DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG6052 and Abca15

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_649002.3 Gene:CG6052 / 39971 FlyBaseID:FBgn0036747 Length:1725 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001099763.2 Gene:Abca15 / 293442 RGDID:1305981 Length:1668 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1789 Identity:571/1789 - (31%)
Similarity:897/1789 - (50%) Gaps:235/1789 - (13%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    21 KLKLLMWKNWILQWNQKMQIVFALVLPVLFLCLILVLRIIVLPEKMDEIRYPTVSISDLNLYMRM 85
            ||.||:|||:.|:..:...:|..::|.:.|..::|..|.::...||:.:.:|...:..:..:.|:
  Rat     8 KLLLLLWKNFTLKRRKFGALVTEIILMLAFSIVLLTTRHLLSINKMESLHFPDQPVGAVPFFFRV 72

  Fly    86 VPLGNRILHENGSLNIPRNF-LCYTPNN-------------PIN--SAIVGATAIRLRLLGTRAY 134
                        |.|..|.: |.|.|:|             .:|  .|::|..:         ..
  Rat    73 ------------SANSSRPWELAYVPSNITVVHNIVENVKKDLNFPMAVIGFPS---------ES 116

  Fly   135 DTALHMEQDMVLHNFLAGVQFEDNENVNTNDAGYPLNLNYSLRFPSELRTMQGPII---DTWRTS 196
            |...:....:...|.||.:.| |:...|:.|. .|..:.|:|||....:.:.|...   .||.|.
  Rat   117 DFEDYARSSVNSRNILAAIVF-DHNFANSRDP-LPKKIKYNLRFSDIKKNIHGMAYYQGHTWLTK 179

  Fly   197 RLFLSYDTSGSRNRLDNDGGVPVGYIREGFLPIQHALTMSWLALASGVTDTGI---PAIHLQRFP 258
            .||......|.||..:.|||.| |||.||||.:||||..:.:....|...|.:   .::.:||||
  Rat   180 FLFPPLRIVGPRNPQEADGGSP-GYITEGFLAVQHALDKAIMLHHGGAAATALFNDVSLFIQRFP 243

  Fly   259 YRAYTYDQLLSGLRQLLPFVILLSFIYPASTVTKYVTSEKELQLKEIMKLIGVHNWLHWVAWFVK 323
            |.||.:|.........:|..:...|......:...:..|||.:|||...:||:.||:.|:|:|. 
  Rat   244 YPAYYHDHFYLFANTFVPLTVASIFFLNHLILVWSIVWEKENRLKEYQLMIGLRNWMFWIAYFF- 307

  Fly   324 SYIMLMLVVFLIMSLIMVKFYASVAVLTFSSWVPVLLFLHTYVVTSVCLCFMLAVLFSKASTASA 388
            ::..|..:..:.|.:::........:..::..:.|.:.|..|.::|:...||::.||::.|.|.:
  Rat   308 TFFCLYFINIIFMCIVLFVKIDPAPIFQYNDPILVFILLLFYAISSIFFSFMISTLFNRVSFAVS 372

  Fly   389 VAAIFWFLTYIPYSFGYYYYERLSLMSKLLISLIFSNSALGFGIHVIVMWEGTGEGITWRNMFHP 453
            :.:..:||||:|.......:|.:....||:.|..| |..:.||...:|..|....|:.|.|:|.|
  Rat   373 LGSFLFFLTYLPAITMNQSFEHMPPRQKLIWSFDF-NVGMAFGFRFLVNAETRKTGMKWNNIFLP 436

  Fly   454 VSTDDSLTLFYIIMTMSFGSIMFISICLYVEQVFPGEYGVPRRWNFMCHKNYW----RQYVPSLN 514
            ..: |||...|::..:...:.::..:..|:|.|||||||||:.|||....:||    ||..|.: 
  Rat   437 TDS-DSLLFTYVLGMLLVDAFIYGLVAWYIEAVFPGEYGVPKPWNFFLMHSYWFGESRQQKPEI- 499

  Fly   515 IVPSFQTILHGSAKAKSCRRARE-----------VGIQLFNLQK-----NYGKLKAVKGISLKMH 563
                          .:.|:|...           .|||:.:|.|     |..|: |:..:||.::
  Rat   500 --------------TQFCKRVESKYFEVEPTDLTAGIQIKHLHKVFQENNITKV-AINDLSLNVY 549

  Fly   564 RNEITVLLGHNGAGKTTTINMITGIVKPTSGTAIVNGYDIRTHLAKARESLGICPQNNILFKEMS 628
            ..:||||||||||||:||:::::|:..||||.|.|:|.||..|:.:.|..||:|||.|:||..::
  Rat   550 EGQITVLLGHNGAGKSTTLSILSGLYPPTSGEAYVHGEDISQHMDQIRNFLGLCPQQNLLFDHLT 614

  Fly   629 VRDHIIFFSKLKGIRGTKAVENEVGKYMTMLKLQDKSYVAAKNLSGGMKRKLSLCCALCGNAKVV 693
            |.:|:.|:.::||:.....:| |....::...|.:|....:|:|||||||||::..||.|.:|||
  Rat   615 VSEHLYFYCRVKGVPQNMCLE-ETNNMLSAFNLTEKRDAFSKSLSGGMKRKLAIIIALIGGSKVV 678

  Fly   694 LCDEPSSGIDAAGRRSLWDLLQSEKDGRTILLTTHYMDEADVLGDRIAILSEGKLQCQGTSFYLK 758
            :.|||:||:|.|.|||.||::|:.|..||||||||||||||:|||||||:.:|.|:|.|:|.:||
  Rat   679 ILDEPTSGMDPASRRSTWDVVQTYKQNRTILLTTHYMDEADMLGDRIAIMVQGTLRCCGSSVFLK 743

  Fly   759 KRFGTGYLLVCIMQSGCDVGAVTQLIRKYVPPIKPERVLGTELTYRLPTEYSKKFAELLQDLDEK 823
            :.:|.|..:|.:.:..|||..:::||..|:|....:..:|.||::.||.||:.||..||..|:|.
  Rat   744 RLYGVGSHIVMVKEPVCDVDEISKLIHYYIPTATLKTNVGNELSFILPKEYTHKFEALLTALEEN 808

  Fly   824 CAQLQLVGYGLSGATLEDVFMAVN--TDKRVQGGAEGPPVDGSIDFKELVFDSKTR-------EK 879
            ...|.:..:|:|..|:|:||:.|:  .|.:....|...|..||...:....:|..|       |.
  Rat   809 QENLGISSFGMSITTMEEVFLRVSKMEDSKPDMEATQSPSAGSKGNRNRDVESSMRAGFPTQSED 873

  Fly   880 RRI---RRCFMFWQ---ALFLKKFYTTTRNYWLLGIQLVLPIAVMALTILNS---RGGRIYYELP 935
            :.|   ..|.::.|   |:|:|:.....||:.:|.:| :|.:.:....:|.|   |..||     
  Rat   874 QTIVFNTGCPLYLQQFHAMFMKRLMYNWRNWRVLSVQ-ILGLVISTFLLLKSHEFRHKRI----- 932

  Fly   936 AMPISINQYSSAYVVL----EDNTTDKTSSLADAYSKHLEHYARRCTLLRTGDLKFEDY---ILS 993
             ..::::.|....|..    :.|.|  ||.|.     |||:      :|:.|:.:.::.   :|.
  Rat   933 -RQMNLDDYGQTIVPFSILGKSNLT--TSLLI-----HLEN------MLKPGNHQLKEVQGDLLK 983

  Fly   994 HDVNHSRRIDFHFLA---GLTVSENNFIVWLNNKPLHTAPLTLNLLHNALAIKLLGQDASTYVTN 1055
            :...:...|....:|   .:........|..||:..|:..|:|.:|.|.|.:.|.|.:||..|.:
  Rat   984 YLEGNEECIHLCIVALSIKVAAGRAKLTVLFNNEAYHSPSLSLAVLDNILFMSLSGANASITVFH 1048

  Fly  1056 EPLPYSDDTRTLRLNKGQVLGAEISINLSLTM---CFITAFYAIPIIRERETRAKLLQFLSGVDV 1117
            :|.|........|...|:::..:|.:.::|.:   |.:|       :.||.|:||.:|||||..|
  Rat  1049 KPQPRPTSKEWPRSTYGKIVAFKIQLGMALLVSGFCILT-------VTERITKAKHMQFLSGASV 1106

  Fly  1118 CAYWTSHIVWDYLVFVLSALSSILTIAAFKEIGYITPLDLSRYFYMLLIFGFPGIMLSYAASGCF 1182
            ..||.|.:|:|:::|.:|....::....:|...|:|...:.....:|::||:..|.|:|..|..|
  Rat  1107 LVYWLSALVFDFIIFFISCCFLLVMFKYYKIDIYVTDYHILETMLILILFGWSAIPLTYLMSFLF 1171

  Fly  1183 SDAATGFTRISIINTLMGTGLFLMFMTLNFEAFQLKDVAEKLAWYFRLS-----PHYSLASSTHS 1242
            |.:...:.::.:...|.||...|:...:  || .|..:.......|.||     |.|:|......
  Rat  1172 SKSIPAYIQLLVFYYLSGTSGLLIDTII--EA-GLSTIISNSTQTFLLSSLLFFPTYNLGKCISE 1233

  Fly  1243 IHIGYNIRRGCSIGGIRKLPKQLRC------RNVPICCDIPGYYGWRKPGVLVEITYMIMLGSTL 1301
            ..:.|..:..|.  ..:.:.|.|.|      :|:         |..:||.:...:..|.:.|...
  Rat  1234 YTVIYQRKILCI--QQKNVLKYLNCSKEYTKKNI---------YSLKKPMIGKYLIAMSIAGFVY 1287

  Fly  1302 FLLIVMHDA---KVCNLIAEKL--GNCFSKRKRVE------GGTSIENDSVVAEQRVVREMINSG 1355
            .|.|...:.   |:..||.:.:  |.|  |:.:.:      .|||.:||  |..:|  ||::...
  Rat  1288 LLFIFFWENISWKLRMLIHQHIYFGVC--KKYKSDIISNELSGTSEDND--VENER--REILYQP 1346

  Fly  1356 RK--DVPLLVYKISKRYRSK---LAVKAISFHVPHAECFGLLGINGAGKTSTFKMLAGDEKITSG 1415
            .|  :.|:|:.:::|.|...   ||||.||..:...|||||||.||||||:||::|.|:...|:|
  Rat  1347 EKFLNCPVLIKQLTKIYFKSPLILAVKNISLAIQERECFGLLGFNGAGKTTTFQILTGEITPTAG 1411

  Fly  1416 EAYIDGTNISTH--KVYRKIGYCPQFDALFEDLTGRETLNIYCLLRGVQRRHVTPICWGLAISFG 1478
            :.:|||.:|:..  ||..|||||||||||.|.|||.|.:.:|..:.|:..|.:.|.......|..
  Rat  1412 DVFIDGISITKDVLKVRSKIGYCPQFDALLEYLTGWEIMVMYARIWGISERQIRPYVNTYLNSLE 1476

  Fly  1479 FAKHMDKQTKHYSGGNRRKLSTAISVLGNPSVLYLDEPTSGMDPAARRQLWQIIGLIRTAGKSIV 1543
            ...|.:.....||.||:|:|||||:::|.|||::||||::||||.|||.||..:..||.:||:|:
  Rat  1477 LEPHANSLISTYSEGNKRRLSTAIAMMGKPSVIFLDEPSTGMDPRARRLLWDAVIKIRESGKAII 1541

  Fly  1544 LTSHSMDECEALCSRLAIMVDGEFKCLGSVQSLKNQFSKGLILKVKVKHKKKTFQRVVEDSSSSN 1608
            :|||||:||||||:||:|||.|:..||||.|.|||:|....|||.|||                 
  Rat  1542 ITSHSMEECEALCTRLSIMVHGKLTCLGSPQYLKNKFGDIYILKTKVK----------------- 1589

  Fly  1609 DKKSISETDLKFLQMASVMESSQADRILKVNRFISKEIPDAELKEEYNGLITYYIPHSKTLS--K 1671
                                  ..:.:.:...||:...|.:|||:|..|::.|||| ||..|  |
  Rat  1590 ----------------------SGETLKEFKNFITLTFPGSELKQENQGILNYYIP-SKDNSWGK 1631

  Fly  1672 IFQLLETNSHKLNIEDYLIMQTRLEEIFLDFASK 1705
            :|.:||....:.::|||.|.|..|:::||.||.:
  Rat  1632 VFGILEKAKEQYDLEDYSISQITLDQVFLAFADQ 1665

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG6052NP_649002.3 rim_protein 21..>54 CDD:130324 11/32 (34%)
rim_protein <149..1709 CDD:130324 542/1645 (33%)
Abca15NP_001099763.2 rim_protein <112..1665 CDD:130324 544/1671 (33%)

Return to query results.
Submit another query.