DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ash1 and Ash1l

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001246834.1 Gene:ash1 / 40133 FlyBaseID:FBgn0005386 Length:2226 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_008759376.1 Gene:Ash1l / 310638 RGDID:1306350 Length:2958 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2680 Identity:704/2680 - (26%)
Similarity:1104/2680 - (41%) Gaps:721/2680 - (26%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    20 QESGSENE----ETDSITDQ-----SSQSKSIKSATQFSVQRSDTDGL-RMRISAIRPTLGV-VA 73
            |:|.|.||    ||.....|     :|....|..|:..|..:|....: ...:.:..||:.| ..
  Rat   502 QDSFSSNERGAFETSKHEKQPPVYCTSPDFQIGGASDASTAKSPFGAVGESNLPSSSPTVSVNPL 566

  Fly    74 TKKPPKSRKM---------STQDTESGCSEA--KN-------------RAVSKKVKV-------- 106
            |:.||::...         ||.:.....||:  ||             |::...:.:        
  Rat   567 TRNPPETSSQLVPNPLLLNSTAEQMEEISESIGKNQFTAESTHLNVGHRSLGHSISIECKGIDKE 631

  Fly   107 -------------------KRKKLASSSGISK------------SDK--------VSKSKKSQIS 132
                               |:..|||.|||..            |:|        .:..|..|::
  Rat   632 LNESKSTHLDISRISSSLGKKPSLASDSGIHTITPSVVNFTSLFSNKPFLKLGAVAAPDKHCQVA 696

  Fly   133 AFSSDSEDDLPLKVHQQRAPRVLLSAIIQAAQSASKPTLDIGISS-----SDNELPNLVQAAIKR 192
            ...|.|....|||..:.|..|  .:.::..:...|...||:..|.     |.:.|.|..:.| |.
  Rat   697 ESLSTSFQSKPLKKRKGRKAR--WTKVVARSTCRSPKGLDLERSELFKNVSCSSLSNSSEPA-KF 758

  Fly   193 VESDTEDTTVEGSFRKAAKDKNLPQYQSTLLQDFMEKTQMLGQTVNAKLAEEKVAKAK------- 250
            :::....:.|:..|.|    :.||:...:.....            |.||:.:.|..|       
  Rat   759 MKTIGASSFVDHDFLK----RRLPKLSKSSAPSL------------ALLADSEKASHKSFITHKL 807

  Fly   251 EETLVQTA-----VPRKRRGRPK-KVVPTVPAPGNSGPAINESADSGVISTTSTTQSTTPSPKMQ 309
            ..::..|:     :.:.:||||| |.:|.:..|    |.......:..:.:..:.:...| |.:|
  Rat   808 SSSMCVTSDLLSDIYKPKRGRPKSKEMPQLEGP----PKRTLKIPASKVFSLQSKEEQEP-PILQ 867

  Fly   310 NENAVPTGSLPIASSSKPKIDMAYLDKRMYATERVLYPPPRS--------------KRRQNNKKT 360
            .|..:|:....::.|..||  .....||...:...:.||..|              ...:|::.:
  Rat   868 PEIEIPSFKQSLSVSPFPK--KRGRPKRQMRSPVKMKPPVLSVAPFVATESPSKLESESENHRSS 930

  Fly   361 ACSSSNKEELQ----LDPLWR---------EIDVNKKFRLRSMSVGAASGTGASTTICS----KV 408
            :....::::||    |:...|         |::.:||...|:      :|....|.|..    |.
  Rat   931 SDFFESEDQLQDTDDLEDSHRQSVCSVSDLEMEPDKKISKRN------NGQLMKTIIRKINKMKT 989

  Fly   409 LAAKSGYVSDYGSVRHQRSSHNHNSGYKSDASCKSRYSTKSCMSRRSRAKSCGYRSDCKESGKSG 473
            |..|        .:.:|..|.:..|..|.....| .::|.|.::....:| .|.:.:..:.|...
  Rat   990 LKRK--------KLLNQILSSSVESSNKGKVQSK-LHNTVSSLAATFGSK-LGQQINVSKKGTIY 1044

  Fly   474 LRMRRKRRASMLLK-----SSADDTVEDQDILQLAGLSLGQ-------SSEESNEYISKPSLKSL 526
            :..||.|:...:|.     |.|...|.:|...|.||.:|||       |...|:|.:..|.....
  Rat  1045 IGKRRGRKPKTVLNGLLSGSPASLAVLEQTAQQAAGSALGQILPPLLPSPASSSEILPSPICSQS 1109

  Fly   527 PTTS---------------ASKKYGEINRYVTTGQYFGRGGSLSAT------------------- 557
            ..||               :|..|..::         .|.||:..|                   
  Rat  1110 SGTSGGQSPVSSDAGFVEPSSVPYLHVH---------SRQGSMIQTLAMKKAAKGRRRLSPPTLL 1165

  Fly   558 -NPDNFISKMMNQRKETPAPSKSS--------------------------CKIKSRRSS------ 589
             |..:.:|::.:.::.||:|...|                          |..|.||.|      
  Rat  1166 PNSPSHLSELTSLKEATPSPVSESHSDETIPSDSGIGTDNNSTSDRAEKFCGQKKRRHSFEHISL 1230

  Fly   590 ----AASMCSS---------------YVSGVSRMRRRHRRKSFSHNKSLN-IDSKLLTEIEIITS 634
                .:::.:|               |:| ..:|:|:.|::...:.:..| .|...:.|:|.:.|
  Rat  1231 IPPETSTVLNSLKEKHKHKCKRRSHDYLS-YDKMKRQKRKRKKKYPQLRNRQDPDFIAELEELIS 1294

  Fly   635 TFNSRCRIQDDRLTGSSG---KEKLLADANKLQATLAAPSPAQQLTLNGGGPASTLSKPLKRGLK 696
                  |:.:.|:|..|.   ...||....::........|:..|     .|...:.||   .||
  Rat  1295 ------RLSEIRITHRSHHFIPRDLLPTIFRINFNSFYTHPSFPL-----DPLHYIRKP---DLK 1345

  Fly   697 KRKLSEPLVDFAM--------LSASASGT------------------PNGSGSSNG--------- 726
            |::...|.:..||        ||...|.|                  |.|.|....         
  Rat  1346 KKRGRPPKMREAMAEMPFMHSLSFPLSSTGFYPSYGMPYSPSPLTAAPIGLGYYGRYPPTLYPPP 1410

  Fly   727 ----------------------NTKRRHKKSQSNDSSSPDDHKLPLKKRHYLLTPGERP------ 763
                                  |..:.|||.          ||  |.::...||....|      
  Rat  1411 PSPSFTTPLPPPSYMHAGHLLLNPTKYHKKK----------HK--LLRQEAFLTTSRTPLLSMST 1463

  Fly   764 ----PAEVAFA--------NGKLNAEAWAAAAAAAKSTASTKS------QAQFNARSVKSA---- 806
                |.|:|:.        :...:.|..:.....:..|.|::|      :.:|...:|...    
  Rat  1464 YPSVPPEMAYGWMVEHKHRHRHKHREHRSEQPQVSMDTGSSRSVLESLKRYRFGKDTVGDRYKHK 1528

  Fly   807 -----------LTPKKRHLLEQPTSVSGAGSSASN------SPLRIVVDNNSIS---GG------ 845
                       |:|.|..:..:...||...|.:|:      :||:|....:|.|   ||      
  Rat  1529 EKHRCHMSCPHLSPSKSLINREEQWVSREPSESSSLALGLQTPLQIDCSESSPSLSLGGFTPNSE 1593

  Fly   846 -----KLLDISPSSLCSLKQQRRGGAAKQKVSAAKDLVQLQSPAGSYPPPGVFEPSVELEIQIPL 905
                 :.:::..|::.|.:......:.::|::.:..|..:|..|.|.|......||.|..||   
  Rat  1594 PASSDEHMNLFTSAIGSCRVSNPNSSCRKKLTDSPGLFPVQDTALSRPHRKEPLPSTERAIQ--- 1655

  Fly   906 SKLNESVITKAEVESPLLSALDIKEDTKKEVGQRVVETLLHKTGGNLLLKRKRKKINRT-----G 965
                               :|...:....:..||..|:.      |....|||.....|     |
  Rat  1656 -------------------SLAGSQSASDKPSQRSSEST------NCSPTRKRSSSESTSSTVNG 1695

  Fly   966 FPTVRRKKRKVSVEQQTTAVI------DEHEPEFDPDDEPLQSL---------------RETRSS 1009
            .|: |..:...|::.....::      ||.|......|.|:.::               |....|
  Rat  1696 IPS-RSPRLVASLDDSVDCLLQRIVQHDEQESVEKNGDAPITTVSAPPSSSPGHSYSKERTLGKS 1759

  Fly  1010 NNVNVQAAPNPPLDCERVPQAGEARETFVARTNQKAPRLSVVALERLQRPQTPARGRPRGRKPKN 1074
            :::.|.|.|:.  .|..:|...   |...:|.:....:.|||  |.:||         :.||..|
  Rat  1760 DSLLVPAVPSD--SCNSIPLLS---EKLASRCSPHHIKRSVV--EAMQR---------QARKMCN 1808

  Fly  1075 REQAEAAPQPPPKSEPEIRPAKKRGRQPKQP---VLEEP-PPTPPPQQKKNKMEP-------NIR 1128
            .::..|..:...... :|..|||..||.:..   |...| .|...|.|....|:.       |..
  Rat  1809 YDKILATKKNLDHVN-KILKAKKLQRQARTGNNFVKRRPGRPRKCPLQAVVSMQAFQAAQFVNPE 1872

  Fly  1129 LPDG------IDPNT------------NFSCKIRLK-RRKN--LEAGTQPKKEKPVQPVTVE--- 1169
            |.:|      :.|:|            |.:.:.:.. :|||  ||..|: ||:|.| |...|   
  Rat  1873 LNEGEEVSLHLSPDTVTDVIEAVVQSVNLNSEHKKGWKRKNWLLEEQTR-KKQKTV-PEEEEQEN 1935

  Fly  1170 -----EIPPEIPVSQEEIDAEAEAKRLDSIPTEHD----PLPA---SESHNPGPQDYASCSESSE 1222
                 |.|.||| |..|..||         |:|.:    |:.|   .|...|.|.          
  Rat  1936 NKSFIEKPVEIP-SPLETPAE---------PSEPESNLQPVLALIPREKKAPRPP---------- 1980

  Fly  1223 DKASTTSLRKLSKVKKTYLVAGLFSNHYKQS------LMPPPAKVNKKPGLEEQVGPASLLPPPP 1281
                          ||.|..|||:|:.||.:      :.....|:...|| |.:.|   |.|.|.
  Rat  1981 --------------KKKYQRAGLYSDVYKTTDPKSRLIQLKKEKLEYTPG-EHEYG---LFPAPI 2027

  Fly  1282 YCEKYLRRTEMDFELPYDIWWAYTNSKLPTRNVVPSWNYRKIRTNVYAESVRPNLAGFDHPTCNC 1346
            :..||||:..:||:|||||.|.:.:::|..:..||.  |:|||:|||.: |:| |:|::..||||
  Rat  2028 HVGKYLRQKRIDFQLPYDILWQWKHNQLYKKPDVPL--YKKIRSNVYVD-VKP-LSGYEATTCNC 2088

  Fly  1347 KNQGE---KSCLDNCLNRMVYTECSPSNCPAGEKCRNQKIQRHAVAPGVERFMTADKGWGVRTKL 1408
            |...:   |.|.|:|||||::.||||:.||.||:|.||:||||.....:|||...:||||:|||.
  Rat  2089 KKPDDDTRKGCGDDCLNRMIFAECSPNTCPCGEQCCNQRIQRHEWVQCLERFRAEEKGWGIRTKE 2153

  Fly  1409 PIAKGTYILEYVGEVVTEKEFKQRMASIYLNDTHHYCLHLDGGLVIDGQRMGSDCRFVNHSCEPN 1473
            |:..|.:|:||:||||:|:||:.||...|.|.:.||||:||.|:|||..|||::.||:||||:||
  Rat  2154 PLKAGQFIIEYLGEVVSEQEFRNRMIEQYHNHSDHYCLNLDSGMVIDSYRMGNEARFINHSCDPN 2218

  Fly  1474 CEMQKWSVNGLSRMVLFAKRAIEEGEELTYDYNFSLFNPSEGQPCRCNTPQCRGVIGGKSQRVKP 1538
            ||||||||||:.|:.|:|.:.:..|.||||||||..||..:.|.|:|...:|||:|||||||:..
  Rat  2219 CEMQKWSVNGVYRIGLYALKDVPAGTELTYDYNFHSFNVEKQQLCKCGFEKCRGIIGGKSQRMNG 2283

  Fly  1539 LPAVE-AKPSG---EGLSGRNGRQRKQKAKK---HAQRQAGKDISSAVAVA---KLQPLSEKEKK 1593
            ||:.: ::|:.   :....:..|:.|.|.||   |...:..::|::...:.   :::|:|.:|:.
  Rat  2284 LPSHKGSQPASTHRKSARSKEKRKSKHKLKKRRGHPSEEPSENINTPTRLTPQLQMKPMSNRERN 2348

  Fly  1594 LVRQFNTFLVRNFEKI--RRCKAKRASDAAATASSPALGTT-NGDIPGRRPSTPSSPSLAAQISA 1655
            .|.:.:.|||||:|||  ::.:.|.:.|..:|    :|.|. ||..  |......|.....|.||
  Rat  2349 FVLKHHVFLVRNWEKIHQKQEEVKHSRDIHST----SLYTRWNGIC--RDDGNIKSDVFMTQFSA 2407

  Fly  1656 LCSPRNIKTRGLTQAVHDPELEKMAKMAVVLRDICSAMETLKMSD-------LLTTVSSKKKKPI 1713
            |.:.|:::||.|..|..:.|:.:.|::|.:.::||..:.:.|.|.       ||.....||....
  Rat  2408 LQTARSVRTRRLAAAEENLEVARAARLAQIFKEICDGIISYKDSSQQALAAPLLNLPPKKKNADY 2472

  Fly  1714 KTTLSGKLGSTAATSKVEFRSIQAQVEQGHYKTPQEFDDHMQQLFVEAKQQHGDDEGKEKALQSL 1778
            ...:|..|         :..:|:.|:..|:|||.:.||..|.::|..|::.:|......:.:..|
  Rat  2473 YEKISDPL---------DLSTIEKQILTGYYKTVEAFDADMLKVFRNAEKYYGRKSPIGRDVCRL 2528

  Fly  1779 KDSYEQQKIASYVQLVEILGDSESLQSFKPKEVLSSEEEPGKIAVKKSPGAKERDSPIVPLKVTP 1843
            :.:|...:..:..|:.||:|::            :||.:..:.:|.:...:.|:           
  Rat  2529 RKAYYSARHEASAQIDEIVGET------------ASEADSSETSVSEKENSHEK----------- 2570

  Fly  1844 PPLLPIEASPDEDVIRCICGLYKDEGLMIQCSKCMVWQHTECTKADIDADNYQCERCEPREVDRE 1908
                      |:|||||||||||||||||||.|||||||.:|...:.|.::|.||:|:||.||||
  Rat  2571 ----------DDDVIRCICGLYKDEGLMIQCDKCMVWQHCDCMGVNTDVEHYLCEQCDPRPVDRE 2625

  Fly  1909 IPL---EEFTEEGHRYYLSLMRGDLQVRQGDAVYVLRDIPIKDESGKVLPTKKHTYETIGAIDYQ 1970
            :|:   ..:.:.|..|::.|:|.||.:||||.||::||.....:...|    :.:|..:..|:..
  Rat  2626 VPMIPRPHYAQPGCVYFICLLRDDLLLRQGDCVYLMRDSRRTPDGHPV----RQSYRLLSHINRD 2686

  Fly  1971 ECDIFRVEHLWKNELGKRFIFGHHFLRPHETFHEPSRRFYPNEVVRVSLYEVVPIELVIGRCWVL 2035
            :.||||:|.|||||..:||.||||:.|||||.|.||||||.||:.||.|||::|:|.|:|.|.||
  Rat  2687 KLDIFRIEKLWKNEKEERFAFGHHYFRPHETHHSPSRRFYHNELFRVPLYEIIPLEAVVGTCCVL 2751

  Fly  2036 DRTTFCKGRPMECNDEDHCYICELRVDKTARFFSKAKAN-HPACTKSYAFRKFPEKIKISKSYAP 2099
            |..|:|||||....::| .|||:.|:||:|..|.|...| :|.|||.|||..||:|:...:.::|
  Rat  2752 DLYTYCKGRPKGVKEQD-VYICDYRLDKSAHLFYKIHRNRYPVCTKPYAFDHFPKKLTPKRDFSP 2815

  Fly  2100 HDVDP--------SLLKTRKQKTEL-DVGAGPTTM---HKVSGRQEQ-----------HQAKMVG 2141
            |.|..        |..|:.:.|..| |:|.....:   .:|...|||           .|.::.|
  Rat  2816 HYVPDNYKRNGGRSSWKSERSKPLLKDLGQDDDALPLIEEVLASQEQAANEMPSPEEPDQERVTG 2880

  Fly  2142 ------RKPRGISAPADATAVHVVTPVAPNKQMLKKRKSRLENVLITMKLKCLDAQTAQEQPIDL 2200
                  :||...|......:    ||    ::....::.||..:|:.: |:.:..:.|    ||:
  Rat  2881 DVSDAEKKPEESSQEPQLAS----TP----EERRHSQRERLNQILLNL-LEKIPGKNA----IDV 2932

  Fly  2201 SYLL---SGRGARQR 2212
            :|||   |||..|:|
  Rat  2933 TYLLEEGSGRKLRRR 2947

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ash1NP_001246834.1 AWS 1340..1388 CDD:197795 28/50 (56%)
SET 1392..1512 CDD:214614 70/119 (59%)
Bromo_ASH1 1680..1787 CDD:99955 26/113 (23%)
PHD_ASH1L 1858..1900 CDD:277023 29/41 (71%)
BAH_polybromo 1929..2073 CDD:240068 72/143 (50%)
Ash1lXP_008759376.1 AWS 2082..2133 CDD:197795 28/50 (56%)
SET_ASH1L 2136..2276 CDD:380951 78/139 (56%)
Bromo_ASH1 2432..2537 CDD:99955 26/113 (23%)
PHD_ASH1L 2575..2617 CDD:277023 29/41 (71%)
BAH_polybromo 2654..2788 CDD:240068 69/138 (50%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C166351984
Domainoid 1 1.000 149 1.000 Domainoid score I4298
eggNOG 1 0.900 - - E2759_KOG1083
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 1 1.010 - - D507784at2759
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0007422
OrthoInspector 1 1.000 - - oto98516
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_106446
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR46147
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X5557
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 1 0.960 - -
1312.710

Return to query results.
Submit another query.