Protein Alignment Vps45 and Vps33B

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_649909.1
• Gene: Vps45 / 41153
• FlyBaseID: FBgn0261049
• Length: 574
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_651395.1
• Gene: Vps33B / 43077
• FlyBaseID: FBgn0039335
• Length: 640
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 686
• Identity: 134/686 - (19%)
• Similarity: 242/686 - (35%)
• Gaps: 210/686 - (30%)

  Fly     4 ISGIKLYI-EKMCSE--SGPGMKIILLD----KETTSIISMAFSQSDMLQREVYLFERLDSGRSN 61
            :.|.:|.. ||:||.  |.||.|.::|:    |....:::.::.:...:|| :|   :.|:.:|.
  Fly     9 LQGFQLVAQEKLCSILCSIPGKKELILEPDLIKPLEHVVTASWLKLKGIQR-IY---KHDAAQSL 69

  Fly    62 ERLKYLKCIVFIRPTKQNIQLLANELR------NPKYS----------AYYIYFSNIIPRTDIKY 110
            .|......|..||......|.|..:|:      .|..|          :.|.||..::.:..:..
  Fly    70 PRSADQVHIYMIRSVLGTFQTLLKQLQPVASEEMPDISMKMYHIVCVPSCYSYFQTLLEQAGLYG 134

  Fly   111 LAECDESESVREVKELYADYLCVNPNLFSLGIPN---CMANLNWLPDALNRSMQGITAVLLSLKL 172
            |.         ::.....|::..:..:.||.:||   |:        .|.::...:.||..||:|
  Fly   135 LV---------QLHHFNWDFIYFDQGVLSLELPNLYECL--------YLQKNTSPLPAVAQSLRL 182

  Fly   173 ------NPVIRYRAGSQAAQLLAKLIYEQITKESSLFDFRSNMDGAAPPLL---LVLDRRDDPVT 228
                  .|.:....|..::||:      |:.|........:|     ||..   ||:||..|...
  Fly   183 LQMICGQPSLILSFGHHSSQLM------QMAKTLGKLPAPTN-----PPDYGGWLVIDRDKDYPA 236

  Fly   229 PLLHQWTYQAMVHELLHIKNNRLDLSNCPNVPKDFKELVLSGDQ--------------------D 273
            .||....|..::.|:....:..:.:.|..|..:..:..:|.|.:                    |
  Fly   237 SLLTPAIYAGLLLEVFEHSSGEILVDNSKNKIRSQRVELLQGKKSKIGVNSASKPCSIRLNSTSD 301

  Fly   274 DFYGNNMYANYGEIGSTI----KQLMEEFQRKANDHKKVESIADMKNFI-ESYPQFKKMSGTVQK 333
            :.||:|.|..:.::.|.|    |.|..|.| |.||.:    :.:|.::: ...|:..::...|.:
  Fly   302 EIYGDNRYKRFAQVSSLIHAQVKALGLELQ-KLNDMQ----LDEMHDYVARKLPKLTELKSKVLR 361

  Fly   334 HL-------CVIGELSAL-----------SNKRNLFEVSEL---------EQEIACKAEHS---- 367
            ||       .::|....|           |.||.|.|:.||         ...:.|...|.
  Fly   362 HLNASEIVIQMMGNFRKLQTLEEDILNNDSRKRLLSEIDELLTTDGQRFNTLRLLCLLHHCVGVA 426

  Fly   368 --------------------------AQLQRIKKLIADER--VSIDDALKLVALYALRYERHANC 404
                                      :|...:..|:.:::  ..:...|.|.......::.:||
  Fly   427 PEELQIFARNYCNLFGHQELGVFQQLSQAGLLPPLVVEKKAPTKLLSNLPLPKFQQTEFQANAN- 490

  Fly   405 DTSGLLQIIKTRG-GRAAIVPSLIEYAGTHVRQGDLFN-------------MVRITDAVKLTRNL 455
                .|:::.:.| |:.....|..:.:|.......:||             :::|..|.:|:..|
  Fly   491 ----RLKLLTSSGDGQDGGSSSKSQSSGLQTCPSFVFNGTYIPLVAQLCSILLKINSAEELSSKL 551

  Fly   456 --IKGL-------KGVENVFTQHTPLLKETLEDVFKGRELDPLFPAINSELVPFRRPPQEVVVFI 511
              |:||       |.....:.....|.....:|:|                 |.|.  :.:.|||
  Fly   552 GMIEGLHLHLDSGKITPKAYASQVKLNGVADQDMF-----------------PLRL--RNLFVFI 597

  Fly   512 IGGATYEEALA---VHQLNNAGYKV----ILGGTTI 540
            :|||:|.|..|   |.:|..|...|    ::.|:.:
  Fly   598 VGGASYAEIAACDFVAKLTGAQITVASDSLMAGSDL 633

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Vps45	NP_649909.1	Sec1	23..549	CDD:460020	125/664 (19%)
Vps33B	NP_651395.1	Sec1	31..634	CDD:460020	125/664 (19%)