Protein Alignment Ir75d and grik2

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_649074.2
• Gene: Ir75d / 40065
• FlyBaseID: FBgn0036829
• Length: 675
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001410875.1
• Gene: grik2 / 556013
• ZFINID: ZDB-GENE-080414-1
• Length: 908
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 657
• Identity: 134/657 - (20%)
• Similarity: 265/657 - (40%)
• Gaps: 105/657 - (15%)

  Fly    49 MLVAYYRHHGVHSLMLVVCHTDIADFRLWKLWQHFNLNNFYVQVSTESSLRDLQHVDALDEHKDA 113
            |:..|| |:...:|.|..  .|:..:|    :...|:..|.:..:..|.:..:....:::..:..
Zfish   247 MMTEYY-HYIFTTLDLFA--LDVEPYR----YSGVNMTGFRILNTENSQVSSIIEKWSMERLQAP 304

  Fly   114 PPPKSFHANNSTHWETSFLLPALPYKMGILLLEFSSECALNLLRWSAASEHNYFTTNRFWLLLTE 178
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Zfish   305 PKPDSGLLDGFMTTDAALMYDAV--HVVAVAVQQSPQITVSSLQCNRHKPWRF--GNRFMTLIKE 365

  Fly   179 D-----PGDIDLLEDPEIFIPPDSELRVLHYENVGNFSCSLIDLYKVAAWKPLKRTLVGHNIRNS 238
            .     .|.|:.  :....:..|.:|.|:..:..|        |.|:..|.|..    |.|:..:
Zfish   366 AHWDGLTGRINF--NRTNGLRTDFDLDVISLKEEG--------LEKIGTWDPAS----GLNMTEN 416

  Fly   239 RHVIHALQHFGSAITYRQDLEGIVFNSAIVIAFPDLFTNIEDLSLRHIDTISKVNHRLMLELANR 303
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Zfish   417 QK--------GKTANVTDSLSNRSLVVSTILEEPYVMFKKSDKPLYGNDRFEGYCVDLLRELAAI 473

  Fly   304 LNMSY--NTYQTVNYGWR-QPNGSFDGLMGRFQRYELDLAQLAIFMRLDRIALVDFVAETYRVRA 365
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Zfish   474 LGFGYELRLVEDGRYGAQDESSGQWNGMVRELMDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGI 538

  Fly   366 GIMFRQPPLSAVANIFAM--PFENDVWVSILMLLI-ITTVVLVLELF-----FSPH--NHDMSYM 420
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Zfish   539 SILYRKPN-GTNPGVFSFLNPLSPDIWMYILLAYLGVSCVLFVIARFSPYEWYNPHPCNPDSDVV 602

  Fly   421 DT----LNFVW---GAMCQQGFYVEVRNRSARIIVFTTFVAALFLFTSFSANIVALL-----QSP 473
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Zfish   603 ENNFTLLNSFWFGVGALMQQGSELMPKALSTRIVGGIWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMESP 667

  Fly   474 SDAIQSLSDLGQSPLEIGVQDTQYNKIYFTESTDPVTKNLYHKKIASKGENIYMRPL-LGMEKMR 537
            .|:...|:.  |:.:|.||.:......:| :.|...|.:...:.::|:..::.::.: .|:|::.
Zfish   668 IDSADDLAK--QTKIEYGVVEDGSTMTFF-KKTKISTYDKMWEFMSSRRHSVMVKSIEEGIERVL 729

  Fly   538 TGLFAYQVELQAGYQIVSDT--FSEPEKC------GLMELEPFQLPMLAIPTRKNFPYKELIR-R 593
            |..:|:.:|        |.|  |.....|      ||::.:.:     .:.|....||::.|. .
Zfish   730 TSDYAFLME--------STTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKAY-----GVGTPMGSPYRDKITIA 781

  Fly   594 QLRWQREVSLVNREERKW----IPQKPKCEGGVGGFVSIGITECRYALGIF---GCGAAVSFVLF 651
            .|:.|.|..|...:|:.|    .|::...|....|..:||        |||   ..|..:|..:.
Zfish   782 ILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCPEEENKEASALGVQNIG--------GIFIVLAAGLVLSVFVA 838

  Fly   652 LFEFIFR 658
            :.||:::
Zfish   839 VGEFLYK 845

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Ir75d	NP_649074.2	Periplasmic_Binding_Protein_Type_2	299..>372	CDD:473866	17/75 (23%)
		Lig_chan	386..643	CDD:459656	69/293 (24%)
grik2	NP_001410875.1	PBP1_iGluR_Kainate	37..414	CDD:380605	34/191 (18%)
		Periplasmic_Binding_Protein_Type_2	430..800	CDD:473866	85/386 (22%)