Fly  2857 VPEIRSLVKKLIVVTRHLWQRTREKLLPTPAKFHYVFSLRDLSRIWQGMVGTLSTVITSESVLMA 2921
            .|.:......||..|....|...|..:||..||||.|:|||||.|:||::......:.....|..
  Rat  2670 CPSVLRTGPSLIQATIAFHQTMAENFVPTAIKFHYNFNLRDLSNIFQGILFASPECLKCPEDLAR 2734

  Fly  2922 LWKHECTRVFADRFTTFQDKEWFGSELACLVREELGDSHSQMILPNP-VFVDFMRDAPEPTGEEG 2985
            ||.||.:||:.||.....|.:.|..::.....:....:.:..:...| |:..|.....:|     
  Rat  2735 LWLHETSRVYGDRLVDANDSDLFQRKMLEAAHKYFKGADANTLQQQPLVYCHFASGREDP----- 2794

  Fly  2986 EDTDMELPKVYEPVHSHEVLRERLVMFLAQFNEMVRGSGMDLVFFPDAMLHLVKISRIIRHPRGS 3050
                     .||||...|.|:..|...:..:||:  .|.|.||.|.|||.|:.:||||:|.|:|.
  Rat  2795 ---------CYEPVKDWEGLKAVLTEMMGNYNEL--HSEMHLVLFEDAMQHVCRISRILRTPQGH 2848

  Fly  3051 VMLVGVGGSGKQSLTKLASFIAGYKTFQIALTRSYNVANFLEDLKLLYRTCGVQGKGTTFLFTDM 3115
            .:||||||||||||::||::|...:.|||.||..|...:...||..||...|.:...|.||.||.
  Rat  2849 ALLVGVGGSGKQSLSRLAAYICSLEVFQITLTEGYGTQDLRVDLANLYVRTGAKNMPTVFLLTDA 2913

  Fly  3116 DIKEEGFLEYLNNILSSGVISNLFSRDEQAEIVQELTPVMKRENQRK---TATPESVMDFFLART 3177
            .:.:|.||..:|::|:||.|..|||.::..:|:..:     |...|.   |.:.|:...|||||.
  Rat  2914 HVLDESFLVLINDLLASGDIPGLFSDEDTDKIISGI-----RNEVRGLGITDSRENCWAFFLARV 2973

  Fly  3178 CTNLHVAFCFSPVGETFRSRVQRFPALVSGCTIDWLHPWPKDALVSVARHFLSHFE-IECTPAVK 3241
            ...|.:.|||||||.|.|.|.::|||||:...|||.|.||::|||||:|.|:...| ||  |..|
  Rat  2974 RLQLKMVFCFSPVGHTLRVRARKFPALVNCTAIDWFHAWPQEALVSVSRRFIEEIEGIE--PQHK 3036

  Fly  3242 EELVNALGSIQDIVAETSQEYFQRFRRATHVTPKSYLNFIAGYKNIYQMKQQELRDGVEKMDTGL 3306
            :.:...:..:...|.|.|..|:|..||..:.||:|:|..|:.:|::.:.|:.|::...|.:..|:
  Rat  3037 DSISLFMAYVHTSVKEVSAWYYQNERRYNYTTPRSFLEQISLFKSLLKKKRGEVQRKKEHLGNGI 3101

  Fly  3307 EKLKEASASVEILKKDLVVMEEELVEASKNAESVLVEVTERAMQAEIVKNQVLIVKDKAEALVAC 3371
            :||:..::.|..||..|...|.||...:::||::   :|:..:|.|.|..:..|. |..|..||.
  Rat  3102 QKLQTTASQVGNLKARLASQEAELQLRNQDAEAL---ITKIGLQTEKVSREKAIA-DAEERKVAA 3162

  Fly  3372 IAHEKALAEEKLEA----AKPALEEAENALNTIKPAHIATVRKLGRPPHLIMRIMDCVLILFKRK 3432
            |..|.:..:.:.||    |:|||..|..||||:...::..::....||:.:..:...|::|.   
  Rat  3163 IQTEASQKQRECEADLLKAEPALVAATAALNTLNRVNLTELKTFPNPPNAVTNVTAAVMVLL--- 3224

  Fly  3433 LHPCIPDAGTPCPKPSWQESLKMMASA-TFLLQLQNYPKDTINDEMIDLL-QPYFRMEDYNMDMA 3495
                .|....|..: ||:.:...|... .||..|.||.|:.|.:..:.:: :.|.:..::|.::.
  Rat  3225 ----APRGRVPKDR-SWKAARIFMGKVDDFLQALINYDKEHIPENCLKVVNEQYLKDPEFNPNLI 3284

  Fly  3496 RRVCGDVAGLLSWTKAMSFFHSVNKEVLPLKANLTMQEARLKLAMDDLAGAEEQLREREEALQAV 3560
            |......|||.:|...:..|:.|..:|.|.:..|......|..|.:.|.....:|.:.:..|:.:
  Rat  3285 RTKSFAAAGLCAWVINIIKFYEVYCDVEPKRQALAQTNLDLAAATEKLEAVRRKLVDLDHNLRRL 3349

  Fly  3561 KDQYDKAVGEKQRLTDAANVCLRKMTAATALINGLSDEKHRWTNQSKEFKIQLGKLVGDVLLATG 3625
            ...::||..||.|..:..|...:.:..|..|::.|..||.||....|.|:.|...|.|||||...
  Rat  3350 TASFEKATAEKVRCQEEVNQTNKTIDLANRLVSELESEKIRWGQSIKSFETQEKTLCGDVLLTAA 3414

  Fly  3626 FLSYCGPYNQEFRANLIK-TWMGILKQK-NIPFTTGLNIINMLVDSSTVSEWTLQGLPNDELSVQ 3688
            |:||.|.:.:::|..|:. .|:..|:|| :||...||::|..|.|.:|::.|..||||:|.:|.:
  Rat  3415 FVSYIGSFTRQYRQELVDCKWIPFLQQKVSIPIAEGLDMIATLTDDATIATWNNQGLPSDRMSTE 3479

  Fly  3689 NALIATKSSSYPLLVDPQTQGKIWIKCKEDRNELQITSLNHKYFRTHLEDSLSLGRPLLIEDVGI 3753
            ||.|.|....:||::|||.||..|||.|.. .:|::|.|..|.|...:|.:|:.|..:|||::..
  Rat  3480 NATILTHCKRWPLMIDPQQQGIKWIKNKYG-PDLKVTHLGQKGFLNAIEMALAFGDVILIENLKE 3543

  Fly  3754 DLDPVIDNVLEKNFIKSGSIEKVLVGDKECDVMPGFMLYITTKLPNPAFSPEVSAKTSIIDFTVT 3818
            .:|||:..:|.:|.||.|  :.:.:|||||:....|.|.:.|||.||.:.||:.|:|::::||||
  Rat  3544 TVDPVLGPLLGRNTIKKG--KYIRIGDKECEFNKNFRLILHTKLANPHYKPELQAQTTLLNFTVT 3606

  Fly  3819 MRGLEDQLLGRVILMEKSDLEAERVALFETVMQN--QRNMKELEANLLLRLSSSQGSLVDDEALI 3881
            ..|||.|||..|:.:|:.||  ||:.|..|..||  :..::.||.:||||||:::||.:||..|:
  Rat  3607 EDGLEGQLLAEVVSVERPDL--ERLKLVLTKHQNDFKIELRHLEEDLLLRLSAAEGSFLDDTDLV 3669

  Fly  3882 EVLRVTKTTAEEVNQKLKISEVTERKIMKAREEFRAVAKRGSILYFLIVEMSNVNAMYQNSLKQF 3946
            |.|..||.||.|:..|:..:...||||.:.||.:|.||.|.|::||:|.::..:|.:||.|||.|
  Rat  3670 ERLETTKATAAEIEHKVIEARENERKINETRECYRPVAARASLMYFVISDLRKINPVYQFSLKAF 3734

  Fly  3947 LVIFNHSITKSTKSSVTEERINIILRYLTYEVYKFTNRSLYERHKQLFTLMLAIKIDYHNGNISH 4011
            ..:|:.:|.::.|...|:|||..::..:||..:...:::|:|:.|..|...:|.:|......| |
  Rat  3735 KTLFHRAIEQADKVEDTQERICALMESVTYATFLHASQALFEKDKLTFLSQMAFQILLRRNEI-H 3798

  Fly  4012 EEFLTFIKGGASLDLNAVTPKPFRWILDITWLNLVEISKLETFSTVLQVIELNEKDWRCWYECEK 4076
            ...|.|:   ....:......|..::...:|..:..::.:|.|..:.:.:|.:.|.||.|.|.|.
  Rat  3799 PLELDFL---LRFTVEHTYSSPVDFLTAQSWSAVKAVALMEEFRGLDRDVEGSAKQWRKWVESEC 3860

  Fly  4077 PENEEIPCGY--NAILDGFRKLLLIRSWCPDRTISQAKKYIEESLGPEYSEMQILDLEEMWLESE 4139
            ||.|::|..:  .:::   :||:::|:..|||.....:.::||.||.:|.|...|||.:.:.||.
  Rat  3861 PEKEKLPQEWKKKSLI---QKLIILRAVRPDRMTYALRNFVEEKLGTKYVERTRLDLGKAFGESS 3922

  Fly  4140 PRTPFVCLLSIGSDPTTQIGALAKQKSIVLKS-----VSMGQGQEYHARKMIIESMAIGG-WVLL 4198
            |.||...:||.|.|....:..|.|:....:.|     ||:|||||..| :|.:|..|||| ||.|
  Rat  3923 PGTPVFFILSPGVDALKDLEVLGKRLGFTIDSGKFHNVSLGQGQELVA-EMALEKAAIGGHWVFL 3986

  Fly  4199 QNVHLS---LPFCSEIIDMLVESEHIDDSFRMWVTTE--PHNEFPI---GLLQMALKFTNEPPQG 4255
            |||||.   |....::::...:..|.|  :|::::.|  |....|:   |||:.::|.|||||.|
  Rat  3987 QNVHLVAKWLGTLEKLLEKFSQGSHRD--YRVFLSAEAAPSQHEPVIPQGLLENSIKITNEPPTG 4049

  Fly  4256 IRASLKRSYQSFTQDFLDYTSATQ-WPPLLYTVAFLHTIVQERRKFGPLGWNIPYEFNQADFAAS 4319
            :.|:|..:..:|.||.|:..|..| :..:|:::.:.|..|..|.:|||.||:..|.|:..|....
  Rat  4050 MLANLHAALYNFDQDTLEMCSKDQEFKSILFSLCYFHGCVAGRLRFGPQGWSRSYPFSPGDLTIC 4114

  Fly  4320 VQFIQNHLDEMDPKKGVSWQTLVYMIGEVQYGGRVTDDFDKRLLTTFTSVWFCEPLLSNSFEFYK 4384
            ...:.||| |.:|.  |.|:.|.|:.||:.|||.:||.:|::|...:...:....|:.:......
  Rat  4115 TNILYNHL-EANPH--VPWEDLRYLFGEIIYGGHITDAWDRKLCRVYLEEFMNPSLIEDELMLAP 4176

  Fly  4385 GYKVPGTKSLQGFIDYINSLPAYDTPEVFGLHSNADITYQINSAKGILDTILSVQPKEGGGG--G 4447
            |:..|......|:..||..:...::|.::|||.||:|.....::..:..|:|.:||:.....  .
  Rat  4177 GFAAPPYSDYSGYHQYIEDMLPPESPALYGLHPNAEIELLTVTSNMLFRTLLEMQPRNAVSNEEQ 4241

  Fly  4448 GETRESIVYQLADDMLRKLPAQYNAYEV-RENLTRMGILLPMNIFLRQEIDRMQRVIKRVHTCLC 4511
            |::.|..|..:.||:|.:||.::|..|: ::|..|.    |..:...||.:||..:::.:...|.
  Rat  4242 GQSTEDKVKNILDDILERLPEEFNMAEIMQKNPNRS----PYILVCFQECERMNVLLREIRVSLQ 4302

  Fly  4512 DLKLAIDGTIVMSPALKESLDAMYDARIPETWMKISWEST-TLGFWYTELLERNGQFRTWI-STD 4574
            .|.|.:.|.:.:||.::..|.|:...|:|:||.|:::.|| .|..|:.:||.|..:..||. ...
  Rat  4303 HLDLGLKGELTLSPDVETQLSALSYDRVPDTWNKLAYPSTYGLAQWFNDLLLRCRELDTWTQDLT 4367

  Fly  4575 RPKVFWMTGFFNPQGFLTAMRQEVTRAHKGWALDSVVLQNQITRYNKEDITEYPTEGVYVHGLFL 4639
            .|.|.|::|.||||.||||:.|.:.|.:: |.||.:.|...:|:..|||....|.||.|:|||.|
  Rat  4368 LPAVVWLSGLFNPQSFLTAIMQTMARKNE-WPLDRMCLTIDVTKKTKEDYGHPPREGAYLHGLHL 4431

  Fly  4640 EGASLDRRSGKLIESKMKVLYEQMPVIYIYAINTTAGKDPKLYECPIYRKPQRTDLKYVGSIDFE 4704
            |||..|.:||.|:::::|.|...||||:..||.....:....||||:|:...| .|.||.:....
  Rat  4432 EGARWDIQSGALVDARLKELTSTMPVIFAKAIPADRQEVKHAYECPVYKTKAR-GLTYVWTFRLR 4495

  Fly  4705 TEFNPKHWTLRGVALLCD 4722
            ::.....|.|.|||||.:
  Rat  4496 SKDRIAKWVLAGVALLLE 4513

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG9492NP_001287256.1 DHC_N1 283..843 CDD:285571 134/589 (23%)
DYN1 1178..4372 CDD:227570 1066/3303 (32%)
DHC_N2 1458..1861 CDD:285579 117/439 (27%)
P-loop_NTPase 1994..2222 CDD:304359 138/227 (61%)
P-loop_NTPase 2309..2444 CDD:304359 53/134 (40%)
P-loop_NTPase 2662..2926 CDD:304359 85/265 (32%)
P-loop_NTPase 3025..3287 CDD:304359 114/265 (43%)
MT 3300..3646 CDD:289543 96/352 (27%)
AAA_9 3674..3890 CDD:289547 94/217 (43%)
Dynein_heavy 4031..4713 CDD:281078 229/703 (33%)
Dnah11XP_038934019.1 DHC_N1 220..789 CDD:400611 133/582 (23%)
DHC_N2 1296..1722 CDD:400618 117/435 (27%)
DYN1 1550..4164 CDD:227570 959/2746 (35%)
AAA_6 1862..2188 CDD:403853 177/326 (54%)
MT 3095..3439 CDD:289543 97/355 (27%)
Dynein_C 4217..4512 CDD:408026 103/300 (34%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
21.810

Return to query results.
Submit another query.