DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG9674 and glt1

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001246804.1 Gene:CG9674 / 39878 FlyBaseID:FBgn0036663 Length:2115 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_594133.1 Gene:glt1 / 2543509 PomBaseID:SPAPB1E7.07 Length:2111 Species:Schizosaccharomyces pombe


Alignment Length:2086 Identity:1124/2086 - (53%)
Similarity:1448/2086 - (69%) Gaps:80/2086 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    73 PGKQGLYDPQNEHEACGVGFIVAIDGKRSHKILRDAQTLSERMNHRGACACDNDTGDGAGVLASI 137
            |..|.||||..|.::|||||...|.|:.||||:.||:.|...|.||||...|...||||||:..:
pombe    54 PKAQALYDPAYEKDSCGVGFTCHIKGQVSHKIVTDARLLLCNMTHRGATGADTRDGDGAGVMTGM 118

  Fly   138 PHGLYSKALAKQGVTLPELGDYATG-IFYLDEAQHA-AAEKEFDDLAKSLGLEVIAWRTVPSNQS 200
            |:....|...:.|.|||:.|:||.| :|:..||... .|...|..:|:.|||.::|||:||.:.|
pombe   119 PYTFMQKEFGQIGCTLPKSGEYAIGNVFFSPEADVCREAMTAFTQVAEKLGLAILAWRSVPCDNS 183

  Fly   201 AIGVVARKSEPLSRQVFVRRPAGSDEKA------FERQVFVLRKRASHELIKPGRRFYICSLSDR 259
            .:|..|...||...|..|...|..|.:|      ||||::||||::|| ||...:.||||||...
pombe   184 ILGPAALSREPTILQPCVVLKAAYDGEAEFDTDLFERQLYVLRKQSSH-LIGKEKWFYICSLHRE 247

  Fly   260 TVVYKGLFTSDQLWDYYTDLKDPEFETYLALVHTRFSTNTFPSWERAHPLRVLAHNGEINTLRGN 324
            |:||||.....|:::|:.||.:.|:.::.||||:||||||||||:||.|:|:.||||||||||||
pombe   248 TIVYKGQLAPVQVYNYFLDLNNAEYVSHFALVHSRFSTNTFPSWDRAQPMRLAAHNGEINTLRGN 312

  Fly   325 VNLMKAREGVMQSDLFGDQLKKLYPVVEPNLSDSGSFDCVLEFLTMASDRSLPESVMTMVPEAWQ 389
            .|.|.||||:|:|..||::...|.|::|...|||.:||.|:|.|..:...||||:||.::|||||
pombe   313 KNWMHAREGLMKSSRFGEEFASLLPIIERGGSDSAAFDNVIELLCASGVVSLPEAVMLLIPEAWQ 377

  Fly   390 NDKTMPQEKRDFYQWAACVMEPWDGPALISFTDGRYIGAVLDRNGLRPSRFYVTKENVLVMASEV 454
            |||.:..||..||:||||.|||||||||.:|.||||.||.||||||||.|||:|.:::::.||||
pombe   378 NDKNISDEKAAFYEWAACQMEPWDGPALFTFADGRYCGANLDRNGLRPCRFYLTSDDMMICASEV 442

  Fly   455 GVYDVDPSQVTLKSRLKPGRMLLVDTKEKKLIQDIELKAKIAKSRPHSEWLQQKMITLDE----- 514
            |...::|.::..|.||.|||||||||||.:::.|.|||..||.......||.|::|.::.     
pombe   443 GTVGIEPDRIVQKGRLYPGRMLLVDTKEGRIVDDKELKHNIASRYDFRSWLDQELIDMNSIVDSL 507

  Fly   515 IRNANVLNTPPVDELAKLPASERGIFDPRLSLFGYSTETVNMLLIPMFKNKKEALGSMGNDAPLA 579
            |.:.:|..||.||:   :|.::    |..:..|||:.|.:||::.||....||.||||||||.:|
pombe   508 IESTSVDLTPIVDD---VPLAD----DKTMLAFGYTLEQINMIMAPMANGGKETLGSMGNDAAIA 565

  Fly   580 CLSNFQPIPYEYFKQLFAQVTNPPIDPFREKVVMSMQCPLGPEANLLQPSAQQVHRIWLTNPILS 644
            |||:...:.|:||:|||||||||||||.||.:|||:||.:||..|||:.:..|..|:.:..|||:
pombe   566 CLSDQPRLLYDYFRQLFAQVTNPPIDPIREAIVMSLQCYIGPSGNLLEINQSQCRRLRMPTPILT 630

  Fly   645 IPDTQLLKRNTHR---GWRTKVLDITFQYNEGVQGYIDAIDRICREGYAAAQAGYQLLVISDRGA 706
            :.:...|| |..|   .|:...:||||..:|||.||..||:|||.|...|...||:.:|:|||..
pombe   631 VEEFNALK-NVDRIYPDWKVASIDITFFKSEGVAGYAAAIERICSEADTAVNEGYKAIVLSDRNV 694

  Fly   707 GIDGKVAVSALLALGALHHHLIETLQRMKVGIVVETAEAREVHHICVLLGYGADAICPYLAFELA 771
            ..: :|.::::.|.||:||:|::...|.:|.:|.|:.:||||||:|.||||||||:|||||.|..
pombe   695 NSE-RVPLASIAACGAVHHYLVQNKLRSRVALVCESGDAREVHHMCTLLGYGADAVCPYLAMEAL 758

  Fly   772 QALRDDGVIAPEVNDKQIYAAYAQAIDTGIAKVMAKMGISTLQSYKSAQIFEAVGLGSDLVAKCF 836
            ..|.....:.|.:.::.....:..||:.||.|||:|||||||||||.||||||:|:.::::.|||
pombe   759 TKLVRQNAMKPGITEETAIKNFKHAINGGILKVMSKMGISTLQSYKGAQIFEALGIDNEVINKCF 823

  Fly   837 RGTQSRIGGVTLEILAKEGLQRYQLTYGKATPDTRILRNP--GQYHWRHGGEAHINEPSSIGSLQ 899
            .||.|||.|||.|.:|.:....::..| ......|.|:.|  |.:::|.|||.|:|.|.:|.|||
pombe   824 LGTASRIRGVTFEHIALDAFALHERGY-PTDQSIRSLQIPDMGDFYYRDGGEQHVNHPKAIASLQ 887

  Fly   900 EAAVNKNLDAFEAFKKTTLDSVKKCALRGQLEFVTD-RQSIDISEVEPASEIVKRFATGAMSFGS 963
            :|..|||..|:..|.:|..:..::|.|||.|:|..| .|:|.|.:|||.:|||:||.|||||:||
pombe   888 DAVRNKNEAAYAEFSRTHYEQTRRCTLRGMLDFDFDSSQAIPIEQVEPWTEIVRRFCTGAMSYGS 952

  Fly   964 ISLEAHQTLSITMNRIGGKSNTGEGGED---SDRYLNQDPNNSRRSAIKQVASGRFGVTASYLAN 1025
            ||:|:|.:|:|.|||:||||||||||||   |.|..|.|   :.||||||:||||||||:.||::
pombe   953 ISMESHSSLAIAMNRLGGKSNTGEGGEDPARSQRLANGD---TMRSAIKQIASGRFGVTSWYLSD 1014

  Fly  1026 ADDLQIKMAQGAKPGEGGELPGYKVTKDIAKTRKSVPGVGLISPPPHHDIYSIEDLAELIYDLKC 1090
            ||:|||||||||||||||||||.||::.|||||.|..|||||||||||||||||||.:||||:|.
pombe  1015 ADELQIKMAQGAKPGEGGELPGNKVSESIAKTRHSTAGVGLISPPPHHDIYSIEDLKQLIYDMKS 1079

  Fly  1091 SNPNARISVKLVSEVGVGVVASGVAKGKAEHIVISGHDGGTGASSWTGIKNAGLPWELGVAETHQ 1155
            :||.||:|||||||||||:|||||||.||:||::||||||||||.|||||.||||||||||||||
pombe  1080 ANPRARVSVKLVSEVGVGIVASGVAKAKADHILVSGHDGGTGASRWTGIKYAGLPWELGVAETHQ 1144

  Fly  1156 VLVLNNLRSRVIVQADGQLRTGFDVVVAALLGADEFGFSTAPLIVMGCTMMRKCHLNTCPVGIAT 1220
            .||||:||.||::|.|||:|||.||.:|.||||:|:||:|.|||.:||.||||||||||||||||
pombe  1145 TLVLNDLRGRVVIQTDGQIRTGRDVAIACLLGAEEWGFATTPLIALGCIMMRKCHLNTCPVGIAT 1209

  Fly  1221 QDPELRKKFTGKPEHVINFFFMLAEDIRKIMAGLGIRKFQDLIGRTDLLRVASQRDAKASNLDLK 1285
            |||||||||.|:||||:|||:.:||::|.|||.||.|...:::||:|.|:||...:.|:..|||.
pombe  1210 QDPELRKKFEGQPEHVVNFFYYVAEELRGIMAKLGFRTINEMVGRSDKLKVAEPINNKSKLLDLT 1274

  Fly  1286 LLLQPALELRPGT---NIVGGSVKQDFQLEKRSDNELIAKAQQIFSGADDNVTVKMRIHNEERAF 1347
            .||.||..||||.   |:    .|||.:|..|.||:||.:|:........:| |:..|.|.:|..
pombe  1275 PLLTPAFTLRPGAATYNV----RKQDHRLYTRLDNKLIDEAEVTLEEGIPSV-VECEIINTDRTL 1334

  Fly  1348 GSTLSYHIACKYGEAGLPAGKSIDIFLEGSAGQSFCAFLARGVNVTLKGDANDYVGKGLCGGNVV 1412
            |:|||..|:.:|||.|||. .||.:.:.|||||||.||||.||.:.|:||.||||||||.||.::
pombe  1335 GATLSNKISKRYGEEGLPT-DSIRVNVFGSAGQSFGAFLAPGVTLQLEGDCNDYVGKGLSGGRLI 1398

  Fly  1413 IMPQDTVPFESHLNVIVGNVCLYGATEGTAYFRGIASERFCVRNSGVTAVVEGVGDHGCEYMTGG 1477
            |.|....||:...|:|:|||||||||.|.|:..|:|:|||.|||||..|||||||||||||||||
pombe  1399 IYPPRVSPFKPEENMIIGNVCLYGATSGHAFISGVAAERFAVRNSGAIAVVEGVGDHGCEYMTGG 1463

  Fly  1478 VVVILGLTGRNFAAGMSGGIAYVYDLDGSFKPKVNPESVELLPLEIEKDVLLVKELLADFIEKTG 1542
            .|||||.||||||||||||||||||:...|..|:|.|.|::..:....::..::.|:.|....||
pombe  1464 RVVILGSTGRNFAAGMSGGIAYVYDMQMDFAGKINTEMVDISSVTDAAEIAFLRGLIQDHRHYTG 1528

  Fly  1543 SKVAKELLDNWAEAQGKFVKVFPYEYQKAL-KDMAEQQAVEQ-----------PLKSAIENGNGK 1595
            |:||..:|.::.....:||||.|.||:..| ::.|:::..::           |::..||..|.:
pombe  1529 SQVADRILSDFPRHLSRFVKVLPREYKAVLEREAAKKEEAKRLQYPKAFMPGNPIRQQIEETNAQ 1593

  Fly  1596 HEPHIKDIEEAIQDVVLEQKRADRVLDKTRGFVKYKRESAPYRDAGERQKDWDEVYNFPHVR--- 1657
                |.|:|:.:...|  :|.|.  |||.|||:||:|.|..||:..:|..||.|:    .||   
pombe  1594 ----IADVEDTLGATV--KKSAP--LDKLRGFMKYQRRSEHYRNPLKRTNDWKEL----SVRLRE 1646

  Fly  1658 KNLKVQAARCMECGVPFCQSNSTGCPLGNIIPKWNDLVFHGEWQEALRQLLQTNNFPEFTGRVCP 1722
            ..|:||.||||:||.|||||: .|||:.|.|..||||||..:|:|||.|||.|||||||||||||
pombe  1647 DELRVQTARCMDCGTPFCQSD-YGCPISNKIFTWNDLVFKQQWKEALTQLLLTNNFPEFTGRVCP 1710

  Fly  1723 APCEGSCVLGISEPAVTIKNIECAIIDHAFEQGWIKPEIPEVRTGKRVAIVGSGPSGLAASQQLN 1787
            |||||:|.|||.|..|.||::|.||||.|:|:|||.|..|..|||:||||:||||:||||:.|||
pombe  1711 APCEGACTLGIIESPVGIKSVERAIIDKAWEEGWIVPRPPAERTGRRVAIIGSGPAGLAAADQLN 1775

  Fly  1788 RAGHFVTVFERNDRVGGLLQYGIPTMKLSKEVVKRRVDLMADEGIEFRTNVHVGK--DLKAEQLL 1850
            ||||.|.::||.||.|||||||||.|||.|:||:||:.||.|||||..|||.|||  |:..::|.
pombe  1776 RAGHHVVIYERADRPGGLLQYGIPNMKLDKKVVERRIQLMIDEGIEVLTNVEVGKNGDVSLDELH 1840

  Fly  1851 QEYDAVLLTTGSTWPRDLPLANRDLKGIHFAMEFLEAQQKKQLGGK---NDIISAAGKNVIIIGG 1912
            :.||||:|.:|||.|||||:.|||.||||||||||....|..|..:   .:.|||.||:||:|||
pombe  1841 KVYDAVVLASGSTVPRDLPIPNRDSKGIHFAMEFLHKNTKSLLDSELKDGNYISAKGKDVIVIGG 1905

  Fly  1913 GDTGCDCIATSLRQGAKSITTFEILPEPPQKRAQDNPWPQWPKVFRVDYGHEEVKLKWGKDPRQY 1977
            ||||.||:.||:|.||||:...|:||.||::||.||||||:|:||||||||.||:..:|:|.|:|
pombe  1906 GDTGNDCLGTSVRHGAKSVRNLELLPIPPRERAFDNPWPQYPRVFRVDYGHAEVQAHYGQDFREY 1970

  Fly  1978 CTTTKEF-VGENGAIKGVNTVEVEWTKTETGQWRMQEVAGSEKYFPADLILLAMGFLGPEKTVPS 2041
            ...||.| ..|:|.:||:|||.:||||...|:|.|:|:..||::|||||::||:||||||:...:
pombe  1971 SILTKSFEKDEDGNVKGINTVRIEWTKNSKGRWIMKEIRNSEEFFPADLVILALGFLGPEEQATA 2035

  Fly  2042 ELGLELDPRGNIKASNGQYGTSNSKVFAAGDCRRGQSLVVWAITEGRQAARQVDSYLTGRPSGLP 2106
            .:.::.|.|.||......|.||...::||||||||||||||.|.||||.||::|....|: :.||
pombe  2036 GMNVDRDARSNISTPTKSYETSVPGIYAAGDCRRGQSLVVWGIQEGRQCAREIDLKFQGK-TFLP 2099

  Fly  2107 GPGGVI 2112
            |.||::
pombe  2100 GDGGLV 2105

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG9674NP_001246804.1 gltB 75..1565 CDD:236968 814/1514 (54%)
GATase_2 88..504 CDD:278726 215/423 (51%)
Glu_syn_central 543..828 CDD:282720 141/287 (49%)
GltS_FMN 918..1271 CDD:239202 251/356 (71%)
gltB_C 1316..1565 CDD:238482 133/248 (54%)
gltD 1623..2106 CDD:237213 287/491 (58%)
Fer4_8 1645..1756 CDD:302761 70/113 (62%)
NAD_binding_8 1772..>1804 CDD:290186 21/31 (68%)
glt1NP_594133.1 gltB 56..1567 CDD:236968 819/1530 (54%)
GATase_2 69..492 CDD:278726 215/423 (51%)
Glu_syn_central 528..815 CDD:282720 141/288 (49%)
GltS_FMN 880..1260 CDD:239202 263/382 (69%)
gltB_C 1303..1552 CDD:238482 133/250 (53%)
GOGAT_sm_gam 1613..2099 CDD:162300 287/491 (58%)
Fer4_8 1635..1744 CDD:302761 70/113 (62%)
NAD_binding_8 1760..>1804 CDD:290186 32/43 (74%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Domainoid 1 1.000 527 1.000 Domainoid score I45
eggNOG 1 0.900 - - E1_COG0069
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H5537
Inparanoid 1 1.050 2025 1.000 Inparanoid score I2
OMA 1 1.010 - - QHG57723
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0006699
OrthoInspector 1 1.000 - - oto102037
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100905
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR11938
Phylome 1 0.910 - -
RoundUp 1 1.030 - avgDist Average_Evolutionary_Distance R16330
SonicParanoid 1 1.000 - - X4899
TreeFam 1 0.960 - -
1413.860

Return to query results.
Submit another query.