DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CCT7 and Cct7

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_649835.1 Gene:CCT7 / 41054 FlyBaseID:FBgn0037632 Length:544 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001100073.1 Gene:Cct7 / 297406 RGDID:1306422 Length:544 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:541 Identity:408/541 - (75%)
Similarity:470/541 - (86%) Gaps:3/541 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MQPQIVLLKEGTDSSQGKPQLVSNINACQSIVDAVRTTLGPRGMDKLIVDAHGKATISNDGATIM 65
            |...::|||||||||||.|||||||:|||.|.:|||||||||||||||||..||||||||||||:
  Rat     2 MPTPVILLKEGTDSSQGIPQLVSNISACQVIAEAVRTTLGPRGMDKLIVDGRGKATISNDGATIL 66

  Fly    66 KLLEIIHPAAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVVLLAGEFLKQVKPFVEEGVHPRVIIKAIRKALQL 130
            |||:::|||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||:||||:||::||:|.|.|.||
  Rat    67 KLLDVVHPAAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEEGLHPQIIIRAFRTATQL 131

  Fly   131 CMEKINEMAVQIVEQSKDQQRALLEKCAATAMSSKLIHQQKDFFSRIVVDAVLSLDELLPLNMIG 195
            .:.||.|:||.:.:|.|.:||.:|||||.||:|||||.|||.||:::|||||:.|||||.|.|||
  Rat   132 AVNKIKEIAVTVKKQDKVEQRKMLEKCAMTALSSKLISQQKVFFAKMVVDAVMMLDELLQLKMIG 196

  Fly   196 IKKVTGGSLEESQLVSGVAFKKTFSYAGFEMAPKSYDNCKIALLNIELELKAERDNAEIRVDNVK 260
            ||||.||:||||:||:|||||||||||||||.||.|.|.||||||:|||||||:|||||||..|:
  Rat   197 IKKVQGGALEESRLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYKNPKIALLNVELELKAEKDNAEIRVHTVE 261

  Fly   261 EYQKVVDAEWQILYNKLAKIHESGANVVLSKLPIGDVATQYFADRDIFCAGRVPEEDLKRTMKAC 325
            :||.:|||||.|||:||.|||:|||.|:||||||||||||||||||:|||||||||||||||.||
  Rat   262 DYQAIVDAEWNILYDKLEKIHQSGAKVILSKLPIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMAC 326

  Fly   326 GGAVMTTANDIKPNVLGLCEHFEERQVGGERFNLFQGCPNAKTSTLILRGGAEQFLEETERSLHD 390
            ||::.|:.|.:.|:|||.|:.|||.|:||||:|.|.|||.|||.|:|||||||||:|||||||||
  Rat   327 GGSIQTSVNALIPDVLGRCQVFEETQIGGERYNFFTGCPKAKTCTIILRGGAEQFMEETERSLHD 391

  Fly   391 AIMIVRRTIKHDSVVAGGGAIEMELSKLLRDYSRTIAGKEQLLIAAIAKGLEIIPRQLCDNAGFD 455
            |||||||.||:||||||||||||||||.||||||||.||:||||.|.||.|||||||||||||||
  Rat   392 AIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFD 456

  Fly   456 ATNILNKLRQKHAQGGQWYGVDINKEDISDNYEQCVWEPSIIKINALTAAAEAACMILSVDETIK 520
            |||||||||.:|||||.|||||||.|||:||::..||||::::|||||||:||||:|:|||||||
  Rat   457 ATNILNKLRARHAQGGMWYGVDINNEDIADNFQAFVWEPAMVRINALTAASEAACLIVSVDETIK 521

  Fly   521 SPKA---GEPPMAGGGMGMGR 538
            :|::   ...|.||.|.|.||
  Rat   522 NPRSTVDAPAPAAGRGRGQGR 542

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CCT7NP_649835.1 TCP1_eta 4..524 CDD:239456 400/519 (77%)
Cct7NP_001100073.1 TCP1_eta 5..525 CDD:239456 400/519 (77%)

Return to query results.
Submit another query.