DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Cpr76Bd and Cpr76Bd

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001262052.1 Gene:Cpr76Bd / 40123 FlyBaseID:FBgn0036881 Length:1231 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_565330.4 Gene:Cpr76Bd / 3290258 VectorBaseID:AGAMI1_008267 Length:864 Species:Anopheles gambiae


Alignment Length:1247 Identity:410/1247 - (32%)
Similarity:561/1247 - (44%) Gaps:406/1247 - (32%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MKLHLVALLG--ILSVVLADPSPTLAPPILPCVHASTAGYAYPPPAEVKFSISPGVTKYSQSPAI 63
            ||:....||.  :.:..||.|    ||...|..|.|  ||:||.|. |:.|:...:...|.:|..
Mosquito     1 MKMFAAVLLAACLATSSLASP----APDCPPSGHVS--GYSYPAPT-VQLSVGKAINSVSVTPGF 58

  Fly    64 STYSENGQLLHTSVGSSGAAYQSTAGIEGL-SHGGITQINKYIAPVQKSLFSPSAEYGG--AGIT 125
            |:||.:|::.:.|||.|.::|:::...... :.|...::..|.|.|:....:|:..|..  ||:.
Mosquito    59 SSYSVDGEVKYASVGPSYSSYEASPAYSAYGASGEDLKLTSYEAGVKTVEAAPAVTYTAKTAGVV 123

  Fly   126 YADKSPAAKYATVVPSGIEIKNLVSPAVTKLDNSYLPPSPGITKVATYTSPGYSYSSASPGISKV 190
            ||||||||.:|:||||....|.:.:|||                            .|.|.:|||
Mosquito   124 YADKSPAATFASVVPSVSYTKTVAAPAV----------------------------YAQPAVSKV 160

  Fly   191 AT-YSSPSLSSVPYYAPPVTSKVETY-SSPAYTYSKTTPGYSKVETYSSPGY-SYGQISPGISRI 252
            .| .::|:......|.||.   |:|| ::||.....:||..:|..  ::|.. ||...:|.:|:.
Mosquito   161 YTSEAAPAYQVTKEYLPPT---VKTYATAPAVASYVSTPTVTKYA--AAPAVSSYVATAPVVSKY 220

  Fly   253 ATYSPSVSYSAPTIAKVSTYS--APSVKLATTSSLLSSHGTGYSASYAPSITKYSQVSDVSHQYI 315
            .:..|:|||||..:|||:|||  ||:.|:||    .::...||:|||||::              
Mosquito   221 VSAGPAVSYSAAPVAKVATYSSYAPAAKVAT----YATPAYGYAASYAPAV-------------- 267

  Fly   316 SKPIVAAYPAITKVAASYGGTASGALSHQYVSQPAIAKVSTYAAPTVATYSSGPAISKLSTSYGA 380
             |...|:|..    |.||   ||.|.:..|.|....|||::|.                      
Mosquito   268 -KASYASYAP----ATSY---ASYAPATTYASYTPAAKVASYT---------------------- 302

  Fly   381 SGSGAVSHQYVSKPAVAIAAPAVAKVATYAAPAISSYSTGPAISKVASYAAPTVSTYSSGYGYGS 445
                         |||..||.|.|....||||| :||::..|.:...:||||             
Mosquito   303 -------------PAVGYAAYAPAAKVAYAAPA-ASYASSYATTSKLAYAAP------------- 340

  Fly   446 SGSGAVSHQYVSKPAVAISAAPAIAKVATYAAPAISTYAAAPVVTKVATGYGGSGSGYSSGAVSH 510
                ||:...||.||||          :.|:|||::.|::||                   |||.
Mosquito   341 ----AVTKTVVSAPAVA----------SYYSAPAVTKYSSAP-------------------AVST 372

  Fly   511 QYVSKPAVAKVATYAAPAISTYSAAPAVTKIATSYGGSGHGAVSHQYVSKPAV-AISAAPAIAKV 574
            .|||.|.|.|   |||..:   :.||||:.....|....:.....:|||.||| :..|.||::||
Mosquito   373 AYVSAPTVTK---YAAAGV---AYAPAVSSYVAPYSAQAYTPAVSKYVSTPAVSSYYATPAVSKV 431

  Fly   575 ATYASPAISTYATAPVVSKVATYAAPSIAT-YSSAPALAKVSYSQAADVSHQYISKPIVAAYPAA 638
            .  :|||.::|.:||.|:|.|  :||:::: |.|.|.::|.:||.|      |::.|.||....|
Mosquito   432 V--SSPAYASYVSAPAVTKYA--SAPAVSSAYVSTPVVSKTAYSGA------YLAAPAVAKVATA 486

  Fly   639 -APAVATYSSAPAITKLSTSYESSGSGAVSHQYVSKPAVAKVAAYAAPAISTYATAPAVSTYSSA 702
             .||||:||:.||::..||       |:....|...|||:||.  ::||::.|:|.||.|:||.|
Mosquito   487 YGPAVASYSTGPAVSAYST-------GSAYSSYSVAPAVSKVV--SSPAVAAYSTGPAYSSYSVA 542

  Fly   703 PVVAKVATGYGGSGSGYSSGAVSHQYISKPAVAIASA-PAIAKVATYAAPAISAYSSAPSLTKIA 766
            |.|:||          ||:          ||||..|| ||::||  |:.||:::||:.|:::|: 
Mosquito   543 PAVSKV----------YST----------PAVAAYSAVPAVSKV--YSTPAVASYSAVPAVSKV- 584

  Fly   767 TGYGESAHGGALSHQYISKPAIAVAPVAPVLSKTYLPAAPAVAKVATGYGISGSGAVSHQYVSKP 831
                            .|.||:|....:|..|.  ..|.||||..:                   
Mosquito   585 ----------------YSTPAVASYSASPAYSS--YSATPAVASYS------------------- 612

  Fly   832 ALTLAAPAVAKVATYAAPAISSYSTGAGISKGLSYAAPVVSTGHGYGGSASEYSSGAVSHQYVSK 896
                |.|||:||  |:.||::|||           |.|.||                   :..|.
Mosquito   613 ----AVPAVSKV--YSTPAVASYS-----------AVPAVS-------------------KVYST 641

  Fly   897 PAVA-ISAAPAIAKVATYVAPAVGHILGGHAVGSVPVLSTKLATGYGGSGSGYSSGAVSHQYVSK 960
            |||| .||.||::||  |.:|||                           :.||:|.....|.:.
Mosquito   642 PAVASYSAVPAVSKV--YSSPAV---------------------------AAYSAGPAYSSYSAT 677

  Fly   961 PAV-AISAAPAIAKVAV-PTVSHISTGPSTPLGVGVGYGSSGHGGVLLGAPLTKLTSAPAYALGG 1023
            ||| |.||.||.:..:| |.|:..:|.     || .||.:||..|               ||.  
Mosquito   678 PAVAAYSAGPAYSAYSVAPAVTKYATS-----GV-AGYATSGVAG---------------YAT-- 719

  Fly  1024 KLASSTAYGIQAGNLGHGSGPSGGYYGAISLGHAKVSPALSYHGLLSHGSGLASGASSLAHLDSS 1088
                              ||.:.|||.|        .||:                 |.||.   
Mosquito   720 ------------------SGATHGYYAA--------GPAV-----------------SAAHY--- 738

  Fly  1089 LSGYSHGVGGIGPLGAGFYRYAPSVPALSSHAPVAATAYLKSAPVTQHAVLKVVPEKHLEHFDAH 1153
                            |.||||.:.|||::.....||.....||.|   |:|.|.||:|||::.:
Mosquito   739 ----------------GGYRYAAAAPALTTAYTAPATVVKTVAPTT---VVKTVAEKYLEHYEDN 784

  Fly  1154 PRYAFEYAVNDPHTGDNKHQKEERDGDVVKGEYSLVEPDGNVRTVKYYADWETGFHAEVINSRDQ 1218
            .||||||.||||.|||.||||||||||||:|:|||||||||||||.|||||.|||||.|.|||||
Mosquito   785 ARYAFEYGVNDPLTGDIKHQKEERDGDVVRGQYSLVEPDGNVRTVDYYADWATGFHATVTNSRDQ 849

  Fly  1219 ---GKIVAKRQT 1227
               .|::.||.|
Mosquito   850 VHATKVLGKRDT 861

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Cpr76BdNP_001262052.1 2A1904 130..>270 CDD:273344 44/142 (31%)
PRK07003 <456..>610 CDD:235906 54/155 (35%)
Chitin_bind_4 1156..1208 CDD:459790 44/51 (86%)
Cpr76BdXP_565330.4 None

Return to query results.
Submit another query.