DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment NKCC and Ncc69

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_730938.1 Gene:NKCC / 40663 FlyBaseID:FBgn0051547 Length:1068 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001261758.1 Gene:Ncc69 / 39410 FlyBaseID:FBgn0036279 Length:1207 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1207 Identity:525/1207 - (43%)
Similarity:730/1207 - (60%) Gaps:158/1207 - (13%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     3 DRFQISKVNGT---------------------ANAGYDG-----------EARSAESDQTDAAHP 35
            :|||::.|||.                     |.||.||           |....|.|..||...
  Fly    18 NRFQVNPVNGNSRKSQGADGPGSGSGAGAGAGAGAGEDGPHEVYRRLTNAEGELLEDDTFDATQM 82

  Fly    36 LPPTSNENHLHPKASGETGENRRSSRLSFRGFGNFLR-----------------------KSDAE 77
            |      |...|:      :.|:|.:.|||......|                       .|..|
  Fly    83 L------NQRQPR------QQRQSIKSSFRDKDKPSRFKDLQTTTRFQVDPQNEESDESNDSQEE 135

  Fly    78 RKF-----------SLAQLTKESLPRLDNYR--ISMRNLKRPSIGELQGEAV----DQSIT-IPE 124
            |:.           |....|:|:||||||||  :|::...||::.||....:    ..|:| ..:
  Fly   136 RELLDNEYDTKYGKSFRHFTREALPRLDNYRNMMSIQAAYRPTLDELHNATLVGKNTHSLTRNQD 200

  Fly   125 PEPEATGGHIKLGWIVGVLIPCLLNIWGVMLFLRLSWVVAESGILQSLIIITISAVVCVITTLSL 189
            ||.....|.:|.|||.|||:.||||||||||||||||||.::|:::..::|..:..|..||.||:
  Fly   201 PESGILNGVLKFGWIKGVLVRCLLNIWGVMLFLRLSWVVGQAGVIEGFVLILTTTAVTTITALSM 265

  Fly   190 SAISTNGEVKGGGVYFIISRSLGPEFGASVGVVFAFANAVSASMNTIGFCESLNVLLKNNDLKIV 254
            |||||||.:||||.|::||||||||||.|:|::|:.||||:.:|..:|||||:..::.....:|:
  Fly   266 SAISTNGVIKGGGTYYMISRSLGPEFGGSIGLIFSLANAVACAMYVVGFCESMLAMMTTFGWEII 330

  Fly   255 DNGINDIRIVGSITVLVLILICCVGMEWETKAQNFLIVTIVLAIFNFLIGAAIGPQGNEEQISRG 319
            |.|:.|:||:|.||:|:|::|..||||||.|||..|::.:::||.:|:||:.|||:.:.| :::|
  Fly   331 DGGVQDVRIIGCITILLLLIIVVVGMEWEAKAQIGLLIILLVAIGDFVIGSFIGPKSDAE-MAKG 394

  Fly   320 FVGFSWATLKENFGSDYRYAE-GVNHDFFSVFAIFFPSVTGIQAGANICGDLKDAGAAIPKGTFW 383
            |:|::....|.|..:|||..: |:.||||||||||||:.|||.|||||.|||||...:|||||..
  Fly   395 FLGYNATLFKNNLFADYRPEKGGIQHDFFSVFAIFFPAATGILAGANISGDLKDPQKSIPKGTIL 459

  Fly   384 SLLISMSSYALFVLFAGGAAVRDASGIPADLVNGTIVSSELPCMATGNCTWGLFNSYEMMQEMSL 448
            :::|:..:|.:.||..|....|||:|..:|:||||.  :.|.|. .|.|.:||.||:::::.:|.
  Fly   460 AIVITTGTYLIMVLQCGATVARDATGNLSDVVNGTF--AFLDCQ-PGECNYGLQNSFQVIELVSA 521

  Fly   449 WGPLIYAGCFAATLSTALTNLLSVPRLVQALGIDQIYPGLIFFSKPYGKHGEPYRGYVLTFFITT 513
            :||||||||:|||||:||.:|:|.|::.|||..|::||.:::|:|.|||:.||.|||||||.|..
  Fly   522 FGPLIYAGCYAATLSSALASLVSAPKVFQALCKDELYPKIVWFAKGYGKNNEPVRGYVLTFIIAC 586

  Fly   514 GFLLIGELNLIAPLISTFYLASYALINFCTFHAAFVKPLGWRPTFKYYNAWLSLFGFAMCVAIMF 578
            .|:|||||||||||||.|:||:|.||||.||||:..||:||||||||||.||||.|..:|||:||
  Fly   587 AFILIGELNLIAPLISNFFLAAYMLINFSTFHASLAKPVGWRPTFKYYNMWLSLLGAILCVAVMF 651

  Fly   579 LINYVAAIITFGIIFALYLVVMYRKPEANWGSTTQAQQYKAALMAVHRLQNVSDHVKNYHPQVLV 643
            ||::..|:|||..:.||||:|.||||:.|||||||||.||.|||:|.:|.||.:|||||.||:||
  Fly   652 LISWATALITFAAVLALYLIVAYRKPDVNWGSTTQAQTYKNALMSVQQLNNVEEHVKNYRPQILV 716

  Fly   644 LSGDPKTRPPLVDFGYLLTKNNSLMFVANIIPVRVGYKNRQHLVKDGQKYLDARKIKAFYNVIDG 708
            |||.|.|||.|||..|:||||.||:...:::......|.|.:|.:....:....::|.||.::||
  Fly   717 LSGLPNTRPVLVDLAYMLTKNLSLLVCGHVLKGSSSQKYRTYLQERAGNWFRKHRVKGFYALVDG 781

  Fly   709 FSLEDGINALTKSTGFGKMSPNIVLVGYKPDWNRCRKEEVESYFSILYNAFSQRMGVALLRLPNG 773
            ...|.|..||.::||.||:.|||:|:|||.||..|..:|::.||::::.|....:.||:||:|.|
  Fly   782 EDFESGTRALMQATGIGKLKPNIILMGYKTDWQTCDHKELDQYFNVMHKALDMYLSVAILRVPQG 846

  Fly   774 LDFSEL---------SSEV--TL-PANGMGHMHTANA---HGFTNELMPAANAAS-------ELL 816
            ||.|::         .|:|  || |....|.:...::   :|.:..:...:...|       :|:
  Fly   847 LDCSQVLGSQDGWKTVSDVPRTLQPNESSGDLQAVDSSVRNGLSGSIDSLSRNVSQEDRNRNQLV 911

  Fly   817 HIDSN-LNL-----------------ASMDSPNSSFT----------MPQP--APMPNMQRNSRS 851
            |.:.| |.:                 |:..:.:.||.          ||.|  |...|:..||..
  Fly   912 HSEQNSLKIVKLRFKQGLRRMRSWPGAASSTSDLSFIAGNQSKDVSGMPDPLDAKSANLVSNSLR 976

  Fly   852 YKVTSSDEPAVTYHTKGGSDIPQNLLDAMTIFTRKQPKGTIDVFWLYDDGGLTILLPYIISMRSH 916
            ......|:||..|...||:::|:.:|..:|.||||:....|||:|||||||||:|||||||.|..
  Fly   977 KSKLKHDDPASLYKGPGGAELPKEVLADLTQFTRKRSHAVIDVWWLYDDGGLTLLLPYIISTRRT 1041

  Fly   917 WQNSKLRVFAMCHGKDE-EQEEKSMASLLTKFRIKYSELIMLKGVSEQPRADTVLKHKRLIEPF- 979
            ||:.||||:|:.:...| |.|::||||||:||||.||:|.::..::::|:..:......||:.| 
  Fly  1042 WQSCKLRVYALANKNSELEFEQRSMASLLSKFRIDYSDLTLIPDITKKPQETSTQFFNELIKDFV 1106

  Fly   980 -----------RRGARNEFG--ITDDELQSMSEKTNRQLRIHELVVKHSSNASLVVMSLPMPRKE 1031
                       .|...||..  ||||:|.::.:||||.||:.|.:.:.|:.:.||||:||||||.
  Fly  1107 VTEKDGENGTSSRATLNEDDALITDDDLLAVQDKTNRYLRLREYLREQSTKSDLVVMTLPMPRKN 1171

  Fly  1032 AISAPLYMSWLEMLTSDMKCPVALARGNQTPVLTLYS 1068
            .:||||||:|||.|:.||. |....|||||.|||.||
  Fly  1172 IVSAPLYMAWLESLSRDMP-PFLFVRGNQTSVLTFYS 1207

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
NKCCNP_730938.1 AA_permease_2 85..1068 CDD:459263 494/1057 (47%)
Ncc69NP_001261758.1 AA_permease_2 155..1207 CDD:459263 494/1056 (47%)

Return to query results.
Submit another query.