DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG9674 and gltB

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001246804.1 Gene:CG9674 / 39878 FlyBaseID:FBgn0036663 Length:2115 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_417679.2 Gene:gltB / 947724 ECOCYCID:EG10403 Length:1486 Species:Escherichia coli


Alignment Length:1528 Identity:661/1528 - (43%)
Similarity:897/1528 - (58%) Gaps:72/1528 - (4%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    78 LYDPQNEHEACGVGFIVAIDGKRSHKILRDAQTLSERMNHRGACACDNDTGDGAGVLASIPHGLY 142
            |||...|.:.||.|.|..|:|:.|||::|.|.....||.||||...|..||||.|:|...|...:
E. coli     2 LYDKSLERDNCGFGLIAHIEGEPSHKVVRTAIHALARMQHRGAILADGKTGDGCGLLLQKPDRFF 66

  Fly   143 SKALAKQGVTLPELGDYATGIFYL--DEAQHAAAEKEFDDLAKSLGLEVIAWRTVPSNQSAIGVV 205
            .....::|..|.:  :||.|:.:|  |....|||.:..::..:...|.::.||.||:|:..:|.:
E. coli    67 RIVAQERGWRLAK--NYAVGMLFLNKDPELAAAARRIVEEELQRETLSIVGWRDVPTNEGVLGEI 129

  Fly   206 ARKSEPLSRQVFVRRPAGSDEKAFERQVFVLRKRASHELIKPGRRFYICSLSDRTVVYKGLFTSD 270
            |..|.|...|:||..|||...:..||::|:.|:|....| :..:.||:||||:...:||||....
E. coli   130 ALSSLPRIEQIFVNAPAGWRPRDMERRLFIARRRIEKRL-EADKDFYVCSLSNLVNIYKGLCMPT 193

  Fly   271 QLWDYYTDLKDPEFETYLALVHTRFSTNTFPSWERAHPLRVLAHNGEINTLRGNVNLMKAREGVM 335
            .|..:|.||.|...|:.:.|.|.||||||.|.|..|.|.|.|||||||||:.||....:||....
E. coli   194 DLPRFYLDLADLRLESAICLFHQRFSTNTVPRWPLAQPFRYLAHNGEINTITGNRQWARARTYKF 258

  Fly   336 QSDLFGDQLKKLYPVVEPNLSDSGSFDCVLEFLTMASDRSLPESVMTMVPEAWQNDKTMPQEKRD 400
            |:.|..| |....|.|....|||.|.|.:||.| :|....:..::..:||.||||:..|..|.|.
E. coli   259 QTPLIPD-LHDAAPFVNETGSDSSSMDNMLELL-LAGGMDIIRAMRLLVPPAWQNNPDMDPELRA 321

  Fly   401 FYQWAACVMEPWDGPALISFTDGRYIGAVLDRNGLRPSRFYVTKENVLVMASEVGVYDVDPSQVT 465
            |:.:.:..||||||||.|..:|||:....||||||||:|:.:||:.::..|||||::|..|.:|.
E. coli   322 FFDFNSMHMEPWDGPAGIVMSDGRFAACNLDRNGLRPARYVITKDKLITCASEVGIWDYQPDEVV 386

  Fly   466 LKSRLKPGRMLLVDTKEKKLIQDIELKAKIAKSRPHSEWLQQKMITLDEIRNANVLNTPPVDELA 530
            .|.|:.||.::::||:..:::...|....:....|:.||:::           ||....|.::|.
E. coli   387 EKGRVGPGELMVIDTRSGRILHSAETDDDLKSRHPYKEWMEK-----------NVRRLVPFEDLP 440

  Fly   531 KLPASERGIFDPRLS----LFGYSTETVNMLLIPMFKNKKEALGSMGNDAPLACLSNFQPIPYEY 591
            ......|.:.|..|:    .|.||.|.::.::..:.:|.:||:||||:|.|.|.||:...|.|:|
E. coli   441 DEEVGSRELDDDTLASYQKQFNYSAEELDSVIRVLGENGQEAVGSMGDDTPFAVLSSQPRIIYDY 505

  Fly   592 FKQLFAQVTNPPIDPFREKVVMSMQCPLGPEANLLQPSAQQVHRIWLTNPILSIPDTQLLKRNTH 656
            |:|.|||||||||||.||..|||:...:|.|.|:...:..|.||:...:|||...|.:.|.....
E. coli   506 FRQQFAQVTNPPIDPLREAHVMSLATSIGREMNVFCEAEGQAHRLSFKSPILLYSDFKQLTTMKE 570

  Fly   657 RGWRTKVLDITFQYNEGVQGYIDA-IDRICREGYAAAQAGYQLLVISDRGAGIDGKVAVSALLAL 720
            ..:|...|||||...:..   ::| :..:|.:.....::|..|||:|||....| ::.|.|.:|:
E. coli   571 EHYRADTLDITFDVTKTT---LEATVKELCDKAEKMVRSGTVLLVLSDRNIAKD-RLPVPAPMAV 631

  Fly   721 GALHHHLIETLQRMKVGIVVETAEAREVHHICVLLGYGADAICPYLAFELAQALRDDGVIAPEVN 785
            ||:...|::...|....|:||||.||:.||..||||:||.||.||||:|....|.|...||.:. 
E. coli   632 GAIQTRLVDQSLRCDANIIVETASARDPHHFAVLLGFGATAIYPYLAYETLGRLVDTHAIAKDY- 695

  Fly   786 DKQIYAAYAQAIDTGIAKVMAKMGISTLQSYKSAQIFEAVGLGSDLVAKCFRGTQSRIGGVTLEI 850
             :.:...|...|:.|:.|:|:||||||:.||:.:::||||||..|:|..||:|..|||||.:.|.
E. coli   696 -RTVMLNYRNGINKGLYKIMSKMGISTIASYRCSKLFEAVGLHDDVVGLCFQGAVSRIGGASFED 759

  Fly   851 LAKEGLQRYQLTYGKATPDTRILRNP----GQYHWRHGGEAHINEPSSIGSLQEAAVNKNLDAFE 911
            ..::.|...:..:        :.|.|    |...:.||||.|...|..:.:||:|..:.....::
E. coli   760 FQQDLLNLSKRAW--------LARKPISQGGLLKYVHGGEYHAYNPDVVRTLQQAVQSGEYSDYQ 816

  Fly   912 AFKKTTLDSVKKCALRGQLEFVTDRQSIDISEVEPASEIVKRFATGAMSFGSISLEAHQTLSITM 976
            .:.| .::......||..|.......:::|::||||||:.|||.|.|||.|::|.|||:.|:..|
E. coli   817 EYAK-LVNERPATTLRDLLAITPGENAVNIADVEPASELFKRFDTAAMSIGALSPEAHEALAEAM 880

  Fly   977 NRIGGKSNTGEGGEDSDRYLNQDPNNSRRSAIKQVASGRFGVTASYLANADDLQIKMAQGAKPGE 1041
            |.|||.||:||||||..||     ..::.|.||||||||||||.:||.|||.:|||:||||||||
E. coli   881 NSIGGNSNSGEGGEDPARY-----GTNKVSRIKQVASGRFGVTPAYLVNADVIQIKVAQGAKPGE 940

  Fly  1042 GGELPGYKVTKDIAKTRKSVPGVGLISPPPHHDIYSIEDLAELIYDLKCSNPNARISVKLVSEVG 1106
            ||:|||.|||..|||.|.|||||.|||||||||||||||||:||:|||..||.|.||||||||.|
E. coli   941 GGQLPGDKVTPYIAKLRYSVPGVTLISPPPHHDIYSIEDLAQLIFDLKQVNPKAMISVKLVSEPG 1005

  Fly  1107 VGVVASGVAKGKAEHIVISGHDGGTGASSWTGIKNAGLPWELGVAETHQVLVLNNLRSRVIVQAD 1171
            ||.:|:||||..|:.|.|:|:|||||||..:.:|.||.|||||:.||.|.||.|.||.::.:|.|
E. coli  1006 VGTIATGVAKAYADLITIAGYDGGTGASPLSSVKYAGCPWELGLVETQQALVANGLRHKIRLQVD 1070

  Fly  1172 GQLRTGFDVVVAALLGADEFGFSTAPLIVMGCTMMRKCHLNTCPVGIATQDPELRKK-FTGKPEH 1235
            |.|:||.|::.||:|||:.|||.|.|::.:||..:|.||||.|..|:||||.:|||. :.|.|..
E. coli  1071 GGLKTGVDIIKAAILGAESFGFGTGPMVALGCKYLRICHLNNCATGVATQDDKLRKNHYHGLPFK 1135

  Fly  1236 VINFFFMLAEDIRKIMAGLGIRKFQDLIGRTDLLRVASQRDAKASNLDLKLLLQPALELRPGTNI 1300
            |.|:|..:|.:.|::||.||:.:..|||||||||:......||...|.|..||:.| |..||..:
E. coli  1136 VTNYFEFIARETRELMAQLGVTRLVDLIGRTDLLKELDGFTAKQQKLALSKLLETA-EPHPGKAL 1199

  Fly  1301 VGGSVKQDFQLEKRSDNELIAKAQQI-----FSGADDNVTVKMRIHNEERAFGSTLSYHIACKYG 1360
            ........|      ||.|: .||.:     |.....:.|....|.|.:|:.|::||.:||..:|
E. coli  1200 YCTENNPPF------DNGLL-NAQLLQQAKPFVDERQSKTFWFDIRNTDRSVGASLSGYIAQTHG 1257

  Fly  1361 EAGLPAGKSIDIFLEGSAGQSFCAFLARGVNVTLKGDANDYVGKGLCGGNVVIMPQDTVPFESHL 1425
            :.|| |...|..:..|:|||||..:.|.||.:.|.||||||||||:.||.:.|.|.....|.||.
E. coli  1258 DQGL-AADPIKAYFNGTAGQSFGVWNAGGVELYLTGDANDYVGKGMAGGLIAIRPPVGSAFRSHE 1321

  Fly  1426 NVIVGNVCLYGATEGTAYFRGIASERFCVRNSGVTAVVEGVGDHGCEYMTGGVVVILGLTGRNFA 1490
            ..|:||.||||||.|..|..|.|.|||.|||||...||||:||:||||||||:|.|||.||.||.
E. coli  1322 ASIIGNTCLYGATGGRLYAAGRAGERFGVRNSGAITVVEGIGDNGCEYMTGGIVCILGKTGVNFG 1386

  Fly  1491 AGMSGGIAYVYDLDGSFKPKVNPESVELLPLEIEKDVLLVKE-----LLADFIEKTGSKVAKELL 1550
            |||:||.|||.|..|.|:.:||||.||:|.:    |.|.:.|     |:.:.::.|||:..:|:|
E. coli  1387 AGMTGGFAYVLDESGDFRKRVNPELVEVLSV----DALAIHEEHLRGLITEHVQHTGSQRGEEIL 1447

  Fly  1551 DNWAEAQGKFVKVFPYEYQ-KALKDMAEQQAVE 1582
            .||:....||..|.|.... |||.....:.|.|
E. coli  1448 ANWSTFATKFALVKPKSSDVKALLGHRSRSAAE 1480

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG9674NP_001246804.1 gltB 75..1565 CDD:236968 655/1508 (43%)
gltD 1623..2106 CDD:237213
gltBNP_417679.2 gltB 1..1481 CDD:236968 661/1528 (43%)
Blue background indicates that the domain is not in the aligned region.

Return to query results.
Submit another query.