DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Cad74A and cdh-10

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_648973.1 Gene:Cad74A / 39936 FlyBaseID:FBgn0036715 Length:1820 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_500204.3 Gene:cdh-10 / 183476 WormBaseID:WBGene00000402 Length:1775 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:1955 Identity:395/1955 - (20%)
Similarity:710/1955 - (36%) Gaps:505/1955 - (25%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   106 EPN--TVSQRRVIPVRDYNDNQPTFLGRPYTA-------SVSESLPVGS---------------E 146
            |||  .:|..:.:..||.:|:....:|...:.       |....||.|.               :
 Worm    60 EPNLERLSSDKFVVRRDSSDSSTEVVGDENSVPDKFDQPSYDFMLPEGKTENSTILAVVDFITRK 124

  Fly   147 LSVEPPIVVVDRDEGINSEVQMKCLEENDICDIFEVRAVKISDGN-YTARVALKQQLDFESRPS- 209
            .:|:|..||              ..:||:...|..|...:..:.: |.|.|.|:|..:.|...: 
 Worm   125 HNVKPAFVV--------------NFDENEWFAIGNVEKTRADNADVYKATVILRQNSNVEIAKTE 175

  Fly   210 ---YILTISASDSALDNRLSSLATISINV-------------IDIQDQPPIFTNAPYSATVPENT 258
               |...:.|....:     .|||.:|:|             :.:.|:|.:.     ..|||..:
 Worm   176 GGLYRFVVEAQQGEV-----VLATTNISVDVIKLAPTTKRTRVTVPDRPKLM-----ETTVPVTS 230

  Fly   259 PAGVSILTVKAVDGDVGIPREIFL--------SLEDEPFGHFELVPFGDPR-------------- 301
            .:..|...:: |||:.....::.|        |.|.      ..||...|.              
 Worm   231 SSSTSSEMIE-VDGESETQEDLTLGGGGAEATSTET------TTVPMTSPEEEVVTSSAATSPAS 288

  Fly   302 -------DGTAVLQTTSEPL------DRENAEILQNGGVYVFSIRAT--------ELIDGA---- 341
                   |...:..|:.||.      :.|..|:|...|.....:..|        ||:|.:    
 Worm   289 TADFSDDDDLTIPVTSPEPTQPKDSEEEEEVEVLDGSGEGSADVLTTTETNEGSGELLDSSTSSN 353

  Fly   342 IPAEHSLTRVTIVVTDVDDHQPTFSGPHFNVSI--TENLANGMPLP-GLSIFVDDRDMGENSRYE 403
            :||..|...:      |::.:...:||   |||  .:|..:|:..| .:.:.:...|:.:..| :
 Worm   354 LPASSSEASL------VEEEEDPITGP---VSILPLQNSPDGIIEPLDIQLTISPSDVIKVPR-D 408

  Fly   404 LSLRDVFNAARVFEVSPTESQGRT-PVVVKVLNASRLDYDVVDPDLRKFE--------------- 452
            ....||....:|...|.||:..:| .:.:::..|..|:   :.|.:..|:               
 Worm   409 ARPGDVIRNLQVEFQSATENLRKTKKIELEIEPAGFLE---IRPKILNFDEKAMIFIGDLAESLS 470

  Fly   453 --FDLVASVKGVEKAKTRVEIHLLD------ANDNAPVFDQGTYRFTAAENLPVDAIIGHVKATD 509
              ..:||.: |....:|.:.:.|.:      .:|.:.:.......|...|.......||.|. :|
 Worm   471 ENLQIVAKI-GNSTLRTPIRLDLTEYLENPGNSDGSEMLSLREVEFAVTETAESGRTIGQVD-SD 533

  Fly   510 LDSGEFGHVRYVLKGFGADNFYVNPETGGVYLL--------KPLDYEKQSSYSLTVVAIDGG--- 563
            |.         ::.|.|...|.:   .|...:|        |.|:.:.|.|:||.::..:|.   
 Worm   534 LK---------IIGGNGNRKFSL---VGNDLILSCSQFDTEKCLENDDQKSFSLILMPKNGALAP 586

  Fly   564 -------QREANANLFVGVTDVNDNH---PNFESKEYSR-TIREGAALFEPQFFVRAHDADGPSQ 617
                   |::||......|..::||.   |.....|.:| .|:.|....:...||:|.:.     
 Worm   587 VQVTIIVQQKANLRTSDKVIRISDNRIISPFAVITERTRKDIQLGGDAAKFLGFVKAQEG----- 646

  Fly   618 GNGRVKYSIVSENSIAGNVFRIEPDTGEIVIQKAARSMDTERGEYELVVSATDFGIPPLSNTTRV 682
                 .|.|:..||.|.                         |.|.|.:|..|       :|...
 Worm   647 -----LYQIIVINSAAS-------------------------GRYSLDISIDD-------DTQSK 674

  Fly   683 LVRVGISGNQRPIFRGHFQNMENLPIIGPPSYRVSIPENAAAGSNVTSVSAHDPDG--LDSLLRY 745
            .:.|.:..:|.   ..||:..           :.|:..:|....|...::..:.:|  :|. .:.
 Worm   675 TIEVFVENSQS---HAHFRKS-----------KYSLEVDAGKVENGLKLTQVELEGVPIDE-AKI 724

  Fly   746 RIVGANDNF-EIDEISGLITVSPQARIDRDSNMNSFEIIVNAVDSGTPIPETATTTVYVNVKDIN 809
            .::..|..: .::|..|.:.|   .:.|.......|.|.:.|||..|   .|..|...|.:...|
 Worm   725 MVLDGNPGWVTVEEYGGKVNV---GKYDGPIYNGKFPIRIGAVDKKT---WTILTETIVEIDVKN 783

  Fly   810 DERP-----KFEQNSYATYVSERTAVGESVLRVKAIDKDLNSKLEYSMVGPVAATTKAGVSIANR 869
            .:.|     |.|:.|..:.|.|.|           .|::.:...|..:               :.
 Worm   784 GQEPLENEQKIEEKSGKSRVLEAT-----------FDREKSEDFEIQL---------------DE 822

  Fly   870 SNYR--LQEAFRVDSQSGEIFVNGTLRHDVAAIIIFTVGVRDLNAEVDPEG------------QV 920
            .|.:  |:..:.:|.:..::.::.|           ::.|...:.::.|:.            ..
 Worm   823 KNMKLDLKSMYGIDEKGQKVTLDPT-----------SITVTSTHVQLTPDSLKSLRLIGMTLKNP 876

  Fly   921 DTTEVTVYVQSFQD-----------TNPVFKNTGWTSSRPVIDVKIKEEMPIDSALFILQAEDPV 974
            |:.::.:.|:....           ..|::. ..||...|||.|:::||:.....:.:.    |.
 Worm   877 DSQKINILVRLISSPEYLKNQEKLAQRPIYP-MPWTRENPVIHVELREELAQGQVVGVF----PA 936

  Fly   975 TRQPITSFEL-IEPKQVDYFQVAERTGEVILKKRLDYEALGDTGPEFELQVRANSADRQRSTVSR 1038
            ..|...|.|: |.....|.|.....|||:.:|:|:|||.|.:....|.|.:.:.....:...:..
 Worm   937 VSQGNLSREIQISGLMSDAFDFNGTTGELKIKQRIDYETLDEAQKTFNLTLSSGENGFKSEAILM 1001

  Fly  1039 VNITVENVNDNSPRFE-RNSYQATIIENRPHPERVIRVRALDKDAVLNARDERLGYHKIIYSLQG 1102
            |.:|  :|:||||..: .::...::.||.....::......|.|          |.......|:|
 Worm  1002 VQVT--DVDDNSPVVDVGDAEMISLPENLSAGTKIAEFDVTDPD----------GSESYQVELEG 1054

  Fly  1103 EHAMLFDIN----NTTG--EIIVASGQTIDRERTPRIQLQIKAEDSPGRPTDAKQSVVELQIEVL 1161
            :.:..|..|    |||.  .|.:|....||||....|.|.:|..|..|.    .:.:: |.|.||
 Worm  1055 DGSKNFMANITSSNTTATLSIFIAENAKIDRETQDFIALLVKILDISGN----SEKII-LPIRVL 1114

  Fly  1162 DVNDNAPEFTQKKYSTVIPENAQIDSFVLQLEAVDAD-EGLGGEVRYELVNEGE-ANGLFKIDTK 1224
            |||||||:|.|..|...:.|:......:.::.|:|:| .|....|.|::.|..: .:.:..:::.
 Worm  1115 DVNDNAPQFEQNLYDVEVMEDLPSGMVIHRVHAMDSDAPGAASTVNYQISNPSDVTDDVISVNST 1179

  Fly  1225 SGLISTRRNLTGKGRAHPYVLIVRAQDNGNQMPKQPTLSTDTDVRIYI---GDVSANDGVPYFLS 1286
            ||::....:|.|..|..||...|.|||.|     .|.|::.:.:.:.:   .:|...:.|.:   
 Worm  1180 SGVVQISGSLWGMPREQPYKFQVIAQDFG-----APGLNSTSILSLRVRNKDEVVTEEAVEF--- 1236

  Fly  1287 PRVGQMANVTENAVTGAPVFQVIASDPDDESTPSGTITYRILPDTPDAE---AFVIDAHSGLITT 1348
            ..:.|...:.||......::...|......|...|.:.| .|.|...:|   .|.:|..||.|..
 Worm  1237 EEITQEVVIQENLAPDTKIYTAKAVLRGIPSKTRGKVVY-TLKDLLSSEKEPIFAVDKDSGDIFV 1300

  Fly  1349 RQSMDRETKDMYRILLEVSDNGQPKQSATRILQIAILDVDDHEPRF------------------- 1394
            .:.:|.|.:..|.:|:...::|....:::.:|:|.:.::||:||.|                   
 Worm  1301 VKPIDFEERSEYTLLITAFNSGNELVTSSTLLKIRVENLDDNEPEFLPSALPIFQVPKNTSKPTA 1365

  Fly  1395 -----AREADAGPLSMSVREEEPAGTIVGNFSALDEDLGENAAIDY-VIIDGNNEQLFTIERNNE 1453
                 ||:||..|:...:...........||: :|.:.||   |.| ..:|.:::.     ...|
 Worm  1366 IGRLTARDADFSPIFYHLLPNCGTPESSDNFN-IDAEFGE---IVYEPKVDPSSKM-----TEAE 1421

  Fly  1454 SLAILKTKKPIDREQV--ESFTLTIKCLKLGEPGYKFIGDPYD--------------RQDLSHLR 1502
            ...|..::|.:|..:|  ::.:...|.:|:     :|:||..|              .|.:|   
 Worm  1422 VCFIATSQKNLDTSEVFFDANSKNFKRVKV-----EFVGDSVDSVANSGKINNGFSGNQSIS--- 1478

  Fly  1503 INVRVLDIDDNLPKFEQPDPTVGIRINVPIDTVVTTLKASDADAEAPPVGLSIENVTFVPQFYKR 1567
               .|.|:.|              |:.:|::....   |...|.|.       :::.|||..|:.
 Worm  1479 ---SVGDVLD--------------RVEIPMNLGAA---AGAQDYEQ-------KSLNFVPANYEL 1516

  Fly  1568 SRSLAVGNLHNLFTLNNRTGELRTGGSFADYVDGYFLMRVMANNSVQPKRQAHSNLKVFVIRDKS 1632
            .|.:.  :......||..||||...|...|...|.:...:...:..:..:|.|.      ||:..
 Worm  1517 GRDMI--SPEGAVELNKNTGELVANGKILDTPQGVYTAEIGRGDGGEGVKQLHH------IRNDR 1573

  Fly  1633 LLKFVFARPPNEIQHNIRPFQEQLQKKLKPLG---------LELHVLDTQVFTRPDMS-LDFTAT 1687
            .|::|.:...||...|:..|:.|:   |:.:|         ||:|      |..|... .:.|.|
 Worm  1574 KLRYVLSMSRNEFGANLEKFRRQI---LEAIGKDDQKAGKQLEIH------FDEPKADRKNSTWT 1629

  Fly  1688 SSCFQMFKNGAALSFNEMQKLMNSQQLRQELIDIYAAYGVSEVESCSVRRTHAAAIFAGMLTSAG 1752
            |.||.:.:..|.|..|:...:::..  ...:..::..:.|..|:.|:.:   .:|..:...:|:.
 Worm  1630 SVCFYLTRQNAILDENQASSIISPS--NGHISKLHHIFKVQNVDMCAPK---PSATSSESTSSSN 1689

  Fly  1753 AWL----VFLAALIGL---AALVSLCTACCLKKKLKRHSKRSLQASLRTPTEHTATSYSYSMPAV 1810
            :.:    :.|..::||   |.|..|...||: .:.:|:.|:... .||..:  :|.|| |..|.:
 Worm  1690 SDIPLNTLILIGVVGLLIIALLALLIYVCCV-SRYQRYLKQKTD-QLRCSS--SAGSY-YKSPNL 1749

  Fly  1811 LYSEP 1815
            :...|
 Worm  1750 IPPPP 1754

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Cad74ANP_648973.1 Cadherin_repeat 33..124 CDD:206637 6/19 (32%)
Cadherin_repeat 132..240 CDD:206637 25/147 (17%)
Cadherin_repeat 249..361 CDD:206637 29/158 (18%)
Cadherin_repeat 487..581 CDD:206637 23/111 (21%)
Cadherin_repeat 589..686 CDD:206637 18/97 (19%)
Cadherin_repeat 713..810 CDD:206637 19/99 (19%)
Cadherin_repeat 819..936 CDD:206637 14/141 (10%)
Cadherin_repeat 953..1049 CDD:206637 24/96 (25%)
Cadherin_repeat 1057..1166 CDD:206637 30/114 (26%)
Cadherin_repeat 1175..1279 CDD:206637 24/108 (22%)
Cadherin_repeat 1293..1390 CDD:206637 22/99 (22%)
Cadherin_repeat 1402..1513 CDD:206637 24/127 (19%)
Cadherin_repeat 1523..1628 CDD:206637 21/104 (20%)
cdh-10NP_500204.3 Cadherin_repeat 916..1010 CDD:206637 26/99 (26%)
Cadherin_repeat 1022..1119 CDD:206637 30/111 (27%)
Cadherin_repeat 1128..1222 CDD:206637 23/98 (23%)
Cadherin_repeat 1242..1342 CDD:206637 22/100 (22%)

Return to query results.
Submit another query.