Protein Alignment Ide and nrd1a

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_524182.3
• Gene: Ide / 40248
• FlyBaseID: FBgn0001247
• Length: 990
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_694205.1
• Gene: nrd1a / 565850
• ZFINID: ZDB-GENE-070912-417
• Length: 1091
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1083
• Identity: 336/1083 - (31%)
• Similarity: 529/1083 - (48%)
• Gaps: 119/1083 - (10%)

  Fly     4 AESSQKSATRKPDSMEPILRLN---------------NIEKSLQDTRDYRGLQLENGLKVLLISD 53
            |.:|..:.:..||..||:...|               .|.||..|.:.||.::|.|||:.|||||
Zfish    10 AAASSPAQSAGPDRGEPVRDPNAPPGDSGGDENQGDPQIIKSPSDPKQYRYIELSNGLRALLISD 74

  Fly    54 -----------------------------------PNTD-------------------------- 57
                                               ..||
Zfish    75 LSGLDGKAEDEDDEDSEEEEAEEEAEGEEEEGDSGEGTDEESEEEGDSQDSDFEELDEESDQKKK 139

  Fly    58 -----VSAAALSVQVGHMSDPTNLPGLAHFCEHMLFLGTEKYPHENGYTTYLSQSGGSSNAATYP 117
                 .|||||.:.||..|||.:|||||||.|||:|:|:||||.|||:..:|.:.|||.||:|..
Zfish   140 KGSEKQSAAALCIGVGSFSDPNDLPGLAHFLEHMVFMGSEKYPSENGFDAFLKKHGGSDNASTDC 204

  Fly   118 LMTKYHFHVAPDKLDGALDRFAQFFIAPLFTPSATEREINAVNSEHEKNLPSDLWRIKQVNRHLA 182
            ..|.:.|.|...:...||||:|||||.||....|.:||:.||:||::...|||..|.:.:...||
Zfish   205 ERTIFQFDVQRKRFKEALDRWAQFFICPLMIEDAIDREVEAVDSEYQLAKPSDSHRKEMLFGSLA 269

  Fly   183 KPDHAYSKFGSGNKTTLSEIPKSKNIDVRDELLKFHKQWYSANIMCLAVIGKESLDELEGMVLEK 247
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Zfish   270 KPDHPMSKFCWGNAQTLKTEPKEKNINVYKRLREFWKRHYSAHYMTLAVQSKESLDTLEEWVREI 334

  Fly   248 FSEIENKNVKVPGW--PRHPYAEERYGQKVKIVPIKDIRSLTISFTTDDLTQFYKSGPDNYLTHL 310
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Zfish   335 FSQVPNNGQLKPDFSDKLNPFETPAFNKLYRVVPVRKVHALTITWALPPQEKHYRVKPLHYIAWL 399

  Fly   311 IGHEGKGSILSELRRLGWCNDLMAGHQNTQNGF------GFFDIVVDLTQEGLEHVDDIVKIVFQ 369
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Zfish   400 IGHEGTGSILSMLRRKCWALALFGG--NSETGFDQNTTYSIFSISITLTDEGFQNFYEVAHLVFQ 462

  Fly   370 YLEMLRKEGPKKWIFDECVKLNEMRFRFKEKEQPENLVTHAVSSMQIFPLEEVLIAPYLSNEWRP 434
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Zfish   463 YLKMLQTLGPQQRIYEEIQKIEANEFHYQEQTDPIEYVEDICENMQLFPKEDFLTGDQLMFEFKP 527

  Fly   435 DLIKGLLDELVPSKSRIVIVSQSFEPDCDLAEPYYKTKYGITRVAKDTVQSW-----ENCELNEN 494
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Zfish   528 EVISAALNLLTPEKANLLLLSPEHEGQCPLREKWFGTQYS----TEDIEQHWREIWAKDFDLNPS 588

  Fly   495 LKLALPNSFIPTNFDISDVPADAPKHPTIILDTPILRVWHKQDNQFNKPKACMTFDMSNPIAYLD 559
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Zfish   589 LHLPAENKFIATDFALKTSDCPDTEYPVRIMNNDRGCLWYKKDNKFKIPKAYVRFHLISPVVQKS 653

  Fly   560 PLNCNLNHMMVMLLKDQLNEYLYDAELASLKLSVMGKSCGIDFTIRGFSDKQVVLLEKLLDHLFD 624
            |.|..|..:.|.:|...|.|..|:|::|.|:..::....|:...::||:.|..:|...::|:|.|
Zfish   654 PKNLVLFDLFVNILVHNLAEPAYEADVAQLEYKLVAGEHGLVIKVKGFNHKLPLLFNLIVDYLAD 718

  Fly   625 FSIDEKRFDILKEEYVRSLKNFKAEQPYQHSIYYLALLLTENAWANMELLDA-MELVTYDRVLNF 688
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Zfish   719 FSAAPDVFSMFAEQLKKTYFNILI-KPEKLGKDVRLLILEHSRWSTIQKYQAVLDGLSVDELMEF 782

  Fly   689 AKEFFQRLHTECFIFGNVTKQQATDIAGRVNTRLEATNAS-KLPILARQMLKKREYKLLAGDSYL 752
            ...|...|:.|..:.||||..::......|..:|:....| ::|:|.|.:...:::.|....|.
Zfish   783 VSGFKSELYAEGLLQGNVTSTESMGFLQYVTEKLQFKKLSVEVPVLFRVVELPQKHHLCKVKSL- 846

  Fly   753 FEKENEFHKSSCAQLYLQCGAQTDHTNIMVNLVSQVLSEPCYDCLRTKEQLGYIVFSGVRKVNGA 817
                |:...:|...:|.|.|.:....:.::.|:...:.|||:|.|||||.|||.|:...|..:|.
Zfish   847 ----NKGDANSEVTVYYQSGPKNLREHTLMELLVMHMEEPCFDFLRTKETLGYHVYPTCRNTSGV 907

  Fly   818 NGIRIIV--QSAK-HPSYVEDRIENFLQTYLQVIEDMPLDEFERHKEALAVKKLEKPKTIFQQFS 879
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Zfish   908 LGFSVTVETQATKFNTELVETKIEEFLVSFGEKMNSLSDDAFRTQVTALVKLKGCEDTHLGEEVD 972

  Fly   880 QFYGEIAMQTYHFEREEAEVAILRKISKADFVDYFKKFIAKDGEERRVLSVHIVSQQTDENATSE 944
            :.:.|:..|.|.|:|...|:..|:.::||:.|::   |:...||..|.||||:|....:||....
Zfish   973 RNWTEVVTQQYVFDRLSREIDALKLMTKAELVNW---FMEHRGEGNRKLSVHVVGYGVEENDPPN 1034

  Fly   945 ----AEPVEITNMERHKPISDIVTFKSCKELYPIALPFLDIKA 983
                .|..|.:.|..:..:|.: ||.....|........||:|
Zfish  1035 DPHPGEEEEASKMSLYGEVSKL-TFLQASNLLASVSTITDIRA 1076

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Ide	NP_524182.3	Ptr	25..954	CDD:440648	322/1031 (31%)
nrd1a	XP_694205.1	Ptr	47..1085	CDD:440648	329/1046 (31%)