Protein Alignment Strump and wshc-5

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_648840.1
• Gene: Strump / 39766
• FlyBaseID: FBgn0036571
• Length: 1191
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_491784.1
• Gene: wshc-5 / 172306
• WormBaseID: WBGene00020259
• Length: 997
• Species: Caenorhabditis elegans
• Alignment Length: 1185
• Identity: 262/1185 - (22%)
• Similarity: 486/1185 - (41%)
• Gaps: 278/1185 - (23%)

  Fly    14 LLNIVSVGNSIIAEILRLKDYVPSIYRLDNKADKAKYGELILDFSYFKIAEDHERRIEQSPELTE 78
            |..::..|.||:|||.||..::|..:|...|:.|.| ..:.|||.|..             ::.:
 Worm     9 LSKLILHGESILAEIFRLSSFIPKDFRDPTKSSKFK-NIVQLDFKYLS-------------KVDQ 59

  Fly    79 LDDEARAQLPLITRFYLAFQSI----HHYASDLQQYIEELNTGYYIQQTLETVLQEEEGR----- 134
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 Worm    60 IEKELESHLRLQTQFYSTFEPVLIAFEQLFSSISEFVQS-----FISYTKEAEIINGETRMDVNR 119

  Fly   135 --QLLCESLYLFGVILLMVDFHIPGDVRERLLIAYYRYSGG-----------DATPSGDESNIHD 186
              :|....||:.|::::.:|.:||..:|||:.||.||.|..           .||..|::|.|..
 Worm   120 TSELEAYCLYISGILIIYMDTYIPAPIRERIYIAIYRKSDVRENAEFLVDFLKATVPGNDSMIRR 184

  Fly   187 VCLLLRSTGYVHPSIAAKVLGLGGKQAGARAASLVVPRYPEAYFSRFRFDENFVDLVVARLRCDD 251
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 Worm   185 IPL------------------------------------PESFITS---TINAIEII-------- 202

  Fly   252 IYNQLNLYPHPAHRSTALS-TQAAMLYVCLYFCPQVLHSQGSQMREIVDKFFCDNWTISVYMGMT 315
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 Worm   203 -------------EGTSLQIPKAQLMYVALQFDRQTLTNDSAIMTKIANSIYRETWVINLGFGVI 254

  Fly   316 VNLVDAWLDFKAARSAIENVISPPAIKALCQQQKEQLGKITQKTQEIVRE----GVLNDNFVLEH 376
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 Worm   255 ANVFDGWYNFKSAWNAINSTIT---------QQDAQ--RIMEKHLKMMNETSFPQVINEMIDFEQ 308

  Fly   377 ANKIIHLMRQSNVLLRWFCLH------TSREVFIFAHTATLTGQVQKCVLHELQF-NRNTLYNLL 434
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 Worm   309 NLKKISMCNRS---LKWLFLHSKISQKTSRP------------------LNKYRLPSDDQLFQWL 352

  Fly   435 LNCSQMELSVREFLAEIQQTKEERWTKSREEAMQRLNELSEAFAGSRPLSKIEQNPQLQQWFGEV 499
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 Worm   353 LHVSRCEILLLNLYTTTLENRDVEGTERKQNIRTLLHQLAEFFEHGFVKMGESQKTNFVKWVRNL 417

  Fly   500 AGRLQKLELSRPQKSGRLIIQVMQALDDVQEYHNLHSNMLVKQQLQETRDMLNQMAQLINLKEDI 564
            :..::|::|:...:|...|.|:::.:..|.:...|..|:.:|..|......|..:..:::|.:.:
 Worm   418 SETVEKIDLNDTTESVETIQQIIRRVKQVGDQLGLSINLTLKDCLSTLDTDLRALMSVLSLSDSM 482

  Fly   565 --EIHIQMITDFSYAWHLLQFDFTPPMQEHIKRQPQAVIGIRAVFLKLASTLEVPLMRINQARSE 627
              |::.:|  :.:|.|.|:. ...|.:|:::.......: :|.:|.||:.:..:..::::....:
 Worm   483 IPEVYSKM--ESTYLWPLIS-QLIPRIQQNLVSTSNTDV-VRQIFTKLSISCYMLKLKLSNFSDK 543

  Fly   628 DLVS--VSNYYSTELANFLRRVLQIVPETMFSILAKIIYLLTNVIKEFPTKVEKERLKDYAQFEE 690
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 Worm   544 DHVASRIANTYSYALEKNLKTVLQSVPQHLFGIMYNVI--MPGLGKTFEPYIEKTELRELSEFVT 606

  Fly   691 RAKVAQLTNSIAVFTKGILMMKTTLVGVIELDPKQLLEDGIRKELVNHLANAYNLGLIFTPEKGK 755
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 Worm   607 NSRLVETTSLIANTSMGISRMMLTRVGTIEINPKELLEEGMIRQLYKEIKKMI----------GT 661

  Fly   756 TPVQLLQQKLQALAKTIEGYRRSFEYIEDYLRVQGLRI----LLEESQRIINYNVEKECNAFLRN 816
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 Worm   662 TSATSSIENLLKMCDNIETMRCSFLYLCDYMNLDGEHVWSVAMDDFFSRI------SEERAFARS 720

  Fly   817 KVQEFQSEHQSQIIPIPNFPPLLGDPSNNFIGRLAHEILRCTDPKQTIFLDLKSTWYEKKAPHQE 881
            .                      |:...|:|..|   .::.|:||.:.|.:...:|.:.|. .:.
 Worm   721 S----------------------GELEKNYIAEL---FIKITNPKASRFSESSLSWKDVKM-SKT 759

  Fly   882 VLAGSGFFEILREALAPAGMVGLERLYAHMLADELKRNLERLQRNLTSDRMWVDTLAALTRELEA 946
            ||:...|..|  |.:.|..:  |..:..|:.. ||::.|.....|.....:..:...::|.|...
 Worm   760 VLSFDVFDRI--EKIVPFHI--LTSIETHITV-ELEKMLIEYISNARKIGVSFNLQNSVTHESAF 819

  Fly   947 RDFPTPEVSKQPLKYYQAYTQRWLKVWP--TLLDWVLC-IGQKQLLRREIAGELSFSSKCDAKLL 1008
            :.|..|.           |.:....:.|  ..|..:|. |||..::.|.|         |:||.|
 Worm   820 QFFTGPN-----------YERLVKSIQPQSAALAAILAQIGQYLIILRTI---------CNAKQL 864

  Fly  1009 EN--TADTLNKALLLELSLS-----KDLCDEKGVVMLTELQETLLYTGNFEPLEQVFLITKNTHN 1066
            .|  ..|::.:. |:|:|:|     .||..|.|.::...:|.:|     ::|...:|.:......
 Worm   865 ANRHKEDSIQRD-LIEMSISMARDPTDLPTEMGTILKLMMQYSL-----YDPERMIFRLKDEPSP 923

  Fly  1067 MALFMFLFTIAHLGRMQHSTITDCLLPKSAKDNIDNVPFI------VGLVTILQQFHKNVKMLYI 1125
                  ||.||         :..|||||     |.:..|:      ||:..:|:|
 Worm   924 ------LFIIA---------LVQCLLPK-----IGDPYFVCPKQLEVGIRFVLRQ---------- 958

  Fly  1126 SYMSQYVVTVSEAQL 1140
            |.:..|.:.:...||
 Worm   959 SRLLPYFLPIIREQL 973

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Strump	NP_648840.1	Strumpellin	22..1132	CDD:463035	257/1167 (22%)
wshc-5	NP_491784.1	Strumpellin	18..958	CDD:463035	255/1149 (22%)