Protein Alignment Ir75d and GRIA4

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_649074.2
• Gene: Ir75d / 40065
• FlyBaseID: FBgn0036829
• Length: 675
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_000820.4
• Gene: GRIA4 / 2893
• HGNCID: 4574
• Length: 902
• Species: Homo sapiens
• Alignment Length: 723
• Identity: 140/723 - (19%)
• Similarity: 268/723 - (37%)
• Gaps: 147/723 - (20%)

  Fly    57 HGVHSLMLVVCHTDIADFRLWKLWQHFNL---NNFYVQVSTESSLRDLQHVDALDEHKDAPPPKS 118
            :|.|  :..:|..:..|....:|.:..:.   ..|.:....|.....|:.:.::.:|     .|.
Human   177 NGWH--VSAICVENFNDVSYRQLLEELDRRQEKKFVIDCEIERLQNILEQIVSVGKH-----VKG 234

  Fly   119 FHANNSTHWETSFLLPALPYK--------------MGILLLEFSSECALNLL-RWSAASEHNY-- 166
            :|          :::..|.:|              .|..|::|::...:.|: ||....:..|
Human   235 YH----------YIIANLGFKDISLERFIHGGANVTGFQLVDFNTPMVIKLMDRWKKLDQREYPG 289

  Fly   167 -FTTNRFWLLLTEDPGDIDLLEDPEIFIPPDSELRVLHYENV-----GNFSCSLIDLYKVAAWK- 224
             .|..::...||.|    .:|...|.|       |.|..:.:     ||....|.:  ..|.|.
Human   290 SETPPKYTSALTYD----GVLVMAETF-------RSLRRQKIDISRRGNAGDCLAN--PAAPWGQ 341

  Fly   225 --PLKRTLVGHNIRNSRHVIHALQHFGSAITYRQDLEGIVFNSAIVIAF---PDLFTNIEDLSLR 284
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Human   342 GIDMERTLKQVRIQGLTGNVQ-FDHYGRRVNYTMDVFELKSTGPRKVGYWNDMDKLVLIQDVPTL 405

  Fly   285 HIDTIS-------------------KVNHR--------------LMLELANRLNMSYN--TYQTV 314
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Human   406 GNDTAAIENRTVVVTTIMESPYVMYKKNHEMFEGNDKYEGYCVDLASEIAKHIGIKYKIAIVPDG 470

  Fly   315 NYGWRQPNGS-FDGLMGR--FQRYELDLAQLAIFMRLDRIALVDFVAETYRVRAGIMFRQPPLSA 376
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Human   471 KYGARDADTKIWNGMVGELVYGKAEIAIAPLTI--TLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSK 533

  Fly   377 VANIFAM--PFENDVWVSILMLLIITTVVLVLELFFSPHN------------------HDMSYMD 421
             ..:|:.  |...::|:.|:...|..:|||.|...|||:.                  ::....:
Human   534 -PGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHTEEPEDGKEGPSDQPPNEFGIFN 597

  Fly   422 TLNFVWGAMCQQGFYVEVRNRSARIIVFTTFVAALFLFTSFSANIVALLQ-----SPSDAIQSLS 481
            :|.|..||..|||..:..|:.|.||:....:...|.:.:|::||:.|.|.     ||   |:|..
Human   598 SLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSP---IESAE 659

  Fly   482 DLG-QSPLEIGVQDTQYNKIYFTESTDPVTKNLYHKKIASKGENIYMRPLL-GMEKMR--TGLFA 542
            ||. |:.:..|..|:...|.:|..|...|.:.:: ..:.|...:::.|... |:.::|  .|.||
Human   660 DLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMW-TYMRSAEPSVFTRTTAEGVARVRKSKGKFA 723

  Fly   543 YQVELQAGYQIVSDTFSEPEKCGLMEL-EPFQLPMLAIPTRKNFPYKELIRRQLRWQREVSLVNR 606
            :.:|     ..:::...:.:.|..|:: .........:.|.|....:..:...:....|..::::
Human   724 FLLE-----STMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSSLRTPVNLAVLKLSEAGVLDK 783

  Fly   607 EERKWIPQK----PKCEGGVGGFVSIGITECRYALGIFGCGAAVSFVLFLFEFIFRHFKQVYRII 667
            .:.||...|    ||..|......::.::.......|...|..::.::.|.||.::...:..|:.
Human   784 LKNKWWYDKGECGPKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMLVALIEFCYKSRAEAKRMK 848

  Fly   668 KGYREVQR 675
            ..:.|..|
Human   849 LTFSEAIR 856

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Ir75d	NP_649074.2	Periplasmic_Binding_Protein_Type_2	299..>372	CDD:473866	18/77 (23%)
		Lig_chan	386..643	CDD:459656	60/288 (21%)
GRIA4	NP_000820.4	PBP1_iGluR_AMPA_GluR4	28..400	CDD:380611	43/253 (17%)
		PBP2_iGluR_AMPA_GluR4	414..795	CDD:270445	82/392 (21%)