Protein Alignment Als2 and HERC2

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_649347.1
• Gene: Als2 / 40410
• FlyBaseID: FBgn0037116
• Length: 1486
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_608388.2
• Gene: HERC2 / 33035
• FlyBaseID: FBgn0031107
• Length: 4912
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 953
• Identity: 193/953 - (20%)
• Similarity: 328/953 - (34%)
• Gaps: 277/953 - (29%)

  Fly     6 DDSAL--GGQEERESFTIYHEGRELQLHWRGL--------PPLQRFPASRICSNAGGE--LLLLT 58
            ||.||  ||     :.|||..|...:....||        .|.:.....|....||||  |..:|
  Fly  4039 DDWALSWGG-----ASTIYGWGHNHRGQLGGLEGSRIKTPTPCEALSLLRPVQLAGGEQSLFAVT 4098

  Fly    59 TDHALYSA-------------------KLQANREHMDLQLLRTDVVDMDFCSGSQELFVVLTNGS 104
            .|..|::.                   .|..:.:|:.::.:..:       ||.:....:.|.|.
  Fly  4099 PDGKLFATGYGSGGRLGVGGSDSWAIPTLLGSLQHVFVKKVAVN-------SGGKHCLALTTEGE 4156

  Fly   105 VQRQATGSGRD--VGHPHAWQTLGFDPLEL--HAEGVRIRRVCCSAQGVVFVGASGE--TYVMGS 163
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  Fly  4157 V--YAWGEGEDGKLGHGN---RMSYDRPKLVEHLNGMSVADIACGSAHSAAITASGHVLTWGKGR 4216

  Fly   164 CGEVFKAEQQPR-HMRLYEE--GKELLDLAAGNEHFVMLVAPYNLADDALQLSVASAKEEPEDER 225
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  Fly  4217 YGRLGHGDSEDQLRPKLVEALLGYRAIDIACG-------------SGDAQTLCIT------DDDN 4262

  Fly   226 A-------------------------------SVKSISSGHSERSVAANTRHLLHQGYALLHTQL 259
            .                               .|..:..| |:.|||     |...|      .:
  Fly  4263 VWSWGDGDYGKLGRGGSDGCKLPYKIESLAGLGVVKVECG-SQFSVA-----LTKSG------AV 4315

  Fly   260 FTFGASNNGLLGSG--DHIRRANVMRLQKLDSMGVCSIAAGLEHTVARTLDGRLYHWGLNNHSQL 322
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  Fly  4316 YTWGKGDFHRLGHGSVDHVRRPK--KVAALQGKKIISIATGSLHCVACSDSGEVYTWGDNDEGQL 4378

  Fly   323 GEDVSSPMEITITENTAALPIEQNSALEATCGDYHTLLLNASGQIHSLQPA--PPM-----RHLQ 380
            |:...:    .|........::....::.|||..|||.|:.|.....|:|.  ||:     |.|.
  Fly  4379 GDGTVT----AIQRPRLVAALQGKHIVKVTCGSAHTLALSTSQLSERLRPLPNPPLEYDLVRDLA 4439

  Fly   381 QSSTYAQTLLQLQLGAAWPRQLRLLMCSGGYTLQNQRQFQRQYHYYLSHLQSQLQLLLKH---RQ 442
            ..:.:|:.:|...........|.:|..||..:              |..|:..|...:|.   |:
  Fly  4440 PEALHARLILLHHFSELVCPCLAMLPISGDLS--------------LGALKDVLVYNIKEAAFRK 4490

  Fly   443 AVQTLEIWQRQSALEPLSALGPLLINWERILCLLVATLHSLEGFYRADFVQPADLL--------- 498
            .:||..:..:|..  |:..|..:.:...|..|..:|.:..::..: ...||...||
  Fly  4491 VIQTTMVRDKQHG--PVIELNRIQVKRSRNRCNGLAGIDGMKSVF-GQMVQKLPLLTQEALALPH 4552

  Fly   499 ------FICHYKEYIDLFDGYTKA---YCD----------VFSVNGFGEA------VVAITGLSS 538
                  |:....:  |...||:::   .||          :.:.||.|||      .:....|||
  Fly  4553 RVWKVKFVGESVD--DCGGGYSESIAEMCDELQNGSVPLLINTPNGRGEAGANRDCFLLDPTLSS 4615

  Fly   539 PLAELNEESYVTRLFQQPFSIYQLFVQFMELLVRTQSEYGEH--RVAWSEFARHSCISQELAVNT 601
            .| ::|              :::.....|.:.|||.|....:  ...|.:.........:|....
  Fly  4616 VL-QMN--------------MFRFLGVLMGIAVRTGSPLSINLAEPVWRQLTGEVLRPTDLTEVD 4665

  Fly   602 KDFWS------SNDRNPRIVQFRGRHRRVILTSAL---VPLKLVTSGISRSSNSFILFSDFLCQV 657
            :|:.:      :.|.:|::  |.........:||.   |||....:.||..:.     ::::...
  Fly  4666 RDYVAGLLCIRNMDDDPKL--FTALELPFSTSSARGHEVPLSTRYTHISPRNR-----AEYVRLA 4723

  Fly   658 SGNSLYSYPLTTLWVWTEGDSLRLTTPEKSFLVSTRSQEMRKVWLDQLQSSIIASLGKPLG--SP 720
            .|..|:.:......| .:|.|..:..|..|...:.           :||:.:..|...|||  ..
  Fly  4724 LGFRLHEFDEQVKAV-RDGMSKVIPVPLLSLFSAA-----------ELQAMVCGSPDIPLGLLKS 4776

  Fly   721 VPSYRSTGYEFSREHPKFSRVKACGTWRKGVL------HGNCYLEYPDGSVYCGELQHGIIEGFG 779
            |.:|:.           |....|..||...|:      ..:.:|.:.                :|
  Fly  4777 VATYKG-----------FDPSSALVTWFWEVMEEFTNQERSLFLRFV----------------WG 4814

  Fly   780 KMVIPTTGLYVGNFKGGRFHGHGVYEMHCKDSPESEVYEGNFC 822
            :..:|.|   :.:|:|..|    |.::..|:.|:..:.|...|
  Fly  4815 RTRLPRT---IADFRGRDF----VLQVLEKNPPDHFLPESYTC 4850

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Als2	NP_649347.1	ATS1	<238..>367	CDD:444065	39/130 (30%)
		PH-like	616..715	CDD:473070	18/101 (18%)
		COG4642	<745..890	CDD:443680	15/84 (18%)
		PLN03185	835..>962	CDD:215619
		VPS9	1373..1479	CDD:460489
HERC2	NP_608388.2	ATS1	625..>894	CDD:444065
		Cyt-b5	1292..1364	CDD:459698
		MIB_HERC2	1928..1988	CDD:461991
		UBA_HERC2	2515..2559	CDD:270585
		Cul7	2624..2699	CDD:463286
		APC10-HERC2	2762..2932	CDD:176485
		ATS1	2987..3320	CDD:444065
		RCC1	3302..3350	CDD:395335
		ATS1	4050..4389	CDD:444065	84/387 (22%)
		HECTc	4509..4880	CDD:238033	73/413 (18%)