DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment LRP2 and lrp2a

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_004516.2 Gene:LRP2 / 4036 HGNCID:6694 Length:4655 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001181916.3 Gene:lrp2a / 568184 ZFINID:ZDB-GENE-050119-2 Length:4673 Species:Danio rerio


Alignment Length:4692 Identity:3079/4692 - (65%)
Similarity:3747/4692 - (79%) Gaps:73/4692 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human    12 LLLALVACLAPASGQECDSAHFRCGSGHCIPADWRCDGTKDCSDDADEIGCAVVTCQQGYFKCQS 76
            |:|.|.|......|..|:|..||||:|.|||...|||||.||||::|||||...||:...|:|.|
Zfish     7 LILTLCALQCDCQGSGCESGFFRCGTGRCIPVSQRCDGTNDCSDNSDEIGCPQPTCESAQFQCLS 71

Human    77 EGQCIPNSWVCDQDQDCDDGSDERQDCSQSTCSSHQITCSNGQCIPSEYRCDHVRDCPDGADEND 141
            :|:|||..||||.::||:|||||||.|...||||.|.||:||.|||..||||.|.||.|||||.:
Zfish    72 DGECIPQHWVCDDEEDCEDGSDERQHCPGRTCSSSQFTCTNGACIPGGYRCDRVPDCLDGADERN 136

Human   142 CQYPTCEQLTCDNGACYNTSQKCDWKVDCRDSSDEINCTEICLHNEFSCGNGECIPRAYVCDHDN 206
            |.||.|.:|.|.||||:|.||:||..::|||.|||.|||:.|...:|.|.|||||||.|:||||:
Zfish   137 CFYPECSELRCANGACFNRSQRCDQVLNCRDGSDEANCTQRCSSGQFQCSNGECIPRGYICDHDD 201

Human   207 DCQDGSDEHACNYPTCGGYQFTCPSGRCIYQNWVCDGEDDCKDNGDEDGCESGPHDVHKCSPREW 271
            ||.|.|||..|.||||.|..|||||||||:|.|:|||||||:||.||.||::...:   |.|.||
Zfish   202 DCGDRSDEQNCTYPTCRGTYFTCPSGRCIHQVWLCDGEDDCEDNADEKGCDNVQRE---CYPGEW 263

Human   272 SCPESGRCISIYKVCDGILDCPGREDENNTSTGKYCSMTLCSALNCQYQCHETPYGGACFCPPGY 336
            .||.||.||....:|||.:.||..|||.|.:.|:.||:..|::|:|::.||.:|.||.|.|||||
Zfish   264 PCPSSGVCIPFDHLCDGTVHCPDGEDETNITAGRNCSIWRCASLSCEHHCHASPDGGTCACPPGY 328

Human   337 IINHNDSRTCVEFDDCQIWGICDQKCESRPGRHLCHCEEGYILERGQYCKANDSFGEASIIFSNG 401
            :||.||||:|:::|||.:||:|||.||.|.|.|.|.|.:|||||:.:||:||.|.|..|:|||||
Zfish   329 VINTNDSRSCMDYDDCSLWGMCDQLCEDRIGSHRCSCRDGYILEQHRYCRANPSSGVPSLIFSNG 393

Human   402 RDLLIGDIHGRSFRILVESQNRGVAVGVAFHYHLQRVFWTDTVQNKVFSVDINGLNIQEVLNVSV 466
            |||||.|:||...:.||:|||||.||||.|||.|||||||||:||||||||::|..:|.||||||
Zfish   394 RDLLIADVHGHGSQTLVQSQNRGAAVGVDFHYQLQRVFWTDTIQNKVFSVDMDGSRLQVVLNVSV 458

Human   467 ETPENLAVDWVNNKIYLVETKVNRIDMVNLDGSYRVTLITENLGHPRGIAVDPTVGYLFFSDWES 531
            :.||||||||||||:|:||..|||||||:||||.|||||.|:||:|||:|:||||||||||||::
Zfish   459 DYPENLAVDWVNNKLYVVEASVNRIDMVDLDGSNRVTLIAEHLGNPRGLALDPTVGYLFFSDWDT 523

Human   532 LSGEPKLERAFMDGSNRKDLVKTKLGWPAGVTLDMISKRVYWVDSRFDYIETVTYDGIQRKTVVH 596
            |:|||.||||:|||:||..:::||||||||:|||:.:|||||||||:|||||.||||:.||||||
Zfish   524 LNGEPGLERAYMDGTNRYGIIRTKLGWPAGITLDLEAKRVYWVDSRYDYIETTTYDGLHRKTVVH 588

Human   597 GGSLIPHPFGVSLFEGQVFFTDWTKMAVLKANKFTETNPQVYYQASLRPYGVTVYHSLRQPYATN 661
            |||:||||||::|||..|::||||||||:||||::::|||..|:.:.||||:||.||.:||:.:|
Zfish   589 GGSVIPHPFGITLFEHSVYYTDWTKMAVMKANKYSDSNPQELYRTTQRPYGLTVVHSYKQPFVSN 653

Human   662 PCKDNNGGCEQVCVLSHRTDNDGLGFRCKCTFGFQLDTDERHCIAVQNFLIFSSQVAIRGIPFTL 726
            ||..:..|||.:|||||||||.|||:||:|..|:.|..|.:.|:||:.||:||||:|:|||||.|
Zfish   654 PCGADRRGCEHICVLSHRTDNGGLGYRCRCRMGYDLHADGKRCVAVRQFLLFSSQLAVRGIPFNL 718

Human   727 STQEDVMVPVSGNPSFFVGIDFDAQDSTIFFSDMSKHMIFKQKIDGTGREILAANRVENVESLAF 791
            |||||:::|::|.||:|||:||.|:|::|||||..|.:|:|||:||||||:||||||:.||.||:
Zfish   719 STQEDIILPITGTPSYFVGVDFSAEDNSIFFSDTVKDIIYKQKVDGTGREVLAANRVDGVEDLAY 783

Human   792 DWISKNLYWTDSHYKSISVMRLADKTRRTVVQYLNNPRSVVVHPFAGYLFFTDWFRPAKIMRAWS 856
            |||||||||||..|:|||||::|||:||.:|:.||||||:||||.||::|:|||:|||||||||.
Zfish   784 DWISKNLYWTDPRYRSISVMKVADKSRRAIVRNLNNPRSIVVHPVAGFIFWTDWYRPAKIMRAWG 848

Human   857 DGSHLLPVINTTLGWPNGLAIDWAASRLYWVDAYFDKIEHSTFDGLDRRRLGHIEQMTHPFGLAI 921
            ||||...::||||||||||||||:|.|||||||:|||||||.|||.:|..|..|.|::|||||.:
Zfish   849 DGSHAQSIVNTTLGWPNGLAIDWSAMRLYWVDAFFDKIEHSNFDGQNRLSLDRITQISHPFGLTV 913

Human   922 FGEHLFFTDWRLGAIIRVRKADGGEMTVIRSGIAYILHLKSYDVNIQTGSNACNQPTHPNGDCSH 986
            ||.:::|||||||.|:||||.|||||..||.||::|:|:||::.:.|.|.|.|::.|:|||||||
Zfish   914 FGGYVYFTDWRLGGIVRVRKTDGGEMMTIRRGISHIMHVKSFNADSQIGFNFCSRQTNPNGDCSH 978

Human   987 FCFPVPNFQRVCGCPYGMRLASNHLTCEGDPTNEPPTEQCGLFSFPCKNGRCVPNYYLCDGVDDC 1051
            ||||.||.||||||||||:|.:|..||..||:|||||.|||..||.|.||||||:.|.|||||||
Zfish   979 FCFPAPNSQRVCGCPYGMKLEANQQTCVDDPSNEPPTLQCGSNSFSCTNGRCVPHSYQCDGVDDC 1043

Human  1052 HDNSDEQLCGTLNNTCSSSAFTCGHGECIPAHWRCDKRNDCVDGSDEHNCPTHAPASCLDTQYTC 1116
            ||||||..||..|||||..||||.:..|:|..|.||..|||.|||||.:|||..|.:|...|:.|
Zfish  1044 HDNSDEAHCGAHNNTCSPLAFTCANQRCVPRSWHCDGHNDCFDGSDERDCPTQTPGTCPADQFIC 1108

Human  1117 DNHQCISKNWVCDTDNDCGDGSDEKNCNSTETCQPSQFNCPNHRCIDLSFVCDGDKDCVDGSDEV 1181
            .||.||.:.|:|||||||||||||.||:|..||.|.||.||:|||||.::|||||:||.||:||.
Zfish  1109 ANHYCIPRTWLCDTDNDCGDGSDENNCDSIGTCYPGQFQCPDHRCIDPNYVCDGDRDCADGADEQ 1173

Human  1182 GCVLNCTASQFKCASGDKCIGVTNRCDGVFDCSDNSDEAGCPTRPPGMCHSD-EFQCQEDGICIP 1245
            |||.||||.:||||:|.:|:....||||||||:|.|||:|||||||||||.: |||||.||.|:|
Zfish  1174 GCVYNCTAYEFKCANGHQCVNSYYRCDGVFDCNDRSDESGCPTRPPGMCHHESEFQCQSDGSCVP 1238

Human  1246 NFWECDGHPDCLYGSDEHNACVPKTCPSSYFHCDNGNCIHRAWLCDRDNDCGDMSDEKDCPTQPF 1310
            ..|||||||||..|||||:||.|:|||::.|.||||||::|.|:||.||||.|.|||:||||.||
Zfish  1239 VNWECDGHPDCEDGSDEHHACPPRTCPTTQFRCDNGNCVYRGWICDGDNDCRDGSDERDCPTPPF 1303

Human  1311 RCPSWQWQCLGHNICVNLSVVCDGIFDCPNGTDESPLCN-----GNSCSDFNGGCTHECVQEPFG 1370
            |||||||||.||::|||||.|||...|||||.|||||||     ..||||.|.||||.|:|.|||
Zfish  1304 RCPSWQWQCPGHSVCVNLSRVCDNTPDCPNGADESPLCNEPLPDQESCSDNNAGCTHGCIQGPFG 1368

Human  1371 AKCLCPLGFLLANDSKTCEDIDECDILGSCSQHCYNMRGSFRCSCDTGYMLESDGRTCKVTASES 1435
            |:|.||:||.|:||||||||||||...|.|||||:|.||||||.|..||.||:|.||||.:.|..
Zfish  1369 AQCTCPMGFQLSNDSKTCEDIDECHPPGVCSQHCFNERGSFRCHCQDGYTLEADARTCKASGSRE 1433

Human  1436 LLLLVASQNKIIADSVTSQVHNIYSLVENGSYIVAVDFDSISGRIFWSDATQGKTWSAFQNGTDR 1500
            .||||||:|:||:|.:.:|.:.|.|||.:|..||||||||::.||:|||.||.:.|||.:|||||
Zfish  1434 ALLLVASRNQIISDDILAQPNAIRSLVRDGRNIVAVDFDSVTERIYWSDTTQDRIWSAHKNGTDR 1498

Human  1501 RVVFDSSIILTETIAIDWVGRNLYWTDYALETIEVSKIDGSHRTVLISKNLTNPRGLALDPRMNE 1565
            .|:|||.:.:||::|:||||||||||||.||||||||:||||||||||:|:||||||.:|||.|.
Zfish  1499 TVIFDSGVTVTESLAVDWVGRNLYWTDYILETIEVSKLDGSHRTVLISENVTNPRGLVVDPRNNT 1563

Human  1566 HLLFWSDWGHHPRIERASMDGSMRTVIVQDKIFWPCGLTIDYPNRLLYFMDSYLDYMDFCDYNGH 1630
            ||:||:|||.:||||||||||.:||.|:.:|::||.||||||||.||||.|:|||::|:|||:|.
Zfish  1564 HLMFWTDWGRNPRIERASMDGKLRTTIISNKLYWPNGLTIDYPNSLLYFADAYLDFIDYCDYDGK 1628

Human  1631 HRRQVIASDLIIRHPYALTLFEDSVYWTDRATRRVMRANKWHGGNQSVVMYNIQWPLGIVAVHPS 1695
            :|:||:||||:::||:|:|:|||.||||||...||:|||||||.||||::||:..|:|:||:||:
Zfish  1629 NRKQVLASDLVLQHPHAITIFEDFVYWTDRYVNRVIRANKWHGQNQSVMLYNLPQPMGLVALHPA 1693

Human  1696 KQPNSVNPC--AFSRCSHLCLLSSQGPHFYSCVCPSGWSLSPDLLNCLRDDQPFLITVRQHIIFG 1758
            :||...|||  ..|.|:|:||||:.||.||||.|||||:|:.|...|.|.:.|||:.||..||:|
Zfish  1694 RQPAGYNPCDPHSSPCTHICLLSAVGPRFYSCACPSGWTLAADQFTCARVEDPFLVVVRDSIIYG 1758

Human  1759 ISLNPEVKSNDAMVPIAGIQNGLDVEFDDAEQYIYWVENPGEIHRVKTDGTNRTVFASISMVGPS 1823
            |.|||..||||||||:||:.||.||:||||||.|||||:||||||||:||||||.||..:::|..
Zfish  1759 IPLNPNDKSNDAMVPVAGLLNGYDVDFDDAEQMIYWVEHPGEIHRVKSDGTNRTEFAPAAILGSP 1823

Human  1824 MNLALDWISRNLYSTNPRTQSIEVLTLHGDIRYRKTLIANDGTALGVGFPIGITVDPARGKLYWS 1888
            :.|||||:|:|||.:||.:|:||||.|.|:|::|||||.|:|:..|.|.|:||.|||||||:||:
Zfish  1824 VGLALDWMSQNLYYSNPSSQAIEVLRLKGEIQFRKTLITNNGSPTGAGAPVGIAVDPARGKMYWT 1888

Human  1889 DQGTDSGVPAKIASANMDGTSVKTLFTGNLEHLECVTLDIEEQKLYWAVTGRGVIERGNVDGTDR 1953
            |.||:||:|||:|||:|||::...|||.||||:|.:|:||.|.||||||||.||||||:.||::|
Zfish  1889 DHGTESGIPAKVASADMDGSNAAILFTHNLEHVEFITIDITENKLYWAVTGTGVIERGDPDGSNR 1953

Human  1954 MILVHQLSHPWGIAVHDSFLYYTDEQYEVIERVDKATGANKIVLRDNVPNLRGLQVYHRRNAAES 2018
            :.:|:.||||||:||:.|:||:||..:|||||||||||.|::|:||||..||.|:|:||.::|.|
Zfish  1954 ITMVNGLSHPWGVAVYGSYLYFTDRDFEVIERVDKATGLNRVVMRDNVAGLRVLKVHHRDSSAGS 2018

Human  2019 SNGCSNNMNACQQICLPVPGGLFSCACATGFKLNPDNRSCSPYNSFIVVSMLSAIRGFSLELSDH 2083
            |||||||:..|:|:|||.|||||||||||||||:.|||:||||.|::|:|||:||:|||||..||
Zfish  2019 SNGCSNNVGTCEQLCLPRPGGLFSCACATGFKLSADNRTCSPYQSYVVISMLTAIKGFSLEGVDH 2083

Human  2084 SETMVPVAGQGRNALHVDVDVSSGFIYWCDFSSSVASDNAIRRIKPDGSSLMNIVTHGIGENGVR 2148
            ||:||||||:|||||||||.::|.|||||||||:|||.|.|||||||||...:|||.|||.||:|
Zfish  2084 SESMVPVAGRGRNALHVDVHMASSFIYWCDFSSTVASQNGIRRIKPDGSGFRSIVTSGIGRNGIR 2148

Human  2149 GIAVDWVAGNLYFTNAFVSETLIEVLRINTTYRRVLLKVTVDMPRHIVVDPKNRYLFWADYGQRP 2213
            ||||||.||||||||||::||.|||:|:|||:||||||..|||||||||||||||||||||||.|
Zfish  2149 GIAVDWAAGNLYFTNAFLTETYIEVIRLNTTFRRVLLKTQVDMPRHIVVDPKNRYLFWADYGQTP 2213

Human  2214 KIERSFLDCTNRTVLVSEGIVTPRGLAVDRSDGYVYWVDDSLDIIARIRINGENSEVIRYGSRYP 2278
            ||||:|||.:|||.|||.|||||||||:|..|||:||||||||:|||:|..|..:||:|||||||
Zfish  2214 KIERAFLDGSNRTALVSSGIVTPRGLALDHRDGYIYWVDDSLDMIARVRPEGGETEVVRYGSRYP 2278

Human  2279 TPYGITVFENSIIWVDRNLKKIFQASKEPENTEPPTVIRDNINWLRDVTIFDKQVQPRSPAEVNN 2343
            |||||||||.::|||||||||:|:|||:|..|:.|.|||||||.||||||||:::||.|..|:||
Zfish  2279 TPYGITVFEGNVIWVDRNLKKVFRASKQPGATDQPAVIRDNINMLRDVTIFDRRMQPSSAHELNN 2343

Human  2344 NPCLENNGGCSHLCFALPGLHTPKCDCAFGTLQSDGKNCAISTENFLIFALSNSLRSLHLDPENH 2408
            |||||:||||:|.|||:.|..|.||.||||.|.:|..:|.:|.:::||:...:::|||.|||::|
Zfish  2344 NPCLESNGGCAHFCFAMAGAQTRKCSCAFGNLAADDSSCVVSRDDYLIYTTESTVRSLRLDPDDH 2408

Human  2409 SPPFQTINVERTVMSLDYDSVSDRIYFTQNLASGVGQISYATLSSGIHTPTVIASGIGTADGIAF 2473
            |.||..:||.||.::||:|.:..||||||:..:|..:||:.||:|.....|.:||.:|..||||:
Zfish  2409 SLPFPVVNVPRTSVALDFDRLDGRIYFTQSSGAGQSKISFITLASPTSPATEVASDLGAPDGIAY 2473

Human  2474 DWITRRIYYSDYLNQMINSMAEDGSNRTVIARVPKPRAIVLDPCQGYLYWADWDTHAKIERATLG 2538
            |||.||||||||:||.|:|||.|||.|||:|:||:||||:||||:||:||.||.|.|||||||||
Zfish  2474 DWINRRIYYSDYINQTISSMAVDGSQRTVVAQVPRPRAIMLDPCRGYMYWTDWGTSAKIERATLG 2538

Human  2539 GNFRVPIVNSSLVMPSGLTLDYEEDLLYWVDASLQRIERSTLTGVDREVIVNAAVHAFGLTLYGQ 2603
            ||||..|||:|||.|:||||||::..|||.|||||:|||.:|||.:|||||:.|::.|.:|:|.|
Zfish  2539 GNFRTEIVNTSLVWPNGLTLDYDDQRLYWADASLQKIERCSLTGTNREVIVSTAIYPFAMTVYDQ 2603

Human  2604 YIYWTDLYTQRIYRANKYDGSGQIAMTTNLLSQPRGINTVVKNQKQQCNNPCEQFNGGCSHICAP 2668
            :|||||..|:.||||||:|||.|..|..||.|:|..|:.:..:::|||::|||||||||||||.|
Zfish  2604 HIYWTDWNTRSIYRANKHDGSDQRVMLQNLPSRPMDIHVLSNSKQQQCSSPCEQFNGGCSHICTP 2668

Human  2669 GPNGAECQCPHEGNWYLANNRKHCIVDNGERCGASSFTCSNGRCISEEWKCDNDNDCGDGSDEME 2733
            ||.|||||||.||.||||:| ||||.|||.||....|||.|||||..:||||||:||||||||:|
Zfish  2669 GPQGAECQCPSEGRWYLADN-KHCIPDNGTRCQPGQFTCMNGRCIRSQWKCDNDDDCGDGSDELE 2732

Human  2734 SVC-------------------ALHTCSPTAFTCANGRCVQYSYRCDYYNDCGDGSDEAGCLFRD 2779
            .||                   |.|||.||.|||.|||||.|.||||:||||||.|||.||:||.
Zfish  2733 RVCGSKHHFVFVRQAAAFISLSAFHTCEPTVFTCGNGRCVPYHYRCDHYNDCGDNSDETGCIFRP 2797

Human  2780 CNATTEFMCNNRRCIPREFICNGVDNCHDNNTSDEKNCPDRTCQSGYTKCHNSNICIPRVYLCDG 2844
            |:..|||.|||.|||.||:||||::||:||.||||:|||:||||..:|||.::||||||.|||||
Zfish  2798 CDPNTEFSCNNGRCIAREYICNGINNCYDNGTSDEQNCPERTCQPEHTKCQSTNICIPRSYLCDG 2862

Human  2845 DNDCGDNSDENPTYCTTHTCSSSEFQCASGRCIPQHWYCDQETDCFDASDEPASCGHSERTCLAD 2909
            ||||||||||:||:|.|.|||.:||:|:||||||.|||||..|||.|.||||.:|....|||.::
Zfish  2863 DNDCGDNSDESPTHCATSTCSHNEFRCSSGRCIPGHWYCDGGTDCNDGSDEPITCTSLVRTCNSE 2927

Human  2910 EFKCDGGRCIPSEWICDGDNDCGDMSDEDKRHQCQNQNCSDSEFLCVNDRPPDRRCIPQSWVCDG 2974
            :|:||.||||.|.||||||||||||||||:||.|.|:.||..||.|||:|||.|:|||:.|||||
Zfish  2928 QFRCDDGRCIASSWICDGDNDCGDMSDEDQRHNCANRTCSAQEFTCVNNRPPQRKCIPRDWVCDG 2992

Human  2975 DVDCTDGYDENQNCTRRTCSENEFTCGYGLCIPKIFRCDRHNDCGDYSDERGCLYQTCQQNQFTC 3039
            |.||:|.:||:||||||:||.|||||..||||...:||||.|||||.|||:||.||.|||:||||
Zfish  2993 DADCSDAFDEHQNCTRRSCSTNEFTCNNGLCIRSSYRCDRRNDCGDSSDEQGCTYQPCQQHQFTC 3057

Human  3040 QNGRCISKTFVCDEDNDCGDGSDELMHLCHTPEPTCPPHEFKCDNGRCIEMMKLCNHLDDCLDNS 3104
            |||||||:.|:||.||||||.||||.|||..|.||||...|:||||.|:...::|:..|||.|||
Zfish  3058 QNGRCISRDFLCDGDNDCGDESDELDHLCRMPAPTCPSGHFRCDNGNCLPQSQVCDRNDDCSDNS 3122

Human  3105 DEKGCGINECHDPSISGCDHNCTDTLTSFYCSCRPGYKLMSDKRTCVDIDECTEMPFVCSQKCEN 3169
            ||||||||||.|||:..||||||||||||.|:|||||:||||.:||.|||||:..|.||||.|||
Zfish  3123 DEKGCGINECTDPSMHHCDHNCTDTLTSFICTCRPGYRLMSDNKTCDDIDECSVTPSVCSQVCEN 3187

Human  3170 VIGSYICKCAPGYLREPDGKTCRQNSNIEPYLIFSNRYYLRNLTIDGYFYSLILEGLDNVVALDF 3234
            .:|||:||||||:||||||.:|||||||.||||||||||||||:.||..|||||:||.:||||||
Zfish  3188 TLGSYVCKCAPGFLREPDGHSCRQNSNIHPYLIFSNRYYLRNLSTDGEAYSLILQGLSSVVALDF 3252

Human  3235 DRVEKRLYWIDTQRQVIERMFLNKTNKETIINHRLPAAESLAVDWVSRKLYWLDARLDGLFVSDL 3299
            |||:|||||||..|:|:||||.|.|.:|.::|..| ..|.|||||:.|||||:|:.||.|.||:|
Zfish  3253 DRVDKRLYWIDVSRRVLERMFFNGTGREAVVNGVL-HGEGLAVDWIGRKLYWVDSFLDCLKVSEL 3316

Human  3300 NGGHRRMLAQHCVDANNTFCFDNPRGLALHPQYGYLYWADWGHRAYIGRVGMDGTNKSVIISTKL 3364
            :|...|.||:||||.|:|:||.|||.:.|||::||:||.|||.||:||||||||.|||.||:||:
Zfish  3317 DGRFVRKLAEHCVDDNHTYCFQNPRAVVLHPKFGYVYWTDWGERAFIGRVGMDGNNKSAIITTKI 3381

Human  3365 EWPNGITIDYTNDLLYWADAHLGYIEYSDLEGHHRHTVYDGALPHPFAITIFEDTIYWTDWNTRT 3429
            |||||:|||||||.|||:||||.|||:|||:|.||||||||.||||||||:||||:|||||||||
Zfish  3382 EWPNGLTIDYTNDKLYWSDAHLNYIEFSDLDGRHRHTVYDGVLPHPFAITVFEDTLYWTDWNTRT 3446

Human  3430 VEKGNKYDGSNRQTLVNTTHRPFDIHVYHPYRQPIVSNPCGTNNGGCSHLCLIKPGGKGFTCECP 3494
            |||||||:||.|:.|||||||||||||.||||||||:|||..||||||||||::.||:|:|||||
Zfish  3447 VEKGNKYNGSGREMLVNTTHRPFDIHVCHPYRQPIVTNPCALNNGGCSHLCLLRAGGQGYTCECP 3511

Human  3495 DDFRTLQLSGSTYCMPMCSSTQFLCANNEKCIPIWWKCDGQKDCSDGSDELALCPQRFCRLGQFQ 3559
            |.|.|:|::|...|:|||||||:.||:||:|||||||||||:||.|||||.:.||.|.|||||||
Zfish  3512 DHFLTVQIAGVARCLPMCSSTQYRCADNERCIPIWWKCDGQRDCRDGSDEPSTCPVRHCRLGQFQ 3576

Human  3560 CSDGNCTSPQTLCNAHQNCPDGSDEDRLLCENHHCDSNEWQCANKRCIPESWQCDTFNDCEDNSD 3624
            |:|||||||..|||::|:||||||||.:||..|.|:|::|||||||||.|:||||..|||.|.||
Zfish  3577 CNDGNCTSPHFLCNSNQDCPDGSDEDTVLCATHQCESHQWQCANKRCISEAWQCDGENDCGDGSD 3641

Human  3625 EDSSHCASRTCRPGQFRCANGRCIPQAWKCDVDNDCGDHSDEPIEECMSSAHLCDNFTEFSCKTN 3689
            ||.:||:|||||||||:|.||||||..||||||:||||:|||||||||..|:.|||.|||.|:||
Zfish  3642 EDPAHCSSRTCRPGQFKCRNGRCIPNTWKCDVDDDCGDNSDEPIEECMGPAYRCDNHTEFDCRTN 3706

Human  3690 YRCIPKWAVCNGVDDCRDNSDEQGCEERTCHPVGDFRCKNHHCIPLRWQCDGQNDCGDNSDEENC 3754
            |||:|.||||||.:|||||||||.|||.||.|.|||||.||.||||||:|||.|||||.|||.||
Zfish  3707 YRCVPLWAVCNGHNDCRDNSDEQNCEELTCEPSGDFRCDNHQCIPLRWRCDGDNDCGDGSDELNC 3771

Human  3755 APRECTESEFRCVNQQCIPSRWICDHYNDCGDNSDERDCEMRTCHPEYFQCTSGHCVHSELKCDG 3819
            :||.|||||:||.|..|||.||:|||.|||.|||||||||:|||||.||||.||||:....||||
Zfish  3772 SPRPCTESEYRCDNLHCIPDRWVCDHDNDCEDNSDERDCELRTCHPGYFQCASGHCIAERFKCDG 3836

Human  3820 SADCLDASDEADCPTRFPDGAYCQATMFECKNHVCIPPYWKCDGDDDCGDGSDEELHLCLDVPCN 3884
            :|||||.|||:.||||:|:..||...:||||||||:..:|.||||:||||.||||||||||:.|:
Zfish  3837 NADCLDFSDESSCPTRYPNSTYCPPFLFECKNHVCVQQHWICDGDNDCGDNSDEELHLCLDISCD 3901

Human  3885 SPNRFRCDNNRCIYSHEVCNGVDDCGDGTDETEEHCRKPTPKPCTEYEYKCGNGHCIPHDNVCDD 3949
            .|.|||||||||||||||||.:|||||||||..|||..||..||:..|||||||.|||....|||
Zfish  3902 PPFRFRCDNNRCIYSHEVCNSIDDCGDGTDERAEHCVTPTHGPCSADEYKCGNGQCIPLQYACDD 3966

Human  3950 ADDCGDWSDELGCNKGKERTCAENICEQNCTQLNEGGFICSCTAGFETNVFDRTSCLDINECEQF 4014
            .|||.|.||||||..|..|:|:||:||.|||.|:.|||||||..|::.|..|:.:|.|::|||.:
Zfish  3967 YDDCEDQSDELGCYFGHGRSCSENLCEHNCTDLSAGGFICSCRPGYKPNPEDKNTCEDVDECEIY 4031

Human  4015 GTCPQHCRNTKGSYECVCADGFTSMSDRPGKRCAAEGSSPLLLLPDNVRIRKYNLSSERFSEYLQ 4079
            |||||.|:||||||||.||:||.|:.::||..|||||:.|:||||||||||::||||.::|:|:.
Zfish  4032 GTCPQLCKNTKGSYECFCAEGFRSVGEQPGVECAAEGNPPVLLLPDNVRIRRFNLSSAQYSDYVD 4096

Human  4080 DEEYIQAVDYDWDPKDIGLSVVYYTVRGEGSRFGAIKRAYIPNFESGRNNLVQEVDLKLKYVMQP 4144
            :.|:|||:||.|||:.:|||:||:||.|.||.||:|||||:..|:...||.|:||||.|:||..|
Zfish  4097 NAEHIQALDYLWDPEGLGLSIVYWTVLGRGSDFGSIKRAYMTTFDDHGNNPVKEVDLNLRYVSSP 4161

Human  4145 DGIAVDWVGRHIYWSDVKNKRIEVAKLDGRYRKWLISTDLDQPAAIAVNPKLGLMFWTDWGKEPK 4209
            |||||||:||||||:|....||||||||||||||||..||||||||.|||.||.|||||||::|:
Zfish  4162 DGIAVDWIGRHIYWTDAGTNRIEVAKLDGRYRKWLIHNDLDQPAAIVVNPSLGKMFWTDWGRKPR 4226

Human  4210 IESAWMNGEDRNILVFEDLGWPTGLSIDYLNNDRIYWSDFKEDVIETIKYDGTDRR-VIAKEAMN 4273
            ||:|||:|:.|.:|:.|||||||||::||||.:||||.|.||::||::|.||:||: :|:.:..:
Zfish  4227 IETAWMDGQQREVLLDEDLGWPTGLALDYLNENRIYWCDSKENIIESMKVDGSDRQIIISGDIGH 4291

Human  4274 PYSLDIFEDQLYWISKEKGEVWKQNKFGQGKKEKTLVVNPWLTQVRIFHQLRYNKSVPNLCKQIC 4338
            |||||:||..:||.:||||||||::|||:|.|.|.|.:|||||||||:.:.|:|.||.|.|:..|
Zfish  4292 PYSLDVFEGHVYWTTKEKGEVWKKDKFGKGDKVKVLTINPWLTQVRIYQEHRHNHSVMNPCQDAC 4356

Human  4339 SHLCLLRPGGYSCACPQGSSFIEGSTTECDAAIELPINLPPPCRCMHGGNCYFDETDLPKCKCPS 4403
            ||||||||||::|||||||:.:..:..:||||||..:::|..||||:||.|:.||..|||||||.
Zfish  4357 SHLCLLRPGGFTCACPQGSTLLTFNKNQCDAAIEAEVSMPLACRCMNGGTCFTDEGGLPKCKCPY 4421

Human  4404 GYTGKYCEMAFSKGISPGTTAVAVLLTILLIVVIGALAIAGFFHYRRTGSLLPALPKLPSLSSLV 4468
            ||:|.||||..|:| :|..|||.|||.:::|:|.|||.:..|.:|||||||:|::||||||||||
Zfish  4422 GYSGSYCEMGKSRG-APAGTAVTVLLAVVIILVTGALVVGVFLNYRRTGSLIPSMPKLPSLSSLV 4485

Human  4469 KPSENGNGVTFRSGADLNMD-----IGVSGFGPETAIDRSMAMSEDFVMEMGKQPIIFENPMYSA 4528
            |..:.||||:|.||.::.||     :|||      .|||:|.:.|:|. :.|:|||.||||:||.
Zfish  4486 KSGDTGNGVSFHSGDNVTMDLEPQTLGVS------FIDRAMQLDENFA-DPGRQPITFENPLYST 4543

Human  4529 R---DSAVKVVQPIQVTV---SENVDNKNYGSPIN------PSEIVPETNPTSPAADGTQVTKWN 4581
            .   .|...|:...||||   ::.||| |:.:|..      .||.|.|.|        ||.:||:
Zfish  4544 AATPSSDPAVIHATQVTVNVSADQVDN-NFSNPTYQQAVEVKSEQVEEKN--------TQESKWS 4599

Human  4582 LFKRKSKQTTNFENPIYAQMENEQKESVA---ATPPPSPSLPAKPKPPSRRDPTPTYSATEDTFK 4643
            .||||.|.:|.||||.|::|::||....|   :|..|||.:|  |||| :|:...|::.|||||:
Zfish  4600 FFKRKLKPSTTFENPTYSEMQDEQTPGAADSSSTAEPSPFVP--PKPP-KREKLSTFTPTEDTFR 4661

Human  4644 DTANLVKEDSEV 4655
            ||||||||||::
Zfish  4662 DTANLVKEDSDI 4673

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
LRP2NP_004516.2 LDLa 28..62 CDD:238060 22/33 (67%)
LDLa 108..142 CDD:238060 23/33 (70%)
LDLa 149..179 CDD:238060 17/29 (59%)
LDLa 183..217 CDD:238060 21/33 (64%)
LDLa 222..256 CDD:238060 24/33 (73%)
LDLa 266..300 CDD:238060 18/33 (55%)
YncE 394..579 CDD:442618 136/184 (74%)
LDL-receptor class B 1. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00461 436..478 32/41 (78%)
LDL-receptor class B 2. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00461 479..521 30/41 (73%)
LY 503..548 CDD:214531 33/44 (75%)
LDL-receptor class B 3. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00461 522..568 32/45 (71%)
LY 551..591 CDD:214531 29/39 (74%)
LDL-receptor class B 4. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00461 569..613 36/43 (84%)
FXa_inhibition 663..704 CDD:464251 22/40 (55%)
LDL-receptor class B 5. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00461 753..795 28/41 (68%)
LY 776..818 CDD:214531 31/41 (76%)
LDL-receptor class B 6. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00461 796..837 29/40 (73%)
LDL-receptor class B 7. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00461 838..881 32/42 (76%)
Ldl_recept_b 838..879 CDD:459654 30/40 (75%)
LY 864..904 CDD:214531 32/39 (82%)
LDL-receptor class B 8. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00461 882..925 28/42 (67%)
FXa_inhibition 981..1013 CDD:464251 24/31 (77%)
LDLa 1026..1060 CDD:238060 25/33 (76%)
LDLa 1067..1101 CDD:238060 19/33 (58%)
LDLa 1109..1143 CDD:238060 21/33 (64%)
LDLa 1149..1183 CDD:238060 22/33 (67%)
LDLa 1187..1222 CDD:238060 21/34 (62%)
LDLa 1230..1264 CDD:238060 24/34 (71%)
LDLa 1271..1305 CDD:238060 21/33 (64%)
LDLa 1311..1344 CDD:197566 24/32 (75%)
FXa_inhibition 1353..1388 CDD:464251 24/34 (71%)
EGF_CA 1390..1429 CDD:214542 26/38 (68%)
LY 1461..1500 CDD:214531 24/38 (63%)
LDL-receptor class B 9. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00461 1478..1520 24/41 (59%)
LY 1501..1543 CDD:214531 30/41 (73%)
LDL-receptor class B 10. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00461 1521..1563 35/41 (85%)
LY 1545..1589 CDD:214531 32/43 (74%)
LDL-receptor class B 11. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00461 1566..1609 29/42 (69%)
LY 1591..1632 CDD:214531 25/40 (63%)
LDL-receptor class B 12. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00461 1610..1654 26/43 (60%)
LDL-receptor class B 13. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00461 1655..1695 26/39 (67%)
YvrE 1787..>1951 CDD:442613 107/163 (66%)
LDL-receptor class B 14. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00461 1790..1832 28/41 (68%)
LDL-receptor class B 15. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00461 1833..1882 28/48 (58%)
LDL-receptor class B 16. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00461 1883..1930 29/46 (63%)
Ldl_recept_b 1883..1928 CDD:459654 27/44 (61%)
LY 1911..1953 CDD:214531 28/41 (68%)
LDL-receptor class B 17. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00461 1931..1972 26/40 (65%)
LDL-receptor class B 18. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00461 1973..2013 26/39 (67%)
FXa_inhibition 2022..2058 CDD:464251 27/35 (77%)
YncE <2091..2252 CDD:442618 126/160 (79%)
LDL-receptor class B 19. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00461 2107..2156 37/48 (77%)
LDL-receptor class B 20. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00461 2157..2201 35/43 (81%)
LDL-receptor class B 21. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00461 2202..2245 34/42 (81%)
LY 2227..2267 CDD:214531 29/39 (74%)
Vgb 2236..2544 CDD:443399 195/307 (64%)
LDL-receptor class B 22. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00461 2246..2289 33/42 (79%)
LDL-receptor class B 23. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00461 2431..2477 22/45 (49%)
LY 2459..2500 CDD:214531 28/40 (70%)
LDL-receptor class B 24. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00461 2478..2518 30/39 (77%)
LY 2500..2542 CDD:214531 32/41 (78%)
LDL-receptor class B 25. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00461 2519..2562 33/42 (79%)
LY 2545..2585 CDD:214531 27/39 (69%)
LDL-receptor class B 26. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00461 2563..2604 23/40 (58%)
LY <2593..2625 CDD:214531 18/31 (58%)
LDL-receptor class B 27. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00461 2605..2646 22/40 (55%)
FXa_inhibition 2655..2692 CDD:464251 30/36 (83%)
LDLa 2700..2732 CDD:238060 22/31 (71%)
LDLa 2741..2775 CDD:238060 25/33 (76%)
LDLa 2784..2817 CDD:238060 23/32 (72%)
LDLa 2821..2854 CDD:197566 25/32 (78%)
Ldl_recept_a 2863..2895 CDD:395011 22/31 (71%)
LDLa 2905..2937 CDD:197566 23/31 (74%)
LDLa 2948..2988 CDD:238060 26/39 (67%)
LDLa 2993..3027 CDD:238060 23/33 (70%)
LDLa 3031..3063 CDD:197566 24/31 (77%)
LDLa 3075..3109 CDD:238060 18/33 (55%)
FXa_inhibition 3121..3150 CDD:464251 22/28 (79%)
vWFA <3147..3190 CDD:469594 30/42 (71%)
LY 3219..3260 CDD:214531 30/40 (75%)
LDL-receptor class B 28. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00461 3239..3281 24/41 (59%)
LY 3262..3304 CDD:214531 22/41 (54%)
Ldl_recept_b 3282..3330 CDD:459654 28/47 (60%)
LDL-receptor class B 29. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00461 3282..3324 25/41 (61%)
LDL-receptor class B 30. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00461 3333..3376 33/42 (79%)
Ldl_recept_b 3333..3374 CDD:459654 31/40 (78%)
LY 3358..3399 CDD:214531 30/40 (75%)
LDL-receptor class B 31. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00461 3377..3419 33/41 (80%)
LY <3408..3441 CDD:214531 29/32 (91%)
LDL-receptor class B 32. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00461 3420..3460 33/39 (85%)
FXa_inhibition 3469..>3498 CDD:464251 20/28 (71%)
LDLa 3512..3544 CDD:197566 25/31 (81%)
LDLa 3553..3584 CDD:197566 24/30 (80%)
LDLa 3594..3626 CDD:238060 22/31 (71%)
LDLa 3634..3666 CDD:197566 25/31 (81%)
LDLa 3682..3714 CDD:238060 25/31 (81%)
LDLa 3719..3754 CDD:238060 26/34 (76%)
LDLa 3759..3793 CDD:238060 25/33 (76%)
LDLa 3798..3832 CDD:238060 23/33 (70%)
LDLa 3885..3915 CDD:197566 25/29 (86%)
LDLa 3928..3962 CDD:238060 22/33 (67%)
EGF_CA 4007..4047 CDD:214542 25/39 (64%)
LY 4141..4176 CDD:214531 26/34 (76%)
LDL-receptor class B 33. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00461 4154..4196 33/41 (80%)
LDL-receptor class B 34. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00461 4197..4240 28/42 (67%)
Ldl_recept_b 4197..4238 CDD:459654 26/40 (65%)
LY 4222..4264 CDD:214531 26/41 (63%)
LDL-receptor class B 35. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00461 4242..4283 22/41 (54%)
FXa_inhibition 4338..>4356 CDD:464251 15/17 (88%)
SH3-binding. /evidence=ECO:0000255 4453..4462 5/8 (63%)
PxLPxI/L motif 1, mediates interaction with ANKRA2. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P98158 4456..4461 2/4 (50%)
PxLPxI/L motif 2, mediates interaction with ANKRA2. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P98158 4459..4464 4/4 (100%)
Endocytosis signal. /evidence=ECO:0000255 4521..4526 4/4 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 4550..4574 7/29 (24%)
Interaction with DAB2. /evidence=ECO:0000269|PubMed:10769163 4589..4602 6/12 (50%)
NPXY motif 4595..4598 2/2 (100%)
SH2-binding. /evidence=ECO:0000255 4598..4601 1/2 (50%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 4601..4655 30/56 (54%)
SH3-binding. /evidence=ECO:0000255 4611..4622 5/10 (50%)
lrp2aNP_001181916.3 None

Return to query results.
Submit another query.