DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment SPoCk and Atp2a3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001262220.1 Gene:SPoCk / 40495 FlyBaseID:FBgn0052451 Length:1062 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_063124535.1 Gene:Atp2a3 / 25391 RGDID:2175 Length:1189 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1056 Identity:328/1056 - (31%)
Similarity:522/1056 - (49%) Gaps:182/1056 - (17%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   107 STSESSTHSASEVAGRLQVDVRTGL---KWTEAKYRAKIIGHNELLLVAEDPTWKKYIEQFRNPL 168
            |..|:...||::|..|..|....||   :.|:|:.|   .|.|||........|:..:|||.:.|
  Rat   190 SMEEAHLLSAADVLRRFSVTAEGGLTLEQVTDARER---YGPNELPTEEGKSLWELVVEQFEDLL 251

  Fly   169 ILLLLGSALVSVIMKQFDDAVSITIA-------ILIVVTVAFI---QEYRSEKSLEELKKLVPPE 223
            :.:||.:||||.::..|::....|.|       :||:|..|.:   ||..:|.::|.||:..|..
  Rat   252 VRILLLAALVSFVLAWFEEGEETTTAFVEPLVIMLILVANAIVGVWQERNAESAIEALKEYEPEM 316

  Fly   224 CHCLREGR--LDTFLARELVPGDIVHLNVGDRVPADVRLFE--AVDLSIDESSFTGETEPARKIT 284
            ...:|..|  :....||::||||||.:.|||:||||:||.|  :..|.:|:|..|||:....|.|
  Rat   317 GKVIRSDRKGVQRIRARDIVPGDIVEVAVGDKVPADLRLIEIKSTTLRVDQSILTGESVSVTKHT 381

  Fly   285 DVLLNNTNVKDHSNMKNIAFMGTLVRCGNGKGIVVSTGERSEFGEVFKMMQAEEAPKTPLQKSMD 349
            |.:.:...|  :.:.||:.|.||.:..|...|:.|:||..:|.|::...|.|.|..:||||:.:|
  Rat   382 DAIPDPRAV--NQDKKNMLFSGTNIASGKALGVAVATGLHTELGKIRSQMAAVEPERTPLQRKLD 444

  Fly   350 ILGAQLSFYSFLIIGVIMLL------------GWLQGKPLSEMFNISVSLAVAAIPEGLPIVVTV 402
            ..|.|||....:|...:.::            .||:|...  .|.|:|:|||||||||||.|:|.
  Rat   445 EFGRQLSHAISVICVAVWVINIGHFADPAHGGSWLRGAVY--YFKIAVALAVAAIPEGLPAVITT 507

  Fly   403 TLALGVMRMAKRNSIVKKLPTVETLGCVNVICSDKTGTLTKNEMTAT---IIITSDG-----YMA 459
            .||||..|||::|:||:.||:||||||.:|||||||||||.|:|:..   ::..::.     :..
  Rat   508 CLALGTRRMARKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMSVCRMFVVAEAEAGACRLHEF 572

  Fly   460 DVTGAGYNDQGEI----HIRHCNNVEMAKTNITNLLEIGAVCNNAYIQNGTL------LGQPTEG 514
            .::|..|..:||:    .:..|...:    .:..|..|.|:||::.:.....      :|:.||.
  Rat   573 TISGTTYTPEGEVRQGEQLVRCGQFD----GLVELATICALCNDSALDYNEAKGVYEKVGEATET 633

  Fly   515 ALVAVAMKNGMYAT-AENYVRIQE-----------------YPFSSEQKMMAVKCIHKYNNNKEE 561
            ||..:..|..::.| .:...|::.                 ..||.::|.|:|.|.....:.|.:
  Rat   634 ALTCLVEKMNVFDTDLKGLSRVERAGACNSVIKQLMRKEFTLEFSRDRKSMSVYCTPTRADPKAQ 698

  Fly   562 --IFFAKGALETLLPQCTKYQFGTQTVPLTKQNEAEFLAEA--YEIGRKGLRVLALA------KG 616
              ..|.|||.|:::.:|:..:.|::||||:..:....||:.  :..|...||.||||      :.
  Rat   699 GSKMFVKGAPESVIERCSSVRVGSRTVPLSATSREHILAKIRDWGSGSDTLRCLALATRDTPPRK 763

  Fly   617 RSMQ------------DLIYCGLVGITDPPRPLVRESIEMLMQSGVRVKMVTGDAQETALAIDPS 669
            ..||            .|.:.|.||:.|||||.|...|....::|:||.|:|||.:.||:||  .
  Rat   764 EDMQLDDCSQFVQYETGLTFVGCVGMLDPPRPEVAACITRCSRAGIRVVMITGDNKGTAVAI--C 826

  Fly   670 RRLQAVPTHAIPAWPTAGGVPLCSASACCSTNCLENAMKEIYLTALAQQGLPLVTANLIGIDTIH 734
            |||                                              |:...|.:::|     
  Rat   827 RRL----------------------------------------------GIFGDTEDVLG----- 840

  Fly   735 HQTLSGQEMDQMNEHQLDKVANNVSVFYRVSPRHKLEIVKSLQRSGNIVGMTGDGVNDGVALKKA 799
             :..:|:|.|.::..|..:.......|.||.|.||..||::||....|..||||||||..|||||
  Rat   841 -KAYTGREFDDLSPEQQRQACRTARCFARVEPAHKSRIVENLQSFNEITAMTGDGVNDAPALKKA 904

  Fly   800 DIGIAMGKNGTDVCKEAADMILVNDDFHTIIAAIEEGKGIFYNIRNFVRFQLSTSIAALALIALA 864
            :|||||| :||.|.|.||:|:|.:|:|.:|:||:|||:.|:.|::.|:|:.:|:::..:..|.|.
  Rat   905 EIGIAMG-SGTAVAKSAAEMVLSDDNFASIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLT 968

  Fly   865 TLMDIANPLNAMQILWINIIMDGPPAQSLGVEPVDHDVLKQKPRNVKQPMIT-----KSVVVNVL 924
            .::.:...|..:|:||:|::.||.||.:||..|.|.|::::.|||.::.:|:     :.:.:.|.
  Rat   969 AILGLPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMEKLPRNPREALISGWLFFRYLAIGVY 1033

  Fly   925 LSASIIVLGTLWV----------------FQREMADGTL--------GKTKRDTTMTFTCFVFFD 965
            :..:.:...|.|.                |.:...|..|        .:::..|||..:..|..:
  Rat  1034 VGLATVAAATWWFLYDAEGPQVTFHQLRNFLKCSEDNPLFAGIDCEVFESRFPTTMALSVLVTIE 1098

  Fly   966 MFNALSCRSQTKSVFTIGLTTNRMFLLAVAFSIIGQMLVVYFPPLQMVFQTEALTPYDIFFLVSL 1030
            |.|||:..|:.:|:..:....|...|.||..|:....|::..|||.::||...|:......::.:
  Rat  1099 MCNALNSVSENQSLLRMPPWLNPWLLGAVVMSMALHFLILLVPPLPLIFQVTPLSGRQWGVVLQM 1163

  Fly  1031 TSSVLVVSEIKKWFER 1046
            :..|:::.|..|:..|
  Rat  1164 SLPVILLDEALKYLSR 1179

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
SPoCkNP_001262220.1 P-type_ATPase_SPCA 139..1042 CDD:319779 315/1015 (31%)
Atp2a3XP_063124535.1 None

Return to query results.
Submit another query.