Protein Alignment CG42816 and Abca5

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_730301.3
• Gene: CG42816 / 39977
• FlyBaseID: FBgn0261998
• Length: 1459
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_775429.1
• Gene: Abca5 / 286970
• RGDID: 628661
• Length: 1642
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 1611
• Identity: 397/1611 - (24%)
• Similarity: 705/1611 - (43%)
• Gaps: 321/1611 - (19%)

  Fly    11 YKTGFLAVQQALSQVHIKHKC-----KEFNKTQ----GDIKFPPIKDLPSPPIFKSDNSSTLQDV 66
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  Rat   169 WSSGFTALQASIDAAIIQLKTNVSLWRELESTKAVIMGEAAVVEIDTFPR--------------- 218

  Fly    67 GIMIIVIIIFFVVVS--LTKSIVEEKELQLKVTLNLMGVGSCLQWVAW-YIQTFIIFLIGSSIIT 128
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  Rat   219 GVILIYLVIAFSPFGYFLAIHIVAEKEKRLKEFLKIMGLHDTAFWLSWVLLYTSLIFL-----MS 278

  Fly   129 LFWKLVLPNSEISFMPFTHWSMALFVLLVL-SHCTICFSFLMSSLISTTYRISLVT-FLALIATY 191
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  Rat   279 LLMAVIATAS--SLFPQSS-SIVIFLLFFLYGLSSVFFALMLTPLFKKSKHVGVVEFFVTVVFGF 340

  Fly   192 LPFLILHSKGCSEGLNVFLS-----LFLLSGLQVLVVGICMWEDYGEGLQWGNLFETSWPGGTLS 251
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  Rat   341 VGLLIVLVESFPRSLVWLFSPLCQCAFLIGIAQVMHL-----EDFNEGALFSSLTEGPYP----- 395

  Fly   252 VGYILLVMILASFLSLLLCLYLEKIRPGPYGV---------PQPWHFPCTRCCSTESLLPYSRLF 307
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  Rat   396 LIITLTMLALDSVFYALLAVYLDQVIPGEFGLRRSSLYFLKPSYW---------SKNKRNYKELS 451

  Fly   308 -NRIFGIYSAAPDEERPDLQLIEPDPVDKIA--GVQIRGLSKTFGK----MEVVKNVSFDMFEGQ 365
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  Rat   452 EGNINGNISLN--------EIVEPVSSEFIGKEAIRISGIQKAYRKKNETVEALRNLSFDIYEGQ 508

  Fly   366 ITVLMGHNGAGKTTLISMLAGFISPTSGTALINGFDIRQ--ERRQAQRCIGLCPQQNVLFKHLSS 428
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  Rat   509 ITALLGHSGTGKSTLMNILCGLCPPSDGFASIYGHRVSEIDEMFEARKMIGICPQSDMNFDVLTV 573

  Fly   429 VSHIQLFSRLRGLRGAEVKSEVQNYLKKLNLQEKKRLAARNLSGGTQRRLSVACSLCGGVKVLIC 493
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  Rat   574 EENLSILASVKGIPANNIIQEVQKVLLDLDMQAIKDNQAKKLSGGQKRKLSLGIAVLGNPKILLL 638

  Fly   494 DEPSTGLDPSARRELWRLILEAKEGCTILLTTHQLDDGEVLGDRVVIISDGQLRCIGSLPFLKKQ 558
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  Rat   639 DEPTAGMDPCSRHIVWNLLKYRKANRVTVFSTHFMDEADILADRKAVISQGMLKCVGSSIFLKSK 703

  Fly   559 VDASCLITCEARKRCDLEKLTSLISRHVGTIQPFSIKGRDVCYKLPLSKSKYFSSLFRDLESQMN 623
            ......::....:.|..|.|:||:.:|:..........:.:.|.||......||.||..|:...|
  Rat   704 WGIGYRLSMYIDRYCATESLSSLVRQHIPAAALLQQNDQQIVYSLPFKDMDKFSGLFSALDIHSN 768

  Fly   624 ILGVRGFSLSSVSLEEIFMSFGAE------DLNSRQSGGAEKRDDDDRDDDEENEV-----QDGN 677
             |||..:.:|..:||::|:....|      |.:.......|:..|....|:.|..:     ...:
  Rat   769 -LGVISYGVSMTTLEDVFLKLEVEAEIDQADYSVFTQQPREEETDSKSFDEMEQSLLILSETKAS 832

  Fly   678 VRSCKKQWRAMM--------------TKKVMALYDNKVYFLLLL--------------------- 707
            :.|....|:..:              :|.|     ..|..|||:
  Rat   833 LVSTMSLWKQQVSTIAKFHFLSLKRESKSV-----RSVLLLLLIFFAVQIFMFLVHHSFKNAVVP 892

  Fly   708 --LTPIVYYITTLMMATKPHH-------SGRPTFNISDYGVDKFT---ILLSVPVSKSYTEERRA 760
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  Rat   893 IKLVPDLYF---LKPGDKPHKYKTSLLLQNSTDSDINDL-IDFFTQQNIIVAMFNDSDYVS--AA 951

  Fly   761 DSIASLIKGKLKLIVVSEQIKDYVDDKWKSREGRREINFVSMAIDTGDRTGLIGWVGPRHYVHAA 825
            ...|:|      .:|.||  ||||              |.::...|              .|::.
  Rat   952 PHSAAL------NVVQSE--KDYV--------------FTAVFNST--------------MVYSL 980

  Fly   826 PMILNLVYNALAQELIGPKISIEVTSVPFTLRKKEDFLISNNGDIPIY----VIGYVSIAMIIFS 886
            |:::|::.|.....| ....:|::.|.|| :::..|.:..    :.:|    ::|.:..||..:.
  Rat   981 PVMMNIISNYYLYHL-NVTDTIQIWSTPF-IQEITDIVFK----VELYFQAALLGIIVTAMPPYF 1039

  Fly   887 SAVIQERVSHMKMLQ----EVSGLEMITYWLSHLAFDMVVFFILVLALLLPLYGYAPWYLLLCVL 947
            :   .|...:.|:..    ::|||....||:.....|:.:||:::..:|..|:.:...      |
  Rat  1040 A---MENAENHKIKAYTQLKLSGLLPSAYWIGQAVVDIPLFFVVLTLMLGSLFAFHHG------L 1095

  Fly   948 FFTGLAGLIFIYFLISMLSATFLAVSMILLSVIIGSLILMILGA---LALIFKMVYVAIYVANMH 1009
            :|..:..|..::.||:.:.      |:||.:.|.......||..   .:.|:.:..:|.......
  Rat  1096 YFYPVKFLAVVFCLIAYVP------SVILFTYIASFTFKKILNTKEFWSFIYSVTALACVAVTEI 1154

  Fly  1010 PLIAGYNCIQKCFHY--------MSLCGSYISEAQN-----PLSENLTSDEMYCINPLAFLEPRC 1061
            ....||. :...|||        ..|.|..||..:.     |.:||
  Rat  1155 TFFLGYG-VTAVFHYTFCIAIPIYPLLGCLISFIKGSWKNIPKTEN------------------- 1199

  Fly  1062 VCVNPMTWPDMLVMLGTAIILFLLIMFFEYGSCV-W------YRCK------------------- 1100
             ..||  |..:||    |:|:       .|..|| |      |..|
  Rat  1200 -AYNP--WDRLLV----AVIM-------PYLQCVLWIFLLQHYEKKHGGRSIRKDPLFRALSQKA 1250

  Fly  1101 --GCCPYSSKGSIEDPKVSREAEKIRAMDADQIGTR--ALVVNGVSKKYG----------CDQLA 1151
              ...|.......||..|..|..|::.:...|....  |::|..:.|:|.          ..::|
  Rat  1251 KHKKFPEPPINEDEDEDVKAERLKVKELMGCQCCEEKPAIMVYNLHKEYDDKKDFLHSRKTTKVA 1315

  Fly  1152 VNNISFALKPSHCVGLLGPNGAGKTTTFKMIVGEHSIDKGNIYISGY-SMRMKRNKAMKELGYCP 1215
            ...:||.:|....:||||||||||:|...::||:.....|.|::..| |...:.:::.|.:||||
  Rat  1316 TKYVSFCVKKGEILGLLGPNGAGKSTIINILVGDVEPTSGKIFLGDYGSHSNEDDESTKCMGYCP 1380

  Fly  1216 QSDSFFEFLTGRQLLKVFLLIWGFPSKDLNKRCEKLADQFGFRKHLDKKITYYSGGTKRKINAAV 1280
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  Rat  1381 QTNPLWPDITLQEHFEIYGAVKGMSSGDMKEVISRITKALDLKEHLQKTVKKLPAGIKRKLCFAL 1445

  Fly  1281 A-CGANSLICLDEPSAGVDPASRRHVWTIINEVAQQGK-AVLLTSHNMDEINALCSKSVILVDGS 1343
            : .|...:..|||||.|:||.:::|:|..|....:..| |.|||:|.|:|..|:|.:..|:|.|.
  Rat  1446 SMLGNPQVTLLDEPSTGMDPRAKQHMWRAIRTAFKNKKRAALLTTHYMEEAEAVCDRVAIMVSGQ 1510

  Fly  1344 IYAMGSVQHVKNKIAKGMTLKLVVNVQPDNMVAMLTKIEDDIYMTYPNAELKEKYEFSGRLTFQI 1408
            :..:|:|||:|:|..||..|::.:....:|:  .:.:::.:|...:|||..:|  .||..|.::|
  Rat  1511 LRCIGTVQHLKSKFGKGYFLEIKLKDWIENL--EIDRLQREIQYIFPNASRQE--SFSSILAYKI 1571

  Fly  1409 SKD--TSWSEIFEYVEGNRSSWHLEDYSLSQPSLEDAFEEIAEERRKKKSN 1457
            .|:  .|.|:.|..:|..:.::.:|:||.||.:||..|.|:.:|:.::.::
  Rat  1572 PKEDVQSLSQSFAKLEEAKHTFAIEEYSFSQATLEQVFVELTKEQEEEDNS 1622

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG42816	NP_730301.3	rim_protein	<81..1451	CDD:130324	381/1524 (25%)
Abca5	NP_775429.1	rim_protein	<107..1618	CDD:130324	397/1605 (25%)