DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Nopp140 and dao-5

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001262195.1 Gene:Nopp140 / 40433 FlyBaseID:FBgn0037137 Length:773 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001021004.1 Gene:dao-5 / 266845 WormBaseID:WBGene00000931 Length:971 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:908 Identity:333/908 - (36%)
Similarity:413/908 - (45%) Gaps:306/908 - (33%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    21 KNLAKVFQQKTKAASVAKS---SPKLSEILQFYQTKSPKKIPAIKATAGDSSEDSDSDSESDAAP 82
            |..|...|:|.:::|.:.|   :.||:.:      |.|.:.||.|..|  ||.|||||   |..|
 Worm   105 KKSATPVQKKAESSSSSDSDAPAKKLTPV------KKPAQTPAQKKAA--SSSDSDSD---DEPP 158

  Fly    83 KKPATAPALT-------------------------NGKA-------------------VKKAASS 103
            ||   |||:|                         :||:                   .||||||
 Worm   159 KK---APAVTTKVAPKPMAKKQDTSDSDSDSEDSDDGKSKKANPVKVTPVANVLQKVVAKKAASS 220

  Fly   104 TSEDSDSEEEKKPAAKATPA----KAVGKKAKSSSEDSSSEEE-----APKKA------------ 147
            :|:.||  :|||||||.|||    |.|.|||:|||:.|..|::     ||.||            
 Worm   221 SSDSSD--DEKKPAAKPTPAKPTPKPVVKKAESSSDSSDDEKKPVAKPAPAKATPKPAAKKADSS 283

  Fly   148 -------APVKAPPAKAAP---AKKVESSSEDSSSEEEPAKPAVKATTTKVAP---AKKADSSSE 199
                   ||.|..||||||   |||.|||| |||.:|:  |||.|.|..|..|   ||||:|||:
 Worm   284 SDSSDDEAPAKKTPAKAAPKPVAKKAESSS-DSSDDEK--KPAAKPTPAKATPKPVAKKAESSSD 345

  Fly   200 ESSSDEETKPAAKPV-AKAAP---AKKAASSSEESDSDDEPAAKKPAVQPAAKPAPKAAASSSED 260
              |||:|.||.|||. |||.|   ||||.|||:.||.:.:||||....:...||..|.|.|||: 
 Worm   346 --SSDDEKKPVAKPAPAKATPKPVAKKAESSSDSSDDEKKPAAKPTPAKATPKPVAKKAESSSD- 407

  Fly   261 SSSEEEVKPAAK-SAAKLAP---AKKGASSSDDSSSEDEAPKKAATLAKPISKAAP---TKKADS 318
             ||::|.||.|| ::||..|   |||..||||  ||:||||.|     |..:||||   :|||:|
 Worm   408 -SSDDEKKPVAKPTSAKATPKPAAKKADSSSD--SSDDEAPAK-----KTPAKAAPKPASKKAES 464

  Fly   319 STEDSSSEDDAPKKVAPAKATPAKAIP---AKK-AASSDDSSSEEEAP-KKAAPANATPARAPPA 378
            |::  ||:|:.|    .||:||||..|   ||| |:||.|||.:|:.| .|..||||||  .|.|
 Worm   465 SSD--SSDDEKP----AAKSTPAKITPKPTAKKVASSSSDSSDDEKKPAAKPTPANATP--KPVA 521

  Fly   379 KKAASSDDSSSEEEAP---------------KKA----------APAKATPAKATP---AKKAAS 415
            |||.||.|||.:|:.|               |||          ||||.|||||.|   :|||.|
 Worm   522 KKAESSSDSSDDEKKPVAKPTSAKATPKPAAKKADLSSDFSDDEAPAKKTPAKAAPKPASKKAES 586

  Fly   416 SDDSSSEEEAPKKAAAPAKATP---AKKAKSSSEDSDSDEE---------EAPKKPAAKAVAKAA 468
            |.| ||::|.|...:.|||.||   ||||.|||.||..||:         :|..|||||....::
 Worm   587 SSD-SSDDEKPAAKSTPAKTTPKPTAKKAASSSSDSSDDEKKPVAKPTSAKATPKPAAKKADSSS 650

  Fly   469 SSED-------------------------SDSSEDEK------PAKAAPKALAKSAKAASSD--- 499
            .|.|                         ||||:|||      |.|..||::.|.|.|:|||   
 Worm   651 DSSDDEAPAKKTPVKPTPVKIVAKKVDSSSDSSDDEKKPTKATPVKVTPKSVTKKAAASSSDSSD 715

  Fly   500 -----------------------SDDSSDEE-TPAVKPAVKKT-AAPAKKADSSSDESD------ 533
                                   ||||||:| .|..||..|.| ...|||||||.|.||      
 Worm   716 DEKKPVVKQTPNVVPKKEKAASSSDDSSDDEKKPTAKPTPKATPKQSAKKADSSDDSSDDEAPAK 780

  Fly   534 -------------------SGEESGE---VKPNSAT---NGNEKTAQKRKFS--GGDQDE----- 566
                               |.::|.:   .|..|||   ....|||.|:..|  ..|.||     
 Worm   781 KTPAKSTPAKTAVKKEASSSSDDSSDDEKTKKKSATTPAKSTPKTALKKAESSDSSDDDEDLPKP 845

  Fly   567 ---ATPNKKYNNFVKSGEQQKND-----------FTSTPNNTFSRNHNMNNSGGGSGRRSPFRRV 617
               .||..:..:..:|.|.:::.           .|||....:.....         :.||||||
 Worm   846 SKAVTPRPQRADSEESAETEESSSRTPALKAKPLATSTEKAVYENRKR---------KSSPFRRV 901

  Fly   618 R-TEDVVVDSRVQDMSFEAKENDFKKHNNGRGGRGGSGFSGRPDRSTWETNKFNGEGGGDGGG 679
            : |:|.|        |.:.:.|....|.:..|.|..... |:.....:...|...:.|..|||
 Worm   902 QMTKDSV--------SEKFRNNQHDSHFDQWGQRANESL-GKVVGKAFRHEKTKKKKGSYGGG 955

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Nopp140NP_001262195.1 None
dao-5NP_001021004.1 PRK12323 <245..457 CDD:481241 109/225 (48%)
PRK12323 <389..606 CDD:481241 108/234 (46%)
PHA03247 <445..886 CDD:223021 160/454 (35%)
SRP40_C 897..966 CDD:461525 19/68 (28%)

Return to query results.
Submit another query.