Protein Alignment EMC1 and emc1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_649747.1
• Gene: EMC1 / 40933
• FlyBaseID: FBgn0037530
• Length: 915
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_593811.1
• Gene: emc1 / 2542716
• PomBaseID: SPAC25H1.07
• Length: 885
• Species: Schizosaccharomyces pombe
• Alignment Length: 1026
• Identity: 229/1026 - (22%)
• Similarity: 392/1026 - (38%)
• Gaps: 264/1026 - (25%)

  Fly     5 WLLPALSLALLLGTCSALYEDQIKKFDWRGVNVGALKQSRVDL-NHFQPRILVTTYEGVVASLCV 68
            |.|...:|.|.:...:::..|:..|.|:....:|.:.....|. |.:   :...:.:|::|.|..
pombe     6 WPLFLTALFLNIYRAASVLIDEAGKNDFEISLLGKVNDLVYDTKNEY---LYAVSQKGLLAKLNA 67

  Fly    69 KTGELVWRQ----------------------------------VLEQK---PRGDVKLLQVS-GF 95
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pombe    68 SNGDVIWRQSIAPETSQLNYNPVTNFIITVDKDYLYIWNSKNGILDRKIELADGKGKLFEVNKGF 132

  Fly    96 AD-----------DSSDTAAAPMGSNMGFDMLTVQGHAP----ALVRGWNTNMGALEWEWSIMPM 145
            ..           |...:.:..:..::..|.::...:|.    ...|.....:.||:..:::...
pombe   133 VYLNPHTRKFIELDLQASFSISIERDLQLDAISFLTYAEKNYVLFKRDGQFVLQALDHNYAVYGP 197

  Fly   146 NT-----ERAQ------DAMWIYSKSVLY--HVLPAWRSHLEVTAYFASSGHSTGSTSKVIAPWI 197
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pombe   198 ETVLNVPENAQLLVTEKDVIIYSSNGVIYGIHVSMADISQLLIDEY------------------K 244

  Fly   198 TSESCTLSGTFYVCTDGKQLISLDLVSKSGQVIRTSLEAEPKGKTQALTGLNGVVIVDGKPISVN 262
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pombe   245 TFEWSSIPG-----------------KRHGYSITVDSQSTP------VTYL--FVIIDSEFVLI- 283

  Fly   263 KDQSICGDLRSSSFAVGSFN--YRKVLAYADLSSGILRINALYLDNCAPAAELEQSLPFPEHFGT 325
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pombe   284 -DEYIHEDTEALGYIHMEDNQTFSRVFAVA---------NQI---KFAPAT----VITIPNQLSR 331

  Fly   326 PSLSNFDCKQKRNGE-------GKNCLFLFSSTSESIVAVQHGRVRWSREESLANVIDSQFVDLP 383
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pombe   332 PVFRLFTFAE---GEISAIVILDDGTFFSFSNT----------ELVWKREEALAYAINPSILPTT 383

  Fly   384 LADTEGTLENEMKGKAGDFTSFERDI------ASAFLRRITTQAVQIRSLFLHVIGLGPPPTDTQ 442
            |                 .||:::.|      :.:||.|......|:.....|       |....
pombe   384 L-----------------LTSYQKSIQDEENSSVSFLNRWYRHFNQLIDFLKH-------PHGFT 424

  Fly   443 RAGLVRDSFGLHKMLVLLTRAGKIFGIDNVSGKHH---WQLHL---PN-----VIGFANDEQMRL 496
            .:.::.|:|  ...:::.|..|.||.:.:...:.|   |:...   |.     ::..::::....
pombe   425 SSSVLDDAF--TTKIIIPTSTGSIFCLSSDPKQVHRILWRYDFNINPESVESWLLDISDEDPKFA 487

  Fly   497 IVQRSAKHFPLQPLCTILGKNAVSGNGV-----------LYRFNPITGKVAEGGLVQLDYRIKQL 550
            .|.:....|....|      ||..|:.:           .|..:.|:..:........||::  |
pombe   488 FVHQWNDAFSFYIL------NASDGSVISQKSRDFKADEFYYVDNISKNLPNQIFAVKDYKV--L 544

  Fly   551 SLLGETEKDFLKGILLLDASNKVHVYPEHAAPLADGMYLYTADLKTAELAGYFVKYAGGQLSSTH 615
            .|.|:               |.:.   |..:..|:.:::||::.|   :.|:.:   ...|:...
pombe   545 PLTGD---------------NSIF---EKISQEANSIFVYTSETK---VEGFSI---SADLTMDV 585

  Fly   616 IWNARLGGHNSEQQIIGVAGKNPIEHVHSQGRVLGDRSVLYKYINPNLVAFVTQAPDSTHKSVLN 680
            .|:..|.   ..:.:|....:||.|.|.|.||||.:|.|:|||:||||.|..::.     |:.|.
pombe   586 QWSYNLA---EGEIVIASIRRNPHEIVASFGRVLQNREVMYKYLNPNLFALFSKC-----KNDLV 642

  Fly   681 LYLVDVVSGSVVFTMTHR------KVRAPLSIVHSENWLAYSYFNEKLR-RTEITTIELYEGKSQ 738
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pombe   643 VYVMDSVTGSIVYQNKHQGIILFDKVYG----VFSENWLVYSYQSDVPNLSTKIISVELFEG-SH 702

  Fly   739 ANSSVWS----SLQAPPMPLVERQSYILPTIVEALRETITERGITNKHVLIGTASGSIVEMPWHL 799
            :|..:.|    |......|....::||....:..|..|.|.:|||::.||:|.:|..:..:|..|
pombe   703 SNEKIDSNEIYSRHNDYRPYAFTKAYIFDREITTLGVTNTPQGITSRDVLLGLSSNQVAMIPQAL 767

  Fly   800 LDPRRPIASTTQGREEGA-IPYIPELPLPTESHINYNQTVARLRNIYTAPSGLESTCLVVATGLD 863
            |.|.||:....:...:.: |||.|.:||..:..::||:.|..:..|.:..:..|||.||::||||
pombe   768 LSPMRPVLRPNEKANDASFIPYEPIIPLNDDMVLSYNKRVYGVSQITSGITNFESTTLVLSTGLD 832

  Fly   864 LFVTRVAPSKTFDLLKEDFDYILISIVLVALTSGSLIVKHLASRKLLKQAW 914
            :|.||.|||..:|:|...||...:.:....:....|:.|.|..:|.|...|
pombe   833 VFFTRTAPSMPYDMLSSHFDKKQLMLTTFGILLAVLLTKPLVKKKQLNTKW 883

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
EMC1	NP_649747.1	EMC1_C	709..914	CDD:462261	71/210 (34%)
emc1	NP_593811.1	EMC1_C	673..883	CDD:462261	71/210 (34%)