Protein Alignment Als2 and rpgrb

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_649347.1
• Gene: Als2 / 40410
• FlyBaseID: FBgn0037116
• Length: 1486
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001299605.1
• Gene: rpgrb / 557752
• ZFINID: ZDB-GENE-081015-2
• Length: 1413
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1210
• Identity: 214/1210 - (17%)
• Similarity: 383/1210 - (31%)
• Gaps: 381/1210 - (31%)

  Fly   163 SCGEVFKAEQQPRHMRLYEEGKELLDLAAGNEHFVMLVAPYNLADDALQLSVASAKEEPEDERAS 227
            |||:        .|..|..|..:|....:.|.             ..|.|...:...:|    ..
Zfish    42 SCGD--------EHTALVTENGKLFMFGSNNW-------------GQLGLGTKTTVNKP----TC 81

  Fly   228 VKSISSGHSERSVAANTRHLLHQGYALLHTQLFT-------FGASNNGLLGSGDHIRRANVMRLQ 285
            ||::.|...:.:....|           ||.:||       .|.:|.|.||.||...|.:...::
Zfish    82 VKALKSERVKLTACGRT-----------HTLVFTSRGNLYACGGNNEGQLGLGDCNDRTSFHLVE 135

  Fly   286 KLDSMG-VCSIAAGLEHTVARTLDGRLYHWGLNNHSQLG----EDVSSPMEITITENTAALPIEQ 345
            ..:..| :..:|||...:.|.|.|||||.||.|:..|:|    .:..:|.|:::.:.
Zfish   136 FFNKQGPIKMLAAGSNTSAALTQDGRLYMWGDNSEGQIGLGKESNALTPQEVSVGKR-------- 192

  Fly   346 NSALEATCGDYHTLLLNASGQIHSLQPAPPMRHLQQSSTYAQTLLQLQLGAAWPRQLRLLMCSGG 410
              ....:||.||:..:...|.:::.......:....:...|...:..|: ...|.::..:.|.||
Zfish   193 --VFWVSCGYYHSAFVTVDGALYTFGEKDSGKLGLSTEKLANHKVPQQV-TDIPDRVVQVACGGG 254

  Fly   411 YTL---QNQ------RQFQRQYHYYLSH----LQSQLQLLLKH--RQAVQTLEIWQRQSALEPLS 460
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Zfish   255 HTVALTENEVYSFGLGQFGQ-----LGHGTFIFESRLPRVVEHFRKGRVKHAACGENHTALITDN 314

  Fly   461 AL---------GPLLINWERI-------LC--LLVATLHSLE--GFYRADFVQPA-----DLLFI 500
            .|         |.|.:..|..       ||  .|...:||:.  |.:.....:|.     ||:.
Zfish   315 GLLYTFGDGRHGKLGLGEENFTNQFKPTLCPRFLDYHVHSVTCGGCHMLVLAKPRTERPDDLIL- 378

  Fly   501 CHYKEYIDLFDGY-TKAYCDVF------------------------SVNGFGEAVVAITGLS-SP 539
                |..|:.:.| .|:|.::.                        |.:.||:....:..|| :.
Zfish   379 ----EEDDVTEDYLEKSYTELLGDTHSQTTLNRSLSARVRRRERERSPDQFGQMFRTLPALSGNQ 439

  Fly   540 LAELNEESYVTRLFQQPFSIYQLFVQFMELL---VRTQSEYGEHRVAWSEFARH----------- 590
            .|.|:..|.:     :|.|.....:....|.   :|.:|......|..||..:.
Zfish   440 SASLSVPSQI-----RPSSKQLGKIPHNSLKTPGIRAKSFDDRSSVEDSESVKDLGETTDLLNLT 499

  Fly   591 SCISQELAVNTKDFWSSNDRNPRIVQFRGRH-------------RRVILTSALVPLKLVTSGISR 642
            ..:..:.:.||........:..::|:..|:.             |..:|:...:|.:|:     |
Zfish   500 HIMKMDPSDNTLTLSPMEKKKVKVVKEHGKEKGKPRDEPTPYSKRAELLSRKALPTELL-----R 559

  Fly   643 SSNSFILFSDFLCQVSGNSLYSYPLTTLWVWTEGDSLRLTTPEKS----------FLVSTR---- 693
            ||             ||:|:.            |||..|.||.||          .|::..
Zfish   560 SS-------------SGSSVV------------GDSRGLGTPHKSPKRRGHDKENVLIALEGRKP 599

  Fly   694 ----------------------------SQEMRKVWLDQLQSSIIASLGKPLGSPVPSYRSTGYE 730
                                        |.:::|...::.|.:....:.:..|:..|:...||..
Zfish   600 GSKTGKGMDKSRAGSKSLKLKHTELMESSDKVKKQSTEKTQQNQEVEVQRSKGTSKPTQEGTGKA 664

  Fly   731 FSREH-----PKFSRV--KACGTWRKGVLHGNCYLEYPDGSVYCGELQHGIIEGFGKMVIPTTGL 788
            .:::|     .:...|  |..|...|.::            :....:...:.....|.|:|....
Zfish   665 KAKDHQLEVKSQLQNVAGKEKGVKSKPII------------IVEQHIDQDLTSKNSKEVLPKVQK 717

  Fly   789 YVGNFKGGRFHGHGVYEMHCKDSPESEVYEGNFCEGL-FHGHGVMRNNRYIYVGEYQANARSGYG 852
            ..|:.|..............|...|.::......:.: ...|.....:......:.:|..|.
Zfish   718 VKGDTKIAETENKSFVPQSKKSGSEKDLKSSKTTKEISTTSHPTSGKDTSAKTKKSRAEQRQ--- 779

  Fly   853 VIEDLVSGDKYMGMFADNKRSGIGSCITNRGDYFEGSFSGDDLTGSGVAVFENDYYYEGELTLLG 917
             :||.:...|.:........|...|.:.:.    |.....:.||               ::|.|
Zfish   780 -VEDKLKKTKMVPTVVSEAASVSESALESE----ENQMKDNPLT---------------KVTSL- 823

  Fly   918 PNGRGEYYMPSGDACGGSGAMGTGEFDDTCELIGNKMFGQLSGTWDTVRIQAGELVLNRRFP-KY 981
                     ..|...|||..           |:|..:..||               |::..| :.
Zfish   824 ---------LQGMGMGGSAL-----------LVGEAVASQL---------------LSQSTPQEM 853

  Fly   982 PSSLGRQVVDHNRKWRSLFNNFESDLANCTASTSSSG------GNQSAGTLRKSSKPTLSTAQIW 1040
            |..|.||        |:|     ||:::.:.|...||      ..::|.|:...:.|..|.
Zfish   854 PKPLSRQ--------RTL-----SDVSSLSESYDVSGQEEAREAERTAVTINVKADPDTSD---- 901

  Fly  1041 NCIAVYMSKQRAREGTKP------GNYFNNILLSLPLPQKTSSPLAKARTTTSALSKLQTEAASA 1099
                  ...:|:|..:|.      |.|           .:......:..:..|...:.:||....
Zfish   902 ------RDTERSRSESKTDAHSEMGTY-----------NRKEEESDEEESEGSVNERDETEDVEE 949

  Fly  1100 LDFLGFPPRRIQSQEALNSKPGGLQRADSLISMGHNTSRDLDNSSLASFQLDQSLMNST--VNGD 1162
            .|.||  .||.:|:|..:|.           |..|:...:.|:.|......|..:.:|:  ...:
Zfish   950 SDGLG--NRRDKSEEVEDSD-----------SKTHDKVGENDDDSEGDEDDDTMIKDSSEEEESE 1001

  Fly  1163 ESSTFNESFSKLSHNNNNSISKHMNNIDCSITSTTSTTSA 1202
            |..|.|::.:|.|..|.....:..:| |..:..|.:..|:
Zfish  1002 EEKTVNDTVTKASSENEEREEEEKSN-DSEVNDTMTKHSS 1040

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Als2	NP_649347.1	ATS1	<238..>367	CDD:444065	36/140 (26%)
		PH-like	616..715	CDD:473070	23/153 (15%)
		COG4642	<745..890	CDD:443680	18/145 (12%)
		PLN03185	835..>962	CDD:215619	20/126 (16%)
		VPS9	1373..1479	CDD:460489
rpgrb	NP_001299605.1	ATS1	40..365	CDD:444065	78/374 (21%)