Protein Alignment Nmdar1 and GluRIID

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_730940.1
• Gene: Nmdar1 / 40665
• FlyBaseID: FBgn0010399
• Length: 997
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_651982.1
• Gene: GluRIID / 44483
• FlyBaseID: FBgn0028422
• Length: 902
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 980
• Identity: 225/980 - (22%)
• Similarity: 417/980 - (42%)
• Gaps: 192/980 - (19%)

  Fly    17 IVLLVAPIDA----AQRHTASDNPSTYNIGGVLSNSDSEEHFSTTIKH----LNFDQQYVP---- 69
            |:|.::.:.|    ...:.||...| ..:|  |...|:.:....|.:|    :| ::..||
  Fly     9 IILSLSRVQAQFYGGNAYEASSGQS-IRLG--LITDDATDRIRQTFEHAISVVN-NELGVPLVGE 69

  Fly    70 -RKVTYYDKTIRMDKNPIKTVFNVCDKLIENRVYAV-------VVSHEQTSGDLSPAAVSYTSGF 126
             .:|.|        .|.::....:| :|:::.|.||       ..||...:.|.......|
  Fly    70 TEQVAY--------GNSVQAFAQLC-RLMQSGVGAVFGPAARHTASHLLNACDSKDIPFIY---- 121

  Fly   127 YSIPVIGISSRDAAFSDKNIHVSFLRTVPPYYHQADVWLEMLSHFAYTKVIIIHSSDTDGRAILG 191
               |.:...|....|   |:|       |.....|:...::::.|.:::.|..:.| .:...||.
  Fly   122 ---PHLSWGSNPDGF---NLH-------PSPEDIANALYDIVNQFEWSRFIFCYES-AEYLKILD 172

  Fly   192 RFQTTSQTYYDDVDVRATVELIVEFEPKLESFTEHLID--MKTAQSRVYLMYASTEDAQVIFRDA 254
            ...|.       ..::..|..::.::..|....:.::.  .|:..||:.::.::|..|::: |.|
  Fly   173 HLMTR-------YGIKGPVIKVMRYDLNLNGNYKSVLRRIRKSEDSRIVVVGSTTGVAELL-RQA 229

  Fly   255 GEYNMTGEGHVWIVTEQALFSNNTPD------GVLGLQLEHAHSDKGHIRDSVYVLASAIKE--- 310
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  Fly   230 QQVGIMNEDYTYIIGNLNLHTFDLEEYKYSEANITGIRM--FSPDQEEVRDLMEKLHQELGESEP 292

  Fly   311 ------MISNE---------TIAEAPK---------DCGDSAVNWE-SGKRLFQYLKSRNITGE- 349
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  Fly   293 VNSGSTFITMEMALTYDAVRVIAETTKHLPYQPQMLNCSERHDNVQPDGSTFRNYMRSLEIKEKT 357

  Fly   350 -TGQVAFDDNGDRIYAGYDVINIREQQKKHVV-------GKFSYDSMRAKMRMRINDSEIIWPGK 406
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  Fly   358 ITGRIYFEGNVRKGFT-FDVI---ELQTSGLVKVGTWEEGK-DFEFQRPPQAVNFNDID------ 411

  Fly   407 QRRKPEGIMI-PTHLRLLTIEEKPFVYVRRMGDDEFRCEPDERPCPLFNNSDATANEFCCRGYCI 470
                 :|.:: .|.:.|:::..||:..:....|            .|..|     |:|  :||.:
  Fly   412 -----DGSLVNKTFIVLISVATKPYASLVESID------------TLIGN-----NQF--QGYGV 452

  Fly   471 DLLIELSKRINFTYDLALSPDG--QFGHYILRNNTGAMTLRKEWTGLIGELVNERADMIVAPLTI 533
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  Fly   453 DLIKELADKLGFNFTFR---DGGNDYGSF---NKTTNST-----SGMLKEIVEGRADLAITDLTI 506

  Fly   534 NPERAEYIEFSKPFKYQGITILEKKPSRS-STLVSFLQPFSNTLWILVMVSVHVVALVLYLLDRF 597
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  Fly   507 TSEREEVIDFSIPFMNLGIAILYVKPQKAPPALFSFMDPFSSEVWLYLGIAYLGVSLCFFIIGRL 571

  Fly   598 SPF---GRFKLSHSDSNEEKALNLSSAVWFAWGVLLNSGIGEGTPRSFSARVLGMVWAGFAMIIV 659
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  Fly   572 SPIEWDNPYPCIEEPEELENQFTINNSLWFTTGALLQQG-SEIAPKALSTRTISAIWWFFTLIMV 635

  Fly   660 ASYTANLAAFLVLERPKTKLSGINDARLRNTMENLTCATVKGSSVDMYFRRQVELSNMYRTMEAN 724
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  Fly   636 SSYTANLAAFLTIENPTSPINSVKD--LADNKDDVQYGAKRTGSTRNFFSTSEE--PIY--IKMN 694

  Fly   725 NYATA---------EQAIQDVKKGKLMAFIWDSSRLEYEASKDCELVTAGELFGRSGYGIGLQKG 780
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  Fly   695 EYLNAHPEMLMENNQQGVDKVKSGTKYAFLMESTSIEFNTVRECNLTKVGDPLDEKGYGIAMVKN 759

  Fly   781 SPWTDAVTLAILEFHESGFMEKLDKQW---IFHGHVQQNCELFEKTPNTLGLKNMAGVFILVGVG 842
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  Fly   760 WPYRDKFNKALLELQEQGVLARLKNKWWNEVGAGVCSAKSD--DDGPSELGVDNLSGIYVVL--- 819

  Fly   843 IAGGVGLIIIEV------IYKKHQVKKQKRLDIARHAADKWRGTIEKRKTIRASLAMQRQYNVGL 901
            :.|.:..|||.:      :|||   .|...:......|:::|..|...:..|...:.|..|:...
  Fly   820 VIGSIISIIISILCWCYFVYKK---AKNYEVPFCDALAEEFRIVIRFSENERPLKSAQSIYSRSR 881

  Fly   902 NSTHA 906
            ||:.:
  Fly   882 NSSQS 886

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Nmdar1	NP_730940.1	PBP1_iGluR_NMDA_NR1	37..405	CDD:380602	79/428 (18%)
		PBP2_iGluR_NMDA_Nr1	417..818	CDD:270437	119/418 (28%)
		CaM_bdg_C0	854..882	CDD:402271	6/33 (18%)
GluRIID	NP_651982.1	PBP1_iGluR_Kainate	35..400	CDD:380605	75/409 (18%)
		PBP2_iGluR_Kainate	417..788	CDD:270432	118/407 (29%)
		Lig_chan	547..819	CDD:459656	74/280 (26%)