DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment LRP1 and Lrp1

DIOPT Version :9

Sequence 1:XP_016874792.1 Gene:LRP1 / 4035 HGNCID:6692 Length:4561 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_008763615.1 Gene:Lrp1 / 299858 RGDID:1307535 Length:4562 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4562 Identity:4467/4562 - (97%)
Similarity:4509/4562 - (98%) Gaps:1/4562 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MLTPPLLLLLPLLSALVA-AAIDAPKTCSPKQFACRDQITCISKGWRCDGERDCPDGSDEAPEIC 64
            |||||||||||||||||| |.:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MLTPPLLLLLPLLSALVAGATMDAPKTCSPKQFACRDQITCISKGWRCDGERDCPDGSDEAPEIC 65

Human    65 PQSKAQRCQPNEHNCLGTELCVPMSRLCNGVQDCMDGSDEGPHCRELQGNCSRLGCQHHCVPTLD 129
            ||||||||.||||:||||||||||||||||:||||||||||.|||||:.||||:|||||||||..
  Rat    66 PQSKAQRCPPNEHSCLGTELCVPMSRLCNGIQDCMDGSDEGAHCRELRVNCSRMGCQHHCVPTPS 130

Human   130 GPTCYCNSSFQLQADGKTCKDFDECSVYGTCSQLCTNTDGSFICGCVEGYLLQPDNRSCKAKNEP 194
            |||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
  Rat   131 GPTCYCNNSFQLQADGKTCKDFDECSVYGTCSQLCTNTDGSFTCGCVEGYLLQPDNRSCKAKNEP 195

Human   195 VDRPPVLLIANSQNILATYLSGAQVSTITPTSTRQTTAMDFSYANETVCWVHVGDSAAQTQLKCA 259
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 VDRPPVLLIANSQNILATYLSGAQVSTITPTSTRQTTAMDFSYANETVCWVHVGDSAAQTQLKCA 260

Human   260 RMPGLKGFVDEHTINISLSLHHVEQMAIDWLTGNFYFVDDIDDRIFVCNRNGDTCVTLLDLELYN 324
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 RMPSLKGFVDEHTINISLSLHHVEQMAIDWLTGNFYFVDDIDDRIFVCNRNGDTCVTLLDLELYN 325

Human   325 PKGIALDPAMGKVFFTDYGQIPKVERCDMDGQNRTKLVDSKIVFPHGITLDLVSRLVYWADAYLD 389
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 PKGIALDPAMGKVFFTDYGQIPKVERCDMDGQNRTKLVDSKIVFPHGITLDLVSRLVYWADAYLD 390

Human   390 YIEVVDYEGKGRQTIIQGILIEHLYGLTVFENYLYATNSDNANAQQKTSVIRVNRFNSTEYQVVT 454
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
  Rat   391 YIEVVDYEGKGRQTIIQGILIEHLYGLTVFENYLYATNSDNANTQQKTSVIRVNRFNSTEYQVVT 455

Human   455 RVDKGGALHIYHQRRQPRVRSHACENDQYGKPGGCSDICLLANSHKARTCRCRSGFSLGSDGKSC 519
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 RVDKGGALHIYHQRRQPRVRSHACENDQYGKPGGCSDICLLANSHKARTCRCRSGFSLGSDGKSC 520

Human   520 KKPEHELFLVYGKGRPGIIRGMDMGAKVPDEHMIPIENLMNPRALDFHAETGFIYFADTTSYLIG 584
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   521 KKPEHELFLVYGKGRPGIIRGMDMGAKVPDEHMIPIENLMNPRALDFHAETGFIYFADTTSYLIG 585

Human   585 RQKIDGTERETILKDGIHNVEGVAVDWMGDNLYWTDDGPKKTISVARLEKAAQTRKTLIEGKMTH 649
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   586 RQKIDGTERETILKDGIHNVEGVAVDWMGDNLYWTDDGPKKTISVARLEKAAQTRKTLIEGKMTH 650

Human   650 PRAIVVDPLNGWMYWTDWEEDPKDSRRGRLERAWMDGSHRDIFVTSKTVLWPNGLSLDIPAGRLY 714
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   651 PRAIVVDPLNGWMYWTDWEEDPKDSRRGRLERAWMDGSHRDIFVTSKTVLWPNGLSLDIPAGRLY 715

Human   715 WVDAFYDRIETILLNGTDRKIVYEGPELNHAFGLCHHGNYLFWTEYRSGSVYRLERGVGGAPPTV 779
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
  Rat   716 WVDAFYDRIETILLNGTDRKIVYEGPELNHAFGLCHHGNYLFWTEYRSGSVYRLERGVAGAQPTV 780

Human   780 TLLRSERPPIFEIRMYDAQQQQVGTNKCRVNNGGCSSLCLATPGSRQCACAEDQVLDADGVTCLA 844
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   781 TLLRSERPPIFEIRMYDAQQQQVGTNKCRVNNGGCSSLCLATPGSRQCACAEDQVLDADGVTCLA 845

Human   845 NPSYVPPPQCQPGEFACANSRCIQERWKCDGDNDCLDNSDEAPALCHQHTCPSDRFKCENNRCIP 909
            |||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   846 NPSYVPPPQCQPGEFACANNRCIQERWKCDGDNDCLDNSDEAPALCHQHTCPSDRFKCENNRCIP 910

Human   910 NRWLCDGDNDCGNSEDESNATCSARTCPPNQFSCASGRCIPISWTCDLDDDCGDRSDESASCAYP 974
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   911 NRWLCDGDNDCGNSEDESNATCSARTCPPNQFSCASGRCIPISWTCDLDDDCGDRSDESASCAYP 975

Human   975 TCFPLTQFTCNNGRCININWRCDNEKDCGDGSDEQTCPEPADNDCGDNSDEAGCSHSCSSTQFKC 1039
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   976 TCFPLTQFTCNNGRCININWRCDNEKDCGDGSDEKTCPEPADNDCGDNSDEAGCSHSCSSTQFKC 1040

Human  1040 NSGRCIPEHWTCDGDNDCGDYSDETHANCTNQATRPPGGCHTDEFQCRLDGLCIPLRWRCDGDTD 1104
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||
  Rat  1041 NSGRCIPEHWTCDGDNDCGDYSDETHANCTNQATRPPGGCHSDEFQCRLDGLCIPLRWRCDGDTD 1105

Human  1105 CMDSSDEKSCEGVTHVCDPSVKFGCKDSARCISKAWVCDGDNDCEDNSDEENCESLACRPPSHPC 1169
            ||||||||.||||||||||:|||||||||||||||||||||:||||||||||||:||||||||||
  Rat  1106 CMDSSDEKGCEGVTHVCDPNVKFGCKDSARCISKAWVCDGDSDCEDNSDEENCEALACRPPSHPC 1170

Human  1170 ANNTSVCLPPDKLCDGNDDCGDGSDEGELCDQCSLNNGGCSHNCSVAPGEGIVCSCPLGMELGPD 1234
            ||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1171 ANNTSVCLSPDKLCDGKDDCGDGSDEGELCDQCSLNNGGCSHNCSVAPGEGIVCSCPLGMELGPD 1235

Human  1235 NHTCQIQSYCAKHLKCSQKCDQNKFSVKCSCYEGWVLEPDGESCRSLDPFKPFIIFSNRHEIRRI 1299
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1236 NHTCQIQSYCAKHLKCSQKCDQNKFSVKCSCYEGWVLEPDGESCRSLDPFKPFIIFSNRHEIRRI 1300

Human  1300 DLHKGDYSVLVPGLRNTIALDFHLSQSALYWTDVVEDKIYRGKLLDNGALTSFEVVIQYGLATPE 1364
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1301 DLHKGDYSVLVPGLRNTIALDFHLSQSALYWTDVVEDKIYRGKLLDNGALTSFEVVIQYGLATPE 1365

Human  1365 GLAVDWIAGNIYWVESNLDQIEVAKLDGTLRTTLLAGDIEHPRAIALDPRDGILFWTDWDASLPR 1429
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1366 GLAVDWIAGNIYWVESNLDQIEVAKLDGTLRTTLLAGDIEHPRAIALDPRDGILFWTDWDASLPR 1430

Human  1430 IEAASMSGAGRRTVHRETGSGGWPNGLTVDYLEKRILWIDARSDAIYSARYDGSGHMEVLRGHEF 1494
            |||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1431 IEAASMSGAGRRTIHRETGSGGWPNGLTVDYLEKRILWIDARSDAIYSARYDGSGHMEVLRGHEF 1495

Human  1495 LSHPFAVTLYGGEVYWTDWRTNTLAKANKWTGHNVTVVQRTNTQPFDLQVYHPSRQPMAPNPCEA 1559
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1496 LSHPFAVTLYGGEVYWTDWRTNTLAKANKWTGHNVTVVQRTNTQPFDLQVYHPSRQPMAPNPCEA 1560

Human  1560 NGGQGPCSHLCLINYNRTVSCACPHLMKLHKDNTTCYEFKKFLLYARQMEIRGVDLDAPYYNYII 1624
            |||:||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1561 NGGRGPCSHLCLINYNRTVSCACPHLMKLHNDNTTCYEFKKFLLYARQMEIRGVDLDAPYYNYII 1625

Human  1625 SFTVPDIDNVTVLDYDAREQRVYWSDVRTQAIKRAFINGTGVETVVSADLPNAHGLAVDWVSRNL 1689
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1626 SFTVPDIDNVTVLDYDAREQRVYWSDVRTQAIKRAFINGTGVETVVSADLPNAHGLAVDWVSRNL 1690

Human  1690 FWTSYDTNKKQINVARLDGSFKNAVVQGLEQPHGLVVHPLRGKLYWTDGDNISMANMDGSNRTLL 1754
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
  Rat  1691 FWTSYDTNKKQINVARLDGSFKNAVVQGLEQPHGLVVHPLRGKLYWTDGDNISMVNMDGSNRTLL 1755

Human  1755 FSGQKGPVGLAIDFPESKLYWISSGNHTINRCNLDGSGLEVIDAMRSQLGKATALAIMGDKLWWA 1819
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||
  Rat  1756 FSGQKGPVGLAIDFPESKLYWISSGNHTINRCNLDGSELEVIDTMRSQLGKATALAIMGDKLWWA 1820

Human  1820 DQVSEKMGTCSKADGSGSVVLRNSTTLVMHMKVYDESIQLDHKGTNPCSVNNGDCSQLCLPTSET 1884
            ||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||:|:||||||||||||||||||||||
  Rat  1821 DQVSEKMGTCNKADGSGSVVLRNSTTLVMHMKVYDESIQLEHEGTNPCSVNNGDCSQLCLPTSET 1885

Human  1885 TRSCMCTAGYSLRSGQQACEGVGSFLLYSVHEGIRGIPLDPNDKSDALVPVSGTSLAVGIDFHAE 1949
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1886 TRSCMCTAGYSLRSGQQACEGVGSFLLYSVHEGIRGIPLDPNDKSDALVPVSGTSLAVGIDFHAE 1950

Human  1950 NDTIYWVDMGLSTISRAKRDQTWREDVVTNGIGRVEGIAVDWIAGNIYWTDQGFDVIEVARLNGS 2014
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1951 NDTIYWVDMGLSTISRAKRDQTWREDVVTNGIGRVEGIAVDWIAGNIYWTDQGFDVIEVARLNGS 2015

Human  2015 FRYVVISQGLDKPRAITVHPEKGYLFWTEWGQYPRIERSRLDGTERVVLVNVSISWPNGISVDYQ 2079
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2016 FRYVVISQGLDKPRAITVHPEKGYLFWTEWGHYPRIERSRLDGTERVVLVNVSISWPNGISVDYQ 2080

Human  2080 DGKLYWCDARTDKIERIDLETGENREVVLSSNNMDMFSVSVFEDFIYWSDRTHANGSIKRGSKDN 2144
            .|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
  Rat  2081 GGKLYWCDARMDKIERIDLETGENREVVLSSNNMDMFSVSVFEDFIYWSDRTHANGSIKRGCKDN 2145

Human  2145 ATDSVPLRTGIGVQLKDIKVFNRDRQKGTNVCAVANGGCQQLCLYRGRGQRACACAHGMLAEDGA 2209
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
  Rat  2146 ATDSVPLRTGIGVQLKDIKVFNRDRQKGTNVCAVANGGCQQLCLYRGGGQRACACAHGMLAEDGA 2210

Human  2210 SCREYAGYLLYSERTILKSIHLSDERNLNAPVQPFEDPEHMKNVIALAFDYRAGTSPGTPNRIFF 2274
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2211 SCREYAGYLLYSERTILKSIHLSDERNLNAPVQPFEDPEHMKNVIALAFDYRAGTSPGTPNRIFF 2275

Human  2275 SDIHFGNIQQINDDGSRRITIVENVGSVEGLAYHRGWDTLYWTSYTTSTITRHTVDQTRPGAFER 2339
            ||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2276 SDIHFGNIQQINDDGSGRTTIVENVGSVEGLAYHRGWDTLYWTSYTTSTITRHTVDQTRPGAFER 2340

Human  2340 ETVITMSGDDHPRAFVLDECQNLMFWTNWNEQHPSIMRAALSGANVLTLIEKDIRTPNGLAIDHR 2404
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2341 ETVITMSGDDHPRAFVLDECQNLMFWTNWNELHPSIMRAALSGANVLTLIEKDIRTPNGLAIDHR 2405

Human  2405 AEKLYFSDATLDKIERCEYDGSHRYVILKSEPVHPFGLAVYGEHIFWTDWVRRAVQRANKHVGSN 2469
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||:
  Rat  2406 AEKLYFSDATLDKIERCEYDGSHRYVILKSEPVHPFGLAVYGEHIFWTDWVRRAVQRANKYVGSD 2470

Human  2470 MKLLRVDIPQQPMGIIAVANDTNSCELSPCRINNGGCQDLCLLTHQGHVNCSCRGGRILQDDLTC 2534
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|.||
  Rat  2471 MKLLRVDIPQQPMGIIAVANDTNSCELSPCRINNGGCQDLCLLTHQGHVNCSCRGGRILQEDFTC 2535

Human  2535 RAVNSSCRAQDEFECANGECINFSLTCDGVPHCKDKSDEKPSYCNSRRCKKTFRQCSNGRCVSNM 2599
            ||:||||||||||||||||||:||||||||.|||||||||||||||||||||||||:||||||||
  Rat  2536 RAMNSSCRAQDEFECANGECISFSLTCDGVSHCKDKSDEKPSYCNSRRCKKTFRQCNNGRCVSNM 2600

Human  2600 LWCNGADDCGDGSDEIPCNKTACGVGEFRCRDGTCIGNSSRCNQFVDCEDASDEMNCSATDCSSY 2664
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2601 LWCNGVDDCGDGSDEIPCNKTACGVGEFRCRDGSCIGNSSRCNQFVDCEDASDEMNCSATDCSSY 2665

Human  2665 FRLGVKGVLFQPCERTSLCYAPSWVCDGANDCGDYSDERDCPGVKRPRCPLNYFACPSGRCIPMS 2729
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2666 FRLGVKGVLFQPCERTSLCYAPSWVCDGANDCGDYSDERDCPGVKRPRCPLNYFACPSGRCIPMS 2730

Human  2730 WTCDKEDDCEHGEDETHCNKFCSEAQFECQNHRCISKQWLCDGSDDCGDGSDEAAHCEGKTCGPS 2794
            ||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2731 WTCDKEDDCENGEDETHCNKFCSEAQFECQNHRCISKQWLCDGSDDCGDGSDEAAHCEGKTCGPS 2795

Human  2795 SFSCPGTHVCVPERWLCDGDKDCADGADESIAAGCLYNSTCDDREFMCQNRQCIPKHFVCDHDRD 2859
            |||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||.|||||||||||||
  Rat  2796 SFSCPGTHVCVPERWLCDGDKDCADGADESISAGCLYNSTCDDREFMCQNRLCIPKHFVCDHDRD 2860

Human  2860 CADGSDESPECEYPTCGPSEFRCANGRCLSSRQWECDGENDCHDQSDEAPKNPHCTSQEHKCNAS 2924
            ||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||
  Rat  2861 CADGSDESPECEYPTCGPNEFRCANGRCLSSRQWECDGENDCHDHSDEAPKNPHCTSPEHKCNAS 2925

Human  2925 SQFLCSSGRCVAEALLCNGQDDCGDSSDERGCHINECLSRKLSGCSQDCEDLKIGFKCRCRPGFR 2989
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2926 SQFLCSSGRCVAEALLCNGQDDCGDGSDERGCHVNECLSRKLSGCSQDCEDLKIGFKCRCRPGFR 2990

Human  2990 LKDDGRTCADVDECSTTFPCSQRCINTHGSYKCLCVEGYAPRGGDPHSCKAVTDEEPFLIFANRY 3054
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2991 LKDDGRTCADVDECSTTFPCSQLCINTHGSYKCLCVEGYAPRGGDPHSCKAVTDEEPFLIFANRY 3055

Human  3055 YLRKLNLDGSNYTLLKQGLNNAVALDFDYREQMIYWTDVTTQGSMIRRMHLNGSNVQVLHRTGLS 3119
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  3056 YLRKLNLDGSNYTLLKQGLNNAVALDFDYRGQMIYWTDVTTQGSMIRRMHLNGSNVQVLHRTGLS 3120

Human  3120 NPDGLAVDWVGGNLYWCDKGRDTIEVSKLNGAYRTVLVSSGLREPRALVVDVQNGYLYWTDWGDH 3184
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  3121 NPDGLAVDWVGGNLYWCDKGRDTIEVSKLNGAYRTVLVSSGLREPRALVVDVQNGYLYWTDWGDH 3185

Human  3185 SLIGRIGMDGSSRSVIVDTKITWPNGLTLDYVTERIYWADAREDYIEFASLDGSNRHVVLSQDIP 3249
            |||||||||||.||:|||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  3186 SLIGRIGMDGSGRSIIVDTKITWPNGLTVDYVTERIYWADAREDYIEFASLDGSNRHVVLSQDIP 3250

Human  3250 HIFALTLFEDYVYWTDWETKSINRAHKTTGTNKTLLISTLHRPMDLHVFHALRQPDVPNHPCKVN 3314
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  3251 HIFALTLFEDYVYWTDWETKSINRAHKTTGANKTLLISTLHRPMDLHVFHALRQPDVPNHPCKVN 3315

Human  3315 NGGCSNLCLLSPGGGHKCACPTNFYLGSDGRTCVSNCTASQFVCKNDKCIPFWWKCDTEDDCGDH 3379
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  3316 NGGCSNLCLLSPGGGHKCACPTNFYLGGDGRTCVSNCTASQFVCKNDKCIPFWWKCDTEDDCGDH 3380

Human  3380 SDEPPDCPEFKCRPGQFQCSTGICTNPAFICDGDNDCQDNSDEANCDIHVCLPSQFKCTNTNRCI 3444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  3381 SDEPPDCPEFKCRPGQFQCSTGICTNPAFICDGDNDCQDNSDEANCDIHVCLPSQFKCTNTNRCI 3445

Human  3445 PGIFRCNGQDNCGDGEDERDCPEVTCAPNQFQCSITKRCIPRVWVCDRDNDCVDGSDEPANCTQM 3509
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  3446 PGIFRCNGQDNCGDGEDERDCPEVTCAPNQFQCSITKRCIPRVWVCDRDNDCVDGSDEPANCTQM 3510

Human  3510 TCGVDEFRCKDSGRCIPARWKCDGEDDCGDGSDEPKEECDERTCEPYQFRCKNNRCVPGRWQCDY 3574
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  3511 TCGVDEFRCKDSGRCIPARWKCDGEDDCGDGSDEPKEECDERTCEPYQFRCKNNRCVPGRWQCDY 3575

Human  3575 DNDCGDNSDEESCTPRPCSESEFSCANGRCIAGRWKCDGDHDCADGSDEKDCTPRCDMDQFQCKS 3639
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  3576 DNDCGDNSDEESCTPRPCSESEFSCANGRCIAGRWKCDGDHDCADGSDEKDCTPRCDMDQFQCKS 3640

Human  3640 GHCIPLRWRCDADADCMDGSDEEACGTGVRTCPLDEFQCNNTLCKPLAWKCDGEDDCGDNSDENP 3704
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  3641 GHCIPLRWRCDADADCMDGSDEEACGTGVRTCPLDEFQCNNTLCKPLAWKCDGEDDCGDNSDENP 3705

Human  3705 EECARFVCPPNRPFRCKNDRVCLWIGRQCDGTDNCGDGTDEEDCEPPTAHTTHCKDKKEFLCRNQ 3769
            |||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||...|||||||||||||
  Rat  3706 EECTRFQCPPNRPFRCKNDRVCLWIGRQCDGTDNCGDGTDEEDCEPPTAQNPHCKDKKEFLCRNQ 3770

Human  3770 RCLSSSLRCNMFDDCGDGSDEEDCSIDPKLTSCATNASICGDEARCVRTEKAAYCACRSGFHTVP 3834
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||.||||||
  Rat  3771 RCLSSSLRCNMFDDCGDGSDEEDCSIDPKLTSCATNASMCGDEARCVRTEKAAYCACRPGFHTVP 3835

Human  3835 GQPGCQDINECLRFGTCSQLCNNTKGGHLCSCARNFMKTHNTCKAEGSEYQVLYIADDNEIRSLF 3899
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  3836 GQPGCQDINECLRFGTCSQLCNNTKGGHLCSCARNFMKTHNTCKAEGSEYQVLYIADDNEIRSLF 3900

Human  3900 PGHPHSAYEQAFQGDESVRIDAMDVHVKAGRVYWTNWHTGTISYRSLPPAAPPTTSNRHRRQIDR 3964
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  3901 PGHPHSAYEQAFQGDESVRIDAMDVHVKAGRVYWTNWHTGTISYRSLPPAAPPTTSNRHRRQIDR 3965

Human  3965 GVTHLNISGLKMPRGIAIDWVAGNVYWTDSGRDVIEVAQMKGENRKTLISGMIDEPHAIVVDPLR 4029
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  3966 GVTHLNISGLKMPRGIAIDWVAGNVYWTDSGRDVIEVAQMKGENRKTLISGMIDEPHAIVVDPLR 4030

Human  4030 GTMYWSDWGNHPKIETAAMDGTLRETLVQDNIQWPTGLAVDYHNERLYWADAKLSVIGSIRLNGT 4094
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  4031 GTMYWSDWGNHPKIETAAMDGTLRETLVQDNIQWPTGLAVDYHNERLYWADAKLSVIGSIRLNGT 4095

Human  4095 DPIVAADSKRGLSHPFSIDVFEDYIYGVTYINNRVFKIHKFGHSPLVNLTGGLSHASDVVLYHQH 4159
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||
  Rat  4096 DPIVAVDSKRGLSHPFSIDVFEDYIYGVTYINNRVFKIHKFGHSPLINLTGGLSHASDVVLYHQH 4160

Human  4160 KQPEVTNPCDRKKCEWLCLLSPSGPVCTCPNGKRLDNGTCVPVPSPTPPPDAPRPGTCNLQCFNG 4224
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
  Rat  4161 KQPEVTNPCDRKKCEWLCLLSPSGPVCTCPNGKRLDNGTCVPVPSPTPPPDAPRPGTCTLQCFNG 4225

Human  4225 GSCFLNARRQPKCRCQPRYTGDKCELDQCWEHCRNGGTCAASPSGMPTCRCPTGFTGPKCTQQVC 4289
            |||||||||||||||||||||||||||||||:|.||||||||||||||||||||||||:||||||
  Rat  4226 GSCFLNARRQPKCRCQPRYTGDKCELDQCWEYCHNGGTCAASPSGMPTCRCPTGFTGPRCTQQVC 4290

Human  4290 AGYCANNSTCTVNQGNQPQCRCLPGFLGDRCQYRQCSGYCENFGTCQMAADGSRQCRCTAYFEGS 4354
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||.||||:
  Rat  4291 AGYCANNSTCTVNQGNQPQCRCLPGFLGDRCQYRQCSGFCENFGTCQMAADGSRQCRCTVYFEGT 4355

Human  4355 RCEVNKCSRCLEGACVVNKQSGDVTCNCTDGRVAPSCLTCVGHCSNGGSCTMNSKMMPECQCPPH 4419
            |||||||||||:||||||||:|||||||||||||||||||:.|||||||||||||||||||||||
  Rat  4356 RCEVNKCSRCLQGACVVNKQTGDVTCNCTDGRVAPSCLTCIDHCSNGGSCTMNSKMMPECQCPPH 4420

Human  4420 MTGPRCEEHVFSQQQPGHIASILIPLLLLLLLVLVAGVVFWYKRRVQGAKGFQHQRMTNGAMNVE 4484
            ||||||||.|.|||||||:.||||||||||||:|||||||||||||:||||||||||||||||||
  Rat  4421 MTGPRCEEQVVSQQQPGHMTSILIPLLLLLLLLLVAGVVFWYKRRVRGAKGFQHQRMTNGAMNVE 4485

Human  4485 IGNPTYKMYEGGEPDDVGGLLDADFALDPDKPTNFTNPVYATLYMGGHGSRHSLASTDEKRELLG 4549
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  4486 IGNPTYKMYEGGEPDDVGGLLDADFALDPDKPTNFTNPVYATLYMGGHGSRHSLASTDEKRELLG 4550

Human  4550 RGPEDEIGDPLA 4561
            ||||||||||||
  Rat  4551 RGPEDEIGDPLA 4562

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
LRP1XP_016874792.1 None
Lrp1XP_008763615.1 LDLa 27..60 CDD:197566 32/32 (100%)
LDLa 72..105 CDD:197566 29/32 (91%)
FXa_inhibition 120..149 CDD:291342 25/28 (89%)
FXa_inhibition 161..189 CDD:291342 26/27 (96%)
LY 276..315 CDD:214531 38/38 (100%)
LY 317..359 CDD:214531 41/41 (100%)
LY 362..402 CDD:214531 39/39 (100%)
FXa_inhibition 487..520 CDD:291342 32/32 (100%)
LY 552..594 CDD:214531 41/41 (100%)
LY 595..634 CDD:214531 38/38 (100%)
LY 641..690 CDD:214531 48/48 (100%)
LY <701..734 CDD:214531 32/32 (100%)
FXa_inhibition 808..843 CDD:291342 34/34 (100%)
LDLa 854..886 CDD:197566 30/31 (97%)
LDLa 896..929 CDD:238060 32/32 (100%)
LDLa 936..968 CDD:197566 31/31 (100%)
LDLa 979..1012 CDD:238060 31/32 (97%)
LDLa 1033..1066 CDD:238060 32/32 (100%)
LDLa 1080..1115 CDD:238060 33/34 (97%)
LDLa 1122..1158 CDD:238060 33/35 (94%)
LDLa 1163..1196 CDD:238060 30/32 (94%)
FXa_inhibition 1203..1239 CDD:291342 35/35 (100%)
LY 1354..1394 CDD:214531 39/39 (100%)
LY 1398..1441 CDD:214531 42/42 (100%)
LY 1442..1486 CDD:214531 42/43 (98%)
LY 1631..1667 CDD:214531 35/35 (100%)
LY 1668..1711 CDD:214531 42/42 (100%)
LY 1715..1752 CDD:214531 35/36 (97%)
LY 1752..1793 CDD:214531 40/40 (100%)
FXa_inhibition 1868..1904 CDD:291342 35/35 (100%)
LY 1934..1974 CDD:214531 39/39 (100%)
LY 1977..2017 CDD:214531 39/39 (100%)
LY 2018..2061 CDD:214531 41/42 (98%)
LY 2063..2105 CDD:214531 39/41 (95%)
FXa_inhibition 2177..2212 CDD:291342 33/34 (97%)
YvrE 2271..2481 CDD:225921 204/209 (98%)
Ldl_recept_b 2362..2403 CDD:278487 39/40 (98%)
LY 2388..2429 CDD:214531 40/40 (100%)
FXa_inhibition 2500..2532 CDD:291342 31/31 (100%)
LDLa 2545..2575 CDD:238060 27/29 (93%)
LDLa 2584..2618 CDD:238060 31/33 (94%)
LDLa 2623..2657 CDD:238060 32/33 (97%)
LDLa <2684..2706 CDD:238060 21/21 (100%)
LDLa 2714..2748 CDD:238060 32/33 (97%)
LDLa 2752..2783 CDD:197566 30/30 (100%)
LDLa 2791..2824 CDD:197566 32/32 (100%)
LDLa 2835..2867 CDD:197566 30/31 (97%)
LDLa 2875..2908 CDD:197566 30/32 (94%)
LDLa 2925..2957 CDD:238060 30/31 (97%)
cEGF 2980..3003 CDD:289433 22/22 (100%)
EGF_CA 3000..>3029 CDD:214542 27/28 (96%)
LY 3067..3111 CDD:214531 42/43 (98%)
LY 3112..3154 CDD:214531 41/41 (100%)
LY 3156..3198 CDD:214531 41/41 (100%)
LY 3200..3241 CDD:214531 38/40 (95%)
LY 3242..3282 CDD:214531 39/39 (100%)
FXa_inhibition 3312..3348 CDD:291342 34/35 (97%)
LDLa 3352..3383 CDD:238060 30/30 (100%)
LDLa 3392..3426 CDD:238060 33/33 (100%)
LDLa 3431..3466 CDD:238060 34/34 (100%)
LDLa 3470..3503 CDD:197566 32/32 (100%)
LDLa 3511..3544 CDD:197566 32/32 (100%)
LDLa 3554..3588 CDD:238060 33/33 (100%)
LDLa 3593..3627 CDD:238060 33/33 (100%)
LDLa 3631..3665 CDD:238060 33/33 (100%)
LDLa 3671..3703 CDD:197566 31/31 (100%)
LDLa 3713..3749 CDD:238060 35/35 (100%)
LDLa 3764..3794 CDD:238060 29/29 (100%)
LY 3973..4010 CDD:214531 36/36 (100%)
Ldl_recept_b 4031..4071 CDD:278487 39/39 (100%)
LY 4055..4096 CDD:214531 40/40 (100%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C83695809
Domainoid 1 1.000 876 1.000 Domainoid score I2140
eggNOG 1 0.900 - - E1_KOG1215
HGNC 1 1.500 - -
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H1744
Inparanoid 1 1.050 9488 1.000 Inparanoid score I8
NCBI 1 1.000 - -
OMA 1 1.010 - - QHG46025
OrthoDB 1 1.010 - - D105at314146
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0002316
OrthoInspector 1 1.000 - - oto137708
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100345
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR24270
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X1742
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 1 0.960 - -
1818.270

Return to query results.
Submit another query.