Protein Alignment Nmdar1 and grin3a

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_730940.1
• Gene: Nmdar1 / 40665
• FlyBaseID: FBgn0010399
• Length: 997
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_073770471.1
• Gene: grin3a / 564832
• ZFINID: ZDB-GENE-130530-780
• Length: 1117
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 957
• Identity: 231/957 - (24%)
• Similarity: 415/957 - (43%)
• Gaps: 177/957 - (18%)

  Fly    84 NPIKTVFNVCDKLIENRVYAVVVSHEQTSGDLSPAAVSYTSGFYSIPVIGISSRDAAFSDKNIHV 148
            :|:..:.:||..:|...|.| ::|..|...:|  ..:.:.:....||||.:...:.....:|:..
Zfish   181 DPVSFLQSVCHTVIVQGVSA-IISFPQNRDEL--VKLEFIASTLQIPVISVVQSEFQRQTQNLLH 242

  Fly   149 SFLRTVPPYYHQADV---------WLEM---------LSHFAYTKVIIIHSSDTDGRAILGRFQT 195
            ..:....|...||::         |.::         :|.|    |.::|::.......:.:..|
Zfish   243 FQMAMQNPQTSQANLIFSLLSMNNWFDVSLVMCQQMNISDF----VFLLHNNSKFHLGTVLKIST 303

  Fly   196 TSQTYYDDVDVRATVELIVEFEPKLESFTEHLIDMKTAQSRVYLMYASTEDAQVIFRDAGEYNMT 260
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Zfish   304 NSSSKND---------FHIFLQAQLES-------IKDSTSTLVTFGCDIRDIRRIFTTIAKFGLI 352

  Fly   261 GEGHVWIVTE----QALFSNNTPDGVLGLQLEHAHSDKG------HIRDSVYVLASAIKE----- 310
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Zfish   353 LPDYHWIIGDSQNVEELRTEGLPMGLL------AHGRMGEPSLDHYVQDALELVARAVGSAATVS 411

  Fly   311 ----MISNETIAEAPKDCGDSAVNWESGKRLFQYLKSRNITGETGQVAFDDNGDRIYAGYDVINI 371
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Zfish   412 PQLALIPGTTNCLARLE----AKNLTSGTFLSRYMASTSFDGLSGCISVQEESTII--------- 463

  Fly   372 REQQKKHVVGKFSYDSMRAKMRMRINDSEI--------IWPGKQRRKPEGIMIPT---HLRLLTI 425
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Zfish   464 --SESHHFIWNLQHDPIGKPMWTRLGSWKHGKVVMDYGVWPNKRRSQPGADWRHSSRLHLRVVTL 526

  Fly   426 EEKPFVYVRRMGDDEFRCEPDERPC--PLFNN--------------SDATANEF--CCRGYCIDL 472
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Zfish   527 VEHPFVFTRDV-DDEGLC-PAGQLCLDPLTNDTALLESLFQGLQGANDTVPLEFKKCCYGYCIDL 589

  Fly   473 LIELSKRINFTYDLALSPDGQFGHYILRNNTGAMTLRKEWTGLIGELVNERADMIVAPLTINPER 537
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Zfish   590 LEKLAEDMGFDFDLYIVGDGKYGAY--KNG--------RWTGLVGDLMSGAAHLAVTSFSINSAR 644

  Fly   538 AEYIEFSKPFKYQGITILEKKPSRSSTLVSFLQPFSNTLWILVMVSVHVVALVLYLLDRFSPFGR 602
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Zfish   645 SQVIDFTSPFFSTSLGILVRTRDTAAPIGAFMWPLHWSMWLGIFVSLHVTAVFLTLYEWKSPFG- 708

  Fly   603 FKLSHSDSNEEKALNLSSAVWFAWGVLLNSGIGEGTPRSFSARVLGMVWAGFAMIIVASYTANLA 667
              ::....|.::..:.|||:...:.:|.........|:.::.|.|..:||.|.:..:::||||||
Zfish   709 --MTPRGRNRDRVFSFSSALNVCYAILFGRTAAIKPPKCWTGRFLMNLWAIFCLFCLSTYTANLA 771

  Fly   668 AFLVLERPKTKLSGINDARLRNTMENLTCATVKGSSVDMYFRRQVELSNMYRTMEANNYATAEQA 732
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Zfish   772 AVMVGEKTYEQLSGIHDPKLHHPSQGFRFGTVRESSAEDYVKK--SFPEMHEYMRRYNAPTTPDG 834

  Fly   733 IQDVKKG--KLMAFIWDSSRLEYEAS--KDCELVTAGELFGRSGYGIGLQKGSPWTDAVTLAILE 793
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Zfish   835 IDHLKDDPQKLDAFIMDKALLDYEVSIDADCKMLTVGKPFAIEGYGIGLKQNSPLTSNISELVSQ 899

  Fly   794 FHESGFMEKLDKQWIFHGHVQQNCELFEKTPN-TLGLKNMAGVFILVGVGIAGGVGLIIIEVIYK 857
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Zfish   900 YKSDGFMDMLHDKW--YKVVPCGKRSFAVTETLQMGIKHFSGLFVMLCVGVA--LSLL------- 953

  Fly   858 KHQVKKQKRLDIARHAADKW-----RGTIEKRKTIRASLAMQRQYNVGLNSTHAPGTISLAVDKR 917
                     ..:..|...:|     :.:.|.:..:..|..:.|    .||.|.....:.....
Zfish   954 ---------TTLGEHIVHRWVIPRMQESTEHKYWLHTSQRLHR----ALNPTFKEDKLQTVAK-- 1003

  Fly   918 RYPRLGQRLGPERAWPGDAADVLRIRRPYELGNPGQSPKVMAANQPG 964
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Zfish  1004 --PEKSCNVGNNQQMPWNS-----------LGTPNCNRRKL-SNQEG 1036

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Nmdar1	NP_730940.1	PBP1_iGluR_NMDA_NR1	37..405	CDD:380602	63/365 (17%)
		PBP2_iGluR_NMDA_Nr1	417..818	CDD:270437	137/425 (32%)
		CaM_bdg_C0	854..882	CDD:402271	2/32 (6%)
grin3a	XP_073770471.1	None