DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Ide and Ide

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_524182.3 Gene:Ide / 40248 FlyBaseID:FBgn0001247 Length:990 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_063138239.1 Gene:Ide / 25700 RGDID:2861 Length:1022 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:945 Identity:450/945 - (47%)
Similarity:644/945 - (68%) Gaps:16/945 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    25 NNIEKSLQDTRDYRGLQLENGLKVLLISDPNTDVSAAALSVQVGHMSDPTNLPGLAHFCEHMLFL 89
            ::|.||.:|.|:||||:|.||:||||||||.||.|:|||.|.:|.:|||.|:|||:|||||||||
  Rat    52 DHIVKSPEDKREYRGLELANGIKVLLISDPTTDKSSAALDVHIGSLSDPPNIPGLSHFCEHMLFL 116

  Fly    90 GTEKYPHENGYTTYLSQSGGSSNAATYPLMTKYHFHVAPDKLDGALDRFAQFFIAPLFTPSATER 154
            ||:|||.||.|:.:||:..|||||.|....|.|:|.|:.:.|:||||||||||:.|||..|..:|
  Rat   117 GTKKYPKENEYSQFLSEHAGSSNAFTSGEHTNYYFDVSHEHLEGALDRFAQFFLCPLFDASCKDR 181

  Fly   155 EINAVNSEHEKNLPSDLWRIKQVNRHLAKPDHAYSKFGSGNKTTLSEIPKSKNIDVRDELLKFHK 219
            |:|||:||||||:.:|.||:.|:.:....|.|.:||||:|||.||...|..:.||||:||||||.
  Rat   182 EVNAVDSEHEKNVMNDAWRLFQLEKATGNPKHPFSKFGTGNKYTLETRPNQEGIDVREELLKFHS 246

  Fly   220 QWYSANIMCLAVIGKESLDELEGMVLEKFSEIENKNVKVPGWPRHPYAEERYGQKVKIVPIKDIR 284
            .:||:|:|.:.|:|:||||:|..:|::.|||:|||||.:|.:|.||:.||...|..|||||||||
  Rat   247 TYYSSNLMAICVLGRESLDDLTNLVVKLFSEVENKNVPLPEFPEHPFQEEHLKQLYKIVPIKDIR 311

  Fly   285 SLTISFTTDDLTQFYKSGPDNYLTHLIGHEGKGSILSELRRLGWCNDLMAGHQNTQNGFGFFDIV 349
            :|.::|...||.|:|||.|.:||.|||||||.||:||||:..||.|.|:.|.:....||.||.|.
  Rat   312 NLYVTFPIPDLQQYYKSNPGHYLGHLIGHEGPGSLLSELKSKGWVNTLVGGQKEGARGFMFFIIN 376

  Fly   350 VDLTQEGLEHVDDIVKIVFQYLEMLRKEGPKKWIFDECVKLNEMRFRFKEKEQPENLVTHAVSSM 414
            ||||:|||.||:||:..:|||::.||.|||::|:|.||..||.:.||||:||:|....:.....:
  Rat   377 VDLTEEGLLHVEDIILHMFQYIQKLRAEGPQEWVFQECKDLNAVAFRFKDKERPRGYTSKIAGKL 441

  Fly   415 QIFPLEEVLIAPYLSNEWRPDLIKGLLDELVPSKSRIVIVSQSFEPDCDLAEPYYKTKYGITRVA 479
            ..:||..||.|.||..|:|||||..:||:|.|...|:.|||:|||...|..|.:|.|:|....:.
  Rat   442 HYYPLNGVLTAEYLLEEFRPDLIDMVLDKLRPENVRVAIVSKSFEGKTDRTEQWYGTQYKQEAIP 506

  Fly   480 KDTVQSWENCELNENLKLALPNSFIPTNFDISDVPADAPKHPTIILDTPILRVWHKQDNQFNKPK 544
            :|.:|.|:|.:||...||...|.||||||:|..:..||..:|.:|.||.:.::|.|||::|..||
  Rat   507 EDVIQKWQNADLNGKFKLPTKNEFIPTNFEILALEKDATPYPALIKDTAMSKLWFKQDDKFFLPK 571

  Fly   545 ACMTFDMSNPIAYLDPLNCNLNHMMVMLLKDQLNEYLYDAELASLKLSVMGKSCGIDFTIRGFSD 609
            ||:.|:..:|.||:|||:||:.::.:.||||.||||.|.||||.|...:.....|:..:::|::|
  Rat   572 ACLNFEFFSPFAYVDPLHCNMAYLYLELLKDSLNEYAYAAELAGLSYDLQNTIYGMYLSVKGYND 636

  Fly   610 KQVVLLEKLLDHLFDFSIDEKRFDILKEEYVRSLKNFKAEQPYQHSIYYLALLLTENAWANMELL 674
            ||.:||:|:.:.:..|.||:|||:|:||.|:|||.||:||||:||::|||.||:||.||...||.
  Rat   637 KQPILLKKITEKMATFEIDKKRFEIIKEAYMRSLNNFRAEQPHQHAMYYLRLLMTEVAWTKDELK 701

  Fly   675 DAMELVTYDRVLNFAKEFFQRLHTECFIFGNVTKQQATDIAGRV-NTRLEATNASKLPILARQML 738
            :|::.||..|:..|..:...|||.|..:.||:|||.|..:...| :|.:|  :|...|:|..|::
  Rat   702 EALDDVTLPRLKAFIPQLLSRLHIEALLHGNITKQAALGVMQMVEDTLIE--HAHTKPLLPSQLV 764

  Fly   739 KKREYKLLAGDSYLFEKENEFHKSSCAQLYLQCGAQTDHTNIMVNLVSQVLSEPCYDCLRTKEQL 803
            :.||.:|.....:::::.||.|.:...::|.|...|:...|:.:.|..|::||||::.|||||||
  Rat   765 RYREVQLPDRGWFVYQRRNEVHNNCGIEIYYQTDMQSTSENMFLELFCQIISEPCFNTLRTKEQL 829

  Fly   804 GYIVFSGVRKVNGANGIRIIVQSAKHPSYVEDRIENFLQTYLQVIEDMPLDEFERHKEALAVKKL 868
            |||||||.|:.||..|:|.|:||.|.|.|:|.|:|.||.|..:.||||..:.|::|.:|||:::|
  Rat   830 GYIVFSGPRRANGIQGLRFIIQSEKPPHYLESRVEAFLITMEKAIEDMTEEAFQKHIQALAIRRL 894

  Fly   869 EKPKTIFQQFSQFYGEIAMQTYHFEREEAEVAILRKISKADFVDYFKKFIAKDGEERRVLSVHIV 933
            :|||.:..:.::::|||..|.|:::|:..|||.|:.:||.|.:.::|:.:|.|...|..:|||::
  Rat   895 DKPKKLSAECAKYWGEIISQQYNYDRDNIEVAYLKTLSKDDIIKFYKEMLAVDAPRRHKVSVHVL 959

  Fly   934 SQQTD------------ENATSEAEPV-EITNMER 955
            :::.|            :...|||.|: ::.|:.|
  Rat   960 AREMDSCPVVGEFPSQNDINLSEAPPLPQVRNLRR 994

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
IdeNP_524182.3 Ptr 25..954 CDD:440648 449/942 (48%)
IdeXP_063138239.1 None

Return to query results.
Submit another query.