Protein Alignment Ccdc39 and ccdc39

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_649495.1
• Gene: Ccdc39 / 40595
• FlyBaseID: FBgn0037276
• Length: 967
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001410743.2
• Gene: ccdc39 / 100005620
• ZFINID: ZDB-GENE-110603-1
• Length: 947
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 992
• Identity: 245/992 - (24%)
• Similarity: 460/992 - (46%)
• Gaps: 97/992 - (9%)

  Fly    20 MASVGWAVDSDIPMASAENLAILKELTALRALKLELQQHMNSLDEREMAVERHTRNIEGTIQQNL 84
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Zfish     6 LEEVGWDADFAIPVANAENKALEEQIRKKQKDILNLDNKLNKHKDVINALTEHLKNLKQEVSHNQ 70

  Fly    85 TLYSSLKDDVIKEAHNVQLVILERNKIKEDLRKNNKELEEYTEYVKVTERKICQSKREIDELTSR 149
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Zfish    71 ALCKAKEKETESEVHLKALAERETGRLKQEITRLESQLTTLNEKKNAQENSIFKATQKIDELTSQ 135

  Fly   150 IKSAKTTLVEWTEAMEDGNKGYQLIEKYYLDDQQKARELNIKRQLLQADIDKRRKQVVLLYDEQM 214
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Zfish   136 LNWDQQTLEAFLQESAHKDEDTMAIIKYAKQDERKIKELTLNIEKLTLESNQKRKTLDNELTETV 200

  Fly   215 TLEKNLERTACLYRSAHAERRQMVETWKSAVNQMTQREHDIQRSEIECAELAQKAQQTAQTYKEY 279
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Zfish   201 TSQIALDKTAESFRQAHTERQELISQWENTIEQMRKRDQDIQQCAMMLAELNQTIREKNDLIKER 265

  Fly   280 DNQLTEVIENNRQVELAIESLNEESSDMKNQIQILIDATLLKEREIDGLRRELENLSNRVHLQRM 344
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Zfish   266 KDFLEREIENNKELERNIGTVERQAFRLRQQLQ-------EEEKNQRRLQDEVEVLKGTVDRTAT 323

  Fly   345 D---NRSQ---MKK----RDEKAKELENFASVMEKVNARLKSVQNKALNAEQRLQILEEMMQAEE 399
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Zfish   324 DVETSRSQLSSMKKDIQDKTTKVEEAQLHNAALEE---KLRMVTEAVLNGEEQAAQMEQLLREQE 385

  Fly   400 TALRNLDKEQEKVNEMLYRTQRQVIELQDEEK-------VLKVQNDSLNSNLAAINRN--QQQ-- 453
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Zfish   386 QNIKEIDSQLLRQKELLFKKSQEVQALRDKEKNVTAEICATRTALSNLDSKLRKLDQNFLQQQMI 450

  Fly   454 VNNE------LKRQTEIHYSLSFKCLE---AERRLAEIKGLADDPEVEATNMARLNTLEQEYEKL 509
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Zfish   451 ISNQDFQIQMLERKT-LHLQGKVNTEEKKALEKKVADLAASLEEKKKTAAN------LNKQLKKL 508

  Fly   510 QRLIATTEAQNKKLNYNMNNLVVQYNADEKELEMVRFKIKEAQVYCEGTVKRLRQIRYENSELIV 574
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Zfish   509 QDDIRCIKKDTEKIGAEKTNLST--------------KIQEVELFIETSEKERKKSRLKKQDSMV 559

  Fly   575 DLNMVKMRCSDLEVGIGGCEQGTYDLEQHRLAFRRAIKDRTVELRSQEDVLLLKKKHLNEELSTL 639
            :..::||....|...:.....|...||:.||..:.|:|:|..|:|...::|..:.|...:|...|
Zfish   560 EKGLLKMEVQRLRNLLYDRADGVLTLEKRRLQLQTAMKEREEEIRVHREMLNKQVKLTEQERQGL 624

  Fly   640 RADLGERKKQIEAMKARFELTAQLLGKNEDGSIMTSTQLKVVSAQERQMLADEGDALNKKVLKAE 704
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Zfish   625 SAAVNEAMSKIDKQRKRYEVLSVSLAPPEGEEDKSQAYFIIKAAQEKEELQRKGDELDAKIRKTE 689

  Fly   705 KEVVALENTLRQFDKSNDNYRKTFRSVDENSKDRERAELELKELEAAYCRELEKLKV---LRCKA 766
            ||:.||||||:..:..|..:||....|.|:|...:                 ||||:   .|...
Zfish   690 KEIHALENTLQVVNNCNSTHRKALTKVTESSPAHQ-----------------EKLKLEEQRRAAE 737

  Fly   767 QHYQQKHAAQRAEEEDLISKIEKAKASRAEHSAVLEKIER----------ELDDQRMKLDRANRE 821
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Zfish   738 EKYKYKRRQTQELQEDIESMSNTLEGLLQEEKVLNEGIERTQAHVLSLNKDILSQEEKINRAVKQ 802

  Fly   822 IRTQLREIKARPFSEEYLAQFERDLSLQELEARNTKALNMITDLANSDESGTDIIGI-LLRKGIK 885
            .....:||::...|.|...: |||:.|:||...|.....|:.|....:...:.|:.| ..:.|:.
Zfish   803 CAKYTKEIRSGKQSTEKTFE-ERDIELRELRDFNKSINKMLLDAMEGNPELSSILQIHFTQAGLS 866

  Fly   886 LPMHLKRTCSRVSWNSSSSGKSSQGQDTASYLNVKGKKFSCDGASARSSVSDMS---SLKDDTSS 947
            ||.......||:| :..||.:||.....:|.|:......|...:|.:....|:.   |:.....|
Zfish   867 LPSPSSTPSSRLS-SKPSSARSSASLHRSSNLSASSSPRSQSVSSPQMKTVDLGLGLSVTSPRGS 930

  Fly   948 TTSHSGLSIISLELPLP 964
            ..|.:|.|..|.:...|
Zfish   931 QPSSAGSSRSSSKCKSP 947

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Ccdc39	NP_649495.1	COG4913	105..>338	CDD:443941	61/232 (26%)
		Smc	<253..>831	CDD:440809	150/620 (24%)
ccdc39	NP_001410743.2	Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	866..947		20/81 (25%)