DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG42637 and Npr1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_524165.2 Gene:CG42637 / 40153 FlyBaseID:FBgn0261360 Length:1525 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_036745.1 Gene:Npr1 / 24603 RGDID:3195 Length:1057 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1139 Identity:410/1139 - (35%)
Similarity:600/1139 - (52%) Gaps:176/1139 - (15%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     9 LLLLSVAVRDCSNHRTVLTVGYLTALTGDLKTRQGLAISGALTMALDEVNKDPNLLPN------- 66
            ||||...:.....|.:.|||..:..||..........:..|:.:||..|...|:|||.       
  Rat    14 LLLLPPLLLLRGGHASDLTVAVVLPLTNTSYPWSWARVGPAVELALARVKARPDLLPGWTVRMVL 78

  Fly    67 -----------------VYLDLRWNDTKGDTVLATKAITEMICDGIATIFGPEGPCYVEAIVSQS 114
                             ..:||:|..:.                  |...|| |..|..|.|.:.
  Rat    79 GSSENAAGVCSDTAAPLAAVDLKWEHSP------------------AVFLGP-GCVYSAAPVGRF 124

  Fly   115 R---NIPMISYKCA--------EYRASAIPTFARTEPPDTQVVKSLLALLRYYAW-NKFSILYED 167
            .   .:|:::....        ||   |:.|  ||.|...::...:.||.|...| ::..:||.|
  Rat   125 TAHWRVPLLTAGAPALGIGVKDEY---ALTT--RTGPSHVKLGDFVTALHRRLGWEHQALVLYAD 184

  Fly   168 -------VWSPVADLLKDQATKRNMTINHKQSFIDNRVKCCEQMLDCCRSGYWYQLVQNTMNRTR 225
                   .:..|..|......:.|:|:|| |.|::.            ...::.:|::....:.|
  Rat   185 RLGDDRPCFFIVEGLYMRVRERLNITVNH-QEFVEG------------DPDHYPKLLRAVRRKGR 236

  Fly   226 IYVFLGAANSLVDFMSSMETAGLFARGEYMVIFVDMMVYSEREA-----EKYLRRVDQITFMSNC 285
            :.....:.::..:.|.....|||... :|:...:|:...|.:.|     :|...|.|     ...
  Rat   237 VIYICSSPDAFRNLMLLALNAGLTGE-DYVFFHLDVFGQSLKSAQGLVPQKPWERGD-----GQD 295

  Fly   286 HSTENFNQMARSLLVVASTPPTKDYIQFTKQVQKYSSKPPFNLEIPRLFVESNFSKFISIYAAYL 350
            .|.....|.|:  ::....|...:|::|.||::..:.| .||..     ||....   :|..|..
  Rat   296 RSARQAFQAAK--IITYKEPDNPEYLEFLKQLKLLADK-KFNFT-----VEDGLK---NIIPASF 349

  Fly   351 YDSVKLYAWAVDKMLREETRVLTDDVIFEVASNGTRVIDTIIKNRTYMSITGSKIKIDQYGDSEG 415
            :|.:.||..||.:.|.:...|          ::|..:... :.||::..:|| .:|||:.||.:.
  Rat   350 HDGLLLYVQAVTETLAQGGTV----------TDGENITQR-MWNRSFQGVTG-YLKIDRNGDRDT 402

  Fly   416 NFSVLAYKPHKWNNSNNMPCNYH-----MVPVAYFHQGEEHPEYKLINGSIDWPSGGEKPADEPM 475
            :||:....|.  ..:..:..||:     ::.|:      ||..|        ||. |..|.|.|.
  Rat   403 DFSLWDMDPE--TGAFRVVLNYNGTSQELMAVS------EHKLY--------WPL-GYPPPDVPK 450

  Fly   476 CGFANE--LCKKDDTHY-TSTVAAVVLGVLLFCSGVITMSIYRKWKIELEIEGLLWKI-----DP 532
            |||.||  .|.:|  |: |..|.|:|..:.|....:::..||||.::|.|:...||::     .|
  Rat   451 CGFDNEDPACNQD--HFSTLEVLALVGSLSLISFLIVSFFIYRKMQLEKELVSELWRVRWEDLQP 513

  Fly   533 NEIKGYSGNEIVSSPSKVSLMS-AQSYGSRWTN----QFVTSTGRLRGAVVRIKELKFPRKR-DI 591
            :.::    ..:.|:.|:::|.. ..:|||..|.    |....|...:|.:|.:|.:.  ||| ::
  Rat   514 SSLE----RHLRSAGSRLTLSGRGSNYGSLLTTEGQFQVFAKTAYYKGNLVAVKRVN--RKRIEL 572

  Fly   592 SREIMKEMRLLRELRHDNINSFIGASVEPTRILLVTDYCAKGSLYDIIENEDIKLDDLFIASLIH 656
            :|:::.|::.:|:::::::..|:||..:|..|.::|:||.:|||.||:|||.|.||.:|..||.:
  Rat   573 TRKVLFELKHMRDVQNEHLTRFVGACTDPPNICILTEYCPRGSLQDILENESITLDWMFRYSLTN 637

  Fly   657 DLIKGMIYIHNSQLVYHGNLKSSNCVVTSRWMLQVTDFGLHELRQCAENESIGEHQHYRNQLWRA 721
            |::|||:::||..:..|||||||||||..|::|::||:||...|   :.|....|..:..:||.|
  Rat   638 DIVKGMLFLHNGAICSHGNLKSSNCVVDGRFVLKITDYGLESFR---DPEPEQGHTLFAKKLWTA 699

  Fly   722 PELLR---NHIHGSQKGDVYAFAIIMYEIFSRKGPF--GQINFEPKEIVDYVKKLPLKGED-PFR 780
            |||||   ....|||.||||:|.||:.||..|.|.|  ..::..||||::.|    .:||. |||
  Rat   700 PELLRMASPPARGSQAGDVYSFGIILQEIALRSGVFYVEGLDLSPKEIIERV----TRGEQPPFR 760

  Fly   781 PEVESIIEAESCPDYVLACIRDCWAEDPEERPEFSVIRNRLKKMRGGKTKNIMDQMMEMMEKYAN 845
            |.    ::.:|..:.:...::.||||||:|||.|..||..|:|.....:.||:|.::..||:|||
  Rat   761 PS----MDLQSHLEELGQLMQRCWAEDPQERPPFQQIRLALRKFNKENSSNILDNLLSRMEQYAN 821

  Fly   846 NLEDIVTERTRLLCEEKMKTEDLLHRMLPQSVAEKLTMGQGVEPVSYDLVTIYFSDIVGFTAMSA 910
            |||::|.|||:...|||.|.|.||:::||.||||:|..|:.|:..::|.|||||||||||||:||
  Rat   822 NLEELVEERTQAYLEEKRKAEALLYQILPHSVAEQLKRGETVQAEAFDSVTIYFSDIVGFTALSA 886

  Fly   911 ESTPLQVVNFLNDLYTVFDRIIRGYDVYKVETIGDAYMVVSGLPIKNGDRHAGEIASMALELLHA 975
            ||||:|||..||||||.||.:|..:|||||||||||||||||||::||..||.|:|.|||.||.|
  Rat   887 ESTPMQVVTLLNDLYTCFDAVIDNFDVYKVETIGDAYMVVSGLPVRNGQLHAREVARMALALLDA 951

  Fly   976 VKQHRIAHRPNETLKLRIGMHTGPVVAGVVGLTMPRYCLFGDTVNTASRMESNGEALKIHISNKC 1040
            |:..||.|||.|.|:||||:|||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||:|::.
  Rat   952 VRSFRIRHRPQEQLRLRIGIHTGPVCAGVVGLKMPRYCLFGDTVNTASRMESNGEALKIHLSSET 1016

  Fly  1041 KLALDKLGGGYITEKRGLVNMKGKGDVVTWWLTG 1074
            |..|::. .|:..|.||.|.|||||.|.|:||.|
  Rat  1017 KAVLEEF-DGFELELRGDVEMKGKGKVRTYWLLG 1049

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG42637NP_524165.2 PBP1_SAP_GC-like 26..445 CDD:380593 97/471 (21%)
PK_GC-A_B 543..827 CDD:270944 115/295 (39%)
HNOBA <833..881 CDD:462234 26/47 (55%)
CYCc 860..1052 CDD:214485 133/191 (70%)
Npr1NP_036745.1 PBP1_NPR_A 32..439 CDD:380608 99/488 (20%)
PK_GC-A_B 530..803 CDD:270944 112/285 (39%)
HNOBA <809..857 CDD:462234 26/47 (55%)
CYCc 836..1025 CDD:214485 132/189 (70%)

Return to query results.
Submit another query.