Protein Alignment Nopp140 and SRP40

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001262195.1
• Gene: Nopp140 / 40433
• FlyBaseID: FBgn0037137
• Length: 773
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_013018.3
• Gene: SRP40 / 853967
• SGDID: S000001800
• Length: 406
• Species: Saccharomyces cerevisiae
• Alignment Length: 684
• Identity: 160/684 - (23%)
• Similarity: 234/684 - (34%)
• Gaps: 299/684 - (43%)

  Fly    29 QKTKAASVAKSSPKLSEILQFYQTKSPKKIPAIKATAGDSSEDSDSDSESDAAPKKPATAPALTN 93
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Yeast     4 KKIKVDEVPKLSVKEKEIEE-------------KSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSGESSSS 55

  Fly    94 GKAVKKAASSTSEDSDSEEEKKPAAKATPAKAVGKKAKSSSEDSSSEEEAPKKAAPVKAPPAKAA 158
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Yeast    56 SSSSSSSSSSDSSDSSDSESSSSSSSSS-------SSSSSSSDSESSSES--------------- 98

  Fly   159 PAKKVESSSEDSSSEEEPAKPAVKATTTKVAPAKKADSSSEESSSDEETKPAAKPVAKAAPAKKA 223
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Yeast    99 -----DSSSSGSSS----------------SSSSSSDESSSESESEDETKKRAR----------- 131

  Fly   224 ASSSEESDSDDEPAAKKPAVQPAAKPAPKAAASSSEDSSSEEEVKPAAKSAAKLAPAKKGASSSD 288
                 |||::|....||...:|       .::||||.|||                   |:|||.
Yeast   132 -----ESDNEDAKETKKAKTEP-------ESSSSSESSSS-------------------GSSSSS 165

  Fly   289 DSSSEDEAPKKAATLAKPISKAAPTKKADSSTEDSSSEDDAPKKVAPAKATPAKAIPAKKAASSD 353
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Yeast   166 ESESGSES------------------DSDSSSSSSSSSD-----------------------SES 189

  Fly   354 DSSSEEEAPKKAAPANATPARAPPAKKAASSDDSSSEEEAPKKAAPAKATPAKATPAKKAASSDD 418
            ||.|:.:                 :..::||.||||:.:                     :||.|
Yeast   190 DSESDSQ-----------------SSSSSSSSDSSSDSD---------------------SSSSD 216

  Fly   419 SSSEEEAPKKAAAPAKATPAKKAKSSSEDSDSDEEEAPKKPAAKAVAKAASSEDSDSSEDEKPAK 483
            |||:.::            :..:.|||.|||||.:               ||.|||||
Yeast   217 SSSDSDS------------SSSSSSSSSDSDSDSD---------------SSSDSDSS------- 247

  Fly   484 AAPKALAKSAKAASSDSDDSSDEETPAVKPAVKKTAAPAKKADSSSDESDSGEESGEVKPNSATN 548
                    .:..:||.||.||||.|                 .|.|.:|||..:||.   :|...
Yeast   248 --------GSSDSSSSSDSSSDEST-----------------SSDSSDSDSDSDSGS---SSELE 284

  Fly   549 GNEKTAQKRKFSGGDQDEATPNKKYNNFVKSGEQQKNDFTSTPNNTFSRNHNMNNSGGGS----- 608
            ..|.||.:.|      .|.||       ..|.|       |||:.:.|.:.|..|...|:
Yeast   285 TKEATADESK------AEETP-------ASSNE-------STPSASSSSSANKLNIPAGTDEIKE 329

  Fly   609 GRRSPFRRVRTEDVVVDSRVQDMSFEAKENDFKKHNNGRGGRGGSGFSGRPDRSTWETNKFNGEG 673
            |:|..|.||..      |::...::|..:|.:|         |.:|        ||      ||.
Yeast   330 GQRKHFSRVDR------SKINFEAWELTDNTYK---------GAAG--------TW------GEK 365

  Fly   674 GGDGGGFKKIGDRKSFGGFDNNQRGGRGGGGRGG 707
            ..:     |:| |.....|..|:...:.|..|||
Yeast   366 ANE-----KLG-RVRGKDFTKNKNKMKRGSYRGG 393

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Nopp140	NP_001262195.1	None
SRP40	NP_013018.3	SRP40_C	334..404	CDD:461525	22/95 (23%)