Protein Alignment CG42816 and ABCA9

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_730301.3
• Gene: CG42816 / 39977
• FlyBaseID: FBgn0261998
• Length: 1459
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_024306297.1
• Gene: ABCA9 / 10350
• HGNCID: 39
• Length: 1634
• Species: Homo sapiens
• Alignment Length: 1608
• Identity: 406/1608 - (25%)
• Similarity: 703/1608 - (43%)
• Gaps: 336/1608 - (20%)

  Fly     5 DGSYPLYKTGFLAVQQALS----QVHIKHKCKE--FNKTQGDIKFPPIKDLPSPPIFKSDNSSTL 63
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Human   177 EGS-EFWEKGFVAFQAAINAAIIEIATNHSVMEQLMSVTGVHMKILP---------FVAQ----- 226

  Fly    64 QDVGIMIIVIIIFFVVVSLTKSI------VEEKELQLKVTLNLMGVGSCLQWVAWYIQTFIIFLI 122
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Human   227 ---GGVATDFFIFFCIISFSTFIYYVSVNVTQERQYITSLMTMMGLRESAFWLSWGLMYAGFILI 288

  Fly   123 GSSIITLFWKLVLPNSEISFMPFTHWSMALFVLLVLSHCTICFSFLMSSLISTTYRISLVTFLAL 187
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Human   289 MATLMA----LIVKSAQIVVLTGFVMVFTLFLLYGLSLITL--AFLMSVLIKKPFLTGLVVFLLI 347

  Fly   188 IA-TYLPFLILHSKGCSEGLNVFL--SLFLLSGLQVLVVGIC--MWEDYGEGLQWGNLFETSWPG 247
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Human   348 VFWGILGFPALYTR-----LPAFLEWTLCLLSPF-AFTVGMAQLIHLDYDVN---SNAHLDSSQN 403

  Fly   248 GTLSVGYILLVMILASFLSLLLCLYLEKIRPGPYGVPQPWHFPCTRCCSTESLLPYSRLF----- 307
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Human   404 PYLIIA-TLFMLVFDTLLYLVLTLYFDKILPAEYG-----H----RC---------SPLFFLKSC 449

  Fly   308 --------NRIFGIYSAAPDEERPD--LQLIEPDPVDKIAGVQIRGLSKTFG----KMEVVKNVS 358
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Human   450 FWFQHGRANHVV-LENETDSDPTPNDCFEPVSPEFCGKEA-IRIKNLKKEYAGKCERVEALKGVV 512

  Fly   359 FDMFEGQITVLMGHNGAGKTTLISMLAGFISPTSGTALINGFDIRQ--ERRQAQRCIGLCPQQNV 421
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Human   513 FDIYEGQITALLGHSGAGKTTLLNILSGLSVPTSGSVTVYNHTLSRMADIENISKFTGFCPQSNV 577

  Fly   422 LFKHLSSVSHIQLFSRLRGLRGAEVKSEVQNYLKKLNLQEKKRLAARNLSGGTQRRLSVACSLCG 486
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Human   578 QFGFLTVKENLRLFAKIKGILPHEVEKEVQRVVQELEMENIQDILAQNLSGGQNRKLTFGIAILG 642

  Fly   487 GVKVLICDEPSTGLDPSARRELWRLILEAKEGCTILLTTHQLDDGEVLGDRVVIISDGQLRCIGS 551
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Human   643 DPQVLLLDEPTAGLDPLSRHRIWNLLKEGKSDRVILFSTQFIDEADILADRKVFISNGKLKCAGS 707

  Fly   552 LPFLKKQVDASCLITCEARKRCDLEKLTSLISRHVGTIQPFSIKGRDVCYKLPLSKSKYFSSLFR 616
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Human   708 SLFLKKKWGIGYHLSLHLNERCDPESITSLVKQHISDAKLTAQSEEKLVYILPLERTNKFPELYR 772

  Fly   617 DLESQMNILGVRGFSLSSVSLEEIFMSFGAEDLNSRQSGGAEKRDDDDRDDDEENEVQDGNVRSC 681
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Human   773 DLDRCSN-QGIEDYGVSITTLNEVFLKLEGKSTIDESDIGIWGQLQTDGAKDIGSLVELEQVLSS 836

  Fly   682 KKQWR------AMMTKKVMALYDNKVYFLLL----------LLTPIVYYITTLM--------MAT 722
            ..:.|      |:..::|.|:  .||.||.|          ||...:.:|..|:        ..:
Human   837 FHETRKTISGVALWRQQVCAI--AKVRFLKLKKERKSLWTILLLFGISFIPQLLEHLFYESYQKS 899

  Fly   723 KPHHSGRPTFNIS--DYGVDKFTILLSVPVSKSYTEERRADSIASLIKGKLKLIVVSEQIKDYVD 785
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Human   900 YPWELSPNTYFLSPGQQPQDPLTHLLVINKTGSTID----NFLHSLRRQNIAIEV---------- 950

  Fly   786 DKWKSREGRREINFVSMAIDTGDRTGLIGWVGPRHYVHAA---------PMILNLVYNALAQELI 841
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Human   951 DAFGTRNGTDDPSYNGAIIVSGDEKD--------HRFSIACNTKRLNCFPVLLDVISNG----LL 1003

  Fly   842 GPKISIEVTSVPFTLRKKEDFLISNNGDIPIYVIGYVS-----IAM-------IIFSSAVIQERV 894
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Human  1004 GIFNSSE------HIQTDRSTFFEEHMD---YEYGYRSNTFFWIPMAASFTPYIAMSSIGDYKKK 1059

  Fly   895 SHMKMLQEVSGLEMITYWLSHLAFDMVVFFILVLALLLPLYGYAP-------WYLLLCVLFFTG- 951
            :|.::  .:|||....||......|:.::|:::|.:.:..|.::|       ..||:.:|...|
Human  1060 AHSQL--RISGLYPSAYWFGQALVDVSLYFLILLLMQIMDYIFSPEEIIFIIQNLLIQILCSIGY 1122

  Fly   952 LAGLIFIYFLISML-----------SATFLAVSMI-----------LLSVIIGSLIL---MILGA 991
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Human  1123 VSSLVFLTYVISFIFRNGRKNSGIWSFFFLIVVIFSIVATDLNEYGFLGLFFGTMLIPPFTLIGS 1187

  Fly   992 LALIF----------------KMVYVAIYVANMHPLIAGYNCIQKCFHYMSLCGSYISEAQNPLS 1040
            | .||                ::||:|:.:..:|.||  :..|.:|.
Human  1188 L-FIFSEISPDSMDYLGASESEIVYLALLIPYLHFLI--FLFILRCL------------------ 1231

  Fly  1041 ENLTSDEMYC------INPLAFLEPRCVCVNPMTWPDMLVMLGTAIILFLLIMFFEYGSCVWYRC 1099
                  ||.|      .:|:..:.||...:.|.
Human  1232 ------EMNCRKKLMRKDPVFRISPRSNAIFPN-------------------------------- 1258

  Fly  1100 KGCCPYSSKGSIEDPKVSREAEKIRAM---DADQIGTRALVVNGVSKKY-----GC-----DQLA 1151
                |...:|..||.::.| ...:.||   |.|:  |..::.:.:.|:|     .|     .::|
Human  1259 ----PEEPEGEEEDIQMER-MRTVNAMAVRDFDE--TPVIIASCLRKEYAGKKKNCFSKRKKKIA 1316

  Fly  1152 VNNISFALKPSHCVGLLGPNGAGKTTTFKMIVGEHSIDKGNIYISGYSMRMKRNKAMKELGYCPQ 1216
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Human  1317 TRNVSFCVKKGEVIGLLGHNGAGKSTTIKMITGDTKPTAGQVILKGSG----GGEPLGFLGYCPQ 1377

  Fly  1217 SDSFFEFLTGRQLLKVFLLIWGFPSKDLNKRCEKLADQFGFRKHLDKKITYYSGGTKRKINAAVA 1281
            .::.:..||.||.|:|:..:.|....|......:|.|....:..|...:...|.|.|||:...::
Human  1378 ENALWPNLTVRQHLEVYAAVKGLRKGDAMIAITRLVDALKLQDQLKAPVKTLSEGIKRKLCFVLS 1442

  Fly  1282 -CGANSLICLDEPSAGVDPASRRHVWTIINEVAQQ-GKAVLLTSHNMDEINALCSKSVILVDGSI 1344
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Human  1443 ILGNPSVVLLDEPSTGMDPEGQQQMWQVIRATFRNTERGALLTTHYMAEAEAVCDRVAIMVSGRL 1507

  Fly  1345 YAMGSVQHVKNKIAKG----MTLKLVVNVQPDNMVAMLTKIEDDIYMTYPNAELKEKYEFSGRLT 1405
            ..:||:||:|:|..|.    |.||.:..::|         :..:|...:|.|..:|:  ||..:.
Human  1508 RCIGSIQHLKSKFGKDYLLEMKLKNLAQMEP---------LHAEILRLFPQAAQQER--FSSLMV 1561

  Fly  1406 FQISKD--TSWSEIFEYVEGNRSSWHLEDYSLSQPSLEDAFEEIAEER 1451
            :::..:  ...|:.|..:|..:.|:.||:|||||.:||..|.|:::|:
Human  1562 YKLPVEDVRPLSQAFFKLEIVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQ 1609

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG42816	NP_730301.3	rim_protein	<81..1451	CDD:130324	388/1524 (25%)
ABCA9	XP_024306297.1	ABC2_membrane_3	53..416	CDD:463674	62/272 (23%)
		rim_protein	<245..1609	CDD:130324	387/1520 (25%)